LOC120562388



Basic Information


Item Value
gene id LOC120562388
gene name NA
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 41220084 ~ 41294381 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>XM_039806101.1
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039806101.1 True 4488 mRNA 0.46 21 41220084 41294381
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XM_039806103.1 False 4041 mRNA 0.46 19 41220084 41294381

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562391 NA coding upstream 45238 41163743 ~ 41174846 (+)
LOC120562397 NA coding upstream 70082 41147864 ~ 41150002 (+)
LOC120562401 NA coding upstream 116301 41102048 ~ 41103783 (+)
LOC120562402 NA coding upstream 312248 40907328 ~ 40907836 (+)
LOC120562405 NA coding upstream 383006 40830512 ~ 40837078 (+)
LOC120562404 NA coding downstream 205804 41500185 ~ 41501659 (+)
LOC120562396 NA coding downstream 246709 41541090 ~ 41545594 (+)
LOC120562406 NA coding downstream 256710 41551091 ~ 41576503 (+)
LOC120561585 NA coding downstream 433185 41727566 ~ 41850702 (+)
LOC120562755 NA coding downstream 1233115 42527496 ~ 42529482 (+)
LOC120562412 NA non-coding upstream 83910 41135950 ~ 41136174 (+)
G80265 NA non-coding upstream 112358 41068184 ~ 41107726 (+)
LOC120562408 NA non-coding upstream 128170 41091477 ~ 41091914 (+)
G80280 LOC100709493,LOC102203400,LOC102799186,LOC102289534,LOC101466554,LOC103358480 non-coding upstream 174692 41044777 ~ 41045392 (+)
LOC120562417 NA non-coding upstream 238457 40979110 ~ 40981627 (+)
G80306 NA non-coding downstream 19330 41313711 ~ 41347897 (+)
G80318 NA non-coding downstream 54201 41348582 ~ 41402166 (+)
G80321 txnip,LOC102791564,LOC102307684,LOC101475238,LOC102207340 non-coding downstream 66078 41360459 ~ 41362553 (+)
G80322 NA non-coding downstream 68298 41362679 ~ 41363468 (+)
G80323 NA non-coding downstream 69157 41363538 ~ 41364714 (+)
polr3glb NA other upstream 33139 41156474 ~ 41186945 (+)
LOC120562400 NA other upstream 207465 41007967 ~ 41012619 (+)
LOC120562387 NA other upstream 563517 40645659 ~ 40656567 (+)
LOC120562499 LOC103374404 other upstream 778768 40378682 ~ 40441316 (+)
LOC120562498 LOC103369894 other upstream 875024 40290982 ~ 40345060 (+)
G80320 NA other downstream 62099 41356480 ~ 41360206 (+)
LOC120562389 NA other downstream 83066 41377447 ~ 41393226 (+)
G80337 NA other downstream 126975 41421356 ~ 41456358 (+)
LOC120561589 NA other downstream 388032 41682413 ~ 41693005 (+)
G80410 NA other downstream 645117 41939498 ~ 42006594 (+)

Expression



Co-expression Network