G92826


Basic Information

Item Value
gene id G92826
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 3351767 ~ 3464206 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU125085
gtctctctctcatgggggggccaaattctcttgtcagggaaagcagagaaaggggaggtaacctttccccttatgacctcataaggagaagattcctgattggtccatctgagctttcattttctcaaagaccaGTCCCtgcagaaaaacgtgattatgcgatcgcataattcaacaaTTATTACGCATTATCAGCCAAAGTACGCATATTTATGCgaactttggctgattatgcgttgaaccCAAACATTTGtctatataattaataaaattaGGATTTTAAAGGACGATTCCAGCGCAAAATGACCCTACAGGCAGACTGAAGTGCACTTCATGATGATCAGTCTGCATATTTTGTAGTgataaaaatgtgattatgccataattcaacacataatcagccaaagtctgcatatttacaAATACGCCacactttcgctgcataaattgcagattttcgcgcaaaatatgcggcgcttgcatgatttcataacccccgcattttcgttgcaaaaaagtcttagcagaaagttgaaaaatgttgcatttacttcacacaagagcagccattttcatcactttcatcacttatttttctctttttcatcaaacaccagttttttgcaagttcccacaatttcatcgcataaaattgcataaatatcccacatattccatcgcatttttttaagaaaacgtgccacatgatcaaggatttttgccccgcaacaatcgcAAAAAACctgaaaggcagagcaggatacccagggctcggtttacacctatcgccatttctagccactgggggtccatagacaggctgggggaactcatattaatgttaaaaaaacctcataaagtgaaattgtcatgccatgggacctttaaagttagTAGCAGCAGTCTGAGAACAGTCTGGATCCAAAcacatatcaatcaatcaagtgCAAAAATACTTTGTTTGTCATAATTACTGTCTTAATTTTTGGTGCTGTTGTTTTGTAGATGAActattaatttatattttttttgcatcttGCTGGAAATTAAcactgttttcttttccttgttgtttgtttttaattgttaagATGATTGCAGGTATGTTTGTGCCAGTGTCTGAGAAACCTGAGGTTTTGGTTTCGCCTTCACACGCCAAAAACCAGCTGCAGGTTGCACTTTATTTCACATCCTTTCTTCGTCAGCTTCCTCACCAGTTTCCGGGGAATGAAATATGTCATTTGGTATAGGTTACATGCTGCATGGGGATGCACCCaatccaggttttttttttgggttcggccgaataccgaatccactggttaagattctggtGAATCTGAAACCGAATACTGAATCCTCCTCCCATTCAGACCATTAAAGTGTGTGTAGGTCGGATTGGGAGGATCCAGGATGTCCTGTcataacacacacgcacacacacacacacacacacacacagagacacacacacagacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacacagagacacagagagacacacgcacacacacacacagacacaaacacacagagacacacacacacagacacacacagagacacacacacacacacagagacacacacacagagacacacacagacacacacagagacacacacacacagacacacacagagacagagacacacacacacgcacacacacagagacacacatacagatacacacacacacacatatactcatgcagacacacacacacacacacacataaacacacacagacaaacacac
>TU125093
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>TU125097
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>TU125098
acacagacacacacacacagacacacagacacacacagacacacacagacacacacagacacacagacacacacagacacacacacacacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacagacacagacacacacacacagacacacacacacacacacacacacagacacacacacacagacacacacacagacacacagacacacagacacacacacacacacacagacacacacacacacacacaacaacacagacacacacagacacacacacagacacacacacacacagacacacacacacacacacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacacacacacagacacacacacacacacacacacacagaaacacacacagacacacacagacacacacacagacacacagacacagacacacacacacacacagacacacacacacacacagacacacacacacagacacacacacacacagacacacacacagacacacacagacacacacacacaccgaaacagacacacacagacacaaacagacacacacacacacacacacacaacacacacagacacacacacaaacagacacacagacacacacacagacacacacacacacacacacacacagacacacacagacacacacacagacacacacacaaacacacacacagac
>TU125102
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>TU125103
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU125085 False 1796 lncRNA 0.41 3 3351767 3399599
TU125093 False 752 lncRNA 0.49 3 3422320 3464206
TU125097 False 1814 lncRNA 0.42 2 3351767 3353933
TU125098 False 717 lncRNA 0.49 3 3422320 3464206
TU125102 True 1968 TUCP 0.42 3 3351767 3366729
TU125103 False 959 lncRNA 0.49 2 3399543 3464206

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565455 patj,LOC104952322 coding upstream 3551 3337832 ~ 3348216 (+)
LOC120565438 gadd45b coding upstream 349228 2999620 ~ 3002539 (+)
LOC120565437 LOC104954941,LOC104939024,LOC103367594,LOC105940182,LOC103463144 coding upstream 492649 2845744 ~ 2859118 (+)
LOC120565422 NA coding upstream 510908 2821642 ~ 2840859 (+)
LOC120565421 NA coding upstream 757784 2586515 ~ 2593983 (+)
LOC120566051 NA coding downstream 165978 3630184 ~ 3633365 (+)
LOC120565880 LOC104960898 coding downstream 362657 3826863 ~ 3854810 (+)
LOC120565394 LOC104935534,LOC103395676,LOC104932847,LOC103395770 coding downstream 667657 4131863 ~ 4132573 (+)
LOC120565396 LOC108262407,LOC104935308,LOC104932967 coding downstream 677372 4141578 ~ 4142106 (+)
LOC120565404 si:ch73-368j24.3,LOC108247233,LOC102383489,LOC105916187,LOC107569590 coding downstream 682287 4146493 ~ 4151003 (+)
G92799 NA non-coding upstream 165191 3106455 ~ 3186576 (+)
G92786 NA non-coding upstream 179585 3165682 ~ 3172182 (+)
G92784 NA non-coding upstream 188757 3046489 ~ 3163010 (+)
G92802 NA non-coding upstream 201532 3109071 ~ 3150235 (+)
G92788 NA non-coding upstream 215189 3135416 ~ 3136578 (+)
G92857 NA non-coding downstream 10285 3474491 ~ 3477249 (+)
G92863 NA non-coding downstream 18348 3482554 ~ 3485139 (+)
G92862 NA non-coding downstream 19411 3483617 ~ 3485506 (+)
G92845 NA non-coding downstream 32629 3496835 ~ 3563459 (+)
G92847 NA non-coding downstream 100919 3565125 ~ 3584004 (+)
G92782 LOC103461136,LOC106954349 other upstream 219563 3125889 ~ 3132204 (+)
G92773 NA other upstream 257357 3010674 ~ 3094410 (+)
G92770 NA other upstream 368753 2982226 ~ 2983014 (+)
G92575 NA other upstream 769396 2533744 ~ 2582371 (+)
reep6 reep6 other upstream 971507 2371988 ~ 2380260 (+)
LOC120565459 NA other downstream 75828 3540034 ~ 3595388 (+)
G92848 NA other downstream 136772 3600978 ~ 3606825 (+)
frem1b LOC100693369,LOC101486624,LOC102206675,LOC102294239 other downstream 250713 3714919 ~ 3823782 (+)
G93150 NA other downstream 710396 4174602 ~ 4217826 (+)
LOC120565391 NA other downstream 820549 4284755 ~ 4313515 (+)

Expression


Co-expression Network