XLOC_004699 (capgb)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_004699
gene name capgb
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 22576404 ~ 22618080 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00009306
TTGATATATTTTCTTCTTGTTTAGGCACAGAAATTTTTCCTGCTGTCAAATTtagtcaaaacaaacaaataacacgtTTAGGAAATCTGTGCACTCCACTTTGCCTCTTTTCCTCATTTTTTGGCATGTTTGTTTAAATGGGGGTGTTTTCAAGGGGGGTGGACCAAAAACCCATTCAGGAAGTCAGTTTGTACATTTGCCTCTCTTCAACAAATTCTCTCTTCCTTTCCTTCTTGAAACTTTGCAGAGTTCTTCAACTTCAACTTCATCAGCAAGAATGCAACCATTTCAGGCGGCTCCAGGACAGTTTGGCGATGAGGTTCGTCAGCCAGGACTTTATTGCTGGAGAGTGGAGAAAATGAAGGCTGTTCCTCTGAATCAAGCTGAAGTGGGGGCTTTCTTCAACGGAGACTCATACCTGGTGCTGGATAACAGGGGAGATCAGGGAGCAGACCTACACATGTGGATCGGAGAGAAATCGTCGCGTGACGAGCAGGTGGCTTGCGCCATGTTGGCCACACAACTGGATAATTTCCTGGGTGGAGATCCAGTCCAGCACAGGCAGGTTCAGGGTTACGAGTCTCCAGAATTCATGAAACTCTTCCCTCGAGGAGTCAGTTATAAGGAGGGAGGAGTGGAGTCTGGCTTCAGAAGAGCGCAGTCTGGACCTGGACCTGTTCAGAGGTTATACCAAATCAAAGGGAAACGCAACATCAGGGCAAAGGAAGTAGATTTGAGCTGGCAGAGTTTTAACAAGGGCGACTGCTTCATACTTGATCTGGGCGAgACGATTGTGTCATGGATTGGATCTCAGGCAAACATCTTCGAGAAGCAGAAGGTGAGAGAGATCGCCTCTCTCATCAGAGATACAGACAGACACGGCAAAGCTCAGATCACCAATGTTAATGAGGGAGAGGAGACACAGGAAATGCTGAAGGTTCTTGGTCCAGTGCCAGAGCTGAAAGAAAGCACTCCAGAGGAGGACAGCAAAGCAGATGCATCAAATTCAGCCTCCCTTTACAAGGTTTCAGATGCCACAGGGTCAATGAAGTTGACCAAGGTGTCAGAGAAAAGTCCATTTGCCAAGGACTTGCTGGTGCGTGATGACTGCTTTATCCTGGACAATGGGGCCAACGGAAAAATCTTTGTTTGGAAAGGAAGTGGAGCCAACGCAGAAGAGAAGAGGGTTGCTTTAAAAATGGCAGATGACTTCATCCAGCAAATGAATTACCCAAAGATGAAAACACAGGTGGAGATTTTACCACAGGGCAGAGAAACTGTTATCTTTAAACAGTTTTTCCAAAGCTGGAATTAAACCTCATTTCACTGCATGATCAGATAATAAACTGCACTCAACCAGTTGTCAAAAAACTGTAATTTACTTCAATAAGGCCATTGATATATTGCGTAATAAACAAATGTACAGTTGTAAAACAAATCATTCATGGAGGTTTGCAGTAATAATGGATATGAGTAAGAGAGGCTTTACTATTTGTTTGGTACCGCGTTTGTACGGCTTTTAGAGGGTGTTTATATTGGTCAATGCTAATTTTAAAgagcttttaataataatttcccCCTTTTTTGATTGAGAGGGTCAAATCTACTGTTATGTTGCAGGCTTAATGAACGCAAACCCTTGAGTAGATGCCATTTCTACTTAAAAACAGAATAATGTAACCACTTTCAAGCCAATTTACTATTTCACAATCTCTGTGAAATggctttttttctcattttgtaCTCATTTTGTGTATGTAACTGCAGCATggaaattaaaatgcaaatgcaacaacagcaaaaa
>TCONS_00009308
