LOC120563856


Basic Information

Item Value
gene id LOC120563856
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053119.1
NCBI id CM020916.1
chromosome length 42187026
location 23198572 ~ 23224641 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU117844
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>XR_005640017.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU117844 True 4748 lncRNA 0.41 5 23198588 23224641
XR_005640017.1 False 4673 lncRNA 0.44 3 23198572 23217138

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pparab LOC104921011,LOC103371465 coding downstream 7141 23161150 ~ 23191431 (-)
yars2 yars2,LOC102786810 coding downstream 41604 23150719 ~ 23156968 (-)
cdkn1bb cdkn1b coding downstream 50269 23144257 ~ 23148303 (-)
mrps35 mrps35,LOC102787710 coding downstream 255096 22934142 ~ 22943476 (-)
adck2 adck2 coding downstream 354809 22837978 ~ 22843763 (-)
fbln1 fbln1,LOC104955511,LOC103380317 coding upstream 151940 23376581 ~ 23407669 (-)
ppm1h ppm1h coding upstream 279156 23503797 ~ 23537525 (-)
avpr1aa LOC103358863,LOC100711102 coding upstream 327212 23551853 ~ 23556076 (-)
LOC120563353 NA coding upstream 352937 23577578 ~ 23584567 (-)
LOC120563807 NA coding upstream 422740 23647381 ~ 23650377 (-)
G87464 NA non-coding downstream 49228 23149119 ~ 23149344 (-)
G87400 NA non-coding downstream 360706 22761185 ~ 22837866 (-)
LOC120563633 NA non-coding downstream 516296 22577017 ~ 22682276 (-)
G87329 appl2 non-coding downstream 808356 22387995 ~ 22390216 (-)
G87320 nuak1 non-coding downstream 843376 22287944 ~ 22355196 (-)
G87469 NA non-coding upstream 6597 23231238 ~ 23238532 (-)
G87596 ankrd26 non-coding upstream 405085 23629726 ~ 23630285 (-)
G87614 bmt2 non-coding upstream 456107 23680748 ~ 23737505 (-)
G87695 NA non-coding upstream 813243 24037884 ~ 24039901 (-)
G87693 NA non-coding upstream 817817 24042458 ~ 24043739 (-)
parvg parvg other downstream 492276 22689161 ~ 22706296 (-)
LOC120564428 NA other downstream 831594 22347170 ~ 22366978 (-)
LOC120564778 LOC103358851,LOC101480430,LOC100706913,LOC102797593 other downstream 1459228 21735006 ~ 21739344 (-)
G87140 NA other downstream 1485018 21713042 ~ 21713554 (-)
dnajb9a dnajb9,LOC100706374,LOC102775779,LOC102215328 other downstream 1826063 21369531 ~ 21372509 (-)
LOC120564579 LOC103366737 other upstream 186869 23411510 ~ 23422457 (-)
G87538 NA other upstream 269689 23494330 ~ 23498659 (-)
G87624 LOC103358853,LOC104921025 other upstream 514341 23738982 ~ 23741190 (-)
LOC120563922 NA other upstream 684528 23909169 ~ 23916202 (-)
G87803 NA other upstream 1840111 25064752 ~ 25065488 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_023776 NA non-coding NC_007136.7 CM002909.2 2189964 ~ 2190062 (+)
bowfin (Amia calva) G112802 NA non-coding CM030134.1 CM030134.1 22257550 ~ 22258386 (+)