LOC120563008


Basic Information

Item Value
gene id LOC120563008
gene name NA
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053118.1
NCBI id CM020915.1
chromosome length 43092710
location 39425328 ~ 39427120 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039807012.1
aactccccaaatcccagaaaaaggtgattttttcataatatgggctcGGACCCAACATGTCAGGGACTGTGGAAGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGCAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTGTGTGTAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTCTGTGCAGGGTGGGATCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCAGCAGGAAGGGTCTGAAGgtttatttaaaggtgccctgccacacaaaaccgtttctCCTTGTATATTTTGAGATATGTCAGCtccatatgtgtgtttgtgttatgtggtgaatgtgtaaataaactgcta
>XM_039807013.1
aactccccaaatcccagaaaaaggtgattttttcataatatgggctcGGACCCAACATGTCAGGGACTGTGGAAGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGCAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTGTGTGTAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCAGCAGGAAGGGTCTGAAGgtttatttaaaggtgccctgccacacaaaaccgtttctCCTTGTATATTTTGAGATATGTCAGCtccatatgtgtgtttgtgttatgtggtgaatgtgtaaataaactgcta
>XM_039807014.1
aactccccaaatcccagaaaaaggtgattttttcataatatgggctcGGACCCAACATGTCAGGGACTGTGGAAGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGCAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATATCAGGGTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGTTCTGTGGAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGGAGGCCTGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGGAGGCTCGGACCCAACATGTCAGGGTGTGTGTAGGCTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTCTGTGCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTCTGTGCAGGGTGGGATCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCATGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCCAGGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGTCAAGGTGGGACCCAACATGCAGCAGGAAGGGTCTGAAGgtttatttaaaggtgccctgccacacaaaaccgtttctCCTTGTATATTTTGAGATATGTCAGCtccatatgtgtgtttgtgttatgtggtgaatgtgtaaataaactgcta

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039807012.1 True 1762 mRNA 0.57 2 39425328 39427120
XM_039807013.1 False 1511 mRNA 0.57 2 39425328 39427120
XM_039807014.1 False 1542 mRNA 0.57 2 39425328 39427120

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120563011 syt11,LOC102778393 coding upstream 5655 39391948 ~ 39419673 (+)
LOC120562489 NA coding upstream 146825 39265833 ~ 39278503 (+)
LOC120563022 NA coding upstream 394494 39020810 ~ 39030834 (+)
LOC120563021 NA coding upstream 415752 38995153 ~ 39009576 (+)
plin6 NA coding upstream 522068 38884290 ~ 38903260 (+)
LOC120562494 LOC108250191,LOC103388058,LOC101480860,LOC107095276 coding downstream 354116 39781236 ~ 39803887 (+)
LOC120562359 NA coding downstream 384735 39811855 ~ 39828704 (+)
LOC120562496 LOC103369586 coding downstream 497205 39924325 ~ 39979365 (+)
LOC120562361 LOC103369586 coding downstream 655910 40083030 ~ 40093260 (+)
si:dkey-15h8.17 NA coding downstream 684313 40111433 ~ 40113823 (+)
G79573 NA non-coding upstream 430 39382036 ~ 39424898 (+)
G79714 NA non-coding upstream 26041 39398655 ~ 39399287 (+)
LOC120563028 NA non-coding upstream 37121 39385546 ~ 39388207 (+)
G79710 NA non-coding upstream 43661 39380288 ~ 39381667 (+)
LOC120563033 NA non-coding upstream 64642 39359474 ~ 39360686 (+)
G79717 NA non-coding downstream 5193 39432313 ~ 39433121 (+)
LOC120563031 LOC107095265,LOC103369586 non-coding downstream 48655 39475775 ~ 39479389 (+)
LOC120563029 NA non-coding downstream 57831 39484951 ~ 39485980 (+)
LOC120563030 NA non-coding downstream 72226 39499346 ~ 39501137 (+)
G79903 NA non-coding downstream 131988 39559108 ~ 39575672 (+)
LOC120563015 NA other upstream 78896 39312639 ~ 39346432 (+)
LOC120563019 NA other upstream 93812 39321432 ~ 39331516 (+)
dcst2 NA other upstream 119241 39302039 ~ 39306087 (+)
cpne4a cpne4,LOC107379031,LOC103372348,LOC102220834,LOC108412597 other upstream 644968 38676736 ~ 38780360 (+)
G79615 NA other upstream 714319 38691646 ~ 38711009 (+)
G79713 NA other downstream 6341 39433461 ~ 39454292 (+)
G79722 LOC100712425 other downstream 33328 39460448 ~ 39463841 (+)
LOC120562364 LOC108234077 other downstream 338053 39765173 ~ 39771420 (+)
LOC120562498 LOC103369894 other downstream 863862 40290982 ~ 40345060 (+)
G80003 NA other downstream 889619 40316739 ~ 40321067 (+)

Expression


Co-expression Network