G91842


Basic Information

Item Value
gene id G91842
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 257904 ~ 342692 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU123584
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtccgtgtgttagtgtgtgtgtgttagtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctttgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU123586
gtgtgtgtgtctatatgtgagagtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtgtctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtccgtgtgttagtgtgtgtgtgttagtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatgtgtgtgtgtgggtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgataaaagAA
>TU123587
ctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctg
>TU123588
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtccgtgtgttagtgtgtgtgtgttagtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctttgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtg
>TU123589
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtgtctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtccgtgtgttagtgtgtgtgtgttagtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgt
>TU123591
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtctgtccgtgtgttagtgtgtgtgtgttagtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctttgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgt
>TU123592
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtttgtgtgcgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtgtgtgtgctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtttgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctg
>TU123593
gtgtgtgtgtctatatgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtttgtgtgcgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtgtgtgtgctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtttgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgt
>TU123595
gcCGAATCAAATATTTAAAAGGTCACGATTCATCTCGTAGCCGATTGGCTCGTttccaggcttaaaactctttatttAAGCATTAAATTAAACGTCAACGGACATGTTGAACGGGAGGAAAAAAACCACTTATGGAACCAGAGACGTTCAAAGAGAGCCGGGCGCTCGATGCCGAGCTGGAGCGTTTGGGGATGTTTAAAGTCAGCGGGAGATTGCGCGAGCTTGTGGCGGCCCGCtggtcccgggacagtcatcatggtgacacaaacatgcagcggtggaagaagtattcagatccttcactAAGTATTCAGTAttattaagtaaaagtactaataacacactgtaaaaatactctgttaaagtcctgcattgatgtgtgtgtgtctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtttctgtgtctgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtttgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtctgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU123584 False 835 lncRNA 0.47 3 273138 322857
TU123586 False 556 lncRNA 0.48 3 257904 274268
TU123587 False 213 lncRNA 0.50 4 313214 342692
TU123588 False 760 lncRNA 0.46 3 273138 322643
TU123589 False 751 lncRNA 0.46 3 273138 318106
TU123591 True 913 lncRNA 0.47 4 273138 322857
TU123592 False 805 TUCP 0.47 3 273138 317968
TU123593 False 391 lncRNA 0.49 3 257904 306121
TU123595 False 719 lncRNA 0.46 4 273138 322857

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565788 LOC100695038,LOC103366337,LOC107380922,LOC107082714,LOC105918713,LOC105028844,LOC106604646,LOC106611650 coding upstream 98447 141925 ~ 159457 (+)
stx6 stx6 coding downstream 441507 784199 ~ 808239 (+)
LOC120565732 NA coding downstream 444010 786702 ~ 787874 (+)
wdr18 wdr18 coding downstream 489549 832241 ~ 854498 (+)
grin3bb grin3b coding downstream 543667 886359 ~ 955236 (+)
med16 med16 coding downstream 640959 983651 ~ 1009213 (+)
G91843 NA non-coding upstream 13063 196596 ~ 244841 (+)
G91840 NA non-coding upstream 105960 151624 ~ 151944 (+)
G91839 NA non-coding upstream 106978 150540 ~ 150926 (+)
G91829 NA non-coding upstream 119347 92274 ~ 138557 (+)
G91866 NA non-coding downstream 21718 364410 ~ 447169 (+)
G91877 NA non-coding downstream 65095 407787 ~ 452499 (+)
G91879 NA non-coding downstream 66763 409455 ~ 410825 (+)
LOC120566002 NA non-coding downstream 110450 453142 ~ 465715 (+)
G91882 NA non-coding downstream 118008 460700 ~ 463115 (+)
G91887 NA other downstream 113017 455709 ~ 566466 (+)
G91897 NA other downstream 198999 541691 ~ 542909 (+)
G91903 bmpr1a other downstream 238115 580807 ~ 593877 (+)
G92019 NA other downstream 379681 722373 ~ 758976 (+)
G92146 NA other downstream 826129 1168821 ~ 1170046 (+)

Expression


Co-expression Network