G79007 (LOC103364590,LOC102314205,LOC102798195)


Basic Information

Item Value
gene id G79007
gene name LOC103364590,LOC102314205,LOC102798195
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 37530690 ~ 37550602 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU105708
gtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgttggcgtgtgtgttgtgtgtgttattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatttgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttgtctcgtgtgtgtgtgcgtgtgattgtgtgtctgtgtgttgtcaagtgtgattgtgtgtgtatatttgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttgtgttttcatgAAAAAGGACCCAGACCGATAATCGAATGTCTTAAACAGAGATTAATTTAGTTTAATGATCTCGGCGTCTGCCGGCGCCGCTGGCGGCGTGGCCGATGCGTCCGTCGCCTCGTGTAGCTTCATGTGGTTGCGGAAGGTCCTGGGTTTGCTCAGGTTCTTCTTGCAGATGTTGCAGAAGTACGGCCGGGCGTTCGAGTGCCTGCTGTCCATGTGGTAGGTGAGCTCCAGGGTGCGGCTGAAGCTCTTGCCGCACAGCGGACACGGGAACCGGACGCCCGAGTGCGTCAGCTGGTGGCACTTGAGCACGCTCTGCTGCTTGAAGGTCTTCTGGCAGATGGTGCACTGGTACGGCCGGGCGTCGGCGTGCAGCCGCTGGTGGCGCCGCAGCGCGCTGGAGAAGGCGAAGCTCCGGTTGCACTGGGCGCAGGTGTAGGGCTTCTCGCCCGTGTGGGTCCTCTGGTGCTCCCTCATGTGCGCCTGCTGGATGAAGCTCTTCCGGCAGATGGGGCACTGGAACGGGCGCTCGCCCGAGTGGATCCTCAGGTGTTTCTGCAGCGCCGACGCCTTGAAGCAGTCGCGGCCGCACACGGGACAGCAGTGCTTACTTTTCCCGC
>TU105710
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>TU105711
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>TU105713
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>TU105714
gtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgttggcgtgtgtgttgtgtgtgttattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatttgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttgtctcgtgtgtgtgtgcgtgtgattgtgtgtctgtgtgttgtcaagtgtgattgtgtgtgtatatttgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttgtgttttcatgAAAAAGGACCCAGACCGATAATCGAATGTCTTAAACAGAGATTAATTTAGTTTAATGATCTCGGCGTCTGCCGGCGCCGCTGGCGGCGTGGCCGATGCGTCCGTCGCCTCGTGTAGCTTCATGTGGTTGCGGAAGGTCCTGGGTTTGCTCAGGTTCTTCTTGCAGATGTTGCAGAAGTACGGCCGGGCGTTCGAGTGCCTGCTGTCCATGTGGTAGGTGAGCTCCAGGGTGCGGCTGAAGCTCTTGCCGCACAGCGGACACGGGAACCGGACGCCCGAGTGCGTCAGCTGGTGGCACTTGAGCACGCTCTGCTGCTTGAAGGTCTTCTGGCAGATGGTGCACTGGTACGGCCGGGCGTCGGCGTGCAGCCGCTGGTGGCGCCGCAGCGCGCTGGAGAAGGCGAAGCTCCGGTTGCACTGGGCGCAGGTGTAGGGCTTCTCGCCCGTGTGGGTCCTCTGGTGCTCCCTCATGTGCGCCTGCTGGATGAAGCTCTTCCGGCAGATGGGGCACTGGAACGGGCGCTCGCCCGAGTGGATCCTCAGGTGTTTCTGCAGCGCCGACGCCTTGAAGCAGTCGCGGCCGCACACGGGACAGCAGTGCTTACTTTTCCCGC
>TU105716
gtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgttggcgtgtgtgttgtgtgtgttattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatttgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtttgtgtgtgtgtg
>TU105717
gtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgttggcgtgtgtgttgtgtgtgttattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatttgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttgtctcgtgtgtgtgtgcgtgtgattgtgtgtctgtgtgttgtcaagtgtgattgtgtgtgtatatttgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttgtgttttcatgAAAAAGGACCCAGACCGATAATCGAATGTCTTAAACAGAGATTAATTTAGTTTAATGATCTCGGCGTCTGCCGGCGCCGCTGGCGGCGTGGCCGATGCGTCCGTCGCCTCGTGTAGCTTCATGTGGTTGCGGAAGGTCCTGGGTTTGCTCAGGTTCTTCTTGCAGATGTTGCAGAAGTACGGCCGGGCGTTCGAGTGCCTGCTGTCCATGTGGTAGGTGAGCTCCAGGGTGCGGCTGAAGCTCTTGCCGCACAGCGGACACGGGAACCGGACGCCCGAGTGCGTCAGCTGGTGGCACTTGAGCACGCTCTGCTGCTTGAAGGTCTTCTGGCAGATGGTGCACTGGTACGGCCGGGCGTCGGCGTGCAGCCGCTGGTGGCGCCGCAGCGCGCTGGAGAAGGCGAAGCTCCGGTTGCACTGGGCGCAGGTGTAGGGCTTCTCGCCCGTGTGGGTCCTCTGGTGCTCCCTCATGTGCGCCTGCTGGATGAAGCTCTTCCGGCAGATGGGGCACTGGAACGGGCGCTCGCCCGAGTGGATCCTCAGGTGTTTCTGCAGCGCCGACGCCTTGAAGCAGTCGCGGCCGCACACGGGACAGCAGTGCTTACTTTTCCCGC
>TU105718
tgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttgtctcgtgtgtgtgtgcgtgtgattgtgtgtctgtgtgttgtcaagtgtgattgtgtgtgtatatttgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttgtgttttcatgAAAAAGGACCCAGACCGATAATCGAATGTCTTAAACAGAGATTAATTTAGTTTAATGATCTCGGCGTCTGCCGGCGCCGCTGGCGGCGTGGCCGATGCGTCCGTCGCCTCGTGTAGCTTCATGTGGTTGCGGAAGGTCCTGGGTTTGCTCAGGTTCTTCTTGCAGATGTTGCAGAAGTACGGCCGGGCGTTCGAGTGCCTGCTGTCCATGTGGTAGGTGAGCTCCAGGGTGCGGCTGAAGCTCTTGCCGCACAGCGGACACGGGAACCGGACGCCCGAGTGCGTCAGCTGGTGGCACTTGAGCACGCTCTGCTGCTTGAAGGTCTTCTGGCAGATGGTGCACTGGTACGGCCGGGCGTCGGCGTGCAGCCGCTGGTGGCGCCGCAGCGCGCTGGAGAAGGCGAAGCTCCGGTTGCACTGGGCGCAGGTGTAGGGCTTCTCGCCCGTGTGGGTCCTCTGGTGCTCCCTCATGTGCGCCTGCTGGATGAAGCTCTTCCGGCAGATGGGGCACTGGAACGGGCGCTCGCCCGAGTGGATCCTCAGGTGTTTCTGCAGCGCCGACGCCTTGAAGCAGTCGCGGCCGCACACGGGACAGCAGTGCTTACTTTTCCCGC
>TU105719
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>TU105721
gtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgttggcgtgtgtgttgtgtgtgttattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatttgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgttgtcatgtgTGATTGTTTGtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtctgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcatgtgtgattgtgtgtgtgttgtcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttgtctcgtgtgtgtgtgcgtgtgattgtgtgtctgtgtgttgtcaagtgtgattgtgtgtgtatatttgtgcgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgttgtgttttcatgAAAAAGGACCCAGACCGATAATCGAATGTCTTAAACAGAGATTAATTTAGTTTAATGATCTCGGCGTCTGCCGGCGCCGCTGGCGGCGTGGCCGATGCGTCCGTCGCCTCGTGTAGCTTCATGTGGTTGCGGAAGGTCCTGGGTTTGCTCAGGTTCTTCTTGCAGATGTTGCAGAAGTACGGCCGGGCGTTCGAGTGCCTGCTGTCCATGTGGTAGGTGAGCTCCAGGGTGCGGCTGAAGCTCTTGCCGCACAGCGGACACGGGAACCGGACGCCCGAGTGCGTCAGCTGGTGGCACTTGAGCACGCTCTGCTGCTTGAAGGTCTTCTGGCAGATGGTGCACTGGTACGGCCGGGCGTCGGCGTGCAGCCGCTGGTGGCGCCGCAGCGCGCTGGAGAAGGCGAAGCTCCGGTTGCACTGGGCGCAGGTGTAGGGCTTCTCGCCCGTGTGGGTCCTCTGGTGCTCCCTCATGTGCGCCTGCTGGATGAAGCTCTTCCGGCAGATGGGGCACTGGAACGGGCGCTCGCCCGAGTGGATCCTCAGGTGTTTCTGCAGCGCCGACGCCTTGAAGCAGTCGCGGCCGCACACGGGACAGCAGTGCTTACTTTTCCCGC

