G95952


Basic Information

Item Value
gene id G95952
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 16166202 ~ 16169844 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU129417
TCGACACTACATTTAAGGAGAAAACATCAAAGCCTCCAAGCACTAATTAGTATGCAGGAAAAAAAGTTTCTGAAGTTTGATAGTTGCTCAAAACTGGGAAGCTTTGCACAGCTGAAGTTCTTCCACTTTGCACTCGTCAGACACCTATTGTTCATTATACAATCACATTGGTGGGGAAAGAAGCAGTGCTGAATTATGGTTGTCTGACAGAAGACAACCGGTCAGTGCAGGGTAATATTGCACACTAAAAGTGCAATCTGTTGCGACTCAAAAGGGGTGTTATGTGCCATGATATCAGTGCAGCATCCCCTAAGCCATACCAGTGAAGACTGTGAAGTTGTCAGTTGAAATCATTTGTTGTCATCTCAACTCAACAtgaagaggttttttttttttctcccaccgGTATCGCaatcttaaaggtgcaatatgtaatattgtgtgtaatactggcagctagcggttaaaatagttactgcagtacaaattcaaaatactggagagtcgtttcccccgccccctcctgcccagactcgaagttcacaggggttgccaggctgagaccgcagcattcaacaatgttgctagatgcttttctcacatagccagacattactccacagcacagcgtagctaacggtagatgctggctatattgacagtcataaaagcccgtgctcacgtggagctctgtaaccaactgacagacacactttttcgccttaaaattacagtatgaaccgctaaaaacaccactagctaccttgccgacggaacacacttcattggcttagaattacggcaacaatcgctaaacacactgcaaactcacagtcctctctttccgatttacagccaccctctcgtggcttaaaataactcaccgttgtcggctccagccgctgacgaggctatacgctgtaaacagccgtgggctgcttgcctggttctccggtaacgttagctagcagttagcagggttagcaaggcggcgttagccaggaccagtcgggatcacgttactggctatgtctcaattgtttttgcgagtaaccaccTCGGGTACTCTAGCAATATAATTCAAtgcgagtacacaaatgttgaaatgacataaaatgcccgtccctagtagctgtgataaattagcctgaagctatgcttacctgttcaggagaaaataagccaactctgcgtccttttgggatctaagttccgtctctggtcacgcaactgttagaaacatgctgttttcttttttttttacgtccggtaaaatctatctccgttgatcctgtttgtttgtttgctgctttcatggctgtactaccgttacagctgtagcgcgctgggtttacgtttttacaggtatatctggcaacccggcctggctgtcaaactgggccgttgataacaacatacagatcaaaacataaacacaaattccgtcacggaatgtaaatttcaaaaagaaaaaatactgacattagcattgttgtcagaaaagatagatagatagaggcattggtgtcatttttggatttattacagtacaaatattacatattggacctttaacatctcattaaaaatgttgagttttgaagtCCTGGATGTTAGAGTATAAGACCCACTCAGCTTTGTTGCTTCTCGATATAAACTTAGTGTGATGCCATATCGAAGAGGTATCTCAAATTTGTAAACACAGATTCAGCATGGCTCTACGTCTCACTGGAATGACTTGTTCTACTCAAAGCATGCGATTTGCAGGAAAAACATTGAGCACCCAAATCAAAGTCTATGTCTTCAGAGCCTAGAGGGAAATatctttttaaacattttggtatttattttttggtcttTCCTTACTTataataacaatacattttGTACTTCGAAACGTGTTGGATCCTCGTGTATTTGTTTTGGAGTATCTTCCTGAAAAAGtagcttttctttgtttgttttttacgtgAGCATGTAAGAGACCCCATGCCTACAAGACCTGTTCCTACTTAATTAACTGTGTAGTGATGTTTACATTGAGAGGAAAAGTGCACTAATGTCTTTTACATGAATTGTGAATGGTGAAGGTGAATTGAAAATGGCAGAGGGAATACCTTACATTGAATCCAAACCCAGGGCTTCTTTAAACAAACGTTTTATGTCTTTGTATTGTACAAATATTGATGTGTATTTTGATAACAAGGATGTTTATAATTCTAAACTTGTTGAAGGACATAATATGCACAGTGACAATTTGAGGCACCAGGATTTTGGGAAGTCTGACTTGAGGGAATATTTCGGATGTACTTCTCGAGGTTTATTGTCTTATTTGTCAGTGGCTTTTGTACCAACTTTCTCCTGAGTCTTCTGTTTCTAAAGCATCAGAATTGTTGATGTGTAAGCTAAGTCCCTCTTCCTCCTTAAAtctcatgatgatgatgatgaccttTTTACAAGATGCTGCTGTTGTGTGGGTAAACAGCATGGAGAGATTGTCCCTGAATGGATCTGTTATTTTTTTGCAGTCTTGACAGAATTGTTTACAATGAACAAACATGCTATGTACTGTACAAACATTTTATATCCTGTGGCTGTTTATGAAGAAACTAAACTCTTTGATACCATGAAAGAAAACAAGTAACATATCTGTTTGtgttcttttaaaaatgttcataAAGAGTAATTTAGCACCAAGCTGAGAAGCATTTAGCGATTTTACATGCCCTTAAGTAACTGGTTTATCATCAGCTTTTTGAAAATGCCTGTTTTTGTAGATGTTATGTAAAGGAGAAACACAGTTTTATTAATAACTGGGCTAAGTAAGGGCTGAGAGGAAACCTGGTTACACAACTAGATTCCTGCTGGGGGGAAAACCGATTTCTTGGTCATAGAAACacttgtaatgttttttttttttaaatatatatgcacatttgcataaaaaaaagatatacaggGAAAGTAATGCTGCAGAGggatgaataaaaaaattgtatatGCGTCAGACAAACTGAAACGGCTGATTTAccactatttgtactactggCACTGTAAGAGACAACCTGTACTCTAAACTGTACTGTAAAAGAGCTTGATAGTtaaataacacattacacataAAATGTGCCAGTCTTCCTTCCAAAATGATTAGAGAGAACCCTTTTTGCAGTGCATGTATACCTAATTTCTCAGGATAACCTGGTTTCTTATGTGAATGTAAACGTAGACAATGCTTGATTGATCGCTACTGTTTGGAAGCTTCAAGCCTGTTTAGCATCTGTAACCACACAGTGATGTGACGGTGGTAagataaaaaaatctaaatcaacACTTAAGCTACTGGAGGTCAGCAATGACTAGATTCTCAGCTGGTGTTAAACTTGCTCTTAAAGAACAAACTGGCAGGTCAAACTGTACATGTGCATGTGTTCCCCTGTGAACTCTTCTGTTCAGTGCATGCTGCATGAGACAAGCACACATCTGTAATACTTGATTGCATGGTATACCGGCGCTGTCGCCCTGTACTGTGTTGTCTTGTGCAACAAATAAAATTTGTATTTCCCT
>TU129418
agaatatatatatatatattcttgcATCTTTGattcaacatacacacacaaatatatatatatatgcgtcTTTGATTCGACACTACATTTAAGGAGAAAACATCAAAGCCTCCAAGCACTAATTAGTATGCAGGAAAAAAAGTTTCTGAAGTTTGATAGTTGCTCAAAACTGGGAAGCTTTGCACAGCTGAAGTTCTTCCACTTTGCACTCGTCAGACACCTATTGTTCATTATACAATCACATTGGTGGGGAAAGAAGCAGTGCTGAATTATGGTTGTCTGACAGAAGACAACCGGTCAGTGCAGGGTAATATTGCACACTAAAAGTGCAATCTGTTGCGACTCAAAAGGGGTGTTATGTGCCATGATATCAGTGCAGCATCCCCTAAGCCATACCAGTGAAGACTGTGAAGTTGTCAGTTGAAATCATTTGTTGTCATCTCAACTCAACAtgaagaggttttttttttttctcccaccgGTATCGCaatcttaaaggtgcaatatgtaatattgtgtgtaatactggcagctagcggttaaaatagttactgcagtacaaattcaaaatactggagagtcgtttcccccgccccctcctgcccagactcgaagttcacaggggttgccaggctgagaccgcagcattcaacaatgttgctagatgcttttctcacatagccagacattactccacagcacagcgtagctaacggtagatgctggctatattgacagtcataaaagcccgtgctcacgtggagctctgtaaccaactgacagacacactttttcgccttaaaattacagtatgaaccgctaaaaacaccactagctaccttgccgacggaacacacttcattggcttagaattacggcaacaatcgctaaacacactgcaaactcacagtcctctctttccgatttacagccaccctctcgtggcttaaaataactcaccgttgtcggctccagccgctgacgaggctatacgctgtaaacagccgtgggctgcttgcctggttctccggtaacgttagctagcagttagcagggttagcaaggcggcgttagccaggaccagtcgggatcacgttactggctatgtctcaattgtttttgcgagtaaccaccTCGGGTACTCTAGCAATATAATTCAAtgcgagtacacaaatgttgaaatgacataaaatgcccgtccctagtagctgtgataaattagcctgaagctatgcttacctgttcaggagaaaataagccaactctgcgtccttttgggatctaagttccgtctctggtcacgcaactgttagaaacatgctgttttcttttttttttacgtccggtaaaatctatctccgttgatcctgtttgtttgtttgctgctttcatggctgtactaccgttacagctgtagcgcgctgggtttacgtttttacaggtatatctggcaacccggcctggctgtcaaactgggccgttgataacaacatacagatcaaaacataaacacaaattccgtcacggaatgtaaatttcaaaaagaaaaaatactgacattagcattgttgtcagaaaagatagatagatagaggcattggtgtcatttttggatttattacagtacaaatattacatattggacctttaacatctcattaaaaatgttgagttttgaagtCCTGGATGTTAGAGTATAAGACCCACTCAGCTTTGTTGCTTCTCGATATAAACTTAGTGTGATGCCATATCGAAGAGGTATCTCAAATTTGTAAACACAGATTCAGCATGGCTCTACGTCTCACTGGAATGACTTGTTCTACTCAAAGCATGCGATTTGCAGGAAAAACATTGAGCACCCAAATCAAAGTCTATGTCTTCAGAGCCTAGAGGGAAATatctttttaaacattttggtatttattttttggtcttTCCTTACTTataataacaatacattttGTACTTCGAAACGTGTTGGATCCTCGTGTATTTGTTTTGGAGTATCTTCCTGAAAAAGtagcttttctttgtttgttttttacgtgAGCATGTAAGAGACCCCATGCCTACAAGACCTGTTCCTACTTAATTAACTGTGTAGTGATGTTTACATTGAGAGGAAAAGTGCACTAATGTCTTTTACATGAATTGTGAATGGTGAAGGTGAATTGAAAATGGCAGAGGGAATACCTTACATTGAATCCAAACCCAGGGCTTCTTTAAACAAACGTTTTATGTCTTTGTATTGTACAAATATTGATGTGTATTTTGATAACAAGGATGTTTATAATTCTAAACTTGTTGAAGGACATAATATGCACAGTGACAATTTGAGGCACCAGGATTTTGGGAAGTCTGACTTGAGGGAATATTTCGGATGTACTTCTCGAGGTTTATTGTCTTATTTGTCAGTGGCTTTTGTACCAACTTTCTCCTGAGTCTTCTGTTTCTAAAGCATCAGAATTGTTGATGTGTAAGCTAAGTCCCTCTTCCTCCTTAAAtctcatgatgatgatgatgaccttTTTACAAGATGCTGCTGTTGTGTGGGTAAACAGCATGGAGAGATTGTCCCTGAATGGATCTGTTATTTTTTTGCAGTCTTGACAGAATTGTTTACAATGAACAAACATGCTATGTACTGTACAAACATTTTATATCCTGTGGCTGTTTATGAAGAAACTAAACTCTTTGATACCATGAAAGAAAACAAGTAACATATCTGTTTGtgttcttttaaaaatgttcataAAGAGTAATTTAGCACCAAGCTGAGAAGCATTTAGCGATTTTACATGCCCTTAAGTAACTGGTTTATCATCAGCTTTTTGAAAATGCCTGTTTTTGTAGATGTTATGTAAAGGAGAAACACAGTTTTATTAATAACTGGGCTAAGTAAGGGCTGAGAGGAAACCTGGTTACACAACTAGATTCCTGCTGGGGGGAAAACCGATTTCTTGGTCATAGAAACacttgtaatgttttttttttttaaatatatatgcacatttgcataaaaaaaagatatacaggGAAAGTAATGCTGCAGAGggatgaataaaaaaattgtatatGCGTCAGACAAACTGAAACGGCTGATTTAccactatttgtactactggCACTGTAAGAGACAACCTGTACTCTAAACTGTACTGTAAAAGAGCTTGATAGTtaaataacacattacacataAAATGTGCCAGTCTTCCTTCCAAAATGATTAGAGAGAACCCTTTTTGCAGTGCATGTATACCTAATTTCTCAGGATAACCTGGTTTCTTATGTGAATGTAAACGTAGACAATGCTTGATTGATCGCTACTGTTTGGAAGCTTCAAGCCTGTTTAGCATCTGTAACCACACAGTGATGTGACGGTGGTAagataaaaaaatctaaatcaacACTTAAGCTACTGGAGGTCAGCAATGACTAGATTCTCAGCTGGTGTTAAACTTGCTCTTAAAGAACAAACTGGCAGGTCAAACTGTACATGTGCATGTGTTCCCCTGTGAACTCTTCTGTTCAGTGCATGCTGCATGAGACAAGCACACATCTGTAATACTTGATTGCATGGTATACCGGCGCTGTCGCCCTGTACTGTGTTGTCTTGTGCAACAAATAAAATTTGTATTTCCCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU129417 False 3567 lncRNA 0.40 1 16166278 16169844