GCCAGGtgaactcactcacacacacacctaggtGCAGGAACAGGCAGGATGGAGCCGGACTCTGACAGCATGCCGGAGCAGGCCGAAGGAGCTTTGCAAATGCAACCATTTCAGGCGGCTCCAGGACAGTTTGGCGATGAGGTTCGTCAGCCAGGACTTTATTGCTGGAGAGTGGAGAAAATGAAGGCTGTTCCTCTGAATCAAGCTGAAGTGGGGGCTTTCTTCAACGGAGACTCATACCTGGTGCTGGATAACAGGGGAGATCAGGGAGCAGACCTACACATGTGGATCGGAGAGAAATCGTCGCGTGACGAGCAGGTGGCTTGCGCCATGTTGGCCACACAACTGGATAATTTCCTGGGTGGAGATCCAGTCCAGCACAGGCAGGTTCAGGGTTACGAGTCTCCAGAATTCATGAAACTCTTCCCTCGAGGAGTCAGTTATAAGGAGGGAGGAGTGGAGTCTGGCTTCAGAAGAGCGCAGTCTGGACCTGGACCTGTTCAGAGGTTATACCAAATCAAAGGGAAACGCAACATCAGGGCAAAGGAAGTAGATTTGAGCTGGCAGAGTTTTAACAAGGGCGACTGCTTCATACTTGATCTGGGCGAg
>TCONS_00009309
ATGGAGCCGGACTCTGACAGCATGCCGGAGCAGGCCGAAGGAGCTTTGCAAATGCAACCATTTCAGGCGGCTCCAGGACAGTTTGGCGATGAGGTTCGTCAGCCAGGACTTTATTGCTGGAGAGTGGAGAAAATGAAGGCTGTTCCTCTGAATCAAGCTGAAGTGGGGGCTTTCTTCAACGGAGACTCATACCTGGTGCTGGATAACAGGGGAGATCAGGGAGCAGACCTACACATGTGGATCGGAGAGAAATCGTCGCGTGACGAGCAGGTGGCTTGCGCCATGTTGGCCACACAACTGGATAATTTCCTGGGTGGAGATCCAGTCCAGCACAGGCAGGTTCAGGGTTACGAGTCTCCAGAATTCATGAAACTCTTCCCTCGAGGAGTCAGTTATAAGGAGGGAGGAGTGGAGTCTGGCTTCAGAAGAGCGCAGTCTGGACCTGGACCTGTTCAGAGGTTATACCAAATCAAAGGGAAACGCAACATCAGGGCAAAGGAAGTAGATTTGAGCTGGCAGAGTTTTAACAAGGGCGACTGCTTCATACTTGATCTGGGCGAgACGATTGTGTCATGGATTGGATCTCAGGCAAACATCTTCGAGAAGCAGAAGGTGAGAGAGATCGCCTCTCTCATCAGAGATACAGACAGACACGGCAAAGCTCAGATCACCAATGTTAATGAGGGAGAGGAGACACAGGAAATGCTGAAGGTTCTTGGTCCAGTGCCAGAGCTGAAAGAAAGCACTCCAGAGGAGGACAGCAAAGCAGATGCATCAAATTCAGCCTCCCTTTACAAGGTTTCAGATGCCACAGGGTCAATGAAGTTGACCAAGGTGTCAGAGAAAAGTCCATTTGCCAAGGACTTGCTGGTGCGTGATGACTGCTTTATCCTGGACAATGGGGCCAACGGAAAAATCTTTGTTTGGAAAGGAAGTGGAGCCAACGCAGAAGAGAAGAGGGTTGCTTTAAAAATGGCAGATGACTTCATCCAGCAAATGAATTACCCAAAGATGAAAACACAGGTGGAGATTTTACCACAGGGCAGAGAAACTGTTATCTTTAAACAGTTTTTCCAAAGCTGGAATTAAACCTCATTTCACTGCATGATCAGATAATAAACTGCACTCAACCAGTTGTCAAAAAACTGTAATTTACTTCAATAAGGCCATTGATATATTGCGTAATAAACAAATGTACAGTTGTAAAACAAATCATTCATGGAGGTTTGCAGTAATAATGGATATGAGTAAGAGAGGCTTTACTATTTGTTTGGTACCGCGTTTGTACGGCTTTTAGAGGGTGTTTATATTGGTCAATGCTAATTTTAAAgagcttttaataataatttcccCCTTTTTTGATTGAGAGGGTCAAATCTACTGTTATGTTGCAGGCTTAATGAACGCAAACCCTTGAGTAGATGCCATTTCTACTTAAAAACAGAATAATGTAACCACTTTCAAGCCAATTTACTATTTCACAATCTCTGTGAAATggctttttttctcattttgtaCTCATTTTGTGTATGTAACTGCAGCATggaaattaaaatgcaaatgcaacaacagcaaaaacacTGTTTCTCAGGTGTGAAGTCGTGCTAATGGGCTGGAATTCCCTTTATGGCTGATAAGATGACAGCAAAGTTATGTAAGCGCCGTTAAGGGTCATTAGCATTCAGGGCATGTTACCATGGTTTACATTAACTCATATCAACTCTTACAAGGATTAACAGCTTAACAACTGAGGATTTAAGCAGATAAACACATATACTCTACATAAATGTTGGTTTATCattacccaacattgggtcaaatatggccAAATCCTATTTGTTGAGTTAAAATGagaaattttaataatttgaaaaaatGAACCCAACATTGGGTGTGTCATTATTTGCCCCAATGTTGGGTTATGACAACACAGTATTTCTACTATATAAGTGAAACCTTCTGTCTACTGAGAATTTTGAaatattgaattgagatctgcaAAGCttggttcatttatttatttctattcattTTCTCTTTTATGAATCTGAACTTTGGATTTGGAGGAGGTAGAACACAGTTATCACATGGTTTCAGAAAATGTTcacctactttttttttcttgtagctGATGTTTGCTGTGTGATTACAGTGTGAAACTTTGGGTGTGACAAGCAAATTTGCAGCTATACATTCACTTTCAGTTAAAGTAATTAACCTGAATTCCTATGTAGTTTGTGGAACTTAAACTGGAATGTTAGGAAAAGGATTTTACGTAATTGCAATTCAAATTACATCATCTTAAAGTAACTAttattaactatatttttattttattttgaccaaAAATCAACATGTAGGCAAGAAAAGAGGATCTGAGGGTCTCAGTTGAGGATGGCGATGGTTCTTTCAAGTATTTTAAGACAAGTATCATCAATATTGAtactacaattattattttatagtattttatgttttttaatcaccatcagtattattaataaagaaaatacaaCAGACAtaatttctttttacatttattaaaattagagAACACTATTAATTACACAACAAATGGCTATATAAAAccatataaaactaaatattacacATCGCACAAAccttgtttcattttttaaaattacatttaatcccattaacatttttatttaatgaaacaaATGGCTGCTGACTCTCCTTTTGAGCCTGTTATTCTTTGACTGATCAGTGGTGTACTGTTTTGTGACAAGTGTCACACAGCCTGTCATTATTAACTGGAGCAAAATAACTCCAGATTAAGCATCTTTTTCGTTCAGTCATGATGACTCCATGCTCAAGTTGAAAACCTGctgctttgtgtgtgtgctgtgcacTATGTTTTGAAAGGGTGTAGCTGTGAGCAAAccttattttttacagtctatggagtAAAACTGACCCATTAACAGAGATACAGCCGAGTAATGTTATAGTTCTCATTCCAGTTCttattaaagtaaatatttattaagatattcTAAAATCAGCAAccatttatttaagaaaaataaaacgtATAAAGGATCGATATAGaaggaataaaaaatattttcacgtATGGAAAATATCGATACTTAAGGATCGATCTACCCAGCCCTAAATtagcagcagaaaaaaataaataaatataaaggtaATCCAGAAGGTAAGCATCAAAGTAACTGCTTGATATGCAAACCCAAATGAAAGAACCAAACTAAGGGCTTAAATACACGAGTAAATAAGAAAGCAAGCCAAATACATGTGAACACAGTTAACTAATGAGTGTAGCCATAGAAACAGCTAGCAAAGGAAATATTAAGTATAAGAGATTTTACATCATTTGTTCCTTTCTAATTCTGTTTTTCACAAAGTGCCTTGGTTTTTTGTTGAAGTGCCTTGGTTGTTTAGTAAAACACTGTTCTAATAGCATGGGACTTAAAATTTTGAAAGAAGGTTACGGTTTTTCTGAAAAAAGCAAGTGTTCAtaaattgttctctaattttaATCTCCACTATGTAAAACAAGAACACAAAATGTCCATAACACTTCAGTTTTAAAAATTTTGTCTCGTTTAAATTTTCTGTTTCAAGTTAGCGGTTTGCTACCTCAGTTAACATTCCCCGTTTTATTGGACAAtaaagttttttatgttttatttgtaatgaAATCATTTTAGGTCAACATGTAAAACTACATACTGCTGGGTGCCAGAAGACTATAAggaaatttttttaaagatttaatacaAGCTTGAATATTAAATATAGATTCCTGCTCTTTCTTTCTCATCACTATGGAGTTTCAGGGTGTGAAGCAGCATTATGTTACTGGGATAAAGTTCATGCCAACAACTGTTGCTTAGGCAATGTGAGTAATCATCACTGTCCCCAAAAAGGTCAAACCAGTGATTAACACTACGTGTCATAAGCAACTTATTtcaaatacagctgaagtcagaattattagcccccctgtttattttttccccaatttctgtttaacggagagacgatttcttcaacacatcactaaacataatagttttaataactcatctctaataactgatttattttatctttgccatgatgacagtaaataatatttcactagatattttcaggacacttctatacagcttaaagtgacatgtaaaggcttaactaggttaattgggttaactaggcaggttagggtaattaggcgagttattgtataaccatggtttattctgtagactatggaaaaaacatagcttaaagaggctaatgattttgaccttaaaagagtttttttaaaaattaaaactgcttttattccaggtaaaataaaacaaataagactttccccagaaaaaaaaaatatcatcagacatactgtgaaaatttccttgccttgttaaacataatttgggaaatatttaaaaaagaaaaaaaaattaaaaggggggctaataattttgacttcaactgtaagtccAAGGAAATCACACAGGATCTTCCTTTtggcttttcttgatttttatgtaatgtaatgtaagcAACCGCTTCAGTTCACTGGAATTTATAATCGTGCTTTTATAATCCTCCTCAGCTTTACTTTTGGATAGTTACATAACCTGTTAACAGTCATATAACCATACATATTTTATATCTGATGACTATAAAATCATCAAGAGAATGGATGCTCAcaaatttgaaatatttgtatataaagcCTGGGTAAATACTGTCTGACATCGTATTTCAGACAATATCGCTAAGTGAGTGTTCAATGAATCAGTAAATGAACAAGTGGCATGATATGGGACAGTATTAACTGCCTGATTCCTGGCATCATGCCATTTTGACTACTGTCTGAATCATTGCTGGGAAAGACCATATCTCATCACGTAGCTTTTTCCTCAGCCTTCGCCTCACACCGTCATGACTGTAAAAACTGAGGTCCAAAGTTCAGAGTATGCAGGAGACGAGGTAAAACACGGGCTGAGAGAGCGCTagccttcagtctcagcagacaCCTCGAGCTGCGTTCACCTGCTCCCCAACACCTCACCATGGGTAAGTCACAGAGGATTTACATGCAGAGATTTGTGCTGGAAAATCAGGGAAATGCAGGAAAAGAAAATTTAT
>TCONS_00009310
ATTTTGTGCAAatatgatttgttttttgttcagaAATCTTTGATATGTATTTCATATGGCACATTTTTCTTCTCACTAGCTGACATACAGCTTTTTTGCTCTACTATATTTAAcacaacatattaataaaaataaaaaaaaccctgaatGCCAGCCTCATCTTTTATagaaaaaaacctttaaaaaagagctaaaaacctgtcatgctaaaatcatgtCATTTAATTTCTAGAGTGATGGCATCTCCATTGCAACTCCTCTTGCTAATTGTCAACAGCGCTATCAGTTCAAGACTTTTGTTATCTGACTGGCATATATAATTGATTGCTATATAATATAATTGCAGGGGAGATTACTGAAAGCTACCCGTATGCATTTTTTATTACTCTATTGAATTGAAAAATCAGTTCGGATAAAAGTACAAAGAAATGTATCTAAAAATTGCTTCCGATAATTGTTCATTAGTTCACTCTTCTGATTCCCTCATCCATTTAATAGGGCATTCAACAGCGTGGTACTCTAGAAACAGGGATGGGAAACGTTTCAAATCATTTCAAAGGCATTTGCATTAGCCATTCACCTTTTTACCATCTCATCTTTGTTCCTCCAGAATGCAACCATTTCAGGCGGCTCCAGGACAGTTTGGCGATGAGGTTCGTCAGCCAGGACTTTATTGCTGGAGAGTGGAGAAAATGAAGGCTGTTCCTCTGAATCAAGCTGAAGTGGGGGCTTTCTTCAACGGAGACTCATACCTGGTGCTGGATAACAGGGGAGATCAGGGAGCAGACCTACACATGTGGATCGGAGAGAAATCGTCGCGTGACGAGCAGGTGGCTTGCGCCATGTTGGCCACACAACTGGATAATTTCCTGGGTGGAGATCCAGTCCAGCACAGGCAGGTTCAGGGTTACGAGTCTCCAGAATTCATGAAACTCTTCCCTCGAGGAGTCAGTTATAAGGAGGGAGGAGTGGAGTCTGGCTTCAGAAGAGCGCAGTCTGGACCTGGACCTGTTCAGAGGTTATACCAAATCAAAGGGAAACGCAACATCAGGGCAAAGGAAGTAGATTTGAGCTGGCAGAGTTTTAACAAGGGCGACTGCTTCATACTTGATCTGGGCGAgACGATTGTGTCATGGATTGGATCTCAGGCAAACATCTTCGAGAAGCAGAAGGTGAGAGAGATCGCCTCTCTCATCAGAGATACAGACAGACACGGCAAAGCTCAGATCACCAATGTTAATGAGGGAGAGGAGACACAGGAAATGCTGAAGGTTCTTGGTCCAGTGCCAGAGCTGAAAGAAAGCACTCCAGAGGAGGACAGCAAAGCAGATGCATCAAATTCAGCCTCCCTTTACAAGGTTTCAGATGCCACAGGGTCAATGAAGTTGACCAAGGTGTCAGAGAAAAGTCCATTTGCCAAGGACTTGCTGGTGCGTGATGACTGCTTTATCCTGGACAATGGGGCCAACGGAAAAATCTTTGTTTGGAAAGGAAGTGGAGCCAACGCAGAAGAGAAGAGGGTTGCTTTAAAAATGGCAGATGACTTCATCCAGCAAATGAATTACCCAAAGATGAAAACACAGGTGGAGATTTTACCACAGGGCAGAGAAACTGTTATCTTTAAACAGTTTTTCCAAAGCTGGAATTAAACCTCATTTCACTGCATGATCAGATAATAAACTGCACTCAACCAGTTGTCAAAAAACTGTAATTTACTTCAATAAGGCCATTGATATATTGCGTAATAAACAAATGTACAGTTGTAAAACAAATCATTCATGGAGGTTTGCAGTAATAATGGATATGAGTAAGAGAGGCTTTACTATTTGTTTGGTACCGCGTTTGTACGGCTTTTAGAGGGTGTTTATATTGGTCAATGCTAATTTTAAAgagcttttaataataatttcccCCTTTTTTGATTGAGAGGGTCAAATCTACTGTTATGTTGCAGGCTTAATGAACGCAAACCCTTGAGTAGATGCCATTTCTACTTAAAAACAGAATAATGTAACCACTTTCAAGCCAATTTACTATTTCACAATCTCTGTGAAATggctttttttctcattttgtaCTCATTTTGTGTATGTAACTGCAGCATggaaattaaaatgcaaatgcaacaacagcaaaaacacTGTTTCTCAGGTGTGAAGTCGTGCTAATGGGCTGGAATTCCCTTTATGGCTGATAAGATGACAGCAAAGTTATGTAAGCGCCGTTAAGGGTCATTAGCATTCAGGGCATGTTACCATGGTTTACATTAACTCATATCAACTCTTACAAGGATTAACAGCTTAACAACTGAGGATTTAAGCAGATAAACACATATACTCTACATAAATGTTGGTTTATCattacccaacattgggtcaaatatggccAAATCCTATTTGTTGAGTTAAAATGagaaattttaataatttgaaaaaatGAACCCAACATTGGGTGTGTCATTATTTGCCCCAATGTTGGGTTATGACAACACAGTATTTCTACTATATAAGTGAAACCTTCTGTCTACTGAGAATTTTGAaatattgaattgagatctgcaAAGCttggttcatttatttatttctattcattTTCTCTTTTATGAATCTGAACTTTGGATTTGGAGGAGGTAGAACACAGTTATCACATGGTTTCAGAAAATGTTcacctactttttttttcttgtagctGATGTTTGCTGTGTGATTACAGTGTGAAACTTTGGGTGTGACAAGCAAATTTGCAGCTATACATTCACTTTCAGTTAAAGTAATTAACCTGAATTCCTATGTAGTTTGTGGAACTTAAACTGGAATGTTAGGAAAAGGATTTTACGTAATTGCAATTCAAATTACATCATCTTAAAGTAACTAttattaactatatttttattttattttgaccaaAAATCAACATGTAGGCAAGAAAAGAGGATCTGAGGGTCTCAGTTGAGGATGGCGATGGTTCTTTCAAGTATTTTAAGACAAGTATCATCAATATTGAtactacaattattattttatagtattttatgttttttaatcaccatcagtattattaataaagaaaatacaaCAGACAtaatttctttttacatttattaaaattagagAACACTATTAATTACACAACAAATGGCTATATAAAAccatataaaactaaatattacacATCGCACAAAccttgtttcattttttaaaattacatttaatcccattaacatttttatttaatgaaacaaATGGCTGCTGACTCTCCTTTTGAGCCTGTTATTCTTTGACTGATCAGTGGTGTACTGTTTTGTGACAAGTGTCACACAGCCTGTCATTATTAACTGGAGCAAAATAACTCCAGATTAAGCATCTTTTTCGTTCAGTCATGATGACTCCATGCTCAAGTTGAAAACCTGctgctttgtgtgtgtgctgtgcacTATGTTTTGAAAGGGTGTAGCTGTGAGCAAAccttattttttacagtctatggagtAAAACTGACCCATTAACAGAGATACAGCCGAGTAATGTTATAGTTCTCATTCCAGTTCttattaaagtaaatatttattaagatattcTAAAATCAGCAAccatttatttaagaaaaataaaacgtATAAAGGATCGATATAGaaggaataaaaaatattttcacgtATGGAAAATATCGATACTTAAGGATCGATCTACCCAGCCCTAAATtagcagcagaaaaaaataaataaatataaaggtaATCCAGAAGGTAAGCATCAAAGTAACTGCTTGATATGCAAACCCAAATGAAAGAACCAAACTAAGGGCTTAAATACACGAGTAAATAAGAAAGCAAGCCAAATACATGTGAACACAGTTAACTAATGAGTGTAGCCATAGAAACAGCTAGCAAAGGAAATATTAAGTATAAGAGATTTTACATCATTTGTTCCTTTCTAATTCTGTTTTTCACAAAGTGCCTTGGTTTTTTGTTGAAGTGCCTTGGTTGTTTAGTAAAACACTGTTCTAATAGCATGGGACTTAAAATTTTGAAAGAAGGTTACGGTTTTTCTGAAAAAAGCAAGTGTTCAtaaattgttctctaattttaATCTCCACTATGTAAAACAAGAACACAAAATGTCCATAACACTTCAGTTTTAAAAATTTTGTCTCGTTTAAATTTTCTGTTTCAAGTTAGCGGTTTGCTACCTCAGTTAACATTCCCCGTTTTATTGGACAAtaaagttttttatgttttatttgtaatgaAATCATTTTAGGTCAACATGTAAAACTACATACTGCTGGGTGCCAGAAGACTATAAggaaatttttttaaagatttaatacaAGCTTGAATATTAAATATAGATTCCTGCTCTTTCTTTCTCATCACTATGGAGTTTCAGGGTGTGAAGCAGCATTATGTTACTGGGATAAAGTTCATGCCAACAACTGTTGCTTAGGCAATGTGAGTAATCATCACTGTCCCCAAAAAGGTCAAACCAGTGATTAACACTACGTGTCATAAGCAACTTATTtcaaatacagctgaagtcagaattattagcccccctgtttattttttccccaatttctgtttaacggagagacgatttcttcaacacatcactaaacataatagttttaataactcatctctaataactgatttattttatctttgccatgatgacagtaaataatatttcactagatattttcaggacacttctatacagcttaaagtgacatgtaaaggcttaactaggttaattgggttaactaggcaggttagggtaattaggcgagttattgtataaccatggtttattctgtagactatggaaaaaacatagcttaaagaggctaatgattttgaccttaaaagagtttttttaaaaattaaaactgcttttattccaggtaaaataaaacaaataagactttccccagaaaaaaaaaatatcatcagacatactgtgaaaatttccttgccttgttaaacataatttgggaaatatttaaaaaagaaaaaaaaattaaaaggggggctaataattttgacttcaactgtaagtccAAGGAAATCACACAGGATCTTCCTTTtggcttttcttgatttttatgtaatgtaatgtaagcAACCGCTTCAGTTCACTGGAATTTATAATCGTGCTTTTATAATCCTCCTCAGCTTTACTTTTGGATAGTTACATAACCTGTTAACAGTCATATAACCATACATATTTTATATCTGATGACTATAAAATCATCAAGAGAATGGATGCTCAcaaatttgaaatatttgtatataaagcCTGGGTAAATACTGTCTGACATCGTATTTCAGACAATATCGCTAAGTGAGTGTTCAATGAATCAGTAAATGAACAAGTGGCATGATATGGGACAGTATTAACTGCCTGATTCCTGGCATCATGCCATTTTGACTACTGTCTGAATCATTGCTGGGAAAGACCATATCTCATCACGTAGCTTTTTCCTCAGCCTTCGCCTCACACCGTCATGACTGTAAAAACTGAGGTCCAAAGTTCAGAGTATGCAGGAGACGAGGTAAAACACGGGCTGAGAGAGCGCTagccttcagtctcagcagacaCCTCGAGCTGCGTTCACCTGCTCCCCAACACCTCACCATGGGTAAGTCACAGAGGATTTACATGCAGAGATTTGTGCTGGAAAATCAGGGAAATGCAGGAAAAGAAAATTTAT
>TCONS_00009311
