G111404


Basic Information

Item Value
gene id G111404
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 2565135 ~ 2667938 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU150017
gtgtgtgtctgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgggtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcggtgtatgtcggtgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtctgtgtttgcgtgtgtgtttgcacatgtgtgtgtctgtctgtctttctacgtgtgtgtctgtctgtctgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgagtctgtgtgcatgtgtgtgtctttgtctgcctccatatgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtcggtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcgcgcatgtctctgtgcgtgtgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgcatgtctatgtgtgcatgtgtg
>TU150021
gtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctg
>TU150022
ctgtgtgagtgtgtgcgtgtgtgcctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgagtctgtgtgcatgtgtgtgtctttgtctgcctccatatgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtcggtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcgcgcatgtctctgtgcgtgtgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgcatgtctatgtgtgcatgtgtg
>TU150023
gtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtctctgtgtgtgtg
>TU150028
gtgtgtctgttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgttctctgtgtgtgtgtgtttctctgtgtatgtgtctgttctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtgtgtgtgtgt
>TU150029
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgagtctgtgtgcatgtgtgtgtctttgtctgcctccatatgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtcggtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcgcgcatgtctctgtgcgtgtgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgcatgtctatgtgtgcatgtgtg
>TU150031
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctccgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgagtctgtgtgcatgtgtgtgtctttgtctgcctccatatgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtcggtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgcgtctgtgtccatctgtgtctgtctgtgtgcgcgcatgtctctgtgcgtgtgtctgtgtgcatgtgtgtgtgtctgtgtgcatgtctatgtgtgcatgtgtg
>TU150032
tctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU150017 True 675 TUCP 0.50 3 2572188 2636043
TU150021 False 287 lncRNA 0.49 3 2583902 2618703
TU150022 False 501 lncRNA 0.51 3 2571176 2636043
TU150023 False 209 lncRNA 0.50 3 2565867 2667938
TU150028 False 252 lncRNA 0.48 4 2565135 2625329
TU150029 False 496 lncRNA 0.51 2 2579853 2636043
TU150031 False 537 TUCP 0.51 4 2615577 2636043
TU150032 False 250 lncRNA 0.49 2 2565686 2618703

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120568517 NA coding upstream 100295 2463673 ~ 2464840 (+)
LOC120567899 NA coding upstream 343244 2221448 ~ 2221891 (+)
LOC120567900 NA coding upstream 385532 2179109 ~ 2179603 (+)
LOC120567901 NA coding upstream 403658 2158796 ~ 2161477 (+)
LOC120568513 NA coding upstream 406570 2154935 ~ 2158565 (+)
LOC120568826 LOC106675582 coding downstream 64668 2732606 ~ 2733898 (+)
ptmab NA coding downstream 630926 3298864 ~ 3304226 (+)
LOC120568524 NA coding downstream 928477 3596415 ~ 3600572 (+)
LOC120568326 NA coding downstream 1047628 3715566 ~ 3715955 (+)
LOC120568529 NA coding downstream 1135960 3803898 ~ 3807690 (+)
G111401 NA non-coding upstream 9123 2555391 ~ 2556012 (+)
G111389 NA non-coding upstream 10360 2501893 ~ 2554775 (+)
G111392 lamc1,LOC103398751,LOC104953968 non-coding upstream 45679 2514154 ~ 2519456 (+)
LOC120568944 NA non-coding upstream 90350 2473964 ~ 2474785 (+)
G111370 NA non-coding upstream 129656 2415364 ~ 2435479 (+)
G111455 NA non-coding downstream 69678 2737616 ~ 2742300 (+)
G111461 NA non-coding downstream 100866 2768804 ~ 2772238 (+)
G111464 NA non-coding downstream 125646 2793584 ~ 2793985 (+)
LOC120568650 NA non-coding downstream 129150 2797088 ~ 2798606 (+)
G111448 NA non-coding downstream 175765 2843703 ~ 2889240 (+)
LOC120568516 NA other upstream 124792 2439709 ~ 2440343 (+)
LOC120568515 NA other upstream 265255 2282608 ~ 2299880 (+)
G111358 NA other upstream 293208 2271639 ~ 2271927 (+)
LOC120568514 NA other upstream 327575 2234821 ~ 2237560 (+)
LOC120567898 NA other upstream 474396 2090229 ~ 2090739 (+)
LOC120568825 NA other downstream 74486 2742424 ~ 2751572 (+)
rasal2 NA other downstream 119841 2787779 ~ 2826854 (+)
G111452 NA other downstream 149006 2816944 ~ 2824588 (+)
G111484 NA other downstream 263701 2931639 ~ 3066029 (+)
G111486 LOC107102160,LOC102799505,LOC103352980 other downstream 270211 2938149 ~ 2940848 (+)

Expression


Co-expression Network