G79351


Basic Information

Item Value
gene id G79351
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 38170054 ~ 38324620 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU106244
gtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtttgtgtgtttgtgtgtctgtgtgtctctatctgtgtgtgtgt
>TU106245
gtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU106246
gtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU106248
gtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU106244 True 502 TUCP 0.48 4 38170054 38320607
TU106245 False 432 lncRNA 0.49 3 38170054 38250032
TU106246 False 498 TUCP 0.49 4 38170054 38320429
TU106248 False 480 lncRNA 0.49 4 38170054 38324620

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120561705 NA coding upstream 324340 37826889 ~ 37845714 (+)
zgc:153896 LOC100708450,LOC103364589,LOC101166003,LOC106527367 coding upstream 427588 37734725 ~ 37742466 (+)
LOC120561575 NA coding upstream 450025 37717368 ~ 37720029 (+)
LOC120562469 NA coding upstream 460093 37706105 ~ 37709961 (+)
LOC120561715 NA coding upstream 583916 37583123 ~ 37586138 (+)
si:dkey-7j14.6 NA coding downstream 78532 38403152 ~ 38428485 (+)
tg NA coding downstream 200584 38525204 ~ 38575568 (+)
LOC120563014 NA coding downstream 256898 38581518 ~ 38592495 (+)
plin6 NA coding downstream 559670 38884290 ~ 38903260 (+)
LOC120563021 NA coding downstream 670533 38995153 ~ 39009576 (+)
G79286 NA non-coding upstream 41082 38126801 ~ 38128972 (+)
G79338 NA non-coding upstream 104856 38064349 ~ 38065198 (+)
G79337 NA non-coding upstream 111633 38058107 ~ 38058421 (+)
G79322 NA non-coding upstream 226680 37942894 ~ 37943374 (+)
G79317 NA non-coding upstream 293977 37875735 ~ 37876077 (+)
LOC120563039 NA non-coding downstream 42499 38367119 ~ 38367849 (+)
G79384 NA non-coding downstream 49207 38373827 ~ 38379212 (+)
G79386 NA non-coding downstream 55972 38380592 ~ 38380881 (+)
G79374 NA non-coding downstream 80491 38405111 ~ 38459995 (+)
G79370 NA non-coding downstream 80857 38405477 ~ 38412407 (+)
nek11 nek11,LOC102796711 other upstream 24250 38056416 ~ 38145804 (+)
cmtm7 cmtm7 other upstream 282048 37878916 ~ 37888006 (+)
G79007 LOC103364590,LOC102314205,LOC102798195 other upstream 619452 37530690 ~ 37550602 (+)
G78989 NA other upstream 737375 37431171 ~ 37432679 (+)
G78888 NA other upstream 1230100 36839222 ~ 36939954 (+)
cmtm6 NA other downstream 109354 38433974 ~ 38455559 (+)
LOC120562999 NA other downstream 269425 38594045 ~ 39098913 (+)
G79605 NA other downstream 341652 38666272 ~ 38673012 (+)
cpne4a cpne4,LOC107379031,LOC103372348,LOC102220834,LOC108412597 other downstream 352116 38676736 ~ 38780360 (+)
G79615 NA other downstream 367026 38691646 ~ 38711009 (+)

Expression


Co-expression Network