agtctcagcagacaCCTCGAGCTGCGTTCACCTGCTCCCCAACACCTCACCATGGGAGAACAGACGAAGCCCTACAAGAGCATCCTGAAGGACAACACTCTAAAAGTGCCTCAGATCTCCAACCAGGGGCAGCAGAGTAACTCTATTGGCGCCGTGCGATGGGTTTTACCGGATGAAGAGGTTCAGGTACACAGCTCCGCGCCCACGATCCCCTACAAGAGTAACAGCGGCTTCTCCACTCGCTCACAGCAAAGGCAGCGTCAGCAGGGCCTTAAGGACCTCCGCAGCTTGGACGAGTGCATTCAGTTCATCAACCGCTGGAAACAGCAGGTGGCACAAGTCTGCAAGAATGAGGACGATCCCGGTGAAGGAAGCAGCAGACCAACAAAAACAGACTCCAGAACTGAACGCAGTCTTGAAGAGAGTCGCAAGCTTATTCTTCAGTGGGCCAATGAACTTCAAAGTGTAGACAAGCTATCCAAAAAGCAGCCATGGTTGAAGGAAAGGAttgatctggaggaagaagatgACAAAACTAAGCTTGATAAAAGTGAGGGTGATGAGGTGCAGGAGAGGATCACAGAATGGGCCAAAGAGATACAGAGTGTGTCAGAGAGCTGCGGTATGCCGGGAGATGAACTGGCGCAGATGTTGCGTCTGCTGGGACTAAGGAAAAAGAGACTGGCTACCCTCATGCCACTTCTGGAGTTCATCACATGGAGTCTGCTGAAAGAAGAGAGCAAGggCATGGTTCCTCATCTTTGGCTTTCTGCTAAGCAGCGCACCTGGAAAGCTGgaatatcACGATACATCCCTAATTCAGTGTGGAGCTGGATTGTCAGTGCAGGAGCTGATGTAAGTCTTGATCCCATGACCAACAACCCTTGGCTTTATGTTTCTGAAGACCACAAGAAGATTCAGGAGGGTCTAATAGAGGCCAATCTGCCTTACAGCTCTCAGCGCTTTGATAGTTTGCCCTGCGTGCTAGGTTGGGAAGGCTACATGAGCGGCCGCCATTACTGGGAAGTGGAGTTTGCAAATAATGGTTATTGGAGAGTAGGAGTGACTACTGCCTCCTCAAAGAGGCACGGCCGCTTCCCGATGAACCCATCAAGTGGTTATTGGGTCCTGTGGCGGAGCACAAGACAGTTCTTCGCCTGCACCAATCCTGAAACCCCCCTGCCACAGGAGCTGGTGCCCCGGAGAATGGGAATATACATTGACTATGAGGAGGGACAGATCTCTTTCTACAATGCCGACAACAAATCACACATTTACACTTTCACTGGACACTTTCGCGAAAAGCTGTACCCTTTCTTTTCTCTCATGGATGGCAGGACCCTTATGACCTTATGGTCTCCTAAAGAGCATAGCCACTTTTAATAGCATGGCAGGTTTAAAAGTTTATCTTTCACTCTGCACTTTCACTCATTTGAACATTTACaccttaataaatgattcattggaaTCAATTTAATCCAAAAGAAATAATAGCAGCCTTTCCATTTAGAGGATTGAACACCATTGTGGGCTGGACCCACTTAATAAAggctattattaaaaataacaaatgaaacACTCTTTCAACATGATTGCCATATTAATATTTCCTATTTagaatatttatatgtatattttatgtcGATCTATAATTATATACATGCATCTCAGCTTGTCTGCTTTCATGTATATGAATAACAGTATGTGTTATGACACAAATATTTCATGAAATATAAATTGCATAATGTTGGTatgtatatatttctatataaagTGTTGTCTGTTAATTCGTGTAACATTGAATAAGATAACTACAATgtgatatttattatattaatgtgtATATGTTGTTATTAAAAGGTTAATCATTCTGTATTATAGATGCTCTGGATGattatgtattaataaaaaaaattaattcaggtC

Function

symbol description
capgb Predicted to enable actin filament binding activity. Predicted to be involved in actin filament severing and actin polymerization or depolymerization. Predicted to act upstream of or within barbed-end actin filament capping. Predicted to be located in several cellular components, including lamellipodium; melanosome; and ruffle. Orthologous to human CAPG (capping actin protein, gelsolin like).

GO:

id name namespace
GO:0051016 barbed-end actin filament capping biological_process
