zyx (zyx,LOC102794270)



Basic Information


Item Value
gene id zyx
gene name zyx,LOC102794270
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 23719861 ~ 23736431 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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Function


symbol description
zyx Predicted to enable metal ion binding activity. Predicted to be involved in integrin-mediated signaling pathway and transforming growth factor beta receptor signaling pathway. Predicted to be active in cytoplasm; focal adhesion; and stress fiber. Orthologous to human ZYX (zyxin).

NR:

description
zyxin-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06273 ZYX; zyxin

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G75227 NA non-coding upstream 278635 23437096 ~ 23441226 (+)
G75199 LOC103372680 non-coding upstream 365686 23351145 ~ 23354175 (+)
G75197 NA non-coding upstream 369094 23346840 ~ 23350767 (+)
G75427 NA non-coding downstream 146746 23883177 ~ 23884631 (+)
G75483 ptpn6 non-coding downstream 207062 23943493 ~ 23948403 (+)
G75493 NA non-coding downstream 235896 23972327 ~ 23975734 (+)
G75517 NA non-coding downstream 291452 24027883 ~ 24031339 (+)
G75523 tpi1,tpi,LOC102304959 non-coding downstream 312494 24048925 ~ 24052956 (+)
casp2 casp2,LOC102795506,LOC103369458 other upstream 68365 23641555 ~ 23651496 (+)
trpv6 LOC104929027,LOC104960406,LOC103388006,LOC107082237 other upstream 148618 23560848 ~ 23571243 (+)
LOC120562612 LOC103367657,LOC105025867,LOC103136704 other upstream 225827 23491125 ~ 23494034 (+)
LOC120562293 LOC103360151,LOC102310947,LOC102785150 other upstream 636714 23070587 ~ 23083147 (+)
cnot3a cnot3 other upstream 808341 22900089 ~ 22911520 (+)
LOC120563204 NA other downstream 31802 23768233 ~ 23813408 (+)
LOC120563047 vamp1,LOC104928996 other downstream 137478 23873909 ~ 23879415 (+)
atn1 atn1 other downstream 290484 24026915 ~ 24039427 (+)
lpcat3 lpcat3 other downstream 320006 24056437 ~ 24073698 (+)
G75644 NA other downstream 698708 24435139 ~ 24436819 (+)

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