G78603


Basic Information

Item Value
gene id G78603
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 35528475 ~ 35531724 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU105092
GGTTTTTAGAAATGTacttttattgctttttatctattctatttTCCATGTTAACTTAGTTACAAACCAAAAAAAGTAGCAATGATCTTTTAACCTTTTCACTAGTTTTATAATacagatttttgttgttgttgttgtttaactTTTCAAGCGTTTGCTAACCGTTCGCGGCCTCGGTGCTCTGAAACGGTGGACGGTCTAATGTTTAATACGTCTGCTGTTGGGAGAGTATAGACCCCGGGCCGAATCGCCACACTGCAATCTGTCCATCTGACAGTTGGACTGAGTCCGAATGGATGCACATTTCTGTcaggaaaagaaaataatggACGAAATGTTGGGAATGAGgacactttttcttttaaaaacacgCCAAGTGAGTCAAAATTACGAGATGGAAAGTCAAAAATATTACTTTTAAAAGTCTAAATAATGAGGTAATGGTATTTATCTCATCATGACAACTTCTCAACTTATAATTGTCACATTTAAAGGCCAAAAAGTTCACTCGCTATCTCAGGATTTTGACTTACtcaaactacacacacatttcacaaaTTTCGACTCCCAAAATTTGAATTACTGCATCAACTTTTGGGTATCAAGGACGTTAAAACGAGTCAGATTTTTACCTTCTCTCAAACATTAAGCCTTCACATCTCATAATTTTGACTTACTgtgagtgttgttttttttttattattattattcctgaCTTTTCACACATTACTTTCTTTTCTCGGCATGAATGGACTTCCATACCGAATCTCATGTTGAAACTTTAAATCATAATCTATCCAAGGATGTGTTGAAAATCCGCTCGAAATGTTATCAAATGATCTCAGAACAGGAGAAAAAGGCTCGACCTTCATATTTGGTCGACTTATTCCAGAATAATCCGTCCTCGGTGATTTTCGGAGTCGATTTTTATTGAGTCAAACGTTAAAAACGAGCAGAAtgaaggctgttttatgctacTGCGTCGTGACCTTTTCGGAGTTCTGCGTCGAGGGTTGAACGTGATTTGCGATTGCGGGGTGTCTGCCggccagtttatgttatgttggCAAGCTAACTTTAGCGCAACTGCCCACAAAGTGctgcttgctggcgaagtgctaatttcaaaaaGCTACTGACATTTTGTAACCAcaatatgtctgagtttatttgcggagctgatgtcagtgaactagcatgttgctactcgcCACAGTTAGGCTGCTTGAAGACTAccaacacacaggaccagttgaccaattgcagtccttgcggtctgcgtcgcctcgacgcaaagtgacacatttttggaggtgcacgtGGAGCTACGGCGGAGGGCTCGGAGGGGGGGTTCTCGTCAGGGCCGGTCCGAGGCTTTtggggggccctaagcaggatttggtttgggggactctccacattgtaacatgcTGCCGCTGCATttggcactaaaccaacttgtgtattgtaaatattagtttaagcactcatatTGTGGAAATAAGAgagacctattagcagcaacGCTATCTTTAtatagaccggctctgttatgagctctattgtgggacatttcaagcgctcttgggggGGCCCCCTCTGGTAGCCCcggggccctaagcagccgcttagttcgcttatgggtCGGGCCGGCTCTGGTTCTCGTCGACGCAGAGGGGTCCGCTGGGGAACGCCGTTGATTCAACGCGGTTGATTGACGCCGAAGCGTAAAACAGCCTTTTTTAGTGAAGCGATTTTATAAAGAAGTTCAGGAAGTGGATCCTGTTTTGAAGATGCACAAAATATATACACTTGTGTAGTACAAACACGCAAGAGAAAAGTTTTTAAAGCTCGGTACAGACCCAGCTGTGGCGGAGACTGTTTGCAGCGTGGTTCCTGAAGCGCCGTCTGACTTGAGTTTGTCTCGGTGGTCTCCGTGGCGATGGGACAGCAGCATCATCAACGTCCGTACGGTTAGATGTAAACGATCGTATAGTTGAGTGGTTCTCTCTGGTGTATTTATGCTTCGGTCTTATTGCtcaaatgtctctctctctctatctatctatctatctatctatctctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctatctctatctctatctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctatctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgctatgGAGCTTTGTAATCATAGCCAATGTTATTTGGTTTTTAAAAGGCAAACTTAAAAGACAGAAGGGATCGGAGGAGACGAACATGCTGATCGGTCTCCTCCGGCTGTCAggtgccttttttttctttcttttatttctcaGTTCATCTCTCCATCATCAAACTAACAGGGatttgtaatgtttttgttCAATGCCTTTTGAAAATTTGTGGATCTCGTGCCTTCCAGgtttaaatgttgaaatgacaatgcATCAATGAAGAACTtgaactcccctttttttttttttttttttttttttcttacgtCCTGAGTGGACATAATCtatcatttttaaaaacacacacacacacatacacacacacacagacacacacacaaaaacggaCATCAGAAACCAACTATGCACCACTCGGAGGAAGCTTGTTTGCTCCGCCCGCCCGCCAAGCATTTTATAATGACTCAACAAACCAGACAGAATGATGTAGCAAAACCTCTTTTCtccttgtttatttaaaaaagttaaaaaaagaaaagtgtgaaGAATATCTGtggcatttttgtttttcaccatgtttttcttttttgttttgttttgttgcttttatttgTGTAGTTTACTGGAATAATACAGCACTTtgccaaaaaggaaaaaaaaggttgtaggACTTTTTAGggttatctttttatttatcgACATAACTGGTCTCCATCTTTGTATTTTGGGATGTGTGACAGATCAATTCACTCTGTTCTGATGTCAACAAAAAAGCTAATTAAAAAGTGGGGTCATCTGTCTTCAGACTGTAATAGTTAATACATGTGATCTCTCTCTCATTAGCCTATAATAA
