tlr18 (LOC103362575)


Basic Information

Item Value
gene id tlr18
gene name LOC103362575
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 33263730 ~ 33278517 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039804734.1
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>XM_039804735.1
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aaagaggaacaataaagcgctgtcagcgatagattta

Function

NR:

description
toll-like receptor 2 type-2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039804734.1 True 5154 mRNA 0.44 4 33263730 33278517
XM_039804735.1 False 5037 mRNA 0.43 4 33270436 33278517

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-113g11.6 LOC103362574,LOC103388694,LOC108243248 coding upstream 2813 33206707 ~ 33260917 (+)
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onecutl LOC106524064,LOC104923936,LOC108243192 coding upstream 167592 33087190 ~ 33096138 (+)
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LOC120562446 NA coding upstream 313020 32947311 ~ 32950710 (+)
s100a1 s100a1,LOC105028680,LOC106605324,LOC107587912,LOC107689908,LOC107663298,LOC107598020,LOC108272706,LOC108441918 coding downstream 4530 33283047 ~ 33286346 (+)
prdm1a prdm1,LOC103362578,LOC100706221 coding downstream 194655 33473172 ~ 33489674 (+)
dctn3 dctn3,LOC102785116 coding downstream 278734 33557251 ~ 33566277 (+)
nt5c3a nt5c3a coding downstream 327329 33605846 ~ 33628945 (+)
trnap-agg_3 NA coding downstream 347414 33625931 ~ 33626002 (+)
G77894 LOC103369035,LOC103362570 non-coding upstream 132857 33115275 ~ 33130873 (+)
G77903 NA non-coding upstream 151665 33111426 ~ 33112065 (+)
G77900 NA non-coding upstream 157159 33106209 ~ 33106571 (+)
G77899 NA non-coding upstream 158097 33101903 ~ 33105633 (+)
G77895 NA non-coding upstream 164182 33097628 ~ 33099548 (+)
G77986 NA non-coding downstream 17734 33296251 ~ 33299542 (+)
G77991 NA non-coding downstream 46087 33324604 ~ 33325020 (+)
G77993 NA non-coding downstream 181505 33460022 ~ 33460235 (+)
G78001 NA non-coding downstream 214907 33493424 ~ 33493660 (+)
G78002 NA non-coding downstream 237192 33515709 ~ 33518515 (+)
G77888 NA other upstream 162196 33100413 ~ 33101534 (+)
LOC120561717 NA other upstream 842258 32405133 ~ 32421472 (+)
G77682 tbx20 other upstream 1283821 31976318 ~ 31979909 (+)
G77447 NA other upstream 2127584 31134829 ~ 31136146 (+)
rab5ab rab5a,LOC104947906,LOC103388351,LOC105936747,LOC100704868,LOC101078239,LOC104931780 other upstream 2532121 30687338 ~ 30731609 (+)
bmper bmper other downstream 547570 33826087 ~ 33879132 (+)
LOC120562157 NA other downstream 615843 33894360 ~ 33904285 (+)
sh3bp5b sh3bp5,LOC102783023 other downstream 712025 33990542 ~ 34042648 (+)
G78200 NA other downstream 1250838 34529355 ~ 34544379 (+)
LOC120562567 NA other downstream 1560640 34839157 ~ 34856532 (+)

Expression


Co-expression Network