LOC120567755



Basic Information


Item Value
gene id LOC120567755
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 235257 ~ 243099 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU149261
gagtgtgtgggaGCAGCATGCAGCAGATCTACAGACAGAGCAACCAAGAGTTTGAAGTTTTTACCACCGTCTTCTCCCCACAAGtgtccCGGGCCAGGACGAGGACTCGACATGTGGAGACAGAGGTGTTGGTGGTGAAGCAGCACCGGTCCCGCTGGCAGAGGGAGCTGGACCTGGACCCGGGAGACCTGAtccaggttctggttcaggagGACGAGGCCTGGTGGTTCGGACGGCTCGCCAACGGAGACGAGGGCTACTTCCTGCGCATGCGTCCAAACGCTGCAGGAGAGGCGGCGCATCAGCGCCTTCACCGGGCCGCCCGGCGCCGGCTGTAACCCGTCCAGAGCCACACCCACGCTGGTGAGGAGGGGGTCGGTACCGGTCGCCGTGACGACAGCAGGCGCCCAATGTGGCTGCACCAGCGGTCTCAGCACTCCGAAGCTGCTGAGGAAGAACAGCATCCTGCGTCCGCTGGGACTCGATGGGTCCCCGGTGGCGTCCGGGCCCCCCAGCTCCCCCAGCCTCCTCCACCGAGTCCTGGCCAAGTCCCGGAGGAAGAGCTGCCCccacctcccccacccccctcccccggAGAACGGCTCTGTCAACACAGCCTTCCTGCCGGACTAGACTGaagactagggttgggcatcgtttggattttaatgattctgattccaattcttcCTTCTGATTCCGGTTCTCATCGATTCTTGATTCAGATTCTTTgatggtggagttgaaacgggtcacatgcctattttcacaaataagaggaaagttttatttttattcaaagggtgggttgcagtttgacggggctttttcaatgtaaaataaagccccactagagcaccgcttactgtgctccatggctgcaacacaacaagcgcctagTCGCTATGGAAACCCaaacttgcgcatattaaattggGAACCCGTGATCAGAtctgaaaccaaatcctccaaacgattccaataaagaaacgattctgtTCGatggaatcggttctcgatgcccaaccctactgaaGACCGCGCAGCtctgtggccggttagctcagtcggtagagcgggcgcacatgtgCAGAGGCTCGTTCCTCGACACAGAAGGTCcaagggtttgaatccgacctgtgacggtccccccccccccctttcatgtctcagCTTTCCTGTCCaataaagacagaaataaaagtagggctgcacaatatatcgtttgtTCATCGTTATCGCAATAATCAAAAGGCGCAATTTACACATCGCGTAAGGCTGCGATAAATCCAATATACACTCATAGATTTTTGTGTCAATTGAAAGAAAATTTCGGTAGAAAAATGCACTTTTAAAAGAAACGGGCATTCTGTTTTTGGTGGGGCACCGCTAAACAGCTGCAAGTCCAACAAATCCTGAGTTTGAATTGCCTGCGGTTACATAAGATAACAACAGCAATAGCAACTGGCGCAATGAACACAATGTGAAAGACACCAAAGAAAAGatcagctttaaaatgtaaatgtcattCTTTCtctagtgctgccttttatattcaattcaatgtttgtTCAacaggcaaggcagctttatttgtagagcacatttcagcaaccgggcaattaaaagtgctttacataaaaacaattaACTACTAGATTAATTACTAGATTAATTAAAAActagaataaaagttacagtgcagtataagaaattaaacattaaagcgcAGTTAAAAACAggtaaacatataaaagcagatagaATACGAGATTTTAGGCTGCTACTATGGGACAATGTATAAGCCGTTGCTCTATACAcgtaataaaaaatgttaaatgattTCATTTCGTTAGttataaattcaacaagcagtttgttgaaTTTTGTCTGAAAGCAGCagacgtaaaaatatcccccTTTCTAAGTAGTCTACCGTCAGCtagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctacctctagctagctactctctctgtagtctactgttagctagctagtctaCCGTCAGCTAGCTACTCTCTCTGAagtctactgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctactgttagctagctagtctaCCGTCAGCtagctactctctctgtagtctactgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtcgtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagttagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctagctaccgtaaatgtaggctacttttaaaatgccatattttcccctctgggctcaccaaaacagacgtaaaagcatattaaccagtCACTGCACGTGATTGATAGTAAATTATATTacttctttttcagtttttccaaaataggtttaggaatcggaatcgtaaaaatccaacgGTACCTAACCCTCCCGAAAACTGGCCGAAAACTTAATGCAGTAAAAATCTTTTAGTCAGAAAACAAAAAGCTGATTgttattaaaatgtgtaaaacgGTGAAATGTGTGAGAGAATTAGACAGCGAGTCGTGTTCAGCCTCTGGGTTTTTATTGCTCATCTGGAACAATGTTAATAAAGTTTTATGTAcgaaaaacaatttaaatgaaaGAATACAAACATGTCGACTGTGTACACTAGATGTCATTCAAACATTAAAAACTCTGAATTACAATCAACA
>TU149262
gagtgtgtgggaGCAGCATGCAGCAGATCTACAGACAGAGCAACCAAGAGTTTGAAGTTTTTACCACCGTCTTCTCCCCACAAGtgtccCGGGCCAGGACGAGGACTCGACATGTGGAGACAGAGGTGTTGGTGGTGAAGCAGCACCGGTCCCGCTGGCAGAGGGAGCTGGACCTGGACCCGGGAGACCTGAtccaggttctggttcaggagGACGAGGCCTGGTGGTTCGGACGGCTCGCCAACGGAGACGAGGGCTACTTCCTGCGCATGCGTCCAAACGCTGCAGGAGAGGCGGCGCATCAGCGCCTTCACCGGGCCGCCCGGCGCCGGCTGTAACCCGTCCAGAGCCACACCCACGCTGGTGAGGAGGGGGTCGGTACCGGTCGCCGTGACGACAGCAGGCGCCCAATGTGGCTGCACCAGCGGTCTCAGCACTCCGAAGCTGCTGAGGAAGAACAGCATCCTGCGTCCGCTGGGACTCGATGGGTCCCCGGTGGCGTCCGGGCCCCCCAGCTCCCCCAGCCTCCTCCACCGAGTCCTGGCCAAGTCCCGGAGGAAGAGCTGCCCccacctcccccacccccctcccccggAGAACGGCTCTGTCAACACAGCCTTCCTGCCGGACTAGACTGaagactagggttgggcatcgtttggattttaatgattctgattccaattcttcCTTCTGATTCCGGTTCTCATCGATTCTTGATTCAGATTCTTTgatggtggagttgaaacgggtcacatgcctattttcacaaataagaggaaagttttatttttattcaaagggtgggttgcagtttgacggggctttttcaatgtaaaataaagccccactagagcaccgcttactgtgctccatggctgcaacacaacaagcgcctagTCGCTATGGAAACCCaaacttgcgcatattaaattggGAACCCGTGATCAGAtctgaaaccaaatcctccaaacgattccaataaagaaacgattctgtTCGatggaatcggttctcgatgcccaaccctactgaaGACCGCGCAGCtctgtggccggttagctcagtcggtagagcgggcgcacatgtgCAGAGGCTCGTTCCTCGACACAGAAGGTCcaagggtttgaatccgacctgtgacggtccccccccccccctttcatgtctcagCTTTCCTGTCCaataaagacagaaataaaagtagggctgcacaatatatcgtttgtTCATCGTTATCGCAATAATCAAAAGGCGCAATTTACACATCGCGTAAGGCTGCGATAAATCCAATATACACTCATAGATTTTTGTGTCAATTGAAAGAAAATTTCGGTAGAAAAATGCACTTTTAAAAGAAACGGGCATTCTGTTTTTGGTGGGGCACCGCTAAACAGCTGCAAGTCCAACAAATCCTGAGTTTGAATTGCCTGCGGTTACATAAGATAACAACAGCAATAGCAACTGGCGCAATGAACACAATGTGAAAGACACCAAAGAAAAGatcagctttaaaatgtaaatgtcattCTTTCtctagtgctgccttttatattcaattcaatgtttgtTCAacaggcaaggcagctttatttgtagagcacatttcagcaaccgggcaattaaaagtgctttacataaaaacaattaACTACTAGATTAATTACTAGATTAATTAAAAActagaataaaagttacagtgcagtataagaaattaaacattaaagcgcAGTTAAAAACAggtaaacatataaaagcagatagaATACGAGATTTTAGGCTGCTACTATGGGACAATGTATAAGCCGTTGCTCTATACAcgtaataaaaaatgttaaatgattTCATTTCGTTAGttataaattcaacaagcagtttgttgaaTTTTGTCTGAAAGCAGCagacgtaaaaatatcccccTTTCTAAGTAGTCTACCGTCAGCtagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtcgtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagttagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctagctaccgtaaatgtaggctacttttaaaatgccatattttcccctctgggctcaccaaaacagacgtaaaagcatattaaccagtCACTGCACGTGATTGATAGTAAATTATATTacttctttttcagtttttccaaaataggtttaggaatcggaatcgtaaaaatccaacgGTACCTAACCCTCCCGAAAACTGGCCGAAAACTTAATGCAGTAAAAATCTTTTAGTCAGAAAACAAAAAGCTGATTgttattaaaatgtgtaaaacgGTGAAATGTGTGAGAGAATTAGACAGCGAGTCGTGTTCAGCCTCTGGGTTTTTATTGCTCATCTGGAACAATGTTAATAAAGTTTTATGTAcgaaaaacaatttaaatgaaaGAATACAAACATGTCGACTGTGTACACTAGATGTCATTCAAACATTAAAAACTCTGAATTACAATCAACA
>TU149263
gagtgtgtgggaGCAGCATGCAGCAGATCTACAGACAGAGCAACCAAGAGTTTGAAGTTTTTACCACCGTCTTCTCCCCACAAGtgtccCGGGCCAGGACGAGGACTCGACATGTGGAGACAGAGGTGTTGGTGGTGAAGCAGCACCGGTCCCGCTGGCAGAGGGAGCTGGACCTGGACCCGGGAGACCTGAtccaggttctggttcaggagGACGAGGCCTGGTGGTTCGGACGGCTCGCCAACGGAGACGAGGGCTACTTCCTGCGCATGCGTCCAAACGCTGCAGGAGAGGCGGCGCATCAGCGCCTTCACCGGGCCGCCCGGCGCCGGCTGTAACCCGTCCAGAGCCACACCCACGCTGGTGAGGAGGGGGTCGGTACCGGTCGCCGTGACGACAGCAGGCGCCCAATGTGGCTGCACCAGCGGTCTCAGCACTCCGAAGCTGCTGAGGAAGAACAGCATCCTGCGTCCGCTGGGACTCGATGGGTCCCCGGTGGCGTCCGGGCCCCCCAGCTCCCCCAGCCTCCTCCACCGAGTCCTGGCCAAGTCCCGGAGGAAGAGCTGCCCccacctcccccacccccctcccccggAGAACGGCTCTGTCAACACAGCCTTCCTGCCGGACTAGACTGaagactagggttgggcatcgtttggattttaatgattctgattccaattcttcCTTCTGATTCCGGTTCTCATCGATTCTTGATTCAGATTCTTTgatggtggagttgaaacgggtcacatgcctattttcacaaataagaggaaagttttatttttattcaaagggtgggttgcagtttgacggggctttttcaatgtaaaataaagccccactagagcaccgcttactgtgctccatggctgcaacacaacaagcgcctagTCGCTATGGAAACCCaaacttgcgcatattaaattggGAACCCGTGATCAGAtctgaaaccaaatcctccaaacgattccaataaagaaacgattctgtTCGatggaatcggttctcgatgcccaaccctactgaaGACCGCGCAGCtctgtggccggttagctcagtcggtagagcgggcgcacatgtgCAGAGGCTCGTTCCTCGACACAGAAGGTCcaagggtttgaatccgacctgtgacggtccccccccccccctttcatgtctcagCTTTCCTGTCCaataaagacagaaataaaagtagggctgcacaatatatcgtttgtTCATCGTTATCGCAATAATCAAAAGGCGCAATTTACACATCGCGTAAGGCTGCGATAAATCCAATATACACTCATAGATTTTTGTGTCAATTGAAAGAAAATTTCGGTAGAAAAATGCACTTTTAAAAGAAACGGGCATTCTGTTTTTGGTGGGGCACCGCTAAACAGCTGCAAGTCCAACAAATCCTGAGTTTGAATTGCCTGCGGTTACATAAGATAACAACAGCAATAGCAACTGGCGCAATGAACACAATGTGAAAGACACCAAAGAAAAGatcagctttaaaatgtaaatgtcattCTTTCtctagtgctgccttttatattcaattcaatgtttgtTCAacaggcaaggcagctttatttgtagagcacatttcagcaaccgggcaattaaaagtgctttacataaaaacaattaACTACTAGATTAATTACTAGATTAATTAAAAActagaataaaagttacagtgcagtataagaaattaaacattaaagcgcAGTTAAAAACAggtaaacatataaaagcagatagaATACGAGATTTTAGGCTGCTACTATGGGACAATGTATAAGCCGTTGCTCTATACAcgtaataaaaaatgttaaatgattTCATTTCGTTAGttataaattcaacaagcagtttgttgaaTTTTGTCTGAAAGCAGCagacgtaaaaatatcccccTTTCTAAGTAGTCTACCGTCAGCtagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctactgttagctagctagtctaCCGTCAGCtagctactctctctgtagtctactgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtcgtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctaactactctctctgtagtgtaccgttagctagctagtctctctgtagtctaccgttagctagctagtctctagctaccgtaaatgtaggctacttttaaaatgccatattttcccctctgggctcaccaaaacagacgtaaaagcatattaaccagtCACTGCACGTGATTGATAGTAAATTATATTacttctttttcagtttttccaaaataggtttaggaatcggaatcgtaaaaatccaacgGTACCTAACCCTCCCGAAAACTGGCCGAAAACTTAATGCAGTAAAAATCTTTTAGTCAGAAAACAAAAAGCTGATTgttattaaaatgtgtaaaacgGTGAAATGTGTGAGAGAATTAGACAGCGAGTCGTGTTCAGCCTCTGGGTTTTTATTGCTCATCTGGAACAATGTTAATAAAGTTTTATGTAcgaaaaacaatttaaatgaaaGAATACAAACATGTCGACTGTGTACACTAGATGTCATTCAAACATTAAAAACTCTGAATTACAATCAACA
>XM_039814765.1
gcgcagagagagagagtgtgtgggaGCAGCATGCAGCAGATCTACAGACAGAGCAACCAAGAGTTTGAAGTTTTTACCACCGTCTTCTCCCCACAAGtgtccCGGGCCAGGACGAGGACTCGACATGTGGAGACAGAGGTGTTGGTGGTGAAGCAGCACCGGTCCCGCTGGCAGAGGGAGCTGGACCTGGACCCGGGAGACCTGAtccaggttctggttcaggagGACGAGGCCTGGTGGTTCGGACGGCTCGCCAACGGAGACGAGGGCTACTTCCTGCGCATGCGTCCAAACGCTGCAGGAGAGGCGGCGCATCAGCGCCTTCACCGGGCCGCCCGGCGCCGGCTGTAACCCGTCCAGAGCCACACCCACGCTGGTGAGGAGGGGGTCGGTACCGGTCGCCGTGACGACAGCAGGCGCCCAATGTGGCTGCACCAGCGGTCTCAGCACTCCGAAGCTGCTGAGGAAGAACAGCATCCTGCGTCCGCTGGGACTCGATGGGTCCCCGGTGGCGTCCGGGCCCCCCAGCTCCCCCAGCCTCCTCCACCGAGTCCTGGCCAAGTCCCGGAGGAAGAGCTGCCCccacctcccccacccccctcccccggAGAACGGCTCTGTCAACACAGCCTTCCTGCCGGACTAGACTGaagactagggttgggcatcgtttggattttaatgattctgattccaattcttcCTTCTGATTCCGGTTCTCATCGATTCTTGATTCAGATTCTTTgatggtggagttgaaacgggtcacatgcctattttcacaaataagaggaaagttttatttttattcaaagggtgggttgcagtttgacggggctttttcaatgtaaaataaagccccactagagcaccgcttactgtgctccatggctgcaacacaacaagcgcctagTCGCTATGGAAACCCaaacttgcgcatattaaattggGAACCCGTGATCAGAtctgaaaccaaatcctccaaacgattccaataaagaaacgattctgtTCGatggaatcggttctcgatgcccaaccctactgaaGACCGCGCAGCtctgtggccggttagctcagtcggtagagcgggcgcacatgtgCAGAGGCTCGTTCCTCGACACAGAAGGTCcaagggtttgaatccgacctgtgacggtccccccccccccctttcatgtctcagCTTTCCTGTCCaataaagacagaaataaaagtagggctgcacaatatatcgtttgtTCATCGTTATCGCAATAATCAAAAGGCGCAATTTACACATCGCGTAAGGCTGCGATAAATCCAATATACACTCATAGATTTTTGTGTCAATTGAAAGAAAATTTCGGTAGAAAAATGCACTTTTAAAAGAAACGGGCATTCTGTTTTTGGTGGGGCACCGCTAAACAGCTGCAAGTCCAACAAATCCTGAGTTTGAATTGCCTGCGGTTACATAAGATAACAACAGCAATAGCAACTGGCGCAATGAACACAATGTGAAAGACACCAAAGAAAAGatcagctttaaaatgtaaatgtcattCTTTCtctagtgctgccttttatattcaattcaatgtttgtTCAacaggcaaggcagctttatttgtagagcacatttcagcaaccgggcaattaaaagtgctttacataaaaacaattaACTACTAGATTAATTACTAGATTAATTAAAAActagaataaaagttacagtgcagtataagaaattaaacattaaagcgcAGTTAAAAACAggtaaacatataaaagcagatagaATACGAGATTTTAGGCTGCTACTATGGGACAATGTATAAGCCGTTGCTCTATACAcgtaataaaaaatgttaaatgattTCATTTCGTTAGttataaattcaacaagcagtttgttgaaTTTTGTCTGAAAGCAGCagacgtaaaaatatcccccTTTCTAAGTAGTCTACCGTCAGCtagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctaccgttagctagctactctctctgtagtctaccgttagctagctagtctacc