GO:0051015 actin filament binding molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-8541 Predicted to enable actin filament binding activity. Predicted to be involved in actin filament severing and actin polymerization or depolymerization. Predicted to act upstream of or within barbed-end actin filament capping. Predicted to be located in several cellular components, including lamellipodium; melanosome; and ruffle. Orthologous to human CAPG (capping actin protein, gelsolin like).
ZDB-GENE-141215-26 Predicted to enable ubiquitin protein ligase activity. Predicted to be involved in protein ubiquitination. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human RNF39 (ring finger protein 39).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000096739 ENSDARG00000099672

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00009306 False 1804 mRNA 0.43 9 22576404 22604311
TCONS_00009308 False 609 mRNA 0.53 4 22580579 22599067
TCONS_00009309 False 5154 mRNA 0.36 9 22580627 22607887
TCONS_00009310 False 5714 mRNA 0.36 8 22588923 22607887
TCONS_00009311 True 1926 mRNA 0.44 11 22607761 22618080

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_004698 polr2a coding upstream 3107 22560067 ~ 22573297 (+)
XLOC_004697 hdlbpb coding upstream 131343 22404108 ~ 22445061 (+)
XLOC_004696 NA coding upstream 271563 22258962 ~ 22304841 (+)
XLOC_004695 NA coding upstream 556634 22017946 ~ 22019770 (+)
XLOC_004694 NA coding upstream 777008 21757817 ~ 21799396 (+)
XLOC_004701 NA coding downstream 308 22618388 ~ 22619122 (+)
XLOC_004702 mfsd8 coding downstream 10624 22628704 ~ 22645215 (+)
XLOC_004703 si:dkey-219e21.4 coding downstream 39843 22657923 ~ 22664563 (+)
XLOC_004704 cdca9 coding downstream 54243 22672323 ~ 22815847 (+)
XLOC_004705 afap1 coding downstream 205139 22823219 ~ 22916314 (+)
XLOC_004691 FO704814.1 non-coding upstream 1138946 21437346 ~ 21437458 (+)
XLOC_004689 NA non-coding upstream 1469417 20806897 ~ 21106987 (+)
XLOC_004707 NA non-coding downstream 419367 23037447 ~ 23040091 (+)
XLOC_004708 BX927205.1 non-coding downstream 492083 23110163 ~ 23110277 (+)
XLOC_004711 NA non-coding downstream 836349 23454429 ~ 23605722 (+)
XLOC_004712 BX005058.1 non-coding downstream 959186 23577266 ~ 23577391 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000063_03848184_03856699 NA coding CI01000063 null 3847172 ~ 3856705 (+)