>TU105094
GGTTTTTAGAAATGTacttttattgctttttatctattctatttTCCATGTTAACTTAGTTACAAACCAAAAAAAGTAGCAATGATCTTTTAACCTTTTCACTAGTTTTATAATacagatttttgttgttgttgttgtttaactTTTCAAGCGTTTGCTAACCGTTCGCGGCCTCGGTGCTCTGAAACGGTGGACGGTCTAATGTTTAATACGTCTGCTGTTGGGAGAGTATAGACCCCGGGCCGAATCGCCACACTGCAATCTGTCCATCTGACAGTTGGACTGAGTCCGAATGGATGCACATTTCTGTcaggaaaagaaaataatggACGAAATGTTGGGAATGAGgacactttttcttttaaaaacacgCCAAGTGAGTCAAAATTACGAGATGGAAAGTCAAAAATATTACTTTTAAAAGTCTAAATAATGAGGTAATGGTATTTATCTCATCATGACAACTTCTCAACTTATAATTGTCACATTTAAAGGCCAAAAAGTTCACTCGCTATCTCAGGATTTTGACTTACtcaaactacacacacatttcacaaaTTTCGACTCCCAAAATTTGAATTACTGCATCAACTTTTGGGTATCAAGGACGTTAAAACGAGTCAGATTTTTACCTTCTCTCAAACATTAAGCCTTCACATCTCATAATTTTGACTTACTgtgagtgttgttttttttttattattattattcctgaCTTTTCACACATTACTTTCTTTTCTCGGCATGAATGGACTTCCATACCGAATCTCATGTTGAAACTTTAAATCATAATCTATCCAAGGATGTGTTGAAAATCCGCTCGAAATGTTATCAAATGATCTCAGAACAGGAGAAAAAGGCTCGACCTTCATATTTGGTCGACTTATTCCAGAATAATCCGTCCTCGGTGATTTTCGGAGTCGATTTTTATTGAGTCAAACGTTAAAAACGAGCAGAAtgaaggctgttttatgctacTGCGTCGTGACCTTTTCGGAGTTCTGCGTCGAGGGTTGAACGTGATTTGCGATTGCGGGGTGTCTGCCggccagtttatgttatgttggCAAGCTAACTTTAGCGCAACTGCCCACAAAGTGctgcttgctggcgaagtgctaatttcaaaaaGCTACTGACATTTTGTAACCAcaatatgtctgagtttatttgcggagctgatgtcagtgaactagcatgttgctactcgcCACAGTTAGGCTGCTTGAAGACTAccaacacacaggaccagttgaccaattgcagtccttgcggtctgcgtcgcctcgacgcaaagtgacacatttttggaggtgcacgtGGAGCTACGGCGGAGGGCTCGGAGGGGGGGTTCTCGTCAGGGCCGGTCCGAGGCTTTtggggggccctaagcaggatttggtttgggggactctccacattgtaacatgcTGCCGCTGCATttggcactaaaccaacttgtgtattgtaaatattagtttaagcactcatatTGTGGAAATAAGAgagacctattagcagcaacGCTATCTTTAtatagaccggctctgttatgagctctattgtgggacatttcaagcgctcttgggggGGCCCCCTCTGGTAGCCCcggggccctaagcagccgcttagttcgcttatgggtCGGGCCGGCTCTGGTTCTCGTCGACGCAGAGGGGTCCGCTGGGGAACGCCGTTGATTCAACGCGGTTGATTGACGCCGAAGCGTAAAACAGCCTTTTTTAGTGAAGCGATTTTATAAAGAAGTTCAGGAAGTGGATCCTGTTTTGAAGATGCACAAAATATATACACTTGTGTAGTACAAACACGCAAGAGAAAAGTTTTTAAAGCTCGGTACAGACCCAGCTGTGGCGGAGACTGTTTGCAGCGTGGTTCCTGAAGCGCCGTCTGACTTGAGTTTGTCTCGGTGGTCTCCGTGGCGATGGGACAGCAGCATCATCAACGTCCGTACGGTTAGATGTAAACGATCGTATAGTTGAGTGGTTCTCTCTGGTGTATTTATGCTTCGGTCTTATTGCtcaaatgtctctctctctctatctatctatctatctatctatctctctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctctgtctctctctatctctatctctatctctctctctctctctctctctctctctctgtttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctatctctctctctctctctctctctctctctctctgctatgGAGCTTTGTAATCATAGCCAATGTTATTTGGTTTTTAAAAGGCAAACTTAAAAGACAGAAGGGATCGGAGGAGACGAACATGCTGATCGGTCTCCTCCGGCTGTCAggtgccttttttttctttcttttatttctcaGTTCATCTCTCCATCATCAAACTAACAGGGatttgtaatgtttttgttCAATGCCTTTTGAAAATTTGTGGATCTCGTGCCTTCCAGgtttaaatgttgaaatgacaatgcATCAATGAAGAACTtgaactcccctttttttttttttttttttttttttcttacgtCCTGAGTGGACATAATCtatcatttttaaaaacacacacacacacatacacacacacacagacacacacacaaaaacggaCATCAGAAACCAACTATGCACCACTCGGAGGAAGCTTGTTTGCTCCGCCCGCCCGCCAAGCATTTTATAATGACTCAACAAACCAGACAGAATGATGTAGCAAAACCTCTTTTCtccttgtttatttaaaaaagttaaaaaaagaaaagtgtgaaGAATATCTGtggcatttttgtttttcaccatgtttttcttttttgttttgttttgttgcttttatttgTGTAGTTTACTGGAATAATACAGCACTTtgccaaaaaggaaaaaaaaggttgtaggACTTTTTAGggttatctttttatttatcgACATAACTGGTCTCCATCTTTGTATTTTGGGATGTGTGACAGATCAATTCACTCTGTTCTGATGTCAACAAAAAAGCTAATTAAAAAGTGGGGTCATCTGTCTTCAGACTGTAATAGTTAATACATGTGATCTCTCTCTCATTAGCCTATAATAA