Function


GO:

id name namespace
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport biological_process
GO:0006813 potassium ion transport biological_process

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU149261 True 3122 TUCP 0.46 5 235257 243086
TU149262 False 2896 TUCP 0.46 6 235257 243086
TU149263 False 2874 TUCP 0.46 7 235257 243086
XM_039814765.1 False 2048 mRNA 0.48 5 236344 243099

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC120568960 LOC103372168,LOC101474198,LOC102083149 coding downstream 145315 64577 ~ 89942 (-)
ttc19 ttc19,LOC107081472 coding downstream 171797 52608 ~ 63460 (-)
LOC120568662 NA coding downstream 189276 274 ~ 45981 (-)
LOC120567752 NA coding upstream 66010 309109 ~ 310062 (-)
LOC120569059 NA coding upstream 83327 326426 ~ 327379 (-)
LOC120569047 LOC100692494,LOC102787312,LOC101472913,LOC107080869 coding upstream 145592 388691 ~ 397504 (-)
LOC120568379 NA coding upstream 155935 399034 ~ 417701 (-)
LOC120568383 NA coding upstream 176802 419901 ~ 433183 (-)
G110874 NA non-coding downstream 5034 173655 ~ 230223 (-)
G110865 NA non-coding downstream 32938 151167 ~ 202319 (-)
G110878 NA non-coding downstream 37021 197870 ~ 198236 (-)
G110846 NA non-coding downstream 84295 149998 ~ 150962 (-)
G110859 NA non-coding downstream 93356 119654 ~ 141901 (-)
G110896 NA non-coding upstream 13282 256381 ~ 269399 (-)
G110899 NA non-coding upstream 17504 260603 ~ 260948 (-)
G110895 NA non-coding upstream 24036 267135 ~ 372691 (-)
G110898 NA non-coding upstream 132214 375313 ~ 397191 (-)
G110925 NA non-coding upstream 254445 497544 ~ 543185 (-)
G110840 NA other downstream 60392 57407 ~ 174865 (-)
adhfe1 adhfe1 other upstream 14976 258075 ~ 302142 (-)
G110889 LOC100692763,LOC108229211,LOC107383400 other upstream 132613 375712 ~ 382665 (-)
G110957 NA other upstream 511164 754263 ~ 766300 (-)
G110988 NA other upstream 606083 849182 ~ 849492 (-)
G111136 NA other upstream 761972 1005071 ~ 1005925 (-)

Expression



Co-expression Network