Function

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein 83-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU105708 False 1164 lncRNA 0.54 3 37530690 37533069
TU105710 False 1268 lncRNA 0.53 3 37530690 37533069
TU105711 False 1080 lncRNA 0.54 3 37531008 37533069
TU105713 False 1189 lncRNA 0.55 3 37530690 37533126
TU105714 False 1150 lncRNA 0.54 2 37530690 37533069
TU105716 False 296 lncRNA 0.44 3 37530690 37550602
TU105717 False 1096 TUCP 0.54 3 37530690 37533069
TU105718 False 1054 lncRNA 0.55 3 37531008 37533069
TU105719 True 1278 TUCP 0.53 3 37530690 37533069
TU105721 False 1164 lncRNA 0.54 3 37530690 37533069

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tmem116 NA coding upstream 105870 37404963 ~ 37424820 (+)
LOC120561882 NA coding upstream 138698 37387117 ~ 37391992 (+)
LOC120562463 NA coding upstream 152906 37362224 ~ 37377784 (+)
LOC120561883 NA coding upstream 171065 37354983 ~ 37359625 (+)
LOC120561884 NA coding upstream 179119 37336071 ~ 37351571 (+)
LOC120561682 NA coding downstream 15154 37565756 ~ 37568029 (+)
LOC120562860 NA coding downstream 26877 37577479 ~ 37578431 (+)
LOC120562465 NA coding downstream 27995 37578597 ~ 37579855 (+)
LOC120561715 NA coding downstream 32521 37583123 ~ 37586138 (+)
LOC120562469 NA coding downstream 155503 37706105 ~ 37709961 (+)
G79004 NA non-coding upstream 93 37525876 ~ 37530597 (+)
G78999 NA non-coding upstream 30580 37499890 ~ 37500110 (+)
G78998 NA non-coding upstream 36087 37492806 ~ 37494603 (+)
G78990 NA non-coding upstream 62810 37433346 ~ 37467880 (+)
G78961 NA non-coding upstream 151376 37295566 ~ 37379314 (+)
LOC120562911 NA non-coding downstream 6073 37556675 ~ 37560786 (+)
G79262 NA non-coding downstream 56583 37607185 ~ 37645567 (+)
G79284 NA non-coding downstream 182606 37733208 ~ 37797202 (+)
G79297 NA non-coding downstream 208633 37759235 ~ 37760174 (+)
G79305 NA non-coding downstream 221638 37772240 ~ 37775336 (+)
G78989 NA other upstream 98011 37431171 ~ 37432679 (+)
G78888 NA other upstream 590736 36839222 ~ 36939954 (+)
LOC120562457 NA other upstream 826697 36685936 ~ 36703993 (+)
LOC120562456 dennd4b other upstream 860661 36580965 ~ 36670029 (+)
LOC120563181 LOC107378893,LOC103370072 other upstream 1065460 36392252 ~ 36465230 (+)
cmtm7 cmtm7 other downstream 328314 37878916 ~ 37888006 (+)
nek11 nek11,LOC102796711 other downstream 505814 38056416 ~ 38145804 (+)
G79351 NA other downstream 619452 38170054 ~ 38324620 (+)
LOC120562476 NA other downstream 631548 38182150 ~ 38188763 (+)
LOC120562481 NA other downstream 750823 38301425 ~ 38305892 (+)

Expression


Co-expression Network