G71517


Basic Information

Item Value
gene id G71517
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 9123163 ~ 9125732 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU95620
tattcaacaaagacaagcaatacatcattgtatagtatgaacaacacaagattagatagattaaacattCTTTCccgaggccaggcctgtatgtgatgataaAATTAGGTGacgcatgaatttatatgaatgacatcttttatttaactacttcagtcccagtagtatattgagcactgaccaagcctggtgtaaacatCCATAAGTCAGAAACAAActagtgcagattgcagaaatataaaaacaaatatgtggctttaccacacttaagcctggttcacacgggacgattttaaaattgtcggccgattttccaatcctgagagaccccacacagGGTGATAAAAAATCACaggtctaacagttttggttgtacagtgtgtggtgcgcagcaaaatcaacacatcacacacgaaccgatttgactcccgagcattcccaggtcagacgggaaatctcgcaaaatccctcgagatcaaacgcgacttcagagtaaacaatcattgcggacgaagaggatgcagtggcgatagtttgtagtgtgtttttaaccgaaaagaaacgttatcaaaagaaaaggcgatggtcaaagaagacaacgcgagcatggactatacttgctacatcatgatatggaggtgatttgttttttctcatagaaatgtcgttaggtattacacagattaataaacgttcatatattcgtttccatATACTatggtggactgcagttgtggatgtagttatgcccatcgactttatttattttacacaggctgcgtgctcgtttgtccccgggggacaccacacacgaggagaaatcgggccaaataaatccaacatgttggatatccccgatttgagatGGGAGGGGTCCCGACGGccttccgagcagacgagagcagtcttaacacaccacacacggcaggaatatctgatcagattattttacgataatcggagcatccttaagattgtcgggaggggtgaatatattatatatataattatcctgccgtctgtACCAGGctttagtagtatttagattatttaattatttactgtatatgtaaacatgtggattgcactttttaaacactgtctttgaatttTACTAGACAGTAAGTTAAAAatatagtacacacacacacacacacacacacacacacaactgtatttttttacagcgcacacagaggagctgcctccagcccctccccctggTGAATTTGCGTGCCGTGTGCATAACAGCGTCAAcgttgcacttgctcagagaggctatcgtaaCGTTAGCAATAGCATGCTGCTGctggtcttgccgtgggattaactgtactaataaaaccatTGAAACAAcgcggccacgctgctgtgaaagctccctgaatgtcatttatcagagtctggttgttaccgctctccgcggcagtctcctccgctccatatctttataacggagctagctaaccggagctaaccgatAATCGGAGCTAATCATTGCTAACCGAGCCTtaagttctgcgtgcctgtatccattaactgcacgTACGGACTCGAGCCTGAATAAAACCCTtccttttattaaaatggctgtaaaagttttaaactacaacttaTTGAGTtgttttgaatgacagaaatctgctcaaggtacggcgtagcgttagcgtgccaagttgatgctttctctgcggagtgcaggctgatttgctctcgcgagtcacgtgacatatcgcgatattattgcaaatgcgattaatcgttcagccctaccgctgcgtcaaggagtaaacctctatatatgggcgcccgctctaccaactgtgcTATCTGGGCGgccaaaatgttgttttttaagattattttttgtgggcttttttttttttattattagataGTTTAGATAGATAGGAAAGGgggaggggatgacacgcagcaaagggagGTGGGTTGAATCACCTATAGGCAGATAAAAAAATGATAGAGCGCTTAGTTCATTTGCTGTTTGACTCTGTGTGGTTTCAATCATATACTGGAGCAGAACACAGCAGATCTTTACTCCTTCACTGATCGGCGTCTCGCATTTTGGCTTTTTCACACTCAGCCACGCAACATTTAACTGAGGagtttgtgagtgtttgtgtgtactgaAATGGTTTTAGGCTCCGATGATCCTGTTAAACCAAACCTAAAGGTTACGCTTTGTCAACTTTTTAGAGAACCATTAAAAGCAGCTACTTTTGATGTATAAGTACAGTATGAATGTATAGCGTTGTAAAATGAACAGGCGGCTGCAGATGTCCTGTAATGTGTATTATTGACAGATTAGATCGGTGCCTATTGTTAATGTAACATTGTGCAGATGTAAAACGGAGATGTGTAAATAGGCTAATGGTGTCTATATTGGACTG
>TU95621
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>TU95622
