tmem255a (tmem255a)



Basic Information


Item Value
gene id tmem255a
gene name tmem255a
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053121.1
NCBI id CM020918.1
chromosome length 40300294
location 25241567 ~ 25251643 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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Function


symbol description
tmem255a Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM255A (transmembrane protein 255A).

NR:

description
transmembrane protein 255A isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039813588.1 True 2462 mRNA 0.47 11 25241567 25251643
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XM_039813590.1 False 2405 mRNA 0.47 10 25241567 25251643
XM_039813591.1 False 2390 mRNA 0.47 10 25241567 25251643
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XM_039813593.1 False 2327 mRNA 0.47 9 25241567 25251643

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
lamp2 NA coding upstream 10064 25215120 ~ 25231503 (+)
cul4b cul4b coding upstream 27020 25202150 ~ 25214547 (+)
c1galt1c1 c1galt1c1 coding upstream 44371 25194743 ~ 25197196 (+)
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zdhhc9 zdhhc9 coding upstream 260767 24948008 ~ 24980800 (+)
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upf3b upf3b coding downstream 13872 25265515 ~ 25269230 (+)
nkrf nkrf coding downstream 59396 25311039 ~ 25315431 (+)
trnae-uuc_61 NA coding downstream 69582 25321225 ~ 25321296 (+)
elf1 LOC104965894,LOC103353227,LOC102314295,LOC100712278 coding downstream 69884 25321527 ~ 25363249 (+)
LOC120566737 NA non-coding upstream 133945 25106440 ~ 25107622 (+)
G107821 NA non-coding upstream 294231 24947121 ~ 24947336 (+)
G107820 NA non-coding upstream 294625 24946738 ~ 24946942 (+)
G107819 NA non-coding upstream 295863 24945327 ~ 24945704 (+)
G107818 trmt12 non-coding upstream 297027 24943550 ~ 24944540 (+)
G107958 NA non-coding downstream 482 25252125 ~ 25252468 (+)
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G107981 NA non-coding downstream 36476 25288119 ~ 25290199 (+)
G107985 tnmd non-coding downstream 129070 25380713 ~ 25394758 (+)
G107988 NA non-coding downstream 134825 25386468 ~ 25387635 (+)
apln NA other upstream 144544 25073213 ~ 25097023 (+)
nox1 nox1 other upstream 394674 24840186 ~ 24846893 (+)
G107789 tmem35a other upstream 432866 24805200 ~ 24808701 (+)
arhgef6 NA other upstream 787654 24387484 ~ 24453913 (+)
LOC120566416 NA other upstream 1376293 23855525 ~ 23865274 (+)
rpl39 NA other downstream 27925 25279568 ~ 25282207 (+)
LOC120567498 NA other downstream 29305 25280948 ~ 25281080 (+)
sept6 sept6,LOC106945475 other downstream 39964 25291607 ~ 25310218 (+)
btk btk other downstream 1209645 26461288 ~ 26476570 (+)
timm8a timm8a other downstream 1225153 26476796 ~ 26479297 (+)

Expression



Co-expression Network