G78759


Basic Information

Item Value
gene id G78759
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 36110851 ~ 36190839 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU105332
TTCAGAGGGTGAAAGTGAAGGTGTTTACTGCGGAAATTAATTTCTATCTGCGTCAGTGTGTTCTAACAGCGACAGGTCGAGGTGTTGATCTGAAGACTGACCGATGTTCTAAAGTCAAGAAGATGGGAGGATCTGCGTCTACAAGTGACCGTTCAATGGCTCAAGGGTCTGATATTTCCTGTGGAATTCCTCCAAACTTTAACACTGGACCTAGACCTTCACAAACACGTGACCAGTCTACTTCAAGCAATCAGAAGAACCAGAACACCCTGATGGTGATTCAATCTCCACATGAGAACAGGAACACATTGGAAGAATCAGCGACATTTCGTCCAAACTTCTGAACCCAACCTTTATCAAACAAGATTCACTGAAGTCAAGAAGATGAATAAATCTCAGAGAGGATCAGCGTCTTCAAATGTCAGTTTAATTCAACATTGAACATGAAGTGAGACAAATTGAAACAGTGTTTAACAGACATGAGGAGGACATCTTCAAGGCCAAACACTAACATGTTGTTATGGATTCATTAAAAGTAACCTAAAAGTATAATTGGCTG
>TU105334
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>TU105341
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>TU105342
CTACTAGACCATCCTCAAAATAAGTAAATTGTAGCACACCTTAGgcaattttaacaaaataaaatgtaacttcCCACAATATTGTGGCTAGTGGAAATGCTGGGTGGCCAGTAACTTTGGAAAACCACAGTGGCTGCTGAGCAAAAGAAGTTGAGGTCAAGCCCCGTTTAAACATGATAAATTAATCTATTATCAAAATATGCAAATTCCCTGTTGATTTGCTGCAGTTATCATTGCAGGAATCCTGTGTATTTATCGACCTGTAATTTATATAATATAGTTTTATAGACATCACTTTATACCTGCATCGGTCTATTCactgttttgtttgtctgtgcatAAACACTAACATAACCTAAAAGTATAACTGGCTGAGCTTTGTCTTTTGCACATTTCACATCCTCCTGATTCTATTTTTTTAAGGTAATTTCTTCCCAAAACGTGTTTGTATTTGGTGAATTTGAAACCCTGTGCAGTTCTttgtgattttttgttttttagatgtATATGATACtttaattgtgatattgatTATTTCTTTAAGGTTTATCGCTATCAGTATGATTTTGGGGAAACTGGTTTACTCAGACATGTTCATGTTTGCTGCAGCCACGACAACTAAAGACCCTACGTGTTTAAAATCTAACCGTGATTCAGGGAAGTTCCTCCTCTGGCTCTAAAACAGCAGCACGGCCTCTTGGTTTGCATCATAAAGAGCTGATTTATTGTAGCACAGCTGTATTTGTTGTAGCCAGAATCCGCGGtgaactgtgtgtttatttaacccttgtgaaATATGGTTTTCTCACTGTAAAAACGATTAACTTTATTTCATGGGCCCTGAAAGCACCGGTCAAACTCTCCCACTTGGACTCTCCCaaagaaaatatttaatcgAGAAAGCCAACCTCTTATCATGTTTTAAAACAGTTTAAGCGCCTATGAATTTGTATATTctctcctgactaaactttgacataaactgtgattgaatcaacatcctctgatcttaactattagtccaaataattcataatttctgctttttaaaacaaaaaaaatgaggaataatgtcatttaaattaggtttattgaccatgaatttaaaaaaaacatcaagcgttacatttaaattgttacctggaaggacaacaagttcatggtcgacagaaagacaacacaaaggttaatAATAATGATCACATTTCAGTGTAATATGTTATTTGCTgtgttaaccctcctgttgtcctcgggtctaatttgacccattttcaacaagtttctatatcagaaatgtgggtttctttcaacaagaTTGTCAACAAAAAAAGTAAGGTGGATGTTTCCCTACatcgctcttcacaagtaaaataaatgatcagttcactactttaatTGAATTTGTGAATTGGTGTTTCACttaatttcatagcatttgaaaaaaaatagaacgttgaaaaaagtgacaaatccCACAAAAGGCTTCAAAAGgcgcagaaaaaaagttgataaaaacataacgttgcatggtcgacgggaagacaacacaagggttaaaagtagcctacatacagtacatgcaataAATAGATATATATGACACACTCACGTCCGCCCCTTCGGGTGAAAGTGAAAGTAGACGTTGTTCACCCTGTTTATTTCTATCTGCGTCTATCTGTGTTCTAACAGCGACAGGTCGAGATGTTGATCCAAAGACTGACCGatgccGTTTATTATAATAAGAAGTGACCGTCTCAGCTCCAATGGAAATCCTCCTGGCTTTAACACTGGACCTACATCTTCACAAAGATGGGTCAAGTATGCTTCAAGCAAGGAGAACCAGAACACCCTGAAGGAGAGTCCATCTGAATTGGTGATGAAGGGACACTCATCCGGGTCGGGTCGTCCAGACTTCTTAACCCAACCTTTATCAAACAAGATTCCCTGAAGTCAAGAAGACGAGTAAATCTCAGAGAGGATCAGCGTCTTCAAATgtcagtttacagttttttccagttGCTAACACACTACAATGACATtcatagcacaattatttaaagtgaaacacagagagcaaaacctcttctcaagtctccaaaactctaaacacattttctgctttacacacattttgcaattcaaaatggccctttttaaatgcactgaacacggttctctgcataagacacaacgatctgacataaagtcacatgtttgccatttcaaaacactgccattcaaaatgacactacatgagcttTTCGGCCAACATATGCGCCACCTGACCAACCACCTCAATGCTTTattgttaccacttcaatcaggaagtaagcactataAAAAGACCACATGTGAGcacctcttt
>TU105344
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Function

