G93613


Basic Information

Item Value
gene id G93613
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 6035369 ~ 6051520 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU126313
TccgtaaaaaaacatctttattaATTTCCATGATAAAAGCTAAAGGAACTCATACACGTCAAACTGCAGTATGTCCATGAATCATCGTCACATACACGGTGTACCCTTTTAGTATTTCCCAAGTTACCTCACAGCATTACATCAAATCAACCGTACTGCTGAGGAGACGGCGATTTGGTTTTACCCAATcaattcaacaaagacaagcaCACGTACCACTGAAAACTAAGAATGAAATGAAAGGACaaatatggaggaaaaaaaagttgctTAAAAGTGGGCAGATTGCACTTCTTCAAACTGAAATTTCCAGGACACAAATGGACATCGATTCAGTCAAGACACGGGCTGTAATACTGCCGAATAAGTTGTCCTTCTGACTGACTGCAGATAGGAAATATCTGGTTTTctgaacacacaaaaatacacatataaaaaagaaagaaaaaaaactcaaaccacTCTGCAAATACTGATTGATGCATTGAAACGTGATTCACACACTCAGTTGTTTAGTCGGTACAGTGTTACGTCAGCCGAAAGCCAGAGTGACGTAGGAGACGATGAAGCGTCTCCTCGCAGAAAAACACTCTGCAATCCCCCCCAATTAGCATATATAAGTGGTATATTACCAATTTATAAATATCTATACCACACTAGAATGTAGCTATGAGCAGAAATAAGTGTGTCAGTATGGGTTTGACAATGTCAATAACTGTATATTCTCAATGAAGCATTGGATATCTCATTTTTAATGGAAGCGAAAATAGCAAATATATCGTGACACTGCAGGTACAGTGTCAGTGGTAAACAAGGTTCAAGACCCTAGGGTGGACGTTTCCCTCGTTCCACAATCTGAAGAAGAGCGCTCAACTCTTGTGGCTCAAACTGTCGTAGCCTACAAACatttgggttacactttacttgaaggcatctacataagagtgacatgacacggtcatggacgtgtcataaacattataaacgagtcataaacgtttaggacataacacttcttttagtgtcatttggtttttgtcatgacaagttatggttagagttagggttcatgtgtcatgtcactgttatggagataccttcaagtaaagtgttaaacatttctgtaacattttaaacagaatattagcctggttgacacaagacccttctcagctgtaactgagagtgggtctggggaagcttcattcacagcccatttccaaaggggcgtcaccaacggacgccgctcaaatgcctctgggtacGATTGggtagtccttcaaccaatcagaccaatgttccgggtgacgtagcagcgggttgctggccgtcatgttgaacggaaacaaaaaaaaaaaactgctcgccattgctgcgctatcgtcatcgtgtaaagcgcctcaacggttgtgattggtgcctcgatttggaaaaattgaaaatgggcttgaatgggctcttggccagacagAGCAAATCTCAAGTTTGCCGGAAGTaaatcagggttttcccaggctaccaGAATATATTATACCACCTTACATTTTTGACTCTTGTCAAATGTTTCCACTTTTATTTTGTGGTGTGGTTACGTCTGGGTATCGGTGCTGATGCCGGACTTTCACcactaaacaccaaaacaatacTTTTCCAGCTAGCAACTTTAATACAAACATTTCTAAATTTAACCAAGCAGACCAATTACTGTTTTGTGTATGCAGTTTGTGTAGCTGGGAAAGAACTTTAATTAGAATGAAAATGAActgattttttaaatttaattcagGAGCCAGCTGATCAAATGTATAGAATACATAATAGGGATGTTTCTTCTCGTTTTGTTtgcacttaacccttgtgttgtcctcgggtccagTTTTATTGTATCAGAAATATGAGTTTCTTTCATCCAACTTGCCCAAACATAACTTGGATGCATATGTGCGTTGTATGGAAGCCATACAACGTTCTTCGCAGGTAACATTAATaattacttccattgaattttgggtgttttatttaattttatagcatttcaaAAACTAATTGTAAAaagggttttaaaacagtatacGGACTAAACATATACTAGTATGTGATTGTCTACTCAACATCCTCGGActttaactattagtcaaaataatttataatttcagctttttttttaactaaaaaactaggtataatgtcatttaaatttggTTTGTTTGATGAATAAAacaagtgttgaaaaaagtgacaaggtTTAAAACTGCATCAAAGGCAtactaaaacgttggaaaaagcacacaaaaaaaatatcctTTTCAGTTTAGAcccggaaggacaacaagttaatggtgacgggaagacaacaggagggttaaagcgCCGCTGTAAGAGCAGGCGTACTGTATGAGGGTTTCTAATAGAAGAGGATGTTGAATCGGGGAATATTTTCTCatgtttctctctttcagcCACCATCGAGTTTCCCCTCATGAAAGCTGATCCGAGGCAACTGATCcaagcagtcaacaatagtcaaAACCCACAGGGCTGTTATCAACTCAATATCTAAAACGCTGAAAAATATGCAAACCCTTTTAATTTttatcaaaaaaatatattaggCATGTATAtacattattatttcattatctGTAAACGTTaggctcttaaaaaaaaaaacatgcaccgATCTTGATAAAAGTGGATTTCTAAAATGATAAAATGCAAACTATGAAACTCCTTTAGGATTGATAGatgtaaaataaatagataagtTAAAACATAAGTACAAAATGAACAAAGCACtcagttaaaaaacaacaaacgaAAGGAAGAAAACGGGCTAAATTCTGGCGAGTGTGCCTTTGTGTCATTTGCACCGTAGAATTGATATTCACCAAACCGCGGATCGGCCCACAGTTGTCAcggaaactgaaaaaaaaaaaagctgttgaCAGTCATATACTGTTTCGGTCGTTCAGTCACGTTCAaccaaaacagtttttttagCATCGTCGTTCCTCCTCCAGCTGTTGGACGGATATTGTAGTGCAGTTTGTAGTGTTAATGCCCCCTTTCATTTCAAtataagaaagaaacaaaaatgggGACTCCATTTCCCAGGTATCCTCTGGTACACAAGTTCAACACTTAGGAAAAAAGTCAGTTTTGTAGTTGTGGGTCCCCCGGCTGGATGATCAGTGGTTGTTGGTGGAGAGAGAAGAGTTAAGGCCTGGGCTGgtcgaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctacatctGCTCCACCGGTGCTCCCTCTTCTTTGGGTGGAGGCTCTAAGTGAATGGGAGTAACGCCGGCGGGTTTCTTCACACTGCCCGTGGgacaaagagagggacagacaggaggacagagagtggacaggcagtggtggaaagaTAAGAAAAGGGAAAAATTGTGACATATTTGTGCTGGGGGTTT
>TU126314
TccgtaaaaaaacatctttattaATTTCCATGATAAAAGCTAAAGGAACTCATACACGTCAAACTGCAGTATGTCCATGAATCATCGTCACATACACGGTGTACCCTTTTAGTATTTCCCAAGTTACCTCACAGCATTACATCAAATCAACCGTACTGCTGAGGAGACGGCGATTTGGTTTTACCCAATcaattcaacaaagacaagcaCACGTACCACTGAAAACTAAGAATGAAATGAAAGGACaaatatggaggaaaaaaaagttgctTAAAAGTGGGCAGATTGCACTTCTTCAAACTGAAATTTCCAGGACACAAATGGACATCGATTCAGTCAAGACACGGGCTGTAATACTGCCGAATAAGTTGTCCTTCTGACTGACTGCAGATAGGAAATATCTGGTTTTctgaacacacaaaaatacacatataaaaaagaaagaaaaaaaactcaaaccacTCTGCAAATACTGATTGATGCATTGAAACGTGATTCACACACTCAGTTGTTTAGTCGGTACAGTGTTACGTCAGCCGAAAGCCAGAGTGACGTAGGAGACGATGAAGCGTCTCCTCGCAGAAAAACACTCTGCAATCCCCCCCAATTAGCATATATAAGTGGTATATTACCAATTTATAAATATCTATACCACACTAGAATGTAGCTATGAGCAGAAATAAGTGTGTCAGTATGGGTTTGACAATGTCAATAACTGTATATTCTCAATGAAGCATTGGATATCTCATTTTTAATGGAAGCGAAAATAGCAAATATATCGTGACACTGCAGGTACAGTGTCAGTGGTAAACAAGGTTCAAGACCCTAGGGTGGACGTTTCCCTCGTTCCACAATCTGAAGAAGAGCGCTCAACTCTTGTGGCTCAAACTGTCGTAGCCTACAAACatttgggttacactttacttgaaggcatctacataagagtgacatgacacggtcatggacgtgtcataaacattataaacgagtcataaacgtttaggacataacacttcttttagtgtcatttggtttttgtcatgacaagttatggttagagttagggttcatgtgtcatgtcactgttatggagataccttcaagtaaagtgttaaacatttctgtaacattttaaacagaatattagcctggttgacacaagacccttctcagctgtaactgagagtgggtctggggaagcttcattcacagcccatttccaaaggggcgtcaccaacggacgccgctcaaatgcctctgggtacGATTGggtagtccttcaaccaatcagaccaatgttccgggtgacgtagcagcgggttgctggccgtcatgttgaacggaaacaaaaaaaaaaaactgctcgccattgctgcgctatcgtcatcgtgtaaagcgcctcaacggttgtgattggtgcctcgatttggaaaaattgaaaatgggcttgaatgggctcttggccagacagAGCAAATCTCAAGTTTGCCGGAAGTaaatcagggttttcccaggctaccaGAATATATTATACCACCTTACATTTTTGACTCTTGTCAAATGTTTCCACTTTTATTTTGTGGTGTGGTTACGTCTGGGTATCGGTGCTGATGCCGGACTTTCACcactaaacaccaaaacaatacTTTTCCAGCTAGCAACTTTAATACAAACATTTCTAAATTTAACCAAGCAGACCAATTACTGTTTTGTGTATGCAGTTTGTGTAGCTGGGAAAGAACTTTAATTAGAATGAAAATGAActgattttttaaatttaattcagGAGCCAGCTGATCAAATGTATAGAATACATAATAGGGATGTTTCTTCTCGTTTTGTTtgcacttaacccttgtgttgtcctcgggtccagTTTTATTGTATCAGAAATATGAGTTTCTTTCATCCAACTTGCCCAAACATAACTTGGATGCATATGTGCGTTGTATGGAAGCCATACAACGTTCTTCGCAGGTAACATTAATaattacttccattgaattttgggtgttttatttaattttatagcatttcaaAAACTAATTGTAAAaagggttttaaaacagtatacGGACTAAACATATACTAGTATGTGATTGTCTACTCAACATCCTCGGActttaactattagtcaaaataatttataatttcagctttttttttaactaaaaaactaggtataatgtcatttaaatttggTTTGTTTGATGAATAAAacaagtgttgaaaaaagtgacaaggtTTAAAACTGCATCAAAGGCAtactaaaacgttggaaaaagcacacaaaaaaaatatcctTTTCAGTTTAGAcccggaaggacaacaagttaatggtgacgggaagacaacaggagggttaaagcgCCGCTGTAAGAGCAGGCGTACTGTATGAGGGTTTCTAATAGAAGAGGATGTTGAATCGGGGAATATTTTCTCatgtttctctctttcagcCACCATCGAGTTTCCCCTCATGAAAGCTGATCCGAGGCAACTGATCcaagcagtcaacaatagtcaaAACCCACAGGGCTGTTATCAACTCAATATCTAAAACGCTGAAAAATATGCAAACCCTTTTAATTTttatcaaaaaaatatattaggCATGTATAtacattattatttcattatctGTAAACGTTaggctcttaaaaaaaaaaacatgcaccgATCTTGATAAAAGTGGATTTCTAAAATGATAAAATGCAAACTATGAAACTCCTTTAGGATTGATAGatgtaaaataaatagataagtTAAAACATAAGTACAAAATGAACAAAGCACtcagttaaaaaacaacaaacgaAAGGAAGAAAACGGGCTAAATTCTGGCGAGTGTGCCTTTGTGTCATTTGCACCGTAGAATTGATATTCACCAAACCGCGGATCGGCCCACAGTTGTCAcggaaactgaaaaaaaaaaaagctgttgaCAGTCATATACTGTTTCGGTCGTTCAGTCACGTTCAaccaaaacagtttttttagCATCGTCGTTCCTCCTCCAGCTGTTGGACGGATATTGTAGTGCAGTTTGTAGTGTTAATGCCCCCTTTCATTTCAAtataagaaagaaacaaaaatgggGACTCCATTTCCCAGGTATCCTCTGGTACACAAGTTCAACACTTAGGAAAAAAGTCAGTTTTGTAGTTGTGGGTCCCCCGGCTGGATGATCAGTGGTTGTTGGTGGAGAGAGAAGAGTTAAGGCCTGGGCTGgtcgaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtactgtgtgtgtgt
>TU126315
TccgtaaaaaaacatctttattaATTTCCATGATAAAAGCTAAAGGAACTCATACACGTCAAACTGCAGTATGTCCATGAATCATCGTCACATACACGGTGTACCCTTTTAGTATTTCCCAAGTTACCTCACAGCATTACATCAAATCAACCGTACTGCTGAGGAGACGGCGATTTGGTTTTACCCAATcaattcaacaaagacaagcaCACGTACCACTGAAAACTAAGAATGAAATGAAAGGACaaatatggaggaaaaaaaagttgctTAAAAGTGGGCAGATTGCACTTCTTCAAACTGAAATTTCCAGGACACAAATGGACATCGATTCAGTCAAGACACGGGCTGTAATACTGCCGAATAAGTTGTCCTTCTGACTGACTGCAGATAGGAAATATCTGGTTTTctgaacacacaaaaatacacatataaaaaagaaagaaaaaaaactcaaaccacTCTGCAAATACTGATTGATGCATTGAAACGTGATTCACACACTCAGTTGTTTAGTCGGTACAGTGTTACGTCAGCCGAAAGCCAGAGTGACGTAGGAGACGATGAAGCGTCTCCTCGCAGAAAAACACTCTGCAATCCCCCCCAATTAGCATATATAAGTGGTATATTACCAATTTATAAATATCTATACCACACTAGAATGTAGCTATGAGCAGAAATAAGTGTGTCAGTATGGGTTTGACAATGTCAATAACTGTATATTCTCAATGAAGCATTGGATATCTCATTTTTAATGGAAGCGAAAATAGCAAATATATCGTGACACTGCAGGTACAGTGTCAGTGGTAAACAAGGTTCAAGACCCTAGGGTGGACGTTTCCCTCGTTCCACAATCTGAAGAAGAGCGCTCAACTCTTGTGGCTCAAACTGTCGTAGCCTACAAACatttgggttacactttacttgaaggcatctacataagagtgacatgacacggtcatggacgtgtcataaacattataaacgagtcataaacgtttaggacataacacttcttttagtgtcatttggtttttgtcatgacaagttatggttagagttagggttagggttcatgtgtcatgtcactcttatgtagatacccaAGTAATAAGTAAAGTGggtgcctccctagggaggtgttccaggcacgtccagctgggaggaggcctcgggaaagacccaggactaggtggagggattatatctccaacctggcctgggaacgcctcgggatcccccagtcggagctggttaatgtggctcgggaaagggaagtttggggtcccctgctggagctgctccccccacgacccgacaccggataagcagaagaagatggatggatggataacaaacctttttttttttttttttttttttaacagagccGGGAGAGGGGGTAACATTCAGAGAAACAACTCAGAGAATTTCCGAAATTTA
>TU126316
