G79484


Basic Information

Item Value
gene id G79484
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 38063698 ~ 38221760 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU106423
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtatgtgtgtgtatgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU106424
gtgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtatgtgtctgtgtgtgtgcctgtctgtgtgtgtgtgtgcctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU106426
gtgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttctgtgtgtgtctgttatgtgtgtgtgtgtgtgtttttgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgttttttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU106427
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtcctgtgtgtgtcttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctg
>TU106428
gtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgggtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtcctgtgtgtgtcttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU106429
ggtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgactgtgtgtgtgactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagagctgtgtttgtttgtgtgtgtgtgtgtgtctcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtctctctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtctctttgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgactgtgtgtgtgtg
>TU106430
ggtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgactgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgggtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU106432
gtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgggtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU106433
gtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtcctgtgtgtgtcttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgt
>TU106434
ggtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgactgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagtgtgtgt
>TU106435
ggtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgactgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgggtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctgt
>TU106436
gtgtgagtctgtgtgtgtgtctctgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctg
>TU106437
gtgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtcctgtgtgtgtcttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtgtgtctgt
>TU106438
gtgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttctgtgtgtgtctgttatgtgtgtgtgtgtgtgtttttgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgttttttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatttatgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU106423 False 286 lncRNA 0.49 3 38063698 38132651
TU106424 False 214 lncRNA 0.50 2 38129017 38221760
TU106426 False 381 lncRNA 0.46 3 38189833 38221760
TU106427 False 329 lncRNA 0.50 2 38123460 38132651
TU106428 True 584 lncRNA 0.50 5 38063698 38182999
TU106429 False 469 lncRNA 0.48 2 38187616 38190801
TU106430 False 480 TUCP 0.50 6 38080883 38190801
TU106432 False 371 lncRNA 0.50 4 38126925 38182999
TU106433 False 356 lncRNA 0.50 2 38086763 38132651
TU106434 False 237 lncRNA 0.48 2 38182499 38190801
TU106435 False 394 lncRNA 0.50 4 38086763 38190801
TU106436 False 343 lncRNA 0.50 5 38123460 38134537
TU106437 False 302 lncRNA 0.49 3 38127285 38221760
TU106438 False 580 lncRNA 0.47 5 38126925 38221760

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:dkey-11p23.7 NA coding downstream 208876 37851161 ~ 37854822 (-)
mrps12 mrps12 coding downstream 333632 37725589 ~ 37730066 (-)
LOC120562468 NA coding downstream 368292 37693717 ~ 37695406 (-)
LOC120562948 NA coding downstream 378085 37682235 ~ 37685613 (-)
LOC120562949 NA coding downstream 388685 37672821 ~ 37675013 (-)
dcst1 NA coding upstream 7798 38229558 ~ 38250551 (-)
LOC120563006 NA coding upstream 103522 38325282 ~ 38327753 (-)
LOC120563000 NA coding upstream 113724 38335484 ~ 38337715 (-)
LOC120563004 NA coding upstream 122318 38344078 ~ 38346701 (-)
LOC120563012 NA coding upstream 153902 38375662 ~ 38387184 (-)
G79483 NA non-coding downstream 5267 38058112 ~ 38058431 (-)
LOC120563195 NA non-coding downstream 13163 38045995 ~ 38050535 (-)
G79479 NA non-coding downstream 28847 38034213 ~ 38034851 (-)
G79478 NA non-coding downstream 38887 38024597 ~ 38024811 (-)
LOC120562672 NA non-coding downstream 152573 37905582 ~ 37911125 (-)
G79507 NA non-coding upstream 958 38222718 ~ 38226088 (-)
G79510 NA non-coding upstream 28346 38250106 ~ 38255038 (-)
G79518 NA non-coding upstream 65981 38287741 ~ 38292299 (-)
LOC120563025 NA non-coding upstream 95643 38317403 ~ 38317847 (-)
LOC120563026 NA non-coding upstream 96375 38318135 ~ 38318638 (-)
LOC120562474 NA other downstream 92350 37958449 ~ 37971348 (-)
LOC120562472 NA other downstream 266932 37744084 ~ 37796766 (-)
LOC120561551 NA other downstream 544304 37492800 ~ 37519394 (-)
LOC120562574 NA other downstream 828569 37088824 ~ 37235129 (-)
kiaa0319 LOC103370079 other downstream 1169060 36867667 ~ 36894638 (-)
LOC120562482 NA other upstream 97184 38318944 ~ 38324284 (-)
LOC120562485 NA other upstream 294841 38516601 ~ 38522389 (-)
nudt17 nudt17 other upstream 444507 38666267 ~ 38680480 (-)
G79767 NA other upstream 685020 38906780 ~ 38908021 (-)
G79820 NA other upstream 876012 39097772 ~ 39138382 (-)

Expression


Co-expression Network