Function

NR:

description
PREDICTED: isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105092 True 3160 lncRNA 0.41 3 35528475 35531724
TU105094 False 3112 lncRNA 0.41 2 35528475 35531724

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tp53inp1 NA coding upstream 466 35508333 ~ 35528009 (+)
nagpa NA coding upstream 38998 35448568 ~ 35489477 (+)
LOC120561699 LOC102800167,LOC102194503,LOC101481262,LOC104936483,LOC103358273 coding upstream 165954 35357254 ~ 35362521 (+)
wdr73 csgr05h8orf37 coding upstream 298163 35208147 ~ 35230312 (+)
c7h8orf37 csgr05h8orf37,LOC103366206 coding upstream 327081 35188683 ~ 35201394 (+)
ccne2 LOC103358269 coding downstream 3323 35535047 ~ 35546748 (+)
LOC120562274 NA coding downstream 90036 35621760 ~ 35630081 (+)
LOC120562277 NA coding downstream 317749 35849473 ~ 35856736 (+)
LOC120562454 NA coding downstream 343403 35875127 ~ 35883935 (+)
LOC120562276 NA coding downstream 364626 35896350 ~ 35900892 (+)
G78607 NA non-coding upstream 29737 35498360 ~ 35498738 (+)
G78592 NA non-coding upstream 134876 35393133 ~ 35393599 (+)
G78588 NA non-coding upstream 138592 35389515 ~ 35389883 (+)
G78551 NA non-coding upstream 171990 35356023 ~ 35356485 (+)
G78549 NA non-coding upstream 175660 35351591 ~ 35352815 (+)
G78645 NA non-coding downstream 43448 35575172 ~ 35577811 (+)
G78653 NA non-coding downstream 111182 35642906 ~ 35643353 (+)
G78655 NA non-coding downstream 116806 35648530 ~ 35691645 (+)
G78662 NA non-coding downstream 186228 35717952 ~ 35718951 (+)
G78669 NA non-coding downstream 243548 35775272 ~ 35813607 (+)
G78594 NA other upstream 119793 35405375 ~ 35408682 (+)
LOC120562567 NA other upstream 671943 34839157 ~ 34856532 (+)
G78200 NA other upstream 984096 34529355 ~ 34544379 (+)
sh3bp5b sh3bp5,LOC102783023 other upstream 1485827 33990542 ~ 34042648 (+)
LOC120562157 NA other upstream 1624190 33894360 ~ 33904285 (+)
LOC120562275 NA other downstream 211571 35743295 ~ 35773988 (+)
LOC120562279 NA other downstream 334118 35865842 ~ 35888172 (+)
G78759 NA other downstream 579127 36110851 ~ 36190839 (+)
G78772 NA other downstream 726436 36258160 ~ 36350995 (+)
LOC120563181 LOC107378893,LOC103370072 other downstream 860528 36392252 ~ 36465230 (+)

Expression


Co-expression Network