XLOC_000429 (tmem184c)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_000429
gene name tmem184c
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 36722122 ~ 36746569 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00000739
TTTTGAAGTCCGCaaaattcagttttctttttaTGACATGATTTATGCAACAGCAGTCTTAAACATGACCTCGCGCTAACTTTATAACGTAACCTTACGCAATGGCGAGCGGCTCTTGAAAGCAGTGAATGGCATAAGAGAGAATCAGCTGATTATTTGACGCACTGTCAACACTCATGATTCATCTAGATCTCTGCTGTTTGTACGAATCATATGCGCCTAACCAAACCAATGCGTTAGAACTGACAAAAactcaatttctttttttttttaatttgtagcaGCTTCTGTGTGAAACTCCACTAGAGTGTAATGTGTGTAGTGTGAGAGAGATCCGAGTGAGCGGGGAAGATGCCGTGCACATGCGGGAACTGGAGGAGGTGGATTCGGCCTCTGGTGGTGGTGCTCTACATCCTGCTTCTTTTGGTTGTTCTTCCACTGTGTATATGGGAACTGCAAAAATCAGAGGTTGGTACTCATAATAAAGCATGGTTCATCGCAGGGATATTTGTGTTTATGACTATCCCCATCTCGTTATGGGGAATCCTGCAGCATCTGGTACACTACACCCAACCTGAGCTACAAAAACCTATTATCAGAATATTATGGATGGTTCCTATTTACAGCCTGGACAGTTGGATCGCTTTGAAGTATCCCAACATTGCCATCTATGTAGACACATGTAGAGAGTGCTACGAGGCCTATGTCATTTACAACTTTATGATCTTCCTTCTCAACTACCTGGGGAACCAGTATCCTAGTCTGGTGCTCATGCTGGAGGTCCAGGAGCAACAAAAGCATCTGCCCCCACTTTGCTGTTGCCCACCGTGGCCCATGGGAGAAGTGCTTCTGTTGAGATGCAAACTAGGAGTTCTGCAGTATACGGTTGTGAGACCGGTCACCACAGTCATTGCTTTGATTTGTCAGCTTTGCGGGGTCTACGATGAAGGAAACTTCAGTTCAAAAAATGCCTGGACATACCTGGTTATTTTCAACAATCTGTCTCAGCTTTTTGCCATGTATTGTCTTGTGCTGTTCTACaaggctctgagagaagagctcAGTCCCATCAAACCTGTGGGCAAATTCCTTTGTGTCAAGCTGGTGGTGTTTGTGTCATTCTGGCAAGCTGTGTTCATTGCACTTTTAGTGAAGGTTGGTGTAATCTCAGACTCTCACACCTGGGACTGGGACAGTGTGGAGGCTGTAGCTACAGGTTTACAGGACTTCATCATCTGTGTGGAAATGTTTTTGGCAGCCATTGCCCATCACTTCAGCTTCACTTACAAGCCCTACATACAGGAAGCAGAGGAAGGTTCCTGCTTTGATTCCTTCCTGGCCATGTGggatatttcagacatacggGCTGACATCTCAGAACAAGTGCGCAATGTTGGGAGAACAGTCATGGGTCGTCCAAGGAAAAACTATTTTGGCGAAGAGGCAAACCACGATGAGAACAGAGGACTACTGTCAGCTGGTTCACAGGATGCCGCTATTGAATCGTCCTCCACTCCTCCATCACCCAAGGGCCGGTATCAGGGAATGGGCCACACAGTAACCCCTCATTCCATCTCTGCTCCTGCTAATCTTGGCTGTGTACCATGGGAAGGAGATGTTGATGATATCCCTCCTACAGTTATATCTGACGATCACACAGCCCAACAGGACTCAGACTATGCACCTATCATTTAGCATTACAGAGTTTGAGCTGCCAAAGCTATTGTAGTTAATGTGCGTTAGTATAACGTGCATTGGCTACCATATGGAATATATGCATCCACTGTTAACTCTTTGTAGCGGTGGTTAACGTGTTCAGAAAGGCTCAGTGCAGATTCGGTAGCAAGAAGAAACATGAAGAGCAGTGTTGGTCCTCATTTTATATCTCCGTTTGGTTTTATTTTGTTGGAAACCTGACCAAATTGGTTTTAAACTGACCTTAGAGTTAAGCACAGTAATTAGTGTATTCAGTTCATGGTACTTTTAAGACAGCTTTATGAATGTTTACTCTAAAGCCCAATGTATACTTCAGTTTTTTATGGGTATACAACAATATGTGCACAGCTGCTTTTTACGCAGGCTTTGTAAAGTAGCTAATCTTCATTTGATAGAATGAACACAGATGCCAGACGCGTGCACACTGCAAGTTTTGCTACATCAATTCAAGCAAGTGTCTAATGAGGAAAATGATGGAAGAACTAGTTGATTCAACCTGAACCTTCATCAAAAGCATGACGTGAGTAGGAtgtttatagacctttttcttagaacgcATAATTACCCATTACGCTTTGCTTGTATGagcaaggagaatgctaagaacttccggtcgggagctgatgcgtataaacagtcacatttggacagctttaaaacgatagttttaatcaattttaattGCTTTTAATGTCTTTGAACTAATCCTGCTGTCGATAagcgccacctcctggactgatcacttttaaaaaatgtgatctaggatggaaaacagctggtGTGAGGCAATTTCCCCTTGTTGTTAGACGGCATtttgtgtcatttaaaatgaAGCCTCGTTAtcactaaagtcaacattttctttttcttttaaacatataaccagcccaaacaaatgttaatcaccaaaatgtttgacacacaaaGGTAGCCTTTACTGTTCCACTGACACATTGCTTAAACAAGTgtcacaaagtgaaaataaagtgacgttttgaaatgacagaaaaacactaaCTAACTCAACGAAACATAACGGCTCCCgattagaatcaacatgcaaatcagccagcagagtatcagtaacaaacttttattggtcattttttaaattgcatGACTTGCATACCTGTTTCATGCCAGTTATCTGGTTTGCTCTATATACGTTTTTCTCTTGCACTTGAATTACATCTGACAGATAATAACgactttaacacacacctttcaaactTTCAAAGAtgtatgtcacaaaaacacttcgtaatccactcaaaacgctgTTGAAACCCATTTTCAAATCACAAATGACCtattgtaaacgctgtaaacggaagttctaatcATTCTACCGGAAGATGCTGGTCGCTATGacccctccatgcagcagccaagaaaaaggtctatactgtGCGTGTTAAAAGTGAGGTATACTTTGGGTTTACagggatagatcacccaaaagaagtttttttttttcacactctGAACTTGTaactctttcttctgttgaacactaaagtagatactctgaagaatgctggaaacaatcagccattgacatccatagaacACATAAGAAATTATTTGAATAGTTGAAATGACACAATTctttaggttttatttttttttggttaaatttgtaaactcaatcgatttgtgttgggacgacaAGAAGTAATTGTGTAGAACACAGCATTTTTTAGTGTACGAACAAATACAATGGGAGTTAATAGCtgatttttccaacattcttcattaAATCTTcctatgtgttcaacagaaattcaaTTGGAGGATgaggatgaataaataatgacaggagttaaattttttggtgaactatccctttaagaaatacAATGTATTAATAACactacatgtttttacattttcagtaCTGTCCTGTGTTTTGTTCTTAATGTCTTTTAATACATGACATCTGTTACTTTCAGGTTTTTCTTCTGTAAATTGGAatcatttctttgttttattattttaaaaacagcacTTTCAACATGATGGACAGTAATTTGAAATTGCCAGAATGCCATGGAGATTTGTTCAATTTTGTCTCAGCTAAATATATATGCATGATCTAGAAGATAGAGCAACTACATCAGCTCTAAAGCACAACATACTGAAGCAGTCATATCTCTGCTCGCTATGCTTTAGAGCTTAGCAACTTCCTGCAGAGAAGCTCCATCTAATAACCTCGAAACATAATTGGCTATGCCATTATTCTTTATTTCCATTTCTTTAGTTATTTGCATTCTTATAACAAAATTGGTTTTGGTTTAAAACTTAATTCAGAAACgtatagaaaatatataaaatactgatTTCACATTCACATCGGGAATAATGCAATGTTCTAAATATTAGCCAAAGTCAATGTATGGCTCTTAaaacagtggtctcaaactcaattcctagagggccacagctctgcagatttaagctccaaCCAACTCCAAATGACACCTGCTTAATGGTCTCTTGTatttttgaacaccttgattagttggatcagctgtgtttgattaggggtggagcaaagctgtgcagagctgtggtccttcaggaattgagtttgagaccactgtttTAAGAGCAATAAAAGTTTAGTTctacacaaaaaaataactgCCATCATTCCTCTCATGTCATTCCCAACTTATAAGAATAAGTCAAATTTTCGAGTAACAAGTGAAAGTATTTTTAATGAAACTTTAGGAAGTAACCTCTATTATTCTCCGCGTACGagcgggcacagccatttgaatcattttggcaCAAGACTCCGGTCTCATTCGCTTCTATTCATTTATAGACATTAAAACAgctcgttttgctgcttgatgttgcttACTGACATTTTCTCATTATATTAttgctttgtctgtataatcatgcaaacacttctttgtagagcgagtagtttgaccgttttctgccgtttaatATTCCCAGTCATTTCTCCTATAGACGACTGAACCGGAAATTCTataacaatcgcaaaaacaagcgcacttccgcagtttagaataaggtcaataatggCCCTTGCTTATCAAACAAGTTTACCTTTTTTGATGTGCTCTGTATATGAGATCGAAGTTTATATGTGAACAAaagtctaaatcaggggtgtcaaactcagttccggtcacactggacttttcttccCACAGACTTCCATATATACGCAAGCGAATGCGTCAGAcgagcttggtgaactctgacctgcaaaatcgcatcacttgactgggTGAGAcgaatcgagg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>TCONS_00000740
CAAACTAGGAGTTCTGCAGTATACGGTTGTGAGACCGGTCACCACAGTCATTGCTTTGATTTGTCAGCTTTGCGGGGTCTACGATGAAGGAAACTTCAGTTCAAAAAATGCCTGGACATACCTGGTTATTTTCAACAATCTGTCTCAGCTTACTCCACCTCAGTGTTGACATCATTAGCGCCTGGCTCCTCCTCTTTAACGGCTGTAATGGAGATGCTGCTTTTATGCAGGCGGACGCTGAGTTGAAGCCAGTCTCCTCTGCTGACGGTTAGAGGCTGCTGGAGGACCACTGCCGCCTGCTTCCAGTGAGAATCCTTGCTGTAGGTGCTGACGCTCTGCCAACAGTCCAGATGGATCTGGTACCAGAAGGGAATGGCACTCACCTTGCCTGAGGTGCTGACCTGCACCTGCCAAATCCAAAAAAAAGGTCAAAGATTGTTTGAAATAAAACTCGAGAGTTCGG

