LOC120563607 (celf2,LOC104940643)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120563607
gene name celf2,LOC104940643
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053119.1
NCBI id CM020916.1
chromosome length 42187026
location 21026854 ~ 21059534 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039807883.1
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Function

symbol description
celf2 Predicted to enable mRNA 3'-UTR binding activity. Predicted to be involved in mRNA splice site selection and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to act upstream of or within mRNA processing. Predicted to be part of ribonucleoprotein complex. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Is expressed in immature eye; musculature system; nervous system; and neural tube. Orthologous to human CELF2 (CUGBP Elav-like family member 2).

NR:

description
PREDICTED: CUGBP Elav-like family member 2 isoform X5

GO: NA

KEGG:

id description
K13207 CUGBP, BRUNOL, CELF; CUG-BP- and ETR3-like factor

RNA

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Neighbor

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slc35b4 slc35b4,LOC102781124 coding upstream 100817 21160351 ~ 21165666 (-)
G86853 NA non-coding downstream 118264 20908389 ~ 20908590 (-)
G86761 NA non-coding downstream 327217 20698815 ~ 20699637 (-)
G86686 NA non-coding downstream 565031 20402744 ~ 20461823 (-)
G86660 NA non-coding downstream 762648 20250890 ~ 20264206 (-)
G86652 reln non-coding downstream 785004 20241433 ~ 20241850 (-)
G86976 NA non-coding upstream 43096 21102630 ~ 21103379 (-)
LOC120563411 NA non-coding upstream 80973 21140507 ~ 21146513 (-)
G87030 LOC103366871,LOC104946806,LOC106525492,LOC108230167 non-coding upstream 185476 21245010 ~ 21251759 (-)
G87107 nrcam,LOC101067328 non-coding upstream 403171 21462705 ~ 21466246 (-)
G87120 NA non-coding upstream 426998 21486532 ~ 21512528 (-)
LOC120563850 NA other downstream 139228 20877668 ~ 20887626 (-)
LOC120564033 LOC103358331,LOC102195670 other downstream 197619 20806882 ~ 20829235 (-)
G86638 NA other downstream 767595 20252639 ~ 20259259 (-)
cep152 cep152,LOC104960117 other downstream 1453166 19557452 ~ 19573688 (-)
G86402 LOC103363837 other downstream 1638279 19387822 ~ 19388575 (-)
dnajb9a dnajb9,LOC100706374,LOC102775779,LOC102215328 other upstream 309997 21369531 ~ 21372509 (-)
G87140 NA other upstream 653508 21713042 ~ 21713554 (-)
LOC120564778 LOC103358851,LOC101480430,LOC100706913,LOC102797593 other upstream 675472 21735006 ~ 21739344 (-)
LOC120564428 NA other upstream 1287636 22347170 ~ 22366978 (-)
parvg parvg other upstream 1629627 22689161 ~ 22706296 (-)

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