G79495


Basic Information

Item Value
gene id G79495
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 38148610 ~ 38149340 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU106454
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtgtctctctcc
>TU106455
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtgtctctctcc
>TU106458
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctgctgccTCAgacctctgtttgtctct
>TU106459
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctcactctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtcctctctctctctctctctcctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctgctgccTCAgacctctgtttgtctct
>TU106460
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctccctgtctctctctctctctgtctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtgtctctctcc
>TU106461
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtgtctctctcc
>TU106468
gtgtgtgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctgtctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctgtctctctctctctctctctgtctctctctgtctctctctctctgtctctctctctctctgtctctccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctgtgtctctctcc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU106454 False 396 lncRNA 0.51 2 38148795 38149340
TU106455 False 402 lncRNA 0.50 2 38148795 38149340
TU106458 False 398 lncRNA 0.50 2 38148610 38149340
TU106459 True 444 lncRNA 0.50 2 38148610 38149340
TU106460 False 416 lncRNA 0.51 2 38148795 38149340
TU106461 False 404 lncRNA 0.50 2 38148795 38149340
TU106468 False 380 lncRNA 0.51 2 38148795 38149340

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:dkey-11p23.7 NA coding downstream 293788 37851161 ~ 37854822 (-)
mrps12 mrps12 coding downstream 418544 37725589 ~ 37730066 (-)
LOC120562468 NA coding downstream 453204 37693717 ~ 37695406 (-)
LOC120562948 NA coding downstream 462997 37682235 ~ 37685613 (-)
LOC120562949 NA coding downstream 473597 37672821 ~ 37675013 (-)
LOC120563013 NA coding upstream 62480 38211820 ~ 38230481 (-)
dcst1 NA coding upstream 80218 38229558 ~ 38250551 (-)
LOC120563006 NA coding upstream 175942 38325282 ~ 38327753 (-)
LOC120563000 NA coding upstream 186144 38335484 ~ 38337715 (-)
LOC120563004 NA coding upstream 194738 38344078 ~ 38346701 (-)
G79496 NA non-coding downstream 18589 38129554 ~ 38130021 (-)
G79492 NA non-coding downstream 35983 38109919 ~ 38112627 (-)
G79491 NA non-coding downstream 47682 38100301 ~ 38100928 (-)
G79490 NA non-coding downstream 56814 38090654 ~ 38091796 (-)
G79486 NA non-coding downstream 61103 38081731 ~ 38087507 (-)
G79507 NA non-coding upstream 73378 38222718 ~ 38226088 (-)
G79510 NA non-coding upstream 100766 38250106 ~ 38255038 (-)
G79518 NA non-coding upstream 138401 38287741 ~ 38292299 (-)
LOC120563025 NA non-coding upstream 168063 38317403 ~ 38317847 (-)
LOC120563026 NA non-coding upstream 168795 38318135 ~ 38318638 (-)
LOC120562474 NA other downstream 177262 37958449 ~ 37971348 (-)
LOC120562472 NA other downstream 351844 37744084 ~ 37796766 (-)
LOC120561551 NA other downstream 629216 37492800 ~ 37519394 (-)
LOC120562574 NA other downstream 913481 37088824 ~ 37235129 (-)
kiaa0319 LOC103370079 other downstream 1253972 36867667 ~ 36894638 (-)
LOC120562482 NA other upstream 169604 38318944 ~ 38324284 (-)
LOC120562485 NA other upstream 367261 38516601 ~ 38522389 (-)
nudt17 nudt17 other upstream 516927 38666267 ~ 38680480 (-)
G79767 NA other upstream 757440 38906780 ~ 38908021 (-)
G79820 NA other upstream 948432 39097772 ~ 39138382 (-)

Expression


Co-expression Network