dedd1 (dedd2)



Basic Information


Item Value
gene id dedd1
gene name dedd2
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 24520735 ~ 24534276 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU101229
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>TU101237
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>TU101238
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AGGCGGAGGGCTGTAATTGGTcagtttttcagtgtttttgtgcTACTGCCCGTACGGAACTGCACGGGAGTCGCCCAGACCATCCAACGCTAATGACTAGGAAGGAACCTCTATGCTAGGAACGTTAGTTTTCAGACATAATTACGTAACGTGCCAAGGGGTAATTTGCCGACGTTTGCTGCTTCGTGTTGGAGGAACGCCTTGTCTCTTTGGATTCCAGCTGATTTGAAACGAAGACAACGAAGCACAGTCCTAGCTGACAAAAGTTTGCATTGCATGTTTCAAGACCGCGTCTAGCTAAAACCAAAAACAGTTTAACACAGGTGGTAAGGTGGAGAGGGGCTATAGGCAGACCCATGGCCGCCGTGCATTACCCAGAGTGCCCACTCAGGGACTCACTTTACTGGGATGAAACAGAGTGCCTAAACTACTATGGGATGTTGTCTCTCCATGAGGTCTTTGACGTAGTTGGTTGTCAGCTGACAGAGACTGACATTGACGTGTTGTCATTCCTTCTGGATGAAACCTGTCCTGCACCACACCCCCTTGACCCAACAGGTTGGACAGTTGAGCCCTGTGGCAGCGATCCAGATGACTTGGGCGTGTCCCCGAGTCCTGAGCTGCTAAAAGCCTGGATGCGATTGAAGCCTCAGGGCTCCCAGCATCACTTAGTGGCCTCATATAAGCCCAAGAGTGGCCTTGAGCTATTGTTGGAGCTGGAGAGGCGAGGATACCTTAGTGATGGCAACCTGGAGCCACTGCTGCAACTACTGAGAGTCCTCACTCGCCATGACCTGCTGCCTTTAGTGTCCCACAAAAGGAGGAGGACAGtatCTCCAGAGCGAGTTGGACAGAGGTATGGAGTAGAGAACAGAGAGTTGGTGTGCGCCTCTGGAATGCAACAtaactgcagacagacagaaataccTCTTCCATATTTCACACAGCAATCGAGAATTGGTATTTACCCTCCTATGCCTGGGCCATCtgcaaggaggaggaagaagaggggaaATGGCTGGAGCCGCAAGCCCAAGAAAACTAGCAGACAGGGCCCGCCACTGCCTCCTCTACCACTACCACATAAAGCGTCCTGCAATATCCGCCTGCGTGTCCGGGCCGAATACCTGGAGCATGACTCGGCACTCCGTGAGGGTGTCTCATCGGACAAACGGCAGCCCCTGGAGCGACAGTTTGAATTGTTCAGCCAGGCCAACTCCCTGCTTCGTTCCAGAGACCTGGGTTCCATTGTCTGCGACATCAAGTTCACAGAGCTGGACAACCTGGAGGCCTTCTGGAGTGACTACCTAAGCGGAGCTCTGCTGGAGGCCCTGAAGGGAGTCTTCATCACTGACTCCCTGAGGATGGCAGCAGGCACTGAGGGCGTCCGTCTGCTGATCAGTGTGGATCAGGATGACTACGAGGAGGGCCGAATGCTGCTGAGAGCTAGGAGAATGTTTTCATCTAGTAATGGTGGGCGCACAGAGACTCGCTGGGCTGTATAGGCTGATAAGACTCTTTGGGGTGTATTGTATTAGCTTTGATAAATTGAAAAGTAGGGAATGCTGCGAATTTGTAAGCATTTTACAGGCCTCCTTCTGCAAGTTGCAATCCATGTGttaaccactagatggcagctcttaccatttgttgtttgtgttcatAACTGGCCTTACATTTTCagaattatcattattattttgttgaaaCATTACCattatttgtgaaagaacatgGAATAATAATGAATCAATGTGCTTTCCCTTGGGATCCATGCACAGGTGCTACTTTGTAGGACACCAGGATGAAACACGATGTATCAAGATTGTTCTTAGTCTCAGTAAGAACAGGAGAAAGCAAGCCAGTGCCAAAAGATCAAGTGGTAAGCCCctcattacattattaatcttAAATAAGGTTAAGACAACTGATGTgccacaaataataaaaaaaaacataacctaCATACTGTTGACAGTCAAATGCTCACGGTCAAGGTTGAGACTACGCACGTACATGCATGTACACAAATTAAATGGGCCACAATGATACCAAACTTGTAATCAAGTGTTTGCTGCCCATTTTTTCCACATTTATGCATAGACCGTGGGCATTCAGATTCCAAGATGGCTCTAAATTCTCTTGGTTTTGGACTTGAATGATAATGTTAACTGGcacttttctttaattaaacTAATTTCAAGGACAAAGAAACATGCCAAAAAAGTTTCTGATCTTTAAAAATGTGTGAGAACTGAGCACAGATGGAAAAGCAGGCTGCTCTCAGTACAGATTGATCTTTGTGTTCAACTTTGGAGAGCGGAGCCCACGCATATACACCTAGATAACAAACCTGGGATCCTCAGCCCATGTGTGCCACGATAACTCGACTTGCGATTGCCGTGGTCAGTGGATACGGCAGTTGCCAGTAGATGACAGCAGTGATTAGGGCTAGGCCTCAGCGGACCATGGAAGACTCATCATCCCAAGCTTGTCAACAGCAACTCGGATAATGTAATGGTGGCTTGTGACCGGGCTTCAAGCTAGGCCTCAGCAAGTGCTTCTCTCAGCAAGTAAAGCACAGGACAGTGCGTCGGTCAATAGAAGTGATGTTGGGGAGATCAAAATCAAAAGTGCACATCCCAGCTCCACTCAGCCCTGCTATGTAGGCCCAGTAGAGTGGCTCACGGACAGCTGTCTACTCACCCTGCTGGAACTAATGCCTGGACTTCACTCATAGAAGACGATCAATAAGGCCCCTCCTCCAAGTCCCTTCATGCAGGCACGACTTAAGCAGGCAGTCTTGCTACTGTCTGAGTGCAGGGCAAGGCAGAGGACAATGGACATATTTCCATGTTTActttagtgtgtttttgatCTTGCATTTGTTCTATGTGTGATTGTATTAGTCatagaagataaaaaaaaatacttaaaaaataataattcaggggaacatttttgttaaagaaaaacatttgtttGGTATGCCAATTCTTTTTGTTGAAATctttatatatgatatatttgGTGAATAATAAAGGTTTGATGGCCTAAAGA
>XM_039805272.1
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Function


symbol description
dedd2 Predicted to enable DNA binding activity. Involved in apoptotic nuclear changes; extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; and positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway. Located in nucleolus and nucleoplasm.

NR:

description
PREDICTED: DNA-binding death effector domain-containing protein 2 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU101237 False 6213 lncRNA 0.42 8 24520765 24534169
TU101238 False 6007 lncRNA 0.42 8 24520765 24534169
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XM_039805272.1 False 2752 mRNA 0.47 7 24520735 24534276

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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si:ch73-22o12.1 nectin2,LOC103370823 coding upstream 54717 24387915 ~ 24466018 (+)
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ino80e ino80e,LOC102775861 coding upstream 174791 24342037 ~ 24345944 (+)
si:dkeyp-77h1.4 NA coding upstream 185034 24321302 ~ 24335701 (+)
pou2f2a pou2f2 coding downstream 25789 24560065 ~ 24598707 (+)
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cicb cic,LOC102793300 coding downstream 155024 24689300 ~ 24729988 (+)
gsk3ab gsk3a,LOC103362704 coding downstream 203255 24737531 ~ 24767436 (+)
znf574 LOC103362705 coding downstream 237233 24771509 ~ 24791556 (+)
LOC120562289 NA non-coding upstream 31893 24468834 ~ 24488842 (+)
G75622 flot1,LOC108235422 non-coding upstream 224012 24295838 ~ 24296723 (+)
G75611 NA non-coding upstream 304166 24216140 ~ 24216569 (+)
G75583 NA non-coding upstream 395654 24122027 ~ 24125081 (+)
G75582 gnb3,LOC103375278 non-coding upstream 398726 24119317 ~ 24122009 (+)
G75798 NA non-coding downstream 265965 24800241 ~ 24804853 (+)
G75803 NA non-coding downstream 288750 24823026 ~ 24824765 (+)
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G75942 NA non-coding downstream 609782 25144058 ~ 25144274 (+)
G75644 NA other upstream 83916 24435139 ~ 24436819 (+)
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atn1 atn1 other upstream 481308 24026915 ~ 24039427 (+)
LOC120563047 vamp1,LOC104928996 other upstream 641320 23873909 ~ 23879415 (+)
LOC120563204 NA other upstream 707327 23768233 ~ 23813408 (+)
grik5 grik5 other downstream 272013 24806289 ~ 24885373 (+)
LOC120561858 NA other downstream 380978 24915254 ~ 24996309 (+)
LOC120561674 LOC104943405,LOC103477911,LOC108235491,LOC108235490,LOC102233864,LOC107379681 other downstream 839931 25374207 ~ 25380798 (+)
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apoc2 NA other downstream 968324 25502600 ~ 25504052 (+)

Expression



Co-expression Network