tttttgtttttgtttttttacaccaaTATTGCAATTGCGATTttaatgtgattattttttgagctctttgtcttctgtattattcaacaaagacaagcaatacatcattgtatagtatgaacaacacaagattagatagattaaacattCTTTCccgaggccaggcctgtatgtgatgataaAATTAGGTGacgcatgaatttatatgaatgacatcttttatttaactacttcagtcccagtagtatattgagcactgaccaagcctggtgtaaacatCCATAAGTCAGAAACAAActagtgcagattgcagaaatataaaaacaaatatgtggctttaccacacttaagcctggttcacacgggacgattttaaaattgtcggccgattttccaatcctgagagaccccacacagGGTGATAAAAAATCACaggtctaacagttttggttgtacagtgtgtggtgcgcagcaaaatcaacacatcacacacgaaccgatttgactcccgagcattcccaggtcagacgggaaatctcgcaaaatccctcgagatcaaacgcgacttcagagtaaacaatcattgcggacgaagaggatgcagtggcgatagtttgtagtgtgtttttaaccgaaaagaaacgttatcaaaagaaaaggcgatggtcaaagaagacaacgcgagcatggactatacttgctacatcatgatatggaggtgatttgttttttctcatagaaatgtcgttaggtattacacagattaataaacgttcatatattcgtttccatATACTatggtggactgcagttgtggatgtagttatgcccatcgactttatttattttacacaggctgcgtgctcgtttgtccccgggggacaccacacacgaggagaaatcgggccaaataaatccaacatgttggatatccccgatttgagatGGGAGGGGTCCCGACGGccttccgagcagacgagagcagtcttaacacaccacacacggcaggaatatctgatcagattattttacgataatcggagcatccttaagattgtcgggaggggtgaatatattatatatataattatcctgccgtctgtACCAGGctttagtagtatttagattatttaattatttactgtatatgtaaacatgtggattgcactttttaaacactgtctttgaatttTACTAGACAGTAAGTTAAAAatatagtacacacacacacacacacacacacacacacaactgtatttttttacagcgcacacagaggagctgcctccagcccctccccctggTGAATTTGCGTGCCGTGTGCATAACAGCGTCAAcgttgcacttgctcagagaggctatcgtaaCGTTAGCAATAGCATGCTGCTGctggtcttgccgtgggattaactgtactaataaaaccatTGAAACAAcgcggccacgctgctgtgaaagctccctgaatgtcatttatcagagtctggttgttaccgctctccgcggcagtctcctccgctccatatctttataacggagctagctaaccggagctaaccgatAATCGGAGCTAATCATTGCTAACCGAGCCTtaagttctgcgtgcctgtatccattaactgcacgTACGGACTCGAGCCTGAATAAAACCCTtccttttattaaaatggctgtaaaagttttaaactacaacttaTTGAGTtgttttgaatgacagaaatctgctcaaggtacggcgtagcgttagcgtgccaagttgatgctttctctgcggagtgcaggctgatttgctctcgcgagtcacgtgacatatcgcgatattattgcaaatgcgattaatcgttcagccctaccgctgcgtcaaggagtaaacctctatatatgggcgcccgctctaccaactgtgcTATCTGGGCGgccaaaatgttgttttttaagattattttttgtgggcttttttttttttattattagataGTTTAGATAGATAGGAAAGGgggaggggatgacacgcagcaaagggagGTGGGTTGAATCACCTATAGGCAGATAAAAAAATGATAGAGCGCTTAGTTCATTTGCTGTTTGACTCTGTGTGGTTTCAATCATATACTGGAGCAGAACACAGCAGATCTTTACTCCTTCACTGATCGGCGTCTCGCATTTTGGCTTTTTCACACTCAGCCACGCAACATTTAACTGAGGagtttgtgagtgtttgtgtgtactgaAATGGTTTTAGGCTCCGATGATCCTGTTAAACCAAACCTAAAGGTTACGCTTTGTCAACTTTTTAGAGAACCATTAAAAGCAGCTACTTTTGATGTATAAGTACAGTATGAATGTATAGCGTTGTAAAATGAACAGGCGGCTGCAGATGTCCTGTAATGTGTATTATTGACAGATTAGATCGGTGCCTATTGTTAATGTAACATTGTGCAGATGTAAAACGGAGATGTGTAAATAGGCTAATGGTGTCTATATTGGACTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU95620 False 2411 lncRNA 0.42 1 9123322 9125732
TU95621 True 2570 lncRNA 0.42 1 9123163 9125732
TU95622 False 2491 lncRNA 0.41 1 9123242 9125732

