G2341808


Basic Information

Item Value
gene id G2341808
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493667.1
NCBI id JAAXML020000535.1
chromosome length 1125905
location 1036238 ~ 1073487 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2681861
tctctctttctctccctctctctctctctctctctctctctttctccctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681863
tctctctttctctccctctctctctctctctctctctctttctccctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681856
tctctctctctctctccctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcgatctctctctctctctcaatctctctcgctctctggcagCAGTGGTTTGAAAGaggatgtttttctctctctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccctctctctctctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681860
tctctctctctctctccctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcgatctctctctctctctcaatctctctcgctctctggcagCAGTGGTTTGAAAGaggatgtttttctctctctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccctctctctctctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681862
tctctctctctctctccctctctccctctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatcgGGGGTACAGTCCGTGGGATATACATGTTTAAGCTACACTTCAGAAAGCTCGCCTCTTTAAATAAGTTAAACATGTTTTTGTTGGTCTCCACATTGGGGACAGAGTAGTTTCATCTCCACTATAGAATCATGTCCTCTCACAGACAGGGACCCACCTTATATAGGAATAGTGGCATTTCCCTTTTGACGAGAGACGGCTCAACCTAAAATCAGATGTATCTTTCCGATGTTTTCTCAGATGTTTTCATGTCAAAAGTTCAACCCATATCCCACGCTATCTGAGGGGGAACTTCCCCCATTACGTTTCAACTCAATATACAGGCTTCCTCTGTGATGTTTGGTTTGCGTCAACAGGAGCtatggagagagtgtgtgtgtgtgtgtgggggggggggggggggggtgttccatCTATACAGAATCTCTGGTTTCCATAGTAACCACACGACTGCCATATATCACTTtatccacccccccccaccccaccccaccccacccgaTGGTTCACAAATCTATACAgtgataaaatatatatatagatacgaTTGATTTCTCAAAATAGAAGTGACGGAGATGTTTCGAGATAGAAAACGACCgaggatgaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcaatccgTAGTGATTTCCATATGTTGTCGGTAAAGAAGCAGTGAGAACGAAGGTTGTTCCTGTAAAGTGATGTGATTGGCTGAACAGGAGTTACGTCGTACAGCCGCACGGAACGACACGTTCTTCACTGTTACAGTCCCAAAGGTACACAACGAAAAGCAGAAACACCAAGAGGTGTATCCCAGGCAGTCCTGACGCAACACTATTCTATATTCTGTACAAACACATAGAAATCATCTTAACTACCCTGTCATCTGTAGCCATGGTTACAGAATAACATAAAAAAACTTACAGAAATATAAAcattcgcccccccccccccccccccccccccccccgccctgaAGGGGAGAATGCATCTGTTTCAGTCGATTTCTAATCCTTCAACATCGAACAGTGAATTTCAGTTGAGTCTCGTACACCTTGCAGGAACAGGAAATGTAACTTTCCACCCTCcggttcagttcagttcatcagACAGGAGGAAGAGACGGTTGTAAAAACACATAGGAGCTCCTCGAACTACCCTGTCATCTGTAGCCATGGTTACAGTGTTTACAACAACATGTCGTCTTAATAAAATAGTTATGTGAGGAGGGCGGGGCTTTTATCATTACATACTCTACTCTATTGGCAGGTCGGGAAGTAGAAGAACAAGGAGAAGCCTGGCGATTGGCTAGATACTTTTGACCAGTGTCCAGGGCTTGGAAGAGCAGTCTGATGGGTTTTTGACAGTGAAAAAAGACTCAGCTAGGATCTGCTACAGGTCCATGGTAGGATGTGTCTGGGCTACGACCCAAGGAACGTCTATCAAGACAGGTGGCCTGACAGATCCTTCCCTCCTTCAGGAACTACTTCATATTTCCATTCCTGAAGAATATTCACAAAAAAAAACCTCCTCTGTTTCGAGCCACCCAGTTTAGTTCGTTCTGGTCTAAATACAATCCATCTCTATCCAATCgaatccctctctcatctcccttccGGCCAATGATAGCTCAGTATCATCCCTATTGTCACTAACCACAGGAAAGAATCAGGAAGCGAGTGCGTTCAACCAGGCCTTCATTGGTCAGCGCCAACTGTCAATCAATCATCAACATATAACTATTCTGGGAGGCGGGACTAAAAAAGAAGGTGGGACCCGGAAAATAAGGGGTTTAGAGTCTTCTCATTGGTCTATAGGCTCGTGACCAGTTGGGAGGGGTCAACGGGGGTCAGGGGCTCCTCGGGCGACGAATCAGAATCCTCCTTGTTGACAGGTACCATGTAGCCGTCGCTGCCCCCCCGCCCCATCTGGTAGTAATGGTGGAGCTGGTGGAGGTGGTTCCTGGACCCCAGGTTTGGCATGCTCTTATAGTAAACATCATCCGCCTCCGGCCCCGGTCCGCTCCCGGTGCTGCTGGTACCGGCCTGAATCTCCCCGCTGTCGTCCATCTCGCCGTCCGCTAACCCGTTCATCTGCCCGTGACTACCGTGGCCGTCCGGTAGATCCGTTAACACGGGCATGGAGGTGTACAGAGAGTTTC
>TU2681864
tctctctctctctctccctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcgatctctctctctctctcaatctctctcgctctctggcagCAGTGGTTTGAAAGaggatgtttttctctctctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccctctctctctctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681853
AGTCATTTATTTGTTGGCAAACAACTTTCACTGTTACAACGAATATTAGTTTAATGAGATCATTCAACATGGCACCCATACAAACTGAATAAATAATCCTCAATGAGAAATTGTAATAATAGTTATAATGATCGTAATAATTTAAAAAACTACCAGTGCGGATttaattattctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681854
AGTCATTTATTTGTTGGCAAACAACTTTCACTGTTACAACGAATATTAGTTTAATGAGATCATTCAACATGGCACCCATACAAACTGAATAAATAATCCTCAATGAGAAATTGTAATAATAGTTATAATGATCGTAATAATTTAAAAAACTACCAGTGCGGATttaattattctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctctctctctctctccctgtctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc
>TU2681858
AGTCATTTATTTGTTGGCAAACAACTTTCACTGTTACAACGAATATTAGTTTAATGAGATCATTCAACATGGCACCCATACAAACTGAATAAATAATCCTCAATGAGAAATTGTAATAATAGTTATAATGATCGTAATAATTTAAAAAACTACCAGTGCGGATttaattattctctctctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctctctctctctctgtctctctatctctctctccctgtctctctctatctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctctatctctctccctgtctctctctctctccctgtctctctatctctctctctctctctccctgtctctctttctctccctgtctctctctctctctctccctgtctctctttctctctctctctccctgtctctctctctctctctctctttctctccctgtctctctttctctctctgtctctctctctttctctccctgtctctctttctctccctctctctctctctctctctctctctttctccctgtctctctctctcttgccctgtctctctctgtctttctctgtctctctccctgtctctctatctctctctctccctgtctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctctctgtctttctatctctctccctctctctccctctctctctctctctctctctctctcgtcatc

Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2681861 False 274 lncRNA 0.51 3 1036238 1071163
TU2681863 False 272 lncRNA 0.51 3 1036238 1071163
TU2681856 False 808 TUCP 0.51 3 1048802 1071163
TU2681860 False 882 TUCP 0.51 2 1048802 1071163
TU2681862 False 2340 lncRNA 0.48 3 1048802 1073487
TU2681864 False 766 TUCP 0.51 4 1048802 1071163
TU2681853 False 799 TUCP 0.46 2 1070343 1071163
TU2681854 False 747 TUCP 0.45 2 1070343 1071163
TU2681858 True 743 TUCP 0.45 3 1070343 1071163

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gtf2e2 LOC100194638 coding upstream 25573 968847 ~ 1010665 (+)
LOC110517093 LOC106595071 coding upstream 562194 314630 ~ 474044 (+)
G2341798 NA non-coding upstream 42821 992947 ~ 993417 (+)
G2341794 NA non-coding upstream 55362 979929 ~ 980876 (+)
G2341788 NA non-coding upstream 74547 960820 ~ 961691 (+)
G2341787 NA non-coding upstream 75638 960142 ~ 960600 (+)
G2341778 NA non-coding upstream 94925 940422 ~ 941313 (+)
G2341682 NA other upstream 257310 778116 ~ 778928 (+)
G2341098 NA other upstream 927927 29995 ~ 108311 (+)
G2341829 NA other downstream 15158 1088645 ~ 1089001 (+)
G2341761 NA non-coding upstream 80489 922732 ~ 968313 (+)

Expression


Co-expression Network