TccgtaaaaaaacatctttattaATTTCCATGATAAAAGCTAAAGGAACTCATACACGTCAAACTGCAGTATGTCCATGAATCATCGTCACATACACGGTGTACCCTTTTAGTATTTCCCAAGTTACCTCACAGCATTACATCAAATCAACCGTACTGCTGAGGAGACGGCGATTTGGTTTTACCCAATcaattcaacaaagacaagcaCACGTACCACTGAAAACTAAGAATGAAATGAAAGGACaaatatggaggaaaaaaaagttgctTAAAAGTGGGCAGATTGCACTTCTTCAAACTGAAATTTCCAGGACACAAATGGACATCGATTCAGTCAAGACACGGGCTGTAATACTGCCGAATAAGTTGTCCTTCTGACTGACTGCAGATAGGAAATATCTGGTTTTctgaacacacaaaaatacacatataaaaaagaaagaaaaaaaactcaaaccacTCTGCAAATACTGATTGATGCATTGAAACGTGATTCACACACTCAGTTGTTTAGTCGGTACAGTGTTACGTCAGCCGAAAGCCAGAGTGACGTAGGAGACGATGAAGCGTCTCCTCGCAGAAAAACACTCTGCAATCCCCCCCAATTAGCATATATAAGTGGTATATTACCAATTTATAAATATCTATACCACACTAGAATGTAGCTATGAGCAGAAATAAGTGTGTCAGTATGGGTTTGACAATGTCAATAACTGTATATTCTCAATGAAGCATTGGATATCTCATTTTTAATGGAAGCGAAAATAGCAAATATATCGTGACACTGCAGGTACAGTGTCAGTGGTAAACAAGGTTCAAGACCCTAGGGTGGACGTTTCCCTCGTTCCACAATCTGAAGAAGAGCGCTCAACTCTTGTGGCTCAAACTGTCGTAGCCTACAAACatttgggttacactttacttgaaggcatctacataagagtgacatgacacggtcatggacgtgtcataaacattataaacgagtcataaacgtttaggacataacacttcttttagtgtcatttggtttttgtcatgacaagttatggttagagttagggttcatgtgtcatgtcactgttatggagataccttcaagtaaagtgttaaacatttctgtaacattttaaacagaatattagcctggttgacacaagacccttctcagctgtaactgagagtgggtctggggaagcttcattcacagcccatttccaaaggggcgtcaccaacggacgccgctcaaatgcctctgggtacGATTGggtagtccttcaaccaatcagaccaatgttccgggtgacgtagcagcgggttgctggccgtcatgttgaacggaaacaaaaaaaaaaaactgctcgccattgctgcgctatcgtcatcgtgtaaagcgcctcaacggttgtgattggtgcctcgatttggaaaaattgaaaatgggcttgaatgggctcttggccagacagAGCAAATCTCAAGTTTGCCGGAAGTaaatcagggttttcccaggctaccaGAATATATTATACCACCTTACATTTTTGACTCTTGTCAAATGTTTCCACTTTTATTTTGTGGTGTGGTTACGTCTGGGTATCGGTGCTGATGCCGGACTTTCACcactaaacaccaaaacaatacTTTTCCAGCTAGCAACTTTAATACAAACATTTCTAAATTTAACCAAGCAGACCAATTACTGTTTTGTGTATGCAGTTTGTGTAGCTGGGAAAGAACTTTAATTAGAATGAAAATGAActgattttttaaatttaattcagGAGCCAGCTGATCAAATGTATAGAATACATAATAGGGATGTTTCTTCTCGTTTTGTTtgcacttaacccttgtgttgtcctcgggtccagTTTTATTGTATCAGAAATATGAGTTTCTTTCATCCAACTTGCCCAAACATAACTTGGATGCATATGTGCGTTGTATGGAAGCCATACAACGTTCTTCGCAGGTAACATTAATaattacttccattgaattttgggtgttttatttaattttatagcatttcaaAAACTAATTGTAAAaagggttttaaaacagtatacGGACTAAACATATACTAGTATGTGATTGTCTACTCAACATCCTCGGActttaactattagtcaaaataatttataatttcagctttttttttaactaaaaaactaggtataatgtcatttaaatttggTTTGTTTGATGAATAAAacaagtgttgaaaaaagtgacaaggtTTAAAACTGCATCAAAGGCAtactaaaacgttggaaaaagcaaaaaaacaaacaaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU126313 True 3460 lncRNA 0.39 2 6035369 6038848
