G80129


Basic Information

Item Value
gene id G80129
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 40222367 ~ 40307523 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU107389
gtgtgtgtgtgtgtgtctcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcacgcgagcgcacgtgcgtgcgtgcgtgcttggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtctgtgtatatatgtatatttgtgtgtgtgtgggtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgcatgtatgcatgtctgtgtgtgagagag
>TU107392
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtctgtatgtgtgcggtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU107393
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtctgtatgtgtgcggtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctatctgcctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctttttgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcacgcgagcgcacgtgcgtgcgtgcgtgcttggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtctgtgtatatatgtatatttgtgtgtgtgtgggtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgcatgtatgcatgtctgtgtgtgagagag
>TU107394
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtctgtatgtgtgcggtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctttttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU107395
gtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgcctgtgtgtggtgttgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcacgcgagcgcacgtgcgtgcgtgcgtgcttggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtctgtgtatatatgtatatttgtgtgtgtgtgggtgggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtatgtatgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgcatgtatgcatgtctgtgtgtgagagag

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU107389 False 484 lncRNA 0.49 3 40222367 40293535
TU107392 False 218 lncRNA 0.50 4 40255590 40307523
TU107393 True 791 TUCP 0.49 4 40222367 40307523
TU107394 False 395 lncRNA 0.49 4 40253521 40307523
TU107395 False 475 lncRNA 0.49 2 40222367 40259594

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562374 NA coding downstream 21234 40180342 ~ 40201133 (-)
LOC120562362 NA coding downstream 47251 40125425 ~ 40175116 (-)
LOC120562356 ttc24 coding downstream 299218 39901765 ~ 39923149 (-)
LOC120562358 LOC101076950 coding downstream 379191 39833153 ~ 39843176 (-)
LOC120562487 NA coding downstream 1079662 39107304 ~ 39142705 (-)
tmem79b NA coding upstream 47111 40354634 ~ 40364184 (-)
pmvk pmvk coding upstream 172543 40480066 ~ 40487346 (-)
LOC120562399 NA coding upstream 503712 40811235 ~ 40816555 (-)
LOC120562403 NA coding upstream 576598 40884121 ~ 40888754 (-)
LOC120562505 LOC100690881,LOC102207812,LOC101474950 coding upstream 1092287 41399810 ~ 41409787 (-)
G80088 NA non-coding downstream 99035 40091864 ~ 40123332 (-)
G80099 NA non-coding downstream 122721 40057011 ~ 40099646 (-)
G80102 NA non-coding downstream 123376 40083369 ~ 40098991 (-)
LOC120562371 NA non-coding downstream 153712 39999000 ~ 40068655 (-)
G80154 NA non-coding upstream 9222 40316745 ~ 40318274 (-)
G80158 NA non-coding upstream 14392 40321915 ~ 40322561 (-)
G80170 NA non-coding upstream 109555 40417078 ~ 40420432 (-)
G80177 NA non-coding upstream 136862 40444385 ~ 40444708 (-)
G80178 LOC103374405,LOC107095278,LOC104937304,LOC102793710,LOC100708478,LOC102303267 non-coding upstream 143790 40451313 ~ 40471247 (-)
G80046 NA other downstream 360819 39779384 ~ 39861548 (-)
G80027 NA other downstream 644428 39576663 ~ 39577939 (-)
G79872 NA other downstream 765728 39396261 ~ 39456639 (-)
G79820 NA other downstream 1083985 39097772 ~ 39138382 (-)
G79767 NA other downstream 1314346 38906780 ~ 38908021 (-)
G80186 NA other upstream 184800 40492323 ~ 40497596 (-)
LOC120562415 NA other upstream 370820 40678343 ~ 40765467 (-)
G80488 NA other upstream 708327 41015850 ~ 41017192 (-)
G80498 NA other upstream 795720 41103243 ~ 41104094 (-)
LOC120562506 NA other upstream 1105430 41412953 ~ 41421025 (-)

Expression


Co-expression Network