NR:

description
PREDICTED: tripartite motif-containing protein 35-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105332 False 559 lncRNA 0.41 5 36143677 36159302
TU105334 False 1049 TUCP 0.42 5 36137759 36141222
TU105341 False 394 lncRNA 0.35 2 36128879 36159302
TU105342 True 2365 lncRNA 0.37 5 36128879 36133280
TU105344 False 1168 lncRNA 0.40 8 36110851 36190839

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
dek LOC102312342,LOC102210945 coding upstream 719 36092199 ~ 36110132 (+)
LOC120563160 LOC104935873 coding upstream 84280 36024626 ~ 36026571 (+)
LOC120562276 NA coding upstream 209959 35896350 ~ 35900892 (+)
LOC120562454 NA coding upstream 226916 35875127 ~ 35883935 (+)
LOC120562277 NA coding upstream 254115 35849473 ~ 35856736 (+)
nat16l NA coding downstream 169861 36360700 ~ 36367025 (+)
LOC120563182 NA coding downstream 177855 36368694 ~ 36383096 (+)
LOC120563185 NA coding downstream 337642 36528481 ~ 36541530 (+)
atp2c1 LOC103369286 coding downstream 569671 36760510 ~ 36792668 (+)
LOC120563178 NA coding downstream 618721 36809560 ~ 36829422 (+)
G78756 NA non-coding upstream 22755 36087873 ~ 36088096 (+)
G78736 NA non-coding upstream 76199 36034348 ~ 36034652 (+)
G78716 NA non-coding upstream 147346 35962773 ~ 35963505 (+)
G78707 NA non-coding upstream 181955 35928440 ~ 35928896 (+)
G78706 NA non-coding upstream 201782 35908820 ~ 35909069 (+)
G78776 NA non-coding downstream 97953 36288792 ~ 36289154 (+)
G78770 NA non-coding downstream 144278 36335117 ~ 36339554 (+)
G78798 NA non-coding downstream 207210 36398049 ~ 36415884 (+)
G78813 NA non-coding downstream 255808 36446647 ~ 36507814 (+)
G78822 NA non-coding downstream 309809 36500648 ~ 36706609 (+)
LOC120562279 NA other upstream 222679 35865842 ~ 35888172 (+)
LOC120562275 NA other upstream 336863 35743295 ~ 35773988 (+)
G78594 NA other upstream 702169 35405375 ~ 35408682 (+)
LOC120562567 NA other upstream 1254319 34839157 ~ 34856532 (+)
G78200 NA other upstream 1566472 34529355 ~ 34544379 (+)
G78772 NA other downstream 67321 36258160 ~ 36350995 (+)
LOC120563181 LOC107378893,LOC103370072 other downstream 201413 36392252 ~ 36465230 (+)
LOC120562456 dennd4b other downstream 390126 36580965 ~ 36670029 (+)
LOC120562457 NA other downstream 495097 36685936 ~ 36703993 (+)
G78888 NA other downstream 648383 36839222 ~ 36939954 (+)

Expression


Co-expression Network