arnt


Basic Information

Item Value
gene id arnt
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 22610018 ~ 22625953 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU100045
tgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatggtcaatgcagaaaacctgcgcgtagtataccggaagtaaacaagaagtagaggtaaacatggcgagacacagcaccacacttttggagcgaggggaaaaccaatttctttattagtgtggtgaaaactatgaatataatgtcttttgttgactgcagaaagtaccgagatagtgagatttataagaaggtgaccgaaaagttattgcagCTTAAGGTTGTCCGCTAACCGTGCGtcaccgtttacgtcgggatattgccaattgattacaaattccatgtatacaggagtaactttctctgctcacgcatgtaaacgggttattccgaatgtttcagaaacccgaatagtgaccttaacccgaccataacccgaaaatttacagcttgtaaacgtagtcaatgtcttcctcctctctccttatTTCTCTTTTATGTTGCCATGGTGACGGGTTGGGTGCTATTTTGTCAGCAGGTGTTTGGTTTTTCTCACTCAACAGTGGTGGGCATGGAAATGGGAATGaggctttttctctctctctttctctgtttcccTGTTCAGGCagttacagcagcagcagcaggccgaGCTAGAGGGAAGTGGAGCCAGAGATGGTCTGTATGAGGCAGGACCAATCACCCTCTCACAGATGTCGGTGCAGCCAGTGACAGCGGCAGTGCCAGACCACAGCAAGAGCCTTGAGAAGCCAGAGCTGTACCCTTCTCTTTTCCAAGGCCCAGATCAGACCAAGGGCCTGCCCTCCACCTCCATTGCCACCACACAGATCTACCCTCCAGCCAATAACTTTGCTGCTAGTCGTTCCAATGATGCATACAGGCCAGTCAACATGACTCCACAGATGGCACAGCCAGCCCACTCAGCAGGGCAGATGCTTGCTCAGATGTCTCGTCAGAATGGAGCCCCCCAGTCAGTTCCCCCCTCTAGCACTGGCAGCCCCCTCCATGGAGGACAAGCAGGAGGATGGCCTGGAGCTGCAGCTGGAGTTAGACCACAGTTTAATAACCAGCAGGTGGCTCCCCAGGCAGCAAAGACCATGTCACCACAGTTTGCTCCCATGGGAGGATTTGGCGGTGGTTCTTCCAGCTCTTTTGGCCAGATGCCTACAGGTGCTGCTCCCACCCCAACCAACAATGCAAACTACCCGCCCATTAATGCACGTGCCAGCCTCAGCACCAATGGTTATGATGGCTCTCAGTCTGGGGCACAGTTCCCCTCTCGCGCAGCGGAGGCAGTGTGGCCCCAGTGGCAAGGCCAGCAGCACTCGCAGAGTAATGGCGAGCAGCATCCTCATGCTCAGGGCAACCAGCAAGACATGTTTCCTGTGAGTGATACAAGTTTTATCTCTCAAGCAATTTAttatccctctctctgtcacttaaAATAtatctctttgtctcttttatttttatttagg
>TU100051
tttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttcttcttcttccttcccctttttccccttctttctcccccccccatGGCTTAAATTGCACTGCCACAAGCCAGTTAAAGATGGAGGGATATATCTGACGGCAGATATAAAGGGGAGGAAAATCAAGGGTTTGCTACTGACTAAAAGATAATTATTTTAACAATATTCAAGCCATTGTAAGTGAATTCTCTAACTAGCACTGCCCAAagctaaagtgtgtgtgtgtatgtatatatatatatatatatatatatatatatataatttattttcttctctctttcttacaCTCTTAAACATACACAGGAAGTAAACACATAGACACCACGGCCTTTTATTCTAATGTTTTTCTCAGGCATTGATGGAAAGTGTATTTTGCTGTTTATTCTTTTAGCATGTAGACTAATCACTCCAATCATTGATTTAAACTCTCAGGAAATTGCAGGGATATACAGCTTTGgtgatttcatttttaattcTCAGCTGTTGCACGCAAACCACCACTGTCTGTGCTAACCTCACTCACAGTTTTAAATCCACAGCATGTCACTGCATGTCAGCACTGCTTTCATGAAGCGCTTCTACAATGTGTAGATTTATACTTACTGAGTACAGTTTTCTATGTACATTGATGGCTTCACTtataaatttaattattttgtctATCCTCTCAAGGAAgatgtgagttttttttcttaattgaaTGATGTCCTTTAACAACAACAGACGCACAATGTTACAATGGCTACATACTGTTGATCTATGTACCCATTGTAAATGTATACAATCTATTTGTCTTTGCCTACAttaacatatatacagtatgcatgtgtgtacgtATGTGAAATGGATGCATACAGTATCATTATCAGCTGTAACACAGTTGTAGGGTTTCTGACTCGCTTGATATTCTTCTTTCTGTCGCCCTGCATTACCCTGTACCAAGTATGGGCTTTTTGTACTCCTTTTGTAAAAGATATCACACAGCAATAATTAACAAGCAGGAATTGTGTACTTTTTAAAGCCATTCTTTATTTGTTGtcataaatgtttttcttgattaatgtTATTTCAAAATGGAGAGGTGTGATAGTAATGTTTgatttaaaggagaattccggacgatctttttttttttttaacctgaatCTTGATTGCTAGATGTCTCCGAGTAGTATCGTTCGGGTGGGAAAAAAACGACcaaaatcggtgctagcaagctggagttgctgcagctaatgcccattgctcccagttagctaaaatgccAGTTCTTGGTGCATAttataaagagtgcctttgtgcctcttaacagacaaaaTGCAATTCAAATTTCTGTGCAACAttaacagggcccttacgtgacaacaagatgcgttttcaactcagacattgtgaagaaacggtttaaaatttaaattgtaCTGTCACCTACCTCTTTTTCCATCGCATTGTTCTTCAGCCGGCCCCGTTGTGTTCCATCTGTGTCGTCATCCTTCTCAAAATGCTCGCTGCAAATGCGGTGATCTTTATCGCGTAGTACTTGTATGGGAGTTTGCACATTTGGTCCTTTTTGGTTTTTTCTTTCCTATCGACTTACTCGGTGACATCTAGCGATCAAGATTCAGATAAAAATCGGctggaattctccttttttAATTGGAAAGTTTCCCaagtattttattgttatttgtgaGACTTGATGATCCCTTGAGCTCTCCATTGCCCTATTCTGTATTTAATTAATGGTTTGATCAGGGTGTTTAAAAGGCTTAAAATGGAATAAACAGAGCTTAAAACAATATGATCTACAagctagaggtgtgaatcttcactgatcttttgattacgattatcatgtcagtgattcgatatctcgatgcatcacaatgcgtcaaatacatttttctattaaagccatataggatatttaattcatagcttttcaaagcttcaaaaacaaaacattctgcagtgctctaatactaaataaattggatacataaaactacagcactgagcacatggcacttcctgaatgtgcaaaacataccagaatatgtaaacagaaatgttgttaggcctacattaaattgtaaacggaaataatcgattatggctcggccgattatcgatgcagcattgTCCATGTctacgattcgatgcatcgattatttgatcaatttcaacacctctactacAAGCGagccccttaaaaaaaaaataaaaagcactcGTTTGTGACAGACATTTAGGTCTTTGTCAACAAGTTCCAATCACCTGTGTTTTACAATCATTTTTGGTAAGTTTGTATTATAGAAGAATGTTGTGGTATGAAAGATAATGTTTCTCAAATATTTCGATTTTTAATATGTGGAATTAGTTTAAATTTGACCCTTTTTATGACAGATCTCCATTGTGTGAAACACTCGCACACTTATGACAAATTATGTAATTATATGTAAACCAATGTTGATAATTGTCCATCTTCAAGGAGATGGTATGTTGGTTAATGTGTTGTCTTTATTGGTTGCTCTGTATCCAGGTTGCTTTTCCAATGATGTGAACTTTTATCACTCatagaaacacaaatatatactgtatatgaaatgTTAAACCAGAGAAagaaatgtttggtttttgtattAAATTGTTGAAAGTGCA
>TU100052
tgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatggtcaatgcagaaaacctgcgcgtagtataccggaagtaaacaagaagtagaggtaaacatggcgagacacagcaccacacttttggagcgaggggaaaaccaatttctttattagtgtggtgaaaactatgaatataatgtcttttgttgactgcagaaagtaccgagatagtgagatttataagaaggtgaccgaaaagttattgcagCTTAAGGTTGTCCGCTAACCGTGCGtcaccgtttacgtcgggatattgccaattgattacaaattccatgtatacaggagtaactttctctgctcacgcatgtaaacgggttattccgaatgtttcagaaacccgaatagtgaccttaacccgaccataacccgaaaatttacagcttgtaaacgtagtcaatgtcttcctcctctctccttatTTCTCTTTTATGTTGCCATGGTGACGGGTTGGGTGCTATTTTGTCAGCAGGTGTTTGGTTTTTCTCACTCAACAGTGGTGGGCATGGAAATGGGAATGaggctttttctctctctctttctctgtttcccTGTTCAGGCagttacagcagcagcagcaggccgaGCTAGAGGGAAGTGGAGCCAGAGATGGTCTGTATGAGGCAGGACCAATCACCCTCTCACAGATGTCGGTGCAGCCAGTGACAGCGGCAGTGCCAGACCACAGCAAGAGCCTTGAGAAGCCAGAGCTGTACCCTTCTCTTTTCCAAGGCCCAGATCAGACCAAGGGCCTGCCCTCCACCTCCATTGCCACCACACAGATCTACCCTCCAGCCAATAACTTTGCTGCTAGTCGTTCCAATGATGCATACAGGCCAGTCAACATGACTCCACAGATGGCACAGCCAGCCCACTCAGCAGGGCAGATGCTTGCTCAGATGTCTCGTCAGAATGGAGCCCCCCAGTCAGTTCCCCCCTCTAGCACTGGCAGCCCCCTCCATGGAGGACAAGCAGGAGGATGGCCTGGAGCTGCAGCTGGAGTTAGACCACAGTTTAATAACCAGGTGGCTCCCCAGGCAGCAAAGACCATGTCACCACAGTTTGCTCCCATGGGAGGATTTGGCGGTGGTTCTTCCAGCTCTTTTGGCCAGATGCCTACAGGTGCTGCTCCCACCCCAACCAACAATGCAAACTACCCGCCCATTAATGCACGTGCCAGCCTCAGCACCAATGGTTATGATGGCTCTCAGTCTGGGGCACAGTTCCCCTCTCGCGCAGCGGAGGCAGTGTGGCCCCAGTGGCAAGGCCAGCAGCACTCGCAGAGTAATGGCGAGCAGCATCCTCATGCTCAGGGCAACCAGCAAGACATGTTTCCTGTGAGTGATACAAGTTTTATCTCTCAAGCAATTTAttatccctctctctgtcacttaaAATAtatctctttgtctcttttatttttatttagg
>XM_039805306.1
CAAGAAAACAGTGTAGACCCAGACAGCTCTAGACTGAAACGAAACGCCATCTTGAATATAAAAGGGGGTTTAAACCgggagaaaacagaaaaaggggTCATTGGATTAGATAAACTGTTATTTTTGTCTGTGTCTAAATCCTCCCGGGTTTCCCTTGAACAGTTCTAGTTATGTCTTTGGGCGTTTATAACAAAATTAAGGCGCATACGTGAGGAAATCGACAAGGCGCTTGTTAGCCTCTACCCAGCTAGcaagggggaggagaggggctTGAGGGTTATTTTTTTTCCGCAGCCGaagttgttttgtttatgttattCCAAACGGACATGTCCTCTTCAAACTCAGAGTTACCAGACCCAAATCTGGGTATGGGGGCAAGCGGGACCCAAGGAAGTGGCAGTGCTGTTGTACCAAAAGGGAACAAAAGAAGAGCTGCGCCAGACTTTGATGACGATGATGACGATGAAGGAAACAAGTTGTTCAGGTGTGACGATGAAACAGGAGGCGGTAATGACAAAGAGCGCTTTGCCAGGTTTTTGGAAGAAGATCAGAGTTGTGCAGATAAGGAAAAACAAGCCAGGGAGAACCACAGTGAGATTGAGAGGCGGAGGCGGAACAAGATGACTGCCTACATCACAGAATTGTCGGACATGGTGCCCACCTGCAGTGCACTAGCACGGAAACCAGACAAACTAACCATCCTGCGAATGGCCGTGTCCCATATGAAGTCTCTGAGAGGAAGTGGCAATACCAACTCAGATGGGTCATACAAACCTTCCTTTCTCACTGACCAGGAACTGAAGCACCTCATCCTGGAAGCAGCGGACGGCTTCCTGTTCGTGGTGTCATGTGAGACTGGCCGCATTGTTTACGTCTCTGACTCCCTGACACCCGTCCTCAACCAGGCCCAGTCTGAATGGCTCGGCTCCTCCCTTTATGATCAGCTTCACCCAGATGACACAGAAAAGCTCAGAGAGCAGCTCTCTACTGCTGAGAATAACAACACGGGGAGGATGTTGGACTTGAAGACGGGAACAGTGAAAAAGGAAGGCCAGCAGTCGTCAGCCAGAATGAGTATGGGAGCCCGTCGATCATTCATTTGCAGAATGAGgTGTGGCTCTTGTCCCGTGGAACCGTTGTCCATGAACAGACTGAACTTCCTTAAGAATAGAAACAGGAATGGTTTGGGTACAGCCAAGGAAGGGGAGCCCCAGTATGTTGTGGTCCACTGTACAGGATACATCAAGTCCTGGCCCCCTTCAGGAGTATCTTTAACAGACGATGAATCGGAAAACACTCGGGGGAATCGCTACTGTCTGGTTGCAATTGGGAGATTACAGGTGACTTGTTGCCCAGGTGACACAGACATCAACAGTATCAGTGTTCCAGTGGAGTTCATCTCACGCCATAACTGCCAGGGCATGTTCACCTTCGTAGACCACCGCTGCGTGGCTGCTGTCGACTACCAGCCCCAGGAATTATTGGGGAAAAATATTCTCGAGCTTGCCCACCCTGAAGACCAGGGCTTACTGAGAGACAGCTTCCAACAGGTGGTGAAGCTGAAGGGGCAGGTTCTGTCAGTGAGAaaagttggctttttctctctctctttctctgtttcccTGTTCAGGCagttacagcagcagcagcaggccgaGCTAGAGGGAAGTGGAGCCAGAGATGGTCTGTATGAGGCAGGACCAATCACCCTCTCACAGATGTCGGTGCAGCCAGTGACAGCGGCAGTGCCAGACCACAGCAAGAGCCTTGAGAAGCCAGAGCTGTACCCTTCTCTTTTCCAAGGCCCAGATCAGACCAAGGGCCTGCCCTCCACCTCCATTGCCACCACACAGATCTACCCTCCAGCCAATAACTTTGCTGCTAGTCGTTCCAATGATGCATACAGGCCAGTCAACATGACTCCACAGATGGCACAGCCAGCCCACTCAGCAGGGCAGATGCTTGCTCAGATGTCTCGTCAGAATGGAGCCCCCCAGTCAGTTCCCCCCTCTAGCACTGGCAGCCCCCTCCATGGAGGACAAGCAGGAGGATGGCCTGGAGCTGCAGCTGGAGTTAGACCACAGTTTAATAACCAGCAGGTGGCTCCCCAGGCAGCAAAGACCATGTCACCACAGTTTGCTCCCATGGGAGGATTTGGCGGTGGTTCTTCCAGCTCTTTTGGCCAGATGCCTACAGGTGCTGCTCCCACCCCAACCAACAATGCAAACTACCCGCCCATTAATGCACGTGCCAGCCTCAGCACCAATGGTTATGATGGCTCTCAGTCTGGGGCACAGTTCCCCTCTCGCGCAGCGGAGGCAGTGTGGCCCCAGTGGCAAGGCCAGCAGCACTCGCAGAGTAATGGCGAGCAGCATCCTCATGCTCAGGGCAACCAGCAAGACATGTTTCCTGTGAGTGATACAAGTTTTATCTCTCAAGCAATTTAttatccctctctctgtcacttaaAATAtatctctttgtctcttttattttta

Function

NR:

description
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU100045 False 1918 TUCP 0.44 5 22616972 22623084
TU100051 True 2710 lncRNA 0.35 2 22623215 22625953
TU100052 False 1915 TUCP 0.44 5 22616972 22623084
XM_039805306.1 False 2501 mRNA 0.51 19 22610018 22623078

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cers2b cers2,LOC108241136,LOC102789054,LOC101467232,LOC102212238 coding upstream 3090 22589127 ~ 22606928 (+)
