LOC120562763 (LOC106675675,LOC106675676)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120562763
gene name LOC106675675,LOC106675676
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 42825598 ~ 42831659 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039806652.1
GTCCACACTTCACAAGGAAGAGCTGAGAGGTGTAGTGTGTTACAACACGCAGCACGTGCACTAAACTGGGAAAGATCCTGACGATCATCAACAGCCCCTAGTGCAGATCAACTAACGCTACCCTTCTTACTTACTTAAAAAAGAATGATGACTCCATCTGTGGTCTTTGTCTTGCTGGCTGTTCTAGGACAGACCAGTGCCAAATTTGATCCTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGTGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTTAGGTAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTCAGGAAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGACTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCGTCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACGATAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGGACAGTATAATATGAAACTGATTCTAACCCTAAAACCCTTATTTCTTAGTTTATTTTCACTTATTCTAACGCTAGTCTATGCAATTTTGCCTATTTAGTGTGTTTTTGCTTCGCacacagatattttaagtaAGACACTTTGTATTACATATCATCAGGTCAGGACAATCGTATGCTGAAGCTTTATGTAAAACTGATACATATGGTTGTTTTATACATTAGCTAACATAAAATAAAGGCTATTGTTCAAATTTAAATAGAGAACAAAAGAGATACAGCTCTAGTAACTGATTATACCTACTACCTACTATATGCCATGAAAGCGGCGAGAGATGCATTATTAAAAAGAACTGTGGGAAAAATAAAGGTGAGAAATGATATACAGTGCACTGACTGCATTGTATTTGTTGTAATTTTTCTTGGGCTTGCTTCTATCTACTGTACTTATATACTTGCAAAATAAACATTGCTTTTAAagctaa
>XM_039806653.1
ACTTCACAAGGAAGAGCTGAGAGGTGTAGTGTGTTACAACACGCAGCACGTGCACTAAACTGGGAAAGATCCTGACGATCATCAACAGCCCCTAGTGCAGATCAACTAACGCTACCCTTCTTACTAATGATGACTCCATCTGTGGTCTTTGTCTTGCTGGCTGTTCTAGGACAGACCAGTGCCAAATTTGATCCTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGTGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTTAGGTAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTCAGGAAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGACTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCGTCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACGATAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGGACAGTATAATATGAAACTGATTCTAACCCTAAAACCCTTATTTCTTAGTTTATTTTCACTTATTCTAACGCTAGTCTATGCAATTTTGCCTATTTAGTGTGTTTTTGCTTCGCacacagatattttaagtaAGACACTTTGTATTACATATCATCAGGTCAGGACAATCGTATGCTGAAGCTTTATGTAAAACTGATACATATGGTTGTTTTATACATTAGCTAACATAAAATAAAGGCTATTGTTCAAATTTAAATAGAGAACAAAAGAGATACAGCTCTAGTAACTGATTATACCTACTACCTACTATATGCCATGAAAGCGGCGAGAGATGCATTATTAAAAAGAACTGTGGGAAAAATAAAGGTGAGAAATGATATACAGTGCACTGACTGCATTGTATTTGTTGTAATTTTTCTTGGGCTTGCTTCTATCTACTGTACTTATATACTTGCAAAATAAACATTGCTTTTAAagctaa
>XM_039806654.1
GTCCACACTTCACAAGGAAGAGCTGAGAGGTGTAGTGTGTTACAACACGCAGCACGTGCACTAAACTGGGAAAGATCCTGACGATCATCAACAGCCCCTAGTGCAGATCAACTAACGCTACCCTTCTTACTTACTTAAAAAAGAATGATGACTCCATCTGTGGTCTTTGTCTTGCTGGCTGTTCTAGGACAGACCAGTGCCAAATTTGATCCTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGTGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTTAGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTCAGGAAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGACTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCGTCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACGATAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGGACAGTATAATATGAAACTGATTCTAACCCTAAAACCCTTATTTCTTAGTTTATTTTCACTTATTCTAACGCTAGTCTATGCAATTTTGCCTATTTAGTGTGTTTTTGCTTCGCacacagatattttaagtaAGACACTTTGTATTACATATCATCAGGTCAGGACAATCGTATGCTGAAGCTTTATGTAAAACTGATACATATGGTTGTTTTATACATTAGCTAACATAAAATAAAGGCTATTGTTCAAATTTAAATAGAGAACAAAAGAGATACAGCTCTAGTAACTGATTATACCTACTACCTACTATATGCCATGAAAGCGGCGAGAGATGCATTATTAAAAAGAACTGTGGGAAAAATAAAGGTGAGAAATGATATACAGTGCACTGACTGCATTGTATTTGTTGTAATTTTTCTTGGGCTTGCTTCTATCTACTGTACTTATATACTTGCAAAATAAACATTGCTTTTAAagctaa
>XM_039806655.1
GTCCACACTTCACAAGGAAGAGCTGAGAGGTGTAGTGTGTTACAACACGCAGCACGTGCACTAAACTGGGAAAGATCCTGACGATCATCAACAGCCCCTAGTGCAGATCAACTAACGCTACCCTTCTTACTTACTTAAAAAAGAATGATGACTCCATCTGTGGTCTTTGTCTTGCTGGCTGTTCTAGGACAGACCAGTGCCAAATTTGATCCTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGTGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTTAGGTAACACTGCTCCAACTGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGATTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCATCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACAGTAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGTCTGGCTTCAGATACTAATATTGCCAGAGGTGGAAACGTGACTCAGTCCTCCCAGTATTTGAATGCCGTCCCTGAAAGGGCCATTGATGGAAATCGTGCTAGCGACTGGGCACAGGGATCCTGTACCCACACTAACAATGCTATAAATCCATGGTGGAGACTGGACCTCCTAAAGACATATCAGATCAACACAGTCACCATCACCAACAGAGGAGATTGTTGCCACGAAAGAATTAATGGTGCTGAGATCCGCATTGGAAATTCCCTCAGTGACAATGGCAACGATAACCCCAGatgTGCTGTTATCTCATCTATCGCAGCTGGGACCTCCCAAACCTTTGTGTGTAATGGAATGGAAGGTCGTTATATCAACATTGTGATTCCTGGAAGACAAGAAACCCTGACACTGTGCGAGGTGGAAGTCACTGGGACAGTATAATATGAAACTGATTCTAACCCTAAAACCCTTATTTCTTAGTTTATTTTCACTTATTCTAACGCTAGTCTATGCAATTTTGCCTATTTAGTGTGTTTTTGCTTCGCacacagatattttaagtaAGACACTTTGTATTACATATCATCAGGTCAGGACAATCGTATGCTGAAGCTTTATGTAAAACTGATACATATGGTTGTTTTATACATTAGCTAACATAAAATAAAGGCTATTGTTCAAATTTAAATAGAGAACAAAAGAGATACAGCTCTAGTAACTGATTATACCTACTACCTACTATATGCCATGAAAGCGGCGAGAGATGCATTATTAAAAAGAACTGTGGGAAAAATAAAGGTGAGAAATGATATACAGTGCACTGACTGCATTGTATTTGTTGTAATTTTTCTTGGGCTTGCTTCTATCTACTGTACTTATATACTTGCAAAATAAACATTGCTTTTAAagctaa

Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC106675675

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039806652.1 True 2002 mRNA 0.43 9 42825598 42831659
XM_039806653.1 False 1984 mRNA 0.43 8 42825604 42831659
XM_039806654.1 False 1984 mRNA 0.43 9 42825598 42831659
XM_039806655.1 False 1984 mRNA 0.43 9 42825598 42831659

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120562761 LOC104963449 coding upstream 25002 42787709 ~ 42800596 (+)
LOC120562762 LOC104963449 coding upstream 56934 42764403 ~ 42768664 (+)
LOC120562768 NA coding upstream 159595 42663518 ~ 42666003 (+)
LOC120562755 NA coding upstream 296116 42527496 ~ 42529482 (+)
LOC120561585 NA coding upstream 974896 41727566 ~ 41850702 (+)
LOC120562760 LOC103358480 coding downstream 75357 42907016 ~ 42912785 (+)
LOC120562780 NA non-coding upstream 45075 42778955 ~ 42780523 (+)
G80713 NA non-coding upstream 54879 42675937 ~ 42770719 (+)
G80719 NA non-coding upstream 66972 42740826 ~ 42758626 (+)
G80717 NA non-coding upstream 81945 42696625 ~ 42743653 (+)
LOC120562769 NA non-coding upstream 104744 42719416 ~ 42720854 (+)
LOC120562781 NA non-coding downstream 10916 42842575 ~ 42845934 (+)
G80732 NA non-coding downstream 18938 42850597 ~ 42955526 (+)
LOC120562773 NA non-coding downstream 24778 42856437 ~ 42863102 (+)
G80737 NA non-coding downstream 44127 42875786 ~ 42876732 (+)
LOC120562779 NA non-coding downstream 55436 42887095 ~ 42888441 (+)
LOC120562772 NA other upstream 39193 42783495 ~ 42786405 (+)
LOC120562767 NA other upstream 181608 42632407 ~ 42643990 (+)
LOC120562757 LOC104947480 other upstream 285997 42532924 ~ 42539601 (+)
G80682 NA other upstream 339589 42485335 ~ 42486009 (+)
G80410 NA other upstream 819004 41939498 ~ 42006594 (+)

Expression


Co-expression Network