TU126314 False 3272 lncRNA 0.38 3 6035369 6047722
TU126315 False 1443 TUCP 0.42 2 6035369 6040119
TU126316 False 2302 lncRNA 0.38 3 6035369 6051520

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120565642 tspan1,LOC104930558 coding upstream 6176 6002811 ~ 6029193 (+)
mast2 mast2,LOC102294889,LOC102799744 coding upstream 548484 5211170 ~ 5486885 (+)
LOC120566192 NA coding upstream 833494 5024510 ~ 5201875 (+)
prrx1b prrx1 coding upstream 1034929 4966559 ~ 5000440 (+)
gorab gorab coding upstream 1089062 4934761 ~ 4946307 (+)
LOC120565748 NA coding downstream 16163 6067683 ~ 6071247 (+)
tut4 zcchc11 coding downstream 210700 6262220 ~ 6290119 (+)
LOC120565762 LOC102311032 coding downstream 284231 6335751 ~ 6345081 (+)
cyldl NA coding downstream 576122 6627642 ~ 6641120 (+)
ghrhrb LOC100710271,LOC101475240,LOC103357300 coding downstream 620551 6672071 ~ 6723277 (+)
G93609 NA non-coding upstream 70310 5964812 ~ 5965059 (+)
G93541 NA non-coding upstream 374564 5596770 ~ 5660805 (+)
G93437 NA non-coding upstream 542912 5488294 ~ 5492457 (+)
G93441 NA non-coding upstream 624011 5400131 ~ 5411358 (+)
G93439 NA non-coding upstream 628127 5353344 ~ 5407242 (+)
G93640 NA non-coding downstream 163548 6215068 ~ 6215735 (+)
G93644 NA non-coding downstream 189675 6241195 ~ 6242158 (+)
G93700 atpaf1,LOC102780159 non-coding downstream 338636 6390156 ~ 6398997 (+)
G93713 NA non-coding downstream 537683 6589203 ~ 6589653 (+)
G93758 NA non-coding downstream 785071 6836591 ~ 6836818 (+)
trmt1l trmt1l other upstream 1322136 4685224 ~ 4713233 (+)
LOC120565391 NA other upstream 1721854 4284755 ~ 4313515 (+)
G93150 NA other upstream 1817543 4174602 ~ 4217826 (+)
frem1b LOC100693369,LOC101486624,LOC102206675,LOC102294239 other upstream 2211587 3714919 ~ 3823782 (+)
G92848 NA other upstream 2428544 3600978 ~ 3606825 (+)
G93638 NA other downstream 150565 6202085 ~ 6214017 (+)
rhpn1 rhpn1 other downstream 303372 6354892 ~ 6381598 (+)
G93938 NA other downstream 1298290 7349810 ~ 7350587 (+)
LOC120565294 pycrl other downstream 1827399 7878919 ~ 7890177 (+)
LOC120565614 NA other downstream 1844625 7896145 ~ 7905247 (+)

Expression


Co-expression Network