TU129418 True 3643 lncRNA 0.39 1 16166202 16169844

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mast3b mast3 coding upstream 385 16131146 ~ 16165817 (+)
il12rb1 NA coding upstream 64651 16088746 ~ 16101551 (+)
LOC120565290 comp coding upstream 118281 16034712 ~ 16047921 (+)
tmem38a tmem38a coding upstream 134224 16022577 ~ 16031978 (+)
LOC120565334 LOC104959369 coding upstream 172036 15990550 ~ 15994166 (+)
ndufa7 ndufa7 coding downstream 619 16170463 ~ 16173569 (+)
LOC120565120 NA coding downstream 5064 16174908 ~ 16204745 (+)
LOC120566178 LOC103355552 coding downstream 39530 16209374 ~ 16213553 (+)
LOC120565304 b3gnt3 coding downstream 46452 16216296 ~ 16225462 (+)
slc5a5 slc5a5,LOC104958014 coding downstream 87014 16256858 ~ 16275695 (+)
G95929 NA non-coding upstream 38262 16070354 ~ 16127940 (+)
G95877 NA non-coding upstream 184704 15980690 ~ 15981498 (+)
G95876 NA non-coding upstream 185576 15979752 ~ 15980626 (+)
G95873 NA non-coding upstream 191852 15973181 ~ 15974350 (+)
G95853 apba3,LOC104946396,LOC105938289,LOC107096970,LOC103395862,LOC107392810,LOC103143878 non-coding upstream 231622 15931028 ~ 15934580 (+)
G96070 NA non-coding downstream 333301 16503145 ~ 16503811 (+)
G96075 NA non-coding downstream 423032 16592876 ~ 16593182 (+)
G96076 NA non-coding downstream 506363 16676207 ~ 16676577 (+)
G96086 NA non-coding downstream 602125 16771969 ~ 16772170 (+)
G96088 NA non-coding downstream 708032 16877876 ~ 16878081 (+)
LOC120564959 LOC104946909,LOC103360792,LOC102294988,LOC101486556,LOC102197099 other upstream 533390 15523929 ~ 15632812 (+)
dennd1b NA other upstream 1242357 14810368 ~ 14923845 (+)
LOC120565380 NA other upstream 1461849 14689382 ~ 14704353 (+)
G95460 NA other upstream 1544789 14619358 ~ 14621413 (+)
LOC120564965 LOC102299696 other upstream 2766458 13390823 ~ 13399744 (+)
kcnn1b LOC104945110,LOC103355562 other downstream 119979 16289823 ~ 16301000 (+)
kdm4b kdm4b,LOC104945107,LOC108234360,LOC108412081 other downstream 150650 16320494 ~ 16376449 (+)
nppc nppc,LOC104932751,LOC103372810 other downstream 1685787 17855631 ~ 17859411 (+)
nmur1a LOC103368681,LOC104952433 other downstream 2476859 18646703 ~ 18665113 (+)
G96418 tsc22d2 other downstream 2612756 18782600 ~ 18785636 (+)

Expression


Co-expression Network