G92022 (LOC104936604,LOC103369104)



Basic Information


Item Value
gene id G92022
gene name LOC104936604,LOC103369104
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 765454 ~ 768674 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU123865
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>TU123866
AGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACAGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAAGACTAAACtacattcattattaataaCTGAACGCTGCAGAAACAGAGACTGTTATATTATATCATTCCCTCTCACCTGAACCTCTGCGCCTGGTGGTGGACGGGGCCTCCGAAGCGCCGTGATTGGCCGTGGTACATCTGTGACATCATCTGGGAGTTTCGGGCCTGATTGGGGTTGGCAGCGAACTTGACTGTGATTGGCTCGGAGCAACCGGGGGGCGTGTGCCCGTTCAGGTGTTTGACGGCGTCTTCGGCCTCCGACCTCTTGTCGAAACGGATGAAGGCCACGCCCCTGGACAGACCTGTCGGCCAATCAGAGCACAGTTGAGCAGGGCAGTAATGCTGcatggggttagggttaaaggGGTTTAAAGAAGGGGGTTAAAGGGAGTGTATCAGGCCTGTGATTGGTCAGTTACCTGAGGCCTGGTATTGTGTGTAGGGTGTATCAGGCCTGTGACTGGTCAGTTACCTGAGGCATGGTGTCATGTGTAGGGTGTATCAgggctgtgattggtcagttaCCTGAGGCCTGGTCCACCAGCACTCTGGAGTTGATGATGTGTCCGAAGCGAGTGAACATGTCCTCCAGGTCGGGCTGACTCAGCGTGCGCGGCAGCCCGCTGATGTACAGGTTAGCATCTTTAATCGTGTCCGAACTCGGCCGCGCGAAGGAAACCTGGCgtcaggaaacaggaagtggatcATTCTCTCGCCTTCACACGCACAACTCAGACACGAAGAATCAAcactcaacaaaataaaacagttacagccagtttttaaagaaaatcattttaaatatgtctttaaaatattcaatgaataaaaaaaaaataaaacatttatccAGATTTCTcccaaataaaatataaacaaaaagacaaaaataaaagcatccaaaaaaggCTCAGATCATTTGGCACTTTTGTTCAAATAAAAGCATAaatttatgaaaagaaaagctCGGCACTTAGTCTCACTGAACTGAATAAAACCACAGATTCAGAGCGAACACGTGTCGATTCATAACAAACATGACATCAGAGAAATACCTGGGTGGCGTCTGCTGGGACACAAACATCTATCAGACAGGAAAGGCAGAGAGCAGCTGTTGCACATTACCTTGATAGTTTTAGACTGTAGCCTCAGGCCATTGAGGGTACTGATAGCCCTCTCTGCATCACTAGGGTTAACAAAGTTAACAAAGCCGTAACCTAAACTGTGGCCTAGAGAAACAcaaaggaaaacaacaaaataaaagaagaaaactgTGTGTTACAGCCGCCACACATAAACAAAACTCTCCATAACATCACATTATTCTGAACAGACCCAGAGAACACACCACCACTTCCTTTCTTCGGTTATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTAGTCAGAGTCAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGtcagagtgagagtgagacTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGTGTATATAGTCAGAGTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTAtatattagggttgggcatcgagaacagattcctacttggaatcgtttcaaaaataaCGATTCCATCGGATAGTTTCTTTATTGGATtcatttggaggatttggtttataatctgatcatgggttccaaatttaaagtgatggttcggagtaatttcaccctagggtcctttgcaccatgacctcga
>TU123869
AGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACAGATGTCTCACTGTAACAGACTAAACTACAGACGGATGTCTCACTGTAAGACTAAACtacattcattattaataaCTGAACGCTGCAGAAACAGAGACTGTTATATTATATCATTCCCTCTCACCTGAACCTCTGCGCCTGGTGGTGGACGGGGCCTCCGAAGCGCCGTGATTGGCCGTGGTACATCTGTGACATCATCTGGGAGTTTCGGGCCTGATTGGGGTTGGCAGCGAACTTGACTGTGATTGGCTCGGAGCAACCGGGGGGCGTGTGCCCGTTCAGGTGTTTGACGGCGTCTTCGGCCTCCGACCTCTTGTCGAAACGGATGAAGGCCACGCCCCTGGACAGACCTGTCGGCCAATCAGAGCACAGTTGAGCAGGGCAGTAATGCTGcatggggttagggttaaaggGGTTTAAAGAAGGGGGTTAAAGGGAGTGTATCAGGCCTGTGATTGGTCAGTTACCTGAGGCCTGGTATTGTGTGTAGGGTGTATCAGGCCTGTGACTGGTCAGTTACCTGAGGCATGGTGTCATGTGTAGGGTGTATCAgggctgtgattggtcagttaCCTGAGGCCTGGTCCACCAGCACTCTGGAGTTGATGATGTGTCCGAAGCGAGTGAACATGTCCTCCAGGTCGGGCTGACTCAGCGTGCGCGGCAGCCCGCTGATGTACAGGTTAGCATCTTTAATCGTGTCCGAACTCGGCCGCGCGAAGGAAACCTGGCgtcaggaaacaggaagtggatcATTCTCTCGCCTTCACACGCACAACTCAGACACGAAGAATCAAcactcaacaaaataaaacagttacagccagtttttaaagaaaatcattttaaatatgtctttaaaatattcaatgaataaaaaaaaaataaaacatttatccAGATTTCTcccaaataaaatataaacaaaaagacaaaaataaaagcatccaaaaaaggCTCAGATCATTTGGCACTTTTGTTCAAATAAAAGCATAaatttatgaaaagaaaagctCGGCACTTAGTCTCACTGAACTGAATAAAACCACAGATTCAGAGCGAACACGTGTCGATTCATAACAAACATGACATCAGAGAAATACCTGGGTGGCGTCTGCTGGGACACAAACATCTATCAGACAGGAAAGGCAGAGAGCAGCTGTTGCACATTACCTTGATAGTTTTAGACTGTAGCCTCAGGCCATTGAGGGTACTGATAGCCCTCTCTGCATCACTAGGGTTAACAAAGTTAACAAAGCCGTAACCTAAACTGTGGCCTAGAGAAACAcaaaggaaaacaacaaaataaaagaagaaaactgTGTGTTACAGCCGCCACACATAAACAAAACTCTCCATAACATCACATTATTCTGAACAGACCCAGAGAACACACCACCACTTCCTTTCTTCGGTTATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTCAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGtcagagtgagagtgagacTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTCAGAGTGTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTATGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTATATAGTCAGAGTGAGACTTTGTAtatattagggttgggcatcgagaacagattcctacttggaatcgtttcaaaaataaCGATTCCATCGGATAGTTTCTTTATTGGATtcatttggaggatttggtttataatctgatcatgggttccaaatttaaagtgatggttcggagtaatttcaccctagggtcctttgcaccatgacctcga