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
popdc3 popdc3 coding upstream 76 9115711 ~ 9123087 (+)
LOC120562991 LOC103388880 coding upstream 21661 9088184 ~ 9101502 (+)
LOC120562241 NA coding upstream 618711 8454764 ~ 8504452 (+)
pomgnt2 pomgnt2 coding upstream 738543 8364356 ~ 8384620 (+)
zgc:114181 LOC104932954,LOC102799802,LOC101469313 coding upstream 924302 8187287 ~ 8198861 (+)
bves bves coding downstream 2118 9127850 ~ 9144754 (+)
hace1 hace1 coding downstream 21883 9147615 ~ 9190089 (+)
ascc3 ascc3 coding downstream 881543 10007275 ~ 10200405 (+)
sim1a sim1,LOC103355653,LOC103388874,LOC102313558 coding downstream 1089761 10215493 ~ 10241076 (+)
LOC120562586 LOC104935658,LOC103355652,LOC101471248 coding downstream 1202432 10328164 ~ 10357777 (+)
G71475 NA non-coding upstream 354099 8768688 ~ 8769064 (+)
G71476 NA non-coding upstream 357029 8765894 ~ 8766134 (+)
G71463 NA non-coding upstream 379373 8743528 ~ 8743790 (+)
LOC120561615 NA non-coding upstream 475454 8646964 ~ 8647709 (+)
G71429 NA non-coding upstream 502824 8594033 ~ 8620339 (+)
G71553 NA non-coding downstream 194720 9320452 ~ 9320696 (+)
G71554 NA non-coding downstream 198085 9323817 ~ 9324017 (+)
G71557 NA non-coding downstream 245272 9371004 ~ 9371948 (+)
G71562 NA non-coding downstream 329643 9455375 ~ 9455641 (+)
G71591 NA non-coding downstream 702862 9828594 ~ 9829307 (+)
trnay-gua_42 NA other upstream 273443 8849632 ~ 8849720 (+)
trnay-gua_41 NA other upstream 273826 8849249 ~ 8849337 (+)
trnay-gua_40 NA other upstream 274592 8848483 ~ 8848571 (+)
trnay-gua_39 NA other upstream 275682 8847392 ~ 8847481 (+)
trnay-gua_38 NA other upstream 276008 8847067 ~ 8847155 (+)
G71610 NA other downstream 1081683 10207415 ~ 10208197 (+)
LOC120561920 LOC106676202,LOC102303534 other downstream 1620276 10746008 ~ 10751849 (+)
LOC120562569 LOC104943359,LOC103359623,LOC101482188,LOC107100615,LOC106961743 other downstream 1659922 10785654 ~ 10961130 (+)
G71743 NA other downstream 1694563 10820295 ~ 10821500 (+)
depdc1b depdc1b,LOC103388656,LOC101486657 other downstream 2341613 11467345 ~ 11482423 (+)

Expression


Co-expression Network