adamtsl4 LOC104944899,LOC101074756,LOC106573456 coding upstream 53726 22519118 ~ 22556292 (+)
tars2 NA coding upstream 103521 22490753 ~ 22506497 (+)
prpf3 prpf3 coding upstream 140236 22461131 ~ 22469782 (+)
LOC120562192 LOC104934671 coding upstream 154296 22448519 ~ 22455722 (+)
LOC120561960 NA coding downstream 1394 22627347 ~ 22627532 (+)
setdb1b setdb1 coding downstream 3664 22629617 ~ 22643078 (+)
LOC120561656 NA coding downstream 17393 22643346 ~ 22651387 (+)
clk2b LOC104944907,LOC101465036,LOC102211389,LOC100710865,LOC102298503,LOC102787711 coding downstream 25685 22651638 ~ 22657098 (+)
LOC120562535 LOC103478110,LOC102236274,LOC103136813,LOC106922010,LOC106957061,LOC107088793 coding downstream 41963 22667916 ~ 22674134 (+)
G74769 NA non-coding upstream 354540 22255271 ~ 22255478 (+)
G74765 NA non-coding upstream 364255 22245489 ~ 22245763 (+)
G74764 NA non-coding upstream 366985 22242817 ~ 22243033 (+)
G74760 NA non-coding upstream 425981 22183783 ~ 22184037 (+)
G74737 NA non-coding upstream 480104 22129652 ~ 22129914 (+)
G75042 NA non-coding downstream 292799 22918752 ~ 22920103 (+)
G75045 NA non-coding downstream 298639 22924592 ~ 22925155 (+)
G75065 NA non-coding downstream 356939 22982892 ~ 22987322 (+)
G75069 NA non-coding downstream 368467 22994420 ~ 22994706 (+)
G75077 LOC104960445 non-coding downstream 390854 23016807 ~ 23018595 (+)
celf3b LOC104944900,LOC100708447,LOC107088821,LOC107379582 other upstream 24446 22559944 ~ 22585572 (+)
rprd2b NA other upstream 120074 22469978 ~ 22489944 (+)
rusc1 LOC104958857 other upstream 297498 22264939 ~ 22312520 (+)
fam189b fam189b,LOC102796117 other upstream 321724 22279556 ~ 22288294 (+)
kcnn3 kcnn3,LOC104958859,LOC106930148,LOC106962094 other upstream 361491 22197712 ~ 22248527 (+)
LOC120562537 NA other downstream 34526 22660479 ~ 22667885 (+)
LOC120562539 LOC102295960,LOC100711672,LOC102209551,LOC101487210,LOC102786116 other downstream 63117 22689070 ~ 22705416 (+)
myh14 NA other downstream 159625 22785578 ~ 22820053 (+)
cnot3a cnot3 other downstream 274136 22900089 ~ 22911520 (+)
LOC120562293 LOC103360151,LOC102310947,LOC102785150 other downstream 444634 23070587 ~ 23083147 (+)

Expression


Co-expression Network