Function


NR:

description
PREDICTED: ELAV-like protein 1 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU123865 False 2612 lncRNA 0.41 3 765454 768674
TU123866 False 3085 lncRNA 0.41 3 765454 768674
TU123869 True 3101 lncRNA 0.41 2 765454 768674

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565788 LOC100695038,LOC103366337,LOC107380922,LOC107082714,LOC105918713,LOC105028844,LOC106604646,LOC106611650 coding upstream 605997 141925 ~ 159457 (+)
stx6 stx6 coding downstream 15525 784199 ~ 808239 (+)
LOC120565732 NA coding downstream 18028 786702 ~ 787874 (+)
wdr18 wdr18 coding downstream 63567 832241 ~ 854498 (+)
grin3bb grin3b coding downstream 117685 886359 ~ 955236 (+)
med16 med16 coding downstream 214977 983651 ~ 1009213 (+)
G92015 NA non-coding upstream 70704 694433 ~ 694750 (+)
G92013 NA non-coding upstream 80402 684735 ~ 685052 (+)
G91901 NA non-coding upstream 206641 557869 ~ 558813 (+)
G91900 NA non-coding upstream 207984 555301 ~ 557470 (+)
G91899 NA non-coding upstream 211827 552383 ~ 553627 (+)
G92027 NA non-coding downstream 47908 816582 ~ 818325 (+)
G92029 NA non-coding downstream 55900 824574 ~ 826046 (+)
G92062 NA non-coding downstream 91799 860473 ~ 860703 (+)
G92066 NA non-coding downstream 131547 900221 ~ 984045 (+)
G92093 NA non-coding downstream 196094 964768 ~ 965650 (+)
G92019 NA other upstream 6478 722373 ~ 758976 (+)
G91903 bmpr1a other upstream 171577 580807 ~ 593877 (+)
G91887 NA other upstream 198988 455709 ~ 566466 (+)
G91897 NA other upstream 222545 541691 ~ 542909 (+)
G91827 NA other upstream 341802 83806 ~ 423652 (+)
G92146 NA other downstream 400147 1168821 ~ 1170046 (+)
G92157 NA other downstream 434213 1202887 ~ 1204046 (+)
trmt13 NA other downstream 452136 1220810 ~ 1228679 (+)
G92169 dbt,LOC102778223 other downstream 472713 1241387 ~ 1256194 (+)
LOC120565410 camk4,LOC102194929,LOC102785978 other downstream 695045 1463719 ~ 1535856 (+)

Expression



Co-expression Network