G2010


Basic Information

Item Value
gene id G2010
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053112.1
NCBI id CM020909.1
chromosome length 48724115
location 5231497 ~ 5353152 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU2811
gtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU2812
gtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtcggtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgcatgtgtgtgtgtg
>TU2813
gtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU2814
gtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtgt
>TU2816
TTTATTGTTACTGATAACAtgaatgaaaagaaataaaccTTTATGTACAGACAGCCGGGCTGGCTTCTATGATGTCTAAATATAATGTCTCTTTAATAACTCTCACTGTACACAATAAAGGACAACGATCATTTACAGGCACACTGAACGAGGCTCTGCTATTGGCCACAGAAGACAACGAAATATAAACGTGAAGAGAGTCCAGTGTGTGTTACagccgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtcggtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgcatgtgtgtgtgtg
>TU2817
gtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgcgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtctgtgtgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttt
>TU2818
TTTATTGTTACTGATAACAtgaatgaaaagaaataaaccTTTATGTACAGACAGCCGGGCTGGCTTCTATGATGTCTAAATATAATGTCTCTTTAATAACTCTCACTGTACACAATAAAGGACAACGATCATTTACAGGCACACTGAACGAGGCTCTGCTATTGGCCACAGAAGACAACGAAATATAAACGTGAAGAGAGTCCAGTGTGTGTTACagccgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU2819
TTTATTGTTACTGATAACAtgaatgaaaagaaataaaccTTTATGTACAGACAGCCGGGCTGGCTTCTATGATGTCTAAATATAATGTCTCTTTAATAACTCTCACTGTACACAATAAAGGACAACGATCATTTACAGGCACACTGAACGAGGCTCTGCTATTGGCCACAGAAGACAACGAAATATAAACGTGAAGAGAGTCCAGTGTGTGTTACagccgctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2811 False 222 lncRNA 0.47 2 5276050 5305165
TU2812 False 513 TUCP 0.55 3 5288339 5305165
TU2813 False 324 lncRNA 0.47 3 5276050 5305165
TU2814 False 522 TUCP 0.55 4 5288076 5305165
TU2816 False 519 lncRNA 0.50 3 5288339 5353152
TU2817 False 226 lncRNA 0.45 3 5270921 5289053
TU2818 True 721 lncRNA 0.54 4 5276050 5353152
TU2819 False 581 lncRNA 0.43 4 5231497 5353152

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120563200 LOC103374761 coding downstream 165307 5037606 ~ 5066190 (-)
LOC120563519 LOC103374759 coding downstream 380923 4827103 ~ 4850574 (-)
LOC120563156 NA coding downstream 438454 4785365 ~ 4793043 (-)
LOC120563484 NA coding downstream 470040 4695160 ~ 4761457 (-)
LOC120563624 NA coding upstream 48409 5401561 ~ 5407181 (-)
LOC120563585 NA coding upstream 116911 5470063 ~ 5471326 (-)
LOC120563643 NA coding upstream 118294 5471446 ~ 5472005 (-)
kif16ba kif16b coding upstream 460213 5813365 ~ 5874875 (-)
LOC120563808 NA coding upstream 534317 5887469 ~ 5892793 (-)
LOC120563682 NA non-coding downstream 30669 5200207 ~ 5200828 (-)
G1723 NA non-coding downstream 134873 5075968 ~ 5096624 (-)
G1705 NA non-coding downstream 194972 5034505 ~ 5036525 (-)
G1664 NA non-coding downstream 405315 4821726 ~ 4826182 (-)
G1675 NA non-coding downstream 415851 4807904 ~ 4815646 (-)
G2034 NA non-coding upstream 22340 5375492 ~ 5377786 (-)
G2047 NA non-coding upstream 62184 5415336 ~ 5415888 (-)
G2056 NA non-coding upstream 105629 5458781 ~ 5459073 (-)
G2064 NA non-coding upstream 148901 5502053 ~ 5507095 (-)
G2070 NA non-coding upstream 222700 5575852 ~ 5624485 (-)
LOC120563591 LOC107656489 other downstream 81078 5148516 ~ 5150419 (-)
LOC120564103 NA other downstream 96192 5114020 ~ 5135305 (-)
G1726 NA other downstream 133863 5097369 ~ 5097634 (-)
G1722 hnrnpll,LOC108249392,LOC104956991,LOC106530872,LOC103368822 other downstream 145979 5076606 ~ 5085518 (-)
G1623 NA other downstream 442920 4641586 ~ 4788577 (-)
LOC120563672 esf1,LOC108229506 other upstream 123393 5476545 ~ 5499993 (-)
LOC120563692 NA other upstream 378287 5731439 ~ 5736986 (-)
G2146 NA other upstream 757987 6111139 ~ 6111592 (-)
LOC120563747 LOC104946033 other upstream 847795 6200947 ~ 6206890 (-)
G2177 NA other upstream 913454 6266606 ~ 6267238 (-)

Expression


Co-expression Network