Function

symbol description
tmem184c Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM184C (transmembrane protein 184C).

GO:

id name namespace
GO:0006810 transport biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0005215 transporter activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-090312-89 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM184C (transmembrane protein 184C).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000078789

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00000739 False 6237 mRNA 0.39 10 36722122 36742368
TCONS_00000740 True 463 processed_transcript 0.49 3 36728297 36746569

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_000428 ednraa coding upstream 19767 36612660 ~ 36702355 (+)
XLOC_000427 pou4f2 coding upstream 281821 36436936 ~ 36440301 (+)
XLOC_000426 lsm6 coding upstream 518122 36194761 ~ 36204000 (+)
XLOC_000425 BX324156.1 coding upstream 567745 36154261 ~ 36154377 (+)
XLOC_000424 zgc:152968 coding upstream 719348 35985813 ~ 36002774 (+)
XLOC_000430 arhgap10 coding downstream 25385 36771954 ~ 36913091 (+)
XLOC_000431 NA coding downstream 219431 36966000 ~ 36966282 (+)
XLOC_000432 FO704615.1 coding downstream 377073 37123642 ~ 37123772 (+)
XLOC_000433 dclk2a coding downstream 448896 37195465 ~ 37310490 (+)
XLOC_000434 fam193a coding downstream 566011 37312580 ~ 37362246 (+)
XLOC_000421 NA non-coding upstream 823685 35896392 ~ 35898437 (+)
XLOC_000415 NA non-coding upstream 1628610 35034294 ~ 35093512 (+)
XLOC_000414 NA non-coding upstream 1861065 34857368 ~ 34861057 (+)
XLOC_000408 NA non-coding upstream 2267675 34450659 ~ 34454447 (+)
XLOC_000436 NA non-coding downstream 844689 37591258 ~ 37638367 (+)
XLOC_000439 NA non-coding downstream 1086778 37833347 ~ 37834392 (+)
XLOC_000440 CT583668.1 non-coding downstream 1249890 37996459 ~ 37996577 (+)

Expression


Co-expression Network