LOC110486817 (LOC106601768)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110486817
gene name LOC106601768
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493685.1
NCBI id JAAXML020000486.1
chromosome length 631356
location 593456 ~ 604197 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036972978.1
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>XM_036972979.1
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>TU2694591
GAAGGATTGCTATTTTGTTCACAGGGTTTTAACCCTCATCAACGTTAAACCGAGACGCGCATGACCTGCATTTTCCAGATGTGCATTACATGTACACGGCCACTAGATAGAGCCCAAGTATCAAAAATACTTTATACATTTTTCAGTTCTTGGCCTGGGCCTGTTCCTAGTTGGATGGATTTCGTCATCATTACCGTTATTCGCCCTCCCCATCTCCTTCACCCCCACTCACCACCCAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036972978.1 False 6504 mRNA 0.44 4 593456 604197
XM_036972979.1 False 6444 mRNA 0.44 3 593456 604197
TU2694591 True 240 lncRNA 0.45 1 601090 601329

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110486820 LOC106606690 coding downstream 24886 523322 ~ 568570 (-)
LOC118947907 LOC106606653 coding downstream 70594 513606 ~ 522862 (-)
LOC110486835 LOC106606695 coding downstream 174936 400904 ~ 418520 (-)
LOC118947904 LOC106606697 coding downstream 192626 389054 ~ 400830 (-)
LOC110486843 LOC106601652 coding downstream 209814 382082 ~ 383642 (-)
LOC110519423 LOC106606673 coding upstream 256 604453 ~ 607145 (-)
LOC118947905 LOC106606687 coding upstream 9998 614195 ~ 623434 (-)
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G2350686 NA non-coding downstream 35483 555658 ~ 557973 (-)
G2350679 NA non-coding downstream 52691 540161 ~ 540765 (-)
G2350708 NA non-coding upstream 7106 611303 ~ 611694 (-)
G2350665 NA other downstream 58075 534239 ~ 535381 (-)
G2350673 LOC106606689 other downstream 82847 509912 ~ 510609 (-)
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G2350576 NA other downstream 262819 327477 ~ 330637 (-)

Expression


Co-expression Network