proser3



Basic Information


Item Value
gene id proser3
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 18819201 ~ 18828688 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU98220
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>TU98221
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>TU98224
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>XM_039805436.1
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Function


NR:

description
proline and serine-rich protein 3-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU98220 False 2013 lncRNA 0.40 2 18826582 18828688
TU98221 False 1932 lncRNA 0.40 3 18826582 18828688
TU98224 False 1900 lncRNA 0.40 4 18826582 18828688
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XM_039805437.1 False 3209 mRNA 0.46 13 18819201 18826624

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562037 NA coding upstream 6829 18809356 ~ 18812372 (+)
LOC120562797 ctrl coding upstream 10787 18806002 ~ 18808414 (+)
hsc70 LOC103359601,LOC103478507,LOC104932369,LOC106945881,LOC102237422,LOC106517696 coding upstream 13902 18800355 ~ 18805299 (+)
si:dkey-238d18.4 LOC104961375,LOC103359602 coding upstream 19750 18790625 ~ 18799451 (+)
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zmp:0000001114 NA coding downstream 105542 18934230 ~ 18956037 (+)
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G73493 NA non-coding downstream 43686 18872374 ~ 18873957 (+)
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LOC120562824 NA other upstream 72526 18744662 ~ 18746675 (+)
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LOC120562807 NA other upstream 357875 18455574 ~ 18461326 (+)
kmt2bb kmt2b other downstream 4557 18833245 ~ 18861958 (+)
G73570 LOC103371659 other downstream 319925 19148613 ~ 19158995 (+)
hcst LOC104925504,LOC104961397 other downstream 361332 19190020 ~ 19192102 (+)
si:ch211-254p10.2 LOC102209663,LOC101158134,LOC102295699,LOC101064473 other downstream 618479 19447167 ~ 19453283 (+)
G73779 hdac9 other downstream 818287 19646975 ~ 19649511 (+)

Expression



Co-expression Network