G70460



Basic Information


Item Value
gene id G70460
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 3874445 ~ 3893927 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU94327
AATAATAAAGATACAAGGATATTTGATGTAAACAAACCAGTATTGCACATAGCTCAGGCACATAACAAGTGTCAATTGCTTTAAAGCATTAGCTTATTTCTATGAACAATGCACAGGCTAAATAAAGCTCTACTcccaggaaagaaaaaaaaaaaatagatacacTTCTTCACAAAACTAACAGTGAACTCACATTAACTTTGGCTGAAGATTTCTTTTTGAACAATAAGTCAAACTGTTGAATTTCCAAACCCATCAAAAACAGAAACTAACAAATCAATCTTTGACTTAAAAATTTCATAACGTaaagaactttttttaaacacaacacCTAGGGACACCACAGGACAATGATAACACAACCATCTAACCAGATGATCAGTTTATACATGTAAatgataaatacataaataacccCCTTCATAAATAATCCCATTCATGTCACCATTTTGCTTCAATTCATGGTAACTGTACAGTGCAAAAGTAAGTGTTGGACCCAAAATAACTGCATTGATATCAagtgttaaaaagaaacaaTCTCACAAGTACAAATGCTTAAGTGCTTTTAGTTCAAGGTTAGGCGTGCGCATGCGGGGTGGAAGCATTTAAGCATTCGGCATGCGAGAAACGTGACGAAGAGAGTGCAATCCCATGATGCAACAGCCCCTGATAAGAGCAGCAATGTTGTACACTGGAGCGCTTCCGTCCACACCGTGCCGCGAGTACAGCCAGGCCACAGTGGGTAGCACAGGCGCTGCCACTGCGACAAGATCCACCAGGAAGCTGTTGCTCCAGTAACGCTTGCCGGCCACATCCAGTCCCGGCGACAGACAAGGTTCCTCCTCACCGACACtaaaatccagctcctccatGAACCGCCGGCTCTCTGCAGGTTCCGAACAGCACGTGCCAGAATCTGTGGACGTGTCGGGGCTCTCTGGGGGAGCAGGACTGGGCATGctgggtggggggggtgttGGGTCAGGGAGGTTGGAAGCGAAGTTGGGCAAGTTTGGGAGACCCAGAAGACTGCTGCAGGTTGACAGCGCCGTGTCCCCCACGGTTGCCTCGTGGAACTTGAGCAGCTGGAGGAGCAGAGCCTGCAAGTCTGGGGACAGGGGCATTATGTCGGTCTGGATTCCTTTATCTTCTGCGTTCTGCTGGGAATGTGTGCTCGAGGAGAGGGCCATGGTGGTGTAAACGTTGTTTGGTAGAGGTGCAGTGGATTCGTCAATCAACTGTCCCTCTGACAGCGTGGACACCTCAGGCCCAGACTCTGTCCCTGAACCCAGCTTGCCGCTAGAGTCCTGACTATAATCCACTGCAGTGGACATGAAGACCTGCTCCAAAATGTCCGCTCTGTTGGCCATCTCATCATTGACCAGCAGCCCGCTGTCCGCCATCGCCTCCGCCCCTTGGGTTCCCAGCTCCATCacgccctcctcctccccaaCCACCATCTTCTTCCCACCGTTATCGGGGCTGTCACAGATGAAGTCCAAGGTGTTTTCGTCTGGGAGGTTGGAGCCACTCTGGGCCAGCTCCATGCTTTGCAGCAGGGACTCCAACTTCCTGTTTTGAATGTTGATGTCAATGAAATACTTCTGTATTCCCTTATCCTTCTCCATCAGGCTGCTCTTCATCGTTTCCACCACCTGACGCAGCTGCTTGATCTCTTTGCGAGCCTCTTTGAGGGACAGCTGAGCCTCCACCCGGTGACACTCCTCTTCAATCCAGTCTTCCCTCATCCTGCCAAGCTGGGTCTTAAGCTCCTCCACCTCTGTCTCTCTGTCATGAACCGTGTTCTCTGCCTCCATCAGTTTGCTCTTCAGGTGTCTGATGGTCACTTCCTTCTGCTGGAGAGGGGTGAGATACTGCTCTGGGTTCGGGGCTCTGATGCCATGGTTGTCTCCACAGGAGTGGTAGCGCCCCAGGCTCGCTCTTCTGGTGGTGGGGCTGgagttgcagctgctgctgttggttGAGGAGGCAGCTGTGGGCGGAGTCCTGTAGGGAGCGTAGAGCTCTGCATCGCGGTTGGCTGTAGGGCTCCCAGCTGGTTTGAACACTGGGAGCGGTCTGATGTGGGTGCTGCGACTTGATAAAAGAAAGCGGGGGAAAATTGACATCTTAGTGCATGAACACTCCTGTTTTAGTGTGGTTTAATTTATGCCTTAATCTAGTGGTGAACCCAGCAGATACCGATGATACAGTATGAACCTCAtacccagtggtggaatgtaactaagtacatttactcaagtactgttcttaagtacaaatttgaggtacttgaacTTACTTAAATCTtctcttcatgccactttctacttctactccactacatttcagagagaaatattgtactttttactccactacattaatttgacagctttagttaccatttactttacaaattacatttgcacataaaaacatgtaatttataaaatatgatgctttATTATAAATTGAACTACCGAACAATATAATGGCCTAAAACCCAGCTGAAATTATTAGATGATTAAACGCACAACTGTTGGATCCTCTGCACTTTCTGAAATGGGAAGATTATTCTGcatcgagtacttttactttcaatacttttgagtacattttcctgatgatacggacacttttacttaaagtgatggttcggagtaatttcaccctagggtcctttgcaccatgacctcgagccaaacaccccccca
>TU94330
GTCCCATTCCACTCACTCTTAGTGGCTGctgttcagaaaaaaaaaaaaaaaagctatagtcTCACTTGAAGCCTCAACATTCAGCCTAACATGAACAcaccttttttctctctccatcgtCACAGTTTCCCTTTGTTTATACTAGCCTCTCCTTTAATAAGCACCATTTAACATATCGGTCTGTTACGATCATGTGCAGAATAAAGCAGAACTATCAGGTTACAGTTTCTGTAGGCAAGACTTCCATCAAGTCTCcctgatgaggaggagggggggggggataagcACTAACATTCTCGTACAACACTTTTTGGACCAGCTACTCCCCATGATCTATACCCTTTCTTAGATTAATGGGATTTTGAAGAGCAGGACATAGAGATAAACCACTTACAAATGCATTACCACTCCAGAATTAGCTGATAACATCCGGCCATTATGAGTAAAACAAGCTGCTCAAATGTCACAAGACAGTGTGTATAAAAGGCCTCGGCACAGAACATCTCATTGTGTGTTCTTCATTAGTAAAGATGAAATTTAAAGCCATACCTGAGTAGCATCTTTTGCCATCAAACAAAATCATATTACCGTGTGCAGTGAAGACTGTGACAAAcaaaattgttcaaaacatcAGTGATCCTCCACCACTATGTGAGTCAACTGATGATCTGTGCACATTCAATCAGTGTATACCAACCTCCTGCTAATCAGCCTAATTGGCTAAGCTCCCAAACCTTTCCTCTAACCAATCAGCCTTCATCTTGACTCATGATCAGGCAGtattttttctcctttctcaGATTAAAAGTAGGGGGAAGATTTCAGGATAAAGACTGTAGTGTGCTGTTCCTAAAATATATGTTAAGAAAGCACACATGTGCAGATGGCAATTCACTCTGGTTAATATTCTCCATATAGGCAAGCAGCTGCTTCCCAGCCAGTGTTTGTTCAAGTCAACATGCCAGGGAATCTGCTAGTTGCTGACATTTAAAAGACTTGGTCTTTGGGGAACCACTGGCATGCAgaagtatataaatatatgtatgcAGTGTGCTGTGTTTAAGTCTGTGcatgtaaaaaactaaaacaagttgatcaacacacacaaatcagaTTATTTTAACACATTATAGGATCCATTCATGATAGTGCAGACCTGAGATGAAGATTTCCAatttgtatctgtatctgtgtattCTTCTTTACCTCTGGATTTCATGGCTGACCTCAGCTCCCTCTTGTTCCTCGGGGCGCTCCGTGGTTCGCCGCTCCACTCGGCCATCATCCTCACCCTCTTCACTTTGGTCTTGCGCTCGGGGAGTATGGGCGAGCCGTGGGCACTCTGCTCTGAGCCTGGCGGGGTTTTGGAGGGGGACACAGACTGACTAGTGGGGCAGCCGGTGTCATCTATTGtagacaggcacacagacagtaaTAGCCAAGAACAGGCAGCGTGGTGGCAGGCAGCGAACACAGGCAGTCAATCAGAGCTCAAGGTCTAGCCTGGCTGCTATCTGACAGCTTTCACAATGGCTACTCACTCTCAGAaaatacacagtacacacatgtacacatactGTAGCCTGCATGCACACAGCGTGCATGTGTAGTCCTTTTGTttcatttgttctgttttttaagtggatcacatcactccagttctgaagtctttgcACTGGCTCACTGTCCCTCAAAAGCACTAAACGGTTtggggccaaaatacatttctgttctgctgctacactatgacccacccagacctctcaggtggtccgAGACAGGGCTGCTTTTTGTCCcaagagtcagaactaaacagggggaagcagcgttcagtttttatgctccacatatctggaacaaactctcagaaaactgcaggtctgctgcaactctcagttctttcaaatcaaggctgaagacctttctttttgatgttgccttactttaaataattgtccatttcttatactgcactgtaacttttattctcgtattttatctgttttaatattttttaatgtttttaactgctcttcaatgatttatgtaaagcactttaaaggggtgatagaatgcaaaaccgatttgaccttgtcatagttaaaaaaaaaacagtttggagggtaaataggacatacatagaacctcaaaatcccattgacacctctttcctctgcaaatctcacaatttgaaactgctgctgaaaacgggcgaatctcaacaaagctaaaagttgacgtcaactcctcaactcctagtctttgtcacgccctaacatttgcataggctacaccactgacctgaggtcagcttagtcttctgaatctagctaggtcacgcagatctccaGAGGTCCGCTAtttaattactaaattcacttctgagacttttttatgcgagaaatcaactatgtagaggtcaaatatgggccgttttacgaaagttgatggctaattgcaaattttgtgtgtcgcagttcagcaggagctcagcaggctaacgtgacagcggccggtgctgcctcgccacccGGCGTGTCCTCATTCATAGACCCCAGCTCGCTGTGAGCTAAATGGATCTCAGTCACGACCGGAAGCCCGCGGTGCTCCATACacacgcaaagtcaccgtttctgggttactgaaCTACTAAATGCAAAGGCCCTGacggagctccagggcctgcagctagcCGTGACctttacccataggattgaagggacaccagcagctaacgaaaccccaaaaattcacaaaaatgcattaaattgaaaacggacacaagcgttagctttgtaaaaccttagggtagctgttttataagtggcgtgacgaaattcaaactgtaaatatattatagttatgccaaaagtgtagctagctagctagctagcctcgaTCTTTAgctacccataggattgaatagacactagcagctaacgaaacccctcctattcccaaaaatgcattaaattgaaattggacacaagctttagctttgtaagaccttaatGTAGCTGTTCTATaacggtaggtttccacacagcgaaatttcgctttgctctcattgaggttgaatggagacgaaattcgccctgattgagcgagacgagagcgaatcgccgaggggagcgaaataaagttgacgaaagtttaactttattcaaatgaggaccacttgagaaccaatcaggtcctcgtgtttgtgtttggaggcgggagttacaaaaaaagtctgaccaaGATGGCAGAGGTCATCAGCGCCGTATCATGAaaattttgatgtgattaaaatgtttctacacgaacatcggtacttctatcaacacaaattgtgttttatatgacacacaaacttaattagggcacatacaccactaaatagatcactgtatatgttagtttaaacactcgaacttttcagctagccgaaaggctaatcgctagcatgttcggacattggatttcattgtagcctagccaggtagctagctagctaggctacttttgattttgattacatgttttattggcaaacattgacgcttgtagcaacacggattgttgtttatatgtcacacgaacttaaacagggcaaacacacaccaccaaatagaccactggagatagtttaaacactcaaaatgattcagctagccgacaggtcacccgctagcatgttcggacattgcatttcattgtaagcatagcaaggcagctaggctacatagccaggttaccagagcatttatgagctaacattttaccgatggtttgctgctgtgcatttttaccgccctgtcttctgacagcccgggacatttaaaaaactgTTACGGTCTTGCGTGTTGTTTTCGCGACCACGCCCCCCGAGGCAAACTTTTGCTGGCCGAAATTTGCGAggtgtttcgctgtgtggaaccctaccgtaagtggcgtgacgaaattcaaactgtaaatatattatagttatgccgaaagtgtagctagctagctagctagcctcgaTCTTTAgctacccataggattgaatggacagtagcagctaacgaaacccctcctattcacaaaaatgcattaaatttaaatctgacacaagcgttagctttgtaagaccttagggtagctgttatataagtggcgtgacgaaatttaaactgtaaatatattatagttatgccggcagcagGCCAGCTCCGTGGAGCCCCGCGCCCTGGTTGTCCAGTagctaacccagaaacggtgactttctcCTGGGTATGGAGCGCAGCGGGGCTGCCGCTGTctcatcagactgtgtggaccTCCTGAAATCCAACacatcttaccaaatttgcaattagccatacattttcataaaacagcccatatttgagctttatattgTTGATTTCTCacctaaaaaagtctcagaagtgaatttagtaacgaaacattgcagtgtctgaaatatgagacctgctgtcaagtctccaatgtgtttctatgtggttcgctcaaaccaatcagcgcgcagctcatctaaatattcatgttcaaaccatatttggaagaaaagctcttgttactgTAGCagtatagaaataaagttgtctTGTTGCGCCTGCTGACCACTAGGGCGGCAGTGTATAAGTGCGGCCTTCCTTCTCGCGCTCCCACTGCTGCATCATTTCCGGGTcaggtgtctgtctgtgcagagCAGCGACCGAGTGCTCCGTGTGGCGTTCTCCATttttatttcctggttctcTTGAGCGGTGGTAGATGTCTGCTGTCGTGTgggtctttctctccctccctctcgctGTGCAGGTTTGACTTTGAAAACAGGGAATGCTCATCAGCTGGCCGAAGTCTACCGGTGGTGATTGATGTGATTCCACCACCAGCTGATTGGGGCCGCTGCTGTTTTGTCTCCACTGCTAAATGCTGCTTGGTCTGCCTTTGTCTCCACTGCTAAATGCTGCTAATTGTACAGCTTTCTCTGCTGCTGAATGTATAGCTTTGCCTACAGAGCCTTGTCTGCTGCTGTGCCTCGGCTGCTAACTGCACAGCTTTGTTTTTGCCGCGAACTACACAGCGTGTCGCTACTGCTTGGCACTGTTATTGCTGGCTTTTGGTGCGCATGGTGAATTGCCAACACAAGACTTTTAACTTGTTTATTCCTTTAATTTTAATTGACTGAGGGATTAATCATTTAgtttgtattattgtttttttttttaattttattattttgatcaagtaaactgtttttgtttatcttATTGTTTTGGTTAACCTGATTTTGTGAATTATCTCCTGTTTTGTTGTACATTTTTGAGATTAATTTTGTTGTAACCTCCTTTTTGTTTGTCCTTTTCAGTGgctgcaggctggtggtggtgctggTGACGTGGGTGGTGGTGGTTTTCCTTCTCGTGTGCCGTGTTAACTTGGATTTGGTGCTCTCACTTGgctgcaggctggtggtggtgctggTGACGTGGGTGGTGGTGGTTTTCCTTCTCGTGTGCCGTGTTAACTTGGATTTGGTGATCTCACTGTGTGTCTGGgtgaaccctttttttttttctttaatttagttttattagTTCTTCTTCCCCTTCACCTGCCCTTCCCACCAGTAGGCCTCAGCCCCTGATTaggtttctttcctttttcttattTGTGATCAATGCTATATTTTATATCTATACAGTTTTATTGAATAAACTATTTTTGTAATCTGGGAACCACGTGTTTTTGCCCATTGAGTGGAACGAACCTGTGTGCTTTAAAGGTCTTGGGCCTATCCCAAGTGGCGTTGTCGGAAATCTTAAAATCTCAGAGTGTCATCAAACCCATTCGCTTTGCCACattacaaatagggccatattcacagggtagttatgggcccataaaatagcattcgggcaatttcagcccaaccaatgtaacattggttgggctgaaatcTCCcaaccctattaggagaccttaaggaacaatGTGAAATACCCTAAATAATccttctatcacccctttaaattgtcttgttgctgaaatgtgctatacaaataaaactgccttgccttgcaaggtgctgtaggtaggactgtgaagatccaggacttagccaataaagttgaacatcaacaacttctcagtccctcccccctttccgctaaagcccaaaat

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU94327 False 2717 TUCP 0.47 3 3874445 3879617
