LOC120561945 (znf706,LOC107103982,LOC102223041,LOC103478835)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120561945
gene name znf706,LOC107103982,LOC102223041,LOC103478835
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 184854 ~ 191697 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU93160
CCACTGGAAGCTGTGGAAAGTCCAGGGAATTTAACATGGCGTTTcttgaattttattttggtgGCTATCTTcagtaatatatttatttacactGgTCTAGCATCAGATATGGCCCGTGGGCACCAGAAGTTCCAGTCCCAGCAGAAGAATGCCAAAAAGCAGGCAGACATCAAGAAGAGCAAAGGCCATGACCAGAAGGCAGCAGCTAAGGCTGCTTTAGTCTACACGTGCACTGTGTGTCGGACACAAATGCCCGACCCGAAGACCTTTAAGCAGCACTTTGAAAGCAAACATCCTAAGTCCTCCATGCCCCCGGAGTTGGTCAGTGTGGAGGCGTAATAGATTCACCGGTCTTTCAGTGAGACAGGTGGGGCTGATTCAGGACAGGCTTATacattttataatgttttagaTAAGATATCTTCAGTACAACTTCAATTAATCCTCATGCTCTCTAATTTAGTTATTGAGTGTTTTTATGCAGGGGTGTTACTGGAACTGCCTGCCCATGTTCTTTTAtccaaattgtatttttttgtttgttacaaAGCTATCCTCCACAAACCAGAATTTGATCTGGGTCCAGTACTGACAGCTACCCTCTCTTGGCTTGTGCCAaacatgtatgtatttttttttatctccgaTTGTATGCAATATTCTTATCTGatcatttcaaaaatgttaTGTGCACAAGACCAGCATGTCCATAGGCCCGGCCACCATTACACCATGTCAGGGCTCCCACTGTTTCAAGACTTTGATGCTTTGAATTTAGAAGACATTCTGAATTGGCAATGGCTCAGCTGAACAAAGTTGTAACACTGGGGTGATCATTGGAAGTCCTCTGCATCCAAATCCAATATACTGTGAAACCCATTATGGATTTTTTCTGAAACTAATTTGTGATGTGCCAGGGTTGGGCTTATAATTAACAGAATGACTTTGGATGGTGAGATTGGAAAGACACTTATTCAAAACCACTCCCACTGAATAATGTTCTTTTGAGTAGATTCagatttactttttattttttccttgcCTGGATAATTTTAAAAAGTTTCAAGACAGGTCTATAATTTTTGTTGATATGAAGAACATAATAAACATTGTGCTACACGGGTACTGAAATTGTGCATTGTATTGCATCTCCTCAGATATTCATGAAATGTGTCTAGTTCATGTCAACTGTGTAACTTTCTCATGTGCAAAAGAGAAAAAGTTGACCAGAGAGGGCACTGCAAGTCTACTCATAGCAAACCCTTCAGTGACACAATTTCCTTAACTTCTCTTATCATAAAGCAATGGTATGACTGCTTTAAAACAGTTCTTTGACACTGTTAGAAGGGGTCTGTTGAGTGAATTGGGGTAAACATAAGTTGGCACTGCGCATTGTAAATGATAACGCTAACGATCTGCTCCTATCCGCCCTCTTTGTCATTGTAATAATGGTATAATTGTATGCATCGCTGTAATATTTGATAGTGATTTGGCTCATCACTATTGTATTTTTGCAGCGTAACCGGTCTCACACAGTCATCTCAATGTGAAAATGATCCCAAGTGCAGTGTCGTTTTGCTCTTTAGTGTTAAACCATCATGGTGGTGCAAAAGTATTTTGACTCTGAACCTACATTTAAAGTCTAcattacactgtaaaaaaagtaaagttatttttggtttttatttttacattagtTTCTTTTTGTAGCGTGCTAATACACagaaatttaatttatacaaaATAACTATTTTCAATACATTTGGACCTACTGGTCATTAACCACAGACACTGTATTACTGTGCTAAAGTCTGGACTGACAACCAG
>XM_039805288.1
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>XM_039805289.1
TTCTGCGGTGATCCAGATTGAAAATCTGTGGAATTCTGCGGAATGTTTTTATGGGTTCTTTACCCCATTCCAGCGCATCCCACCACACAGCAGCGTTTAGAcgtgtttctgttgtttgctagcagaggTCTAGCATCAGATATGGCCCGTGGGCACCAGAAGTTCCAGTCCCAGCAGAAGAATGCCAAAAAGCAGGCAGACATCAAGAAGAGCAAAGGCCATGACCAGAAGGCAGCAGCTAAGGCTGCTTTAGTCTACACGTGCACTGTGTGTCGGACACAAATGCCCGACCCGAAGACCTTTAAGCAGCACTTTGAAAGCAAACATCCTAAGTCCTCCATGCCCCCGGAGTTGGTCAGTGTGGAGGCGTAATAGATTCACCGGTCTTTCAGTGAGACAGCTATCCTCCACAAACCAGAATTTGATCTGGGTCCAGTACTGACAGCTACCCTCTCTTGGCTTGTGCCAaacatgtatgtatttttttttatctccgaTTGTATGCAATATTCTTATCTGatcatttcaaaaatgttaTGTGCACAAGACCAGCATGTCCATAGGCCCGGCCACCATTACACCATGTCAGGGCTCCCACTGTTTCAAGACTTTGATGCTTTGAATTTAGAAGACATTCTGAATTGGCAATGGCTCAGCTGAACAAAGTTGTAACACTGGGGTGATCATTGGAAGTCCTCTGCATCCAAATCCAATATACTGTGAAACCCATTATGGATTTTTTCTGAAACTAATTTGTGATGTGCCAGGGTTGGGCTTATAATTAACAGAATGACTTTGGATGGTGAGATTGGAAAGACACTTATTCAAAACCACTCCCACTGAATAATGTTCTTTTGAGTAGATTCagatttactttttattttttccttgcCTGGATAATTTTAAAAAGTTTCAAGACAGGTCTATAATTTTTGTTGATATGAAGAACATAATAAACATTGTGCTACACGGGTACTGAAATTGTGCATTGTATTGCATCTCCTCAGATATTCATGAAATGTGTCTAGTTCATGTCAACTGTGTAACTTTCTCATGTGCAAAAGAGAAAAAGTTGACCAGAGAGGGCACTGCAAGTCTACTCATAGCAAACCCTTCAGTGACACAATTTCCTTAACTTCTCTTATCATAAAGCAATGGTATGACTGCTTTAAAACAGTTCTTTGACACTGTTAGAAGGGGTCTGTTGAGTGAATTGGGGTAAACATAAGTTGGCACTGCGCATTGTAAATGATAACGCTAACGATCTGCTCCTATCCGCCCTCTTTGTCATTGTAATAATGGTATAATTGTATGCATCGCTGTAATATTTGATAGTGATTTGGCTCATCACTATTGTATTTTTGCAGCGTAACCGGTCTCACACAGTCATCTCAATGTGAAAATGATCCCAAGTGCAGTGTCGTTTTGCTCTTTAGTGTTAAACCATCATGGTGGTGCAAAAGTATTTTGACTCTGAACCTACATTTAAAGTCTAcattacactgtaaaaaaagtaaagttatttttggtttttatttttacattagtTTCTTTTTGTAGCGTGCTAATACACagaaatttaatttatacaaaATAACTATTTTCAATACATTTGGACCTACTGGTCATTAACCACAGACACTGTATTACTGTGCTAAAGTCTGGACTGACAACCAGCcatgtttttacttttgtaaTAATCATCTCTTTGTCCATACAATGTTATGTATGGCCTTATAATAAAGGTTTAACTTTTTCATGAACCATTA
>XM_039805290.1
ACTGACAACACATGAAGGCAGCATAGTGTGGGGCTGGTGGGCATGCGCACCAGCACAATGAGGAAAAACCACTGGAAGCTGTGGAAAGTCCAGGGAATTTAACATGGCGTTTcttgaattttattttggtgGCTATCTTcagtaatatatttatttacactGgTCTAGCATCAGATATGGCCCGTGGGCACCAGAAGTTCCAGTCCCAGCAGAAGAATGCCAAAAAGCAGGCAGACATCAAGAAGAGCAAAGGCCATGACCAGAAGGCAGCAGCTAAGGCTGCTTTAGTCTACACGTGCACTGTGTGTCGGACACAAATGCCCGACCCGAAGACCTTTAAGCAGCACTTTGAAAGCAAACATCCTAAGTCCTCCATGCCCCCGGAGTTGGTCAGTGTGGAGGCGTAATAGATTCACCGGTCTTTCAGTGAGACAGGTGGGGCTGATTCAGGACAGGCTTATacattttataatgttttagaTAAGATATCTTCAGTACAACTTCAATTAATCCTCATGCTCTCTAATTTAGTTATTGAGTGTTTTTATGCAGGGGTGTTACTGGAACTGCCTGCCCATGTTCTTTTAtccaaattgtatttttttgtttgttacaaAGCTATCCTCCACAAACCAGAATTTGATCTGGGTCCAGTACTGACAGCTACCCTCTCTTGGCTTGTGCCAaacatgtatgtatttttttttatctccgaTTGTATGCAATATTCTTATCTGatcatttcaaaaatgttaTGTGCACAAGACCAGCATGTCCATAGGCCCGGCCACCATTACACCATGTCAGGGCTCCCACTGTTTCAAGACTTTGATGCTTTGAATTTAGAAGACATTCTGAATTGGCAATGGCTCAGCTGAACAAAGTTGTAACACTGGGGTGATCATTGGAAGTCCTCTGCATCCAAATCCAATATACTGTGAAACCCATTATGGATTTTTTCTGAAACTAATTTGTGATGTGCCAGGGTTGGGCTTATAATTAACAGAATGACTTTGGATGGTGAGATTGGAAAGACACTTATTCAAAACCACTCCCACTGAATAATGTTCTTTTGAGTAGATTCagatttactttttattttttccttgcCTGGATAATTTTAAAAAGTTTCAAGACAGGTCTATAATTTTTGTTGATATGAAGAACATAATAAACATTGTGCTACACGGGTACTGAAATTGTGCATTGTATTGCATCTCCTCAGATATTCATGAAATGTGTCTAGTTCATGTCAACTGTGTAACTTTCTCATGTGCAAAAGAGAAAAAGTTGACCAGAGAGGGCACTGCAAGTCTACTCATAGCAAACCCTTCAGTGACACAATTTCCTTAACTTCTCTTATCATAAAGCAATGGTATGACTGCTTTAAAACAGTTCTTTGACACTGTTAGAAGGGGTCTGTTGAGTGAATTGGGGTAAACATAAGTTGGCACTGCGCATTGTAAATGATAACGCTAACGATCTGCTCCTATCCGCCCTCTTTGTCATTGTAATAATGGTATAATTGTATGCATCGCTGTAATATTTGATAGTGATTTGGCTCATCACTATTGTATTTTTGCAGCGTAACCGGTCTCACACAGTCATCTCAATGTGAAAATGATCCCAAGTGCAGTGTCGTTTTGCTCTTTAGTGTTAAACCATCATGGTGGTGCAAAAGTATTTTGACTCTGAACCTACATTTAAAGTCTAcattacactgtaaaaaaagtaaagttatttttggtttttatttttacattagtTTCTTTTTGTAGCGTGCTAATACACagaaatttaatttatacaaaATAACTATTTTCAATACATTTGGACCTACTGGTCATTAACCACAGACACTGTATTACTGTGCTAAAGTCTGGACTGACAACCAGCcatgtttttacttttgtaaTAATCATCTCTTTGTCCATACAATGTTATGTATGGCCTTATAATAAAGGTTTAACTTTTTCATGAACCATTA

