G92773


Basic Information

Item Value
gene id G92773
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 3010674 ~ 3094410 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU124986
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgt
>TU124988
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgt
>TU124990
tctgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtct
>TU124992
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgt
>TU124993
gtgtctgtacgtgtggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgttgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtatttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtgt
>TU124994
gtgtctgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgt
>TU124995
gtgtctgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtatttgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtcagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtctgtgtgtgtgtgtgt
>TU124996
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU124997
cgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU124998
cgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgttcggtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU124986 False 224 lncRNA 0.50 3 3055994 3094410
TU124988 True 525 TUCP 0.49 4 3011766 3094410
TU124990 False 219 lncRNA 0.49 3 3065541 3068994
TU124992 False 523 TUCP 0.49 4 3011766 3094410
TU124993 False 406 lncRNA 0.49 4 3012578 3087421
TU124994 False 255 lncRNA 0.49 3 3015653 3094410
TU124995 False 470 lncRNA 0.48 5 3015653 3087421
TU124996 False 161 lncRNA 0.50 3 3012482 3037225
TU124997 False 282 lncRNA 0.47 5 3010674 3037899
TU124998 False 489 TUCP 0.49 2 3010674 3014853

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565438 gadd45b coding upstream 8135 2999620 ~ 3002539 (+)
LOC120565437 LOC104954941,LOC104939024,LOC103367594,LOC105940182,LOC103463144 coding upstream 151556 2845744 ~ 2859118 (+)
LOC120565422 NA coding upstream 169815 2821642 ~ 2840859 (+)
LOC120565421 NA coding upstream 416691 2586515 ~ 2593983 (+)
LOC120565432 NA coding upstream 549077 2450531 ~ 2461597 (+)
LOC120565597 sgta coding downstream 123316 3217726 ~ 3574149 (+)
LOC120565455 patj,LOC104952322 coding downstream 243422 3337832 ~ 3348216 (+)
LOC120566051 NA coding downstream 535774 3630184 ~ 3633365 (+)
LOC120565880 LOC104960898 coding downstream 732453 3826863 ~ 3854810 (+)
LOC120565394 LOC104935534,LOC103395676,LOC104932847,LOC103395770 coding downstream 1037453 4131863 ~ 4132573 (+)
G92779 NA non-coding upstream 2609 3007696 ~ 3008065 (+)
G92747 NA non-coding upstream 144716 2860992 ~ 2865958 (+)
G92740 NA non-coding upstream 169472 2840968 ~ 2841202 (+)
G92722 NA non-coding upstream 210641 2775493 ~ 2800033 (+)
G92713 NA non-coding upstream 249317 2761132 ~ 2761357 (+)
G92799 NA non-coding downstream 12045 3106455 ~ 3186576 (+)
G92802 NA non-coding downstream 14661 3109071 ~ 3150235 (+)
G92788 NA non-coding downstream 41006 3135416 ~ 3136578 (+)
G92786 NA non-coding downstream 71272 3165682 ~ 3172182 (+)
G92827 NA non-coding downstream 267682 3362092 ~ 3421936 (+)
G92770 NA other upstream 27660 2982226 ~ 2983014 (+)
G92575 NA other upstream 428303 2533744 ~ 2582371 (+)
reep6 reep6 other upstream 630414 2371988 ~ 2380260 (+)
G92333 NA other upstream 641002 2365899 ~ 2369672 (+)
G92293 NA other upstream 934570 2072182 ~ 2076104 (+)
G92782 LOC103461136,LOC106954349 other downstream 31479 3125889 ~ 3132204 (+)
G92826 NA other downstream 257357 3351767 ~ 3464206 (+)
G92838 NA other downstream 331324 3425734 ~ 3490621 (+)
LOC120565459 NA other downstream 445624 3540034 ~ 3595388 (+)
G92848 NA other downstream 506568 3600978 ~ 3606825 (+)

Expression


Co-expression Network