LOC120565459


Basic Information

Item Value
gene id LOC120565459
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 3540034 ~ 3595388 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU125163
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>TU125164
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>TU125167
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>TU125172
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>TU125173
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>TU125178
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>XR_005640253.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU125163 False 433 lncRNA 0.34 2 3578272 3595388
TU125164 False 3152 TUCP 0.44 3 3557997 3577980
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TU125172 False 1129 lncRNA 0.35 3 3540034 3595388
TU125173 True 4053 lncRNA 0.42 5 3566481 3595388
TU125178 False 412 TUCP 0.45 3 3592105 3593384
XR_005640253.1 False 1216 lncRNA 0.47 3 3575647 3592850

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565455 patj,LOC104952322 coding upstream 191818 3337832 ~ 3348216 (+)
LOC120565438 gadd45b coding upstream 537495 2999620 ~ 3002539 (+)
LOC120565437 LOC104954941,LOC104939024,LOC103367594,LOC105940182,LOC103463144 coding upstream 680916 2845744 ~ 2859118 (+)
LOC120565422 NA coding upstream 699175 2821642 ~ 2840859 (+)
LOC120565421 NA coding upstream 946051 2586515 ~ 2593983 (+)
LOC120566051 NA coding downstream 34796 3630184 ~ 3633365 (+)
LOC120565880 LOC104960898 coding downstream 231475 3826863 ~ 3854810 (+)
LOC120565394 LOC104935534,LOC103395676,LOC104932847,LOC103395770 coding downstream 536475 4131863 ~ 4132573 (+)
LOC120565396 LOC108262407,LOC104935308,LOC104932967 coding downstream 546190 4141578 ~ 4142106 (+)
LOC120565404 si:ch73-368j24.3,LOC108247233,LOC102383489,LOC105916187,LOC107569590 coding downstream 551105 4146493 ~ 4151003 (+)
G92862 NA non-coding upstream 54528 3483617 ~ 3485506 (+)
G92863 NA non-coding upstream 54895 3482554 ~ 3485139 (+)
G92857 NA non-coding upstream 62785 3474491 ~ 3477249 (+)
G92842 NA non-coding upstream 63352 3435937 ~ 3476682 (+)
G92839 NA non-coding upstream 87977 3405063 ~ 3452057 (+)
G92853 NA non-coding downstream 6979 3602367 ~ 3619368 (+)
G92878 NA non-coding downstream 7401 3602789 ~ 3603330 (+)
G92879 NA non-coding downstream 11923 3607311 ~ 3613096 (+)
G92850 NA non-coding downstream 24679 3620067 ~ 3625935 (+)
G92881 NA non-coding downstream 48901 3644289 ~ 3647676 (+)
G92838 NA other upstream 49413 3425734 ~ 3490621 (+)
G92826 NA other upstream 75828 3351767 ~ 3464206 (+)
G92782 LOC103461136,LOC106954349 other upstream 407830 3125889 ~ 3132204 (+)
G92773 NA other upstream 445624 3010674 ~ 3094410 (+)
G92770 NA other upstream 557020 2982226 ~ 2983014 (+)
G92848 NA other downstream 5590 3600978 ~ 3606825 (+)
frem1b LOC100693369,LOC101486624,LOC102206675,LOC102294239 other downstream 119531 3714919 ~ 3823782 (+)
G93150 NA other downstream 579214 4174602 ~ 4217826 (+)
LOC120565391 NA other downstream 689367 4284755 ~ 4313515 (+)
trmt1l trmt1l other downstream 1089836 4685224 ~ 4713233 (+)

Expression


Co-expression Network