G2339291


Basic Information

Item Value
gene id G2339291
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493664.1
NCBI id JAAXML020000507.1
chromosome length 1504970
location 1465454 ~ 1466490 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2678208
gtcgctaggtgttgggtagaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgtggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctagGTGTTGGGgtgaggtcgctaggtgttgggttgagG
>TU2678209
gtcgctaggtgttgggtagaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgtggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggtagaggtcgctaggtgttgggtagaggtcgctaggtgttgggttgagGACGCTAGGTGTTGGGGTGAGGTCTCTAGGTGTTGGGgtgaggtcgctaggtgttgggttgagG
>TU2678210
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>TU2678211
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>TU2678212
gtcgctaggtgttgggtagaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgtggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgagatcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttggggtgaggtcgctaggtgttggggtgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctaggtgttgggttgaggtcgctagGTGTTGGGgtgaggtcgctaggtgttgggttgagG

Function

NR:

description
PREDICTED: hyphally regulated cell wall protein 3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2678208 False 295 lncRNA 0.57 3 1465454 1466490
TU2678209 False 379 lncRNA 0.57 3 1465454 1466490
TU2678210 False 358 lncRNA 0.57 4 1465454 1466490
TU2678211 False 379 lncRNA 0.57 3 1465454 1466490
TU2678212 True 379 lncRNA 0.58 4 1465454 1466490

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110516509 llgl1 coding downstream 47671 1326668 ~ 1417783 (-)
LOC110516784 smcr8 coding downstream 282037 1158052 ~ 1183417 (-)
LOC118947123 NA coding downstream 380671 1083692 ~ 1086303 (-)
LOC110518374 cpsf4 coding downstream 417275 1026745 ~ 1048179 (-)
LOC110513313 slc29a4 coding downstream 462270 973741 ~ 1003184 (-)
G2339288 NA non-coding downstream 13582 1450497 ~ 1451872 (-)
G2339268 NA non-coding downstream 34883 1430291 ~ 1430571 (-)
G2339267 NA non-coding downstream 37634 1427131 ~ 1427820 (-)
G2339263 NA non-coding downstream 42544 1422671 ~ 1422910 (-)
G2339258 NA non-coding downstream 43952 1418389 ~ 1421502 (-)
G2339292 NA non-coding upstream 364 1466854 ~ 1471138 (-)
G2339293 NA non-coding upstream 567 1467057 ~ 1470739 (-)
LOC118947127 LOC106594823 other downstream 11183 1436499 ~ 1488403 (-)
G2339205 NA other downstream 222072 1242074 ~ 1243382 (-)
G2339202 NA other downstream 229866 1235204 ~ 1235588 (-)
G2339156 NA other downstream 342815 1107732 ~ 1122639 (-)

Expression


Co-expression Network