LOC120563981


Basic Information

Item Value
gene id LOC120563981
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053112.1
NCBI id CM020909.1
chromosome length 48724115
location 5793615 ~ 5795764 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XR_005640040.1
GGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt
>XR_005640042.1
GGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt
>XR_005640047.1
ATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt
>XR_005640048.1
GTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt
>XR_005640049.1
GGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt
>XR_005640050.1
GGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTAAATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGTAGTATATAGAGGTGATTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATAGAGGTGATTAAGGTGCAGTATATATATGAGAAATGATCGTAGATTTAGGATTCTTCACCTCTGATTCTTCGGTCGTAGTCGTTGGCCAGCTCCATTAACTCCACCTGGTGTTTCTGGGGAGAATCAAAAGGAGACTTCTGTCACAGAGCAGCGCTGGAAGTAGTATTCACATCCTGTACTGCagttagagtactaataccacactgtaacaatactctggtacaagtaaaagtgtgtaagtatcatcaggaaaatgtagttaaagtattaaaagtgaaGAACAATCCTCCCACTGTAGAAAGTGGAAACTATCCAAAcagttcttttctttcttcccgtctttctgtctctctgtctgtctctttcttt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005640040.1 True 1726 lncRNA 0.36 5 5793615 5795764
XR_005640042.1 False 1621 lncRNA 0.36 4 5793615 5795500
XR_005640047.1 False 1590 lncRNA 0.36 4 5793615 5795756
XR_005640048.1 False 1515 lncRNA 0.36 4 5793615 5795601
XR_005640049.1 False 1712 lncRNA 0.36 6 5793615 5795764
XR_005640050.1 False 1192 lncRNA 0.37 3 5793615 5795019

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120563643 NA coding downstream 321610 5471446 ~ 5472005 (-)
LOC120563585 NA coding downstream 322289 5470063 ~ 5471326 (-)
LOC120563624 NA coding downstream 386434 5401561 ~ 5407181 (-)
LOC120563650 NA coding downstream 517919 5243915 ~ 5275696 (-)
LOC120563200 LOC103374761 coding downstream 727425 5037606 ~ 5066190 (-)
kif16ba kif16b coding upstream 17601 5813365 ~ 5874875 (-)
LOC120563808 NA coding upstream 91705 5887469 ~ 5892793 (-)
LOC120564640 NA coding upstream 103792 5899556 ~ 5905631 (-)
LOC120563798 NA coding upstream 144082 5939846 ~ 5944002 (-)
LOC120563920 NA coding upstream 163563 5959327 ~ 5964163 (-)
G2076 NA non-coding downstream 101140 5689963 ~ 5692475 (-)
G2070 NA non-coding downstream 169130 5575852 ~ 5624485 (-)
G2064 NA non-coding downstream 286520 5502053 ~ 5507095 (-)
G2056 NA non-coding downstream 334542 5458781 ~ 5459073 (-)
G2047 NA non-coding downstream 377727 5415336 ~ 5415888 (-)
G2105 NA non-coding upstream 7086 5802850 ~ 5807849 (-)
G2118 NA non-coding upstream 73937 5869701 ~ 5870003 (-)
G2122 NA non-coding upstream 86153 5881917 ~ 6023413 (-)
G2126 NA non-coding upstream 115414 5911178 ~ 5912263 (-)
G2137 NA non-coding upstream 266456 6062220 ~ 6063639 (-)
LOC120563692 NA other downstream 56629 5731439 ~ 5736986 (-)
LOC120563672 esf1,LOC108229506 other downstream 293622 5476545 ~ 5499993 (-)
G2010 NA other downstream 440463 5231497 ~ 5353152 (-)
LOC120563591 LOC107656489 other downstream 643196 5148516 ~ 5150419 (-)
LOC120564103 NA other downstream 658310 5114020 ~ 5135305 (-)
G2146 NA other upstream 315375 6111139 ~ 6111592 (-)
LOC120563747 LOC104946033 other upstream 405183 6200947 ~ 6206890 (-)
G2177 NA other upstream 470842 6266606 ~ 6267238 (-)
G2219 NA other upstream 725742 6521506 ~ 6534443 (-)
spred2a spred2 other upstream 744878 6540642 ~ 6581598 (-)

Expression


Co-expression Network