Function

symbol description
znf706 Orthologous to human ZNF706 (zinc finger protein 706).

NR:

description
PREDICTED: zinc finger protein 706 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU93160 False 1827 TUCP 0.39 3 184922 191605
XM_039805288.1 False 1950 mRNA 0.39 3 185532 191697
XM_039805289.1 False 1769 mRNA 0.39 4 185530 191697
XM_039805290.1 True 1987 mRNA 0.39 3 184854 191697

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562227 ncalda,ncald,LOC100692199,LOC105901278,LOC103042493,LOC106931336,LOC108268956 coding upstream 31358 38304 ~ 153496 (+)
LOC120561946 LOC100691663,LOC105016475,LOC101481383,LOC101163516 coding downstream 10428 202125 ~ 219066 (+)
pabpc1a pabpc1,LOC106534504,LOC101481678,LOC103364803,LOC107103981,LOC102792184 coding downstream 40774 232471 ~ 240042 (+)
LOC120562125 rnf19a,LOC106907582 coding downstream 60333 252030 ~ 295445 (+)
fbxo43 NA coding downstream 129147 320844 ~ 326479 (+)
LOC120562123 NA coding downstream 135159 326856 ~ 345140 (+)
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G69552 NA non-coding downstream 57324 249021 ~ 249274 (+)
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LOC120562683 NA non-coding downstream 581967 773664 ~ 777916 (+)
G69647 NA non-coding downstream 607510 799207 ~ 799407 (+)
G69701 NA other downstream 865537 1057234 ~ 1065287 (+)
iqcg NA other downstream 1106755 1298452 ~ 1308801 (+)
G70115 NA other downstream 2521740 2713437 ~ 2715401 (+)
ube3d ube3d,LOC102787972 other downstream 3141271 3332968 ~ 3367934 (+)
ibtk ibtk,LOC102788528 other downstream 3249809 3441506 ~ 3475311 (+)

Expression


Co-expression Network