col23a1a (col23a1,LOC101473796,LOC107101682,LOC107375271,LOC102080853)



Basic Information


Item Value
gene id col23a1a
gene name col23a1,LOC101473796,LOC107101682,LOC107375271,LOC102080853
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053121.1
NCBI id CM020918.1
chromosome length 40300294
location 18415035 ~ 18538453 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


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Function


symbol description
col23a1 Predicted to enable identical protein binding activity. Predicted to be an extracellular matrix structural constituent. Predicted to be involved in extracellular matrix organization. Part of collagen-containing extracellular matrix.

NR:

description
PREDICTED: collagen alpha-1(XXIII) chain isoform X2

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ctbp1 LOC107375331,LOC102204710,LOC101481404,LOC102780827,LOC100707048,LOC104922705,LOC103359200 coding downstream 32655 18367171 ~ 18382380 (-)
clk4a LOC103354367,LOC101475428 coding upstream 948 18539401 ~ 18548715 (-)
LOC120566508 rasgef1c coding upstream 15216 18553669 ~ 18606715 (-)
mapk9 mapk9 coding upstream 81680 18620133 ~ 18640808 (-)
gfpt2 LOC108240504,LOC102303939,LOC102210943,LOC106517552 coding upstream 104039 18642492 ~ 18658559 (-)
LOC120567095 kiaa1191 coding upstream 127611 18666064 ~ 18677366 (-)
G105835 NA non-coding downstream 379278 18035382 ~ 18035757 (-)
G105834 c1qtnf2,LOC103471225 non-coding downstream 379787 18033407 ~ 18035248 (-)
G105827 LOC108238064 non-coding downstream 391139 18022437 ~ 18023896 (-)
G105820 NA non-coding downstream 399108 18015451 ~ 18015927 (-)
G105806 atp7a non-coding downstream 434737 17978312 ~ 17980298 (-)
G105967 LOC100708117 non-coding upstream 11657 18550110 ~ 18551684 (-)
G106057 NA non-coding upstream 171589 18710042 ~ 18729032 (-)
G106066 NA non-coding upstream 460087 18998540 ~ 18999875 (-)
G106068 NA non-coding upstream 463319 19001772 ~ 19002114 (-)
G106073 NA non-coding upstream 508811 19047264 ~ 19047863 (-)
reep2 reep2,LOC102782871 other downstream 100620 18285958 ~ 18314415 (-)
LOC120566360 fabp6,LOC102785055,LOC101485489 other downstream 346543 18067425 ~ 18068492 (-)
sfxn1 sfxn1,LOC103359221,LOC100705454,LOC106517750,LOC103471194 other downstream 419685 17987196 ~ 17995350 (-)
LOC120566288 NA other downstream 555280 17857084 ~ 17859755 (-)
LOC120567448 LOC103359144,LOC108240510,LOC107375047,LOC100701092,LOC102792911,LOC102297680,LOC101469512 other downstream 619644 17783560 ~ 17795391 (-)
LOC120566257 NA other upstream 149335 18687788 ~ 18691410 (-)
rgs14b rgs14 other upstream 479299 19017752 ~ 19044951 (-)
LOC120566717 LOC102215832 other upstream 677536 19215989 ~ 19250436 (-)
tomm5 NA other upstream 897386 19435839 ~ 19436927 (-)
tlr1 LOC104951710,LOC102197886 other upstream 939477 19477930 ~ 19482625 (-)

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