G111717


Basic Information

Item Value
gene id G111717
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 3445400 ~ 3450042 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU150528
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>TU150529
aaggtgcttttatttttaacagtCTGCAATGCTTCTGATGTACGCACTTCCTGCCGTTGCAGTAGaacacaaatataaacaaattatACAACAAAATGCTTCAGGGAAGTACTTCTTGATTAAATAAACAAACTACAAATTAAATTAGTGATCATCATGATCAGCTGCGTTATTATGCAACTTCGAGGCAAGAcgcttcaatagcattcacgtgctactattggccaggtgcccatgcttacgcaaggcaATGTAACCcgatgtggtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgcgtgtgtggtcagtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgcatgtatgtttgtgcttgtgtgtgtgtccctgaccaatcggctatcctaaactttaaccactcgaggtcaatgcctaaccccaaccaatcgggctgcttggtagggcgggacttgccaaGAAGTTGCGTAGGAGCCATAATAACGCTGATCAGCTGGgagttgcaacacacacacacacacgcacacgcacacgcacgcacacacacgcacgttgAATATGAACTTTTCTTTCCTGATTCTGAACAAAACTTCCaagaaaaaacaactttttaaattaaaatgtgcagctcgtcaaacagaaaataaataaacacagacaGTCTGACTTATTACTAAGGCTGTCGACTCACATAATTTTCTCAACTAAAATCGATTAGTTCATGTAATTAGGGCTGGATTCTCCAATTAAAACCGATCTTTGTTCCAAAATTCGGGATCTTTTAACATCTGCCTTCTCACCCTGGGTGTAGGGAGTAAAAAgtcctttaaaaacaaactttttgggGCTCAGTTTActtaatgtaaacatgaacCTTGTGCATTATAGAATATATCTGGAGGTTAGCTTCTTTCTTGTACAAGTTCTCAgaagaatctcttttatatccgAGCTAAagttagcctggaaatccacACCCAAATCTGAAAGgttaagggtctggcattgagtaatgaaaatggcccaactcgaggggcatgcatttgaaaatctcactgcacgcgattggataacactacgaccaatcacaacaatacacagggTGACGTATCCCCATatagctaactggtagattagactctcagctaccagaggagctaactggtagattagactctcagctaccagaggagctaactggtagattagactCTCAGCTACCAGAGGaactaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattagactcttagctaccagaggagctaactggtagattaaactctcagctaccagaggagctaactggtagattaaactcttagctaccagaggagctaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattaaactcttagctaccagaggagctaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattaatctcttagctaccagaggagctaactggtagattaaactgtcatcatctgtttagctcgcctctggcctgcctatatcagatacaccgatgtgattggtgcagcttggCTGCAAGGGCATAGCTAATGATCATCATTACTCAAGGTCAGTGCCAATGCCAATTACTCAGTGGCACCAAAAAAGGCCCATCAGTCAACTCCGGGCGGATCTGCTGATTACAGACGCCAGCAAACTAAGTGACACTGAATTGGAAATGTGATCCTATCAGGACCATGTGAATGGGAATCCAATCTGAGACCCAGCCCCAATTCTAATCGACAATGCAACGCAAAATGATGCAAAAGCTCCACTTTAAAAGCACAGATGtgctgataaaaaaacaaacagaaaaagcacaaaaaattacaagttaacaacaaaaaaaatcttagttggctgaaactagggatgcacagaaccctacgcttgcactaggCGAGCTACGCTGGTTGCAgtagtgacggcgccgttgattatgggacatggatctggtgagcagaaaaagttgttgtttggcagtactttcagtcaaaagaagaccattcaagtccagctacatgttcaatctgttcaatgctgattggtctggtggtggcgaggaccctaaactatacacaacatggccgctgttacaacatctggtacgaaacatctgaaagaatacgagttgagcacgaaggaatctccagacagcagccagaatgcagcaacttcaggtacagcaaaggaaagacagtcactgtttacttcattcatgtgtttactgggttcatggactgaggatgggaggaggaggcagcACAATCTGAATTTATACTGCACCATCAATTTTATTCTCGTCTTTTATCTAGTGggattttttgaacagataaacGGACATATTTCTGAGAATTTCTCCAATGCGGGTGGGACATTTATGATACAATCTAAAAAGGAAAACAGTTGGAACTGTTTAGGTTTTTGCAAAAGTGTGCCTGATTAAACTAAGCCTTATAGCGACTGCTATACTGTAGGTAAAGAGAAGTACTCCCACTCTTGTTATAGGTAACGAGAGTACAAAGTