G92594


Basic Information

Item Value
gene id G92594
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 2497787 ~ 2501122 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU124779
agggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagcctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacaggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacaggagagactaacctacactgtgttgtattaacaggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgttgatgcctcgagagaacaaaggaagtgactcagagcttgctgtaaagcagtatctctggccgtatatgtgtatgacatcattgacatttt
>TU124786
agggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagcctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacaggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacgggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacagggagagtctaacctatcagctgtgttgtattaacaggagagactaacctacactgtgttgtattaacaggagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgtattaacagagactaacctatcagctgtgttgttgatgcctcgagagaacaaaggaagtgactcagagcttgctgtaaagcagtatctctggccgtatatgtgtatgacatcattgacatttt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU124779 False 941 lncRNA 0.40 3 2497787 2501122
TU124786 True 1104 lncRNA 0.40 3 2497787 2501122

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565432 NA coding upstream 36190 2450531 ~ 2461597 (+)
LOC120565428 NA coding upstream 70660 2423987 ~ 2427127 (+)
LOC120565427 NA coding upstream 77182 2412231 ~ 2420605 (+)
dph5 dph5,LOC102795811 coding upstream 425884 2050962 ~ 2071903 (+)
LOC120565574 NA coding upstream 503919 1980838 ~ 1993868 (+)
LOC120565421 NA coding downstream 85393 2586515 ~ 2593983 (+)
LOC120565422 NA coding downstream 320520 2821642 ~ 2840859 (+)
LOC120565437 LOC104954941,LOC104939024,LOC103367594,LOC105940182,LOC103463144 coding downstream 344622 2845744 ~ 2859118 (+)
LOC120565438 gadd45b coding downstream 498498 2999620 ~ 3002539 (+)
LOC120565597 sgta coding downstream 716604 3217726 ~ 3574149 (+)
LOC120565450 NA non-coding upstream 5231 2491509 ~ 2492556 (+)
LOC120565445 LOC101882440,LOC101883177 non-coding upstream 16927 2480418 ~ 2480860 (+)
LOC120565447 NA non-coding upstream 57512 2435416 ~ 2440275 (+)
G92577 NA non-coding upstream 61314 2436213 ~ 2436473 (+)
G92305 NA non-coding upstream 106578 2384646 ~ 2391209 (+)
G92595 NA non-coding downstream 5917 2507039 ~ 2518417 (+)
G92603 NA non-coding downstream 50275 2551397 ~ 2551799 (+)
G92578 NA non-coding downstream 77902 2579024 ~ 2579886 (+)
G92611 NA non-coding downstream 87494 2588616 ~ 2589069 (+)
G92695 NA non-coding downstream 225611 2726733 ~ 2727072 (+)
reep6 reep6 other upstream 117527 2371988 ~ 2380260 (+)
G92333 NA other upstream 128115 2365899 ~ 2369672 (+)
G92293 NA other upstream 421683 2072182 ~ 2076104 (+)
LOC120565575 NA other upstream 471856 1988808 ~ 2025931 (+)
LOC120565570 NA other upstream 608700 1867721 ~ 1889087 (+)
G92575 NA other downstream 32622 2533744 ~ 2582371 (+)
G92770 NA other downstream 481104 2982226 ~ 2983014 (+)
G92773 NA other downstream 509552 3010674 ~ 3094410 (+)
G92782 LOC103461136,LOC106954349 other downstream 624767 3125889 ~ 3132204 (+)
G92826 NA other downstream 850645 3351767 ~ 3464206 (+)

Expression


Co-expression Network