LOC120562506


Basic Information

Item Value
gene id LOC120562506
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 41412953 ~ 41421025 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU108152
CTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCCTGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCCTGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTG
>XM_039806213.1
atggatggaggagggatggaggagtGGATGGAAGAGGTGGATGGAGGTGGAGGAAGGAAGAGGGAGTGGATGGAGGAAAAGATGGAGGGAGGTGGAATGGAAGAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTATCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAATCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTCTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGGTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATACTGTTGGTTTTGTCCCTGCAGGTCTCATGTAGTCTGATAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU108152 False 1463 lncRNA 0.48 3 41412953 41416205
XM_039806213.1 True 1878 mRNA 0.48 3 41414474 41421025

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562505 LOC100690881,LOC102207812,LOC101474950 coding downstream 3166 41399810 ~ 41409787 (-)
LOC120562403 NA coding downstream 524199 40884121 ~ 40888754 (-)
LOC120562399 NA coding downstream 596398 40811235 ~ 40816555 (-)
pmvk pmvk coding downstream 925607 40480066 ~ 40487346 (-)
tmem79b NA coding downstream 1048769 40354634 ~ 40364184 (-)
myo1eb LOC104937078,LOC101474664,LOC102208361,LOC100691416,LOC102308324 coding upstream 193884 41614909 ~ 41660714 (-)
selenbp1 selenbp1 coding upstream 582827 42003852 ~ 42047544 (-)
LOC120562508 NA coding upstream 630950 42051975 ~ 42057548 (-)
LOC120562764 NA coding upstream 1198878 42619903 ~ 42623838 (-)
LOC120562512 NA coding upstream 1228424 42649449 ~ 42656684 (-)
G80558 NA non-coding downstream 49143 41362165 ~ 41363810 (-)
G80508 NA non-coding downstream 158736 41186453 ~ 41254217 (-)
LOC120562413 NA non-coding downstream 202307 41209030 ~ 41210646 (-)
G80526 LOC108281047 non-coding downstream 210722 41201771 ~ 41202231 (-)
G80512 NA non-coding downstream 226723 41157964 ~ 41186230 (-)
G80572 NA non-coding upstream 252 41421277 ~ 41502269 (-)
G80580 NA non-coding upstream 71029 41492054 ~ 41492753 (-)
G80603 NA non-coding upstream 189956 41610981 ~ 41611190 (-)
G80578 NA non-coding upstream 241492 41662517 ~ 41666764 (-)
G80607 NA non-coding upstream 249862 41670887 ~ 41671967 (-)
G80498 NA other downstream 308859 41103243 ~ 41104094 (-)
G80488 NA other downstream 395761 41015850 ~ 41017192 (-)
LOC120562415 NA other downstream 647486 40678343 ~ 40765467 (-)
G80186 NA other downstream 915357 40492323 ~ 40497596 (-)
G80129 NA other downstream 1105430 40222367 ~ 40307523 (-)
LOC120562392 LOC103132156,LOC108243373 other upstream 12016 41433041 ~ 41605388 (-)
LOC120562507 LOC105890369,LOC107379007,LOC105018870,LOC105012700,LOC103477466,LOC103369594 other upstream 217112 41638137 ~ 41998854 (-)
G80637 NA other upstream 679164 42100189 ~ 42108573 (-)
LOC120562509 c3-2,LOC102208541,LOC102799596,LOC100692186 other upstream 689955 42110980 ~ 42453873 (-)
LOC120562510 NA other upstream 953093 42374118 ~ 42387280 (-)

Expression


Co-expression Network