TU94330 True 6180 lncRNA 0.43 2 3881060 3893927

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ebag9 ebag9 coding upstream 1545 3854146 ~ 3872900 (+)
tent5aa LOC104929946,LOC103354291,LOC100698511,LOC103388593 coding upstream 370557 3499187 ~ 3503888 (+)
prss35 prss35,LOC104949834 coding upstream 705271 3163016 ~ 3169174 (+)
prdm13 prdm13,LOC102783984 coding upstream 1027499 2840205 ~ 2846946 (+)
zgc:172323 LOC104953825,LOC100700401,LOC102293068,LOC102783698,LOC101479285,LOC103354301 coding upstream 1040104 2828827 ~ 2834341 (+)
seh1l seh1l coding downstream 569510 4463437 ~ 4472667 (+)
cep192 cep192 coding downstream 580079 4474006 ~ 4571309 (+)
LOC120562920 mc5r,LOC101487483,LOC100693278,LOC102795483 coding downstream 1052431 4946358 ~ 5065673 (+)
LOC120562247 NA coding downstream 1461880 5355807 ~ 5357294 (+)
LOC120561876 NA coding downstream 1918950 5812877 ~ 5814642 (+)
G70440 NA non-coding upstream 90277 3783831 ~ 3784168 (+)
G70403 NA non-coding upstream 257176 3617063 ~ 3617269 (+)
LOC120561652 NA non-coding upstream 394371 3478539 ~ 3480074 (+)
LOC120561650 NA non-coding upstream 439383 3427224 ~ 3435062 (+)
G70310 NA non-coding upstream 458496 3415457 ~ 3415949 (+)
G70466 NA non-coding downstream 32765 3926692 ~ 3927045 (+)
LOC120561653 NA non-coding downstream 144004 4037931 ~ 4039348 (+)
G70495 NA non-coding downstream 186990 4080917 ~ 4081209 (+)
G70496 NA non-coding downstream 190793 4084720 ~ 4090069 (+)
G70503 NA non-coding downstream 201521 4095448 ~ 4095658 (+)
LOC120561654 NA other upstream 238615 3634973 ~ 3635830 (+)
LOC120561848 NA other upstream 246764 3625938 ~ 3627681 (+)
G70338 NA other upstream 339383 3533884 ~ 3535062 (+)
ibtk ibtk,LOC102788528 other upstream 399134 3441506 ~ 3475311 (+)
ube3d ube3d,LOC102787972 other upstream 506511 3332968 ~ 3367934 (+)
gdf6a gdf6,gdf6a,LOC104931979,LOC100693017,LOC102300803,LOC101484183,LOC102790179,LOC101068913 other downstream 15349 3909276 ~ 3916418 (+)
trnai-aau_15 NA other downstream 208309 4102236 ~ 4102308 (+)
trnai-aau_16 NA other downstream 209348 4103275 ~ 4103352 (+)
trnar-ucg_9 NA other downstream 209703 4103630 ~ 4103702 (+)
trnai-aau_17 NA other downstream 210388 4104315 ~ 4104388 (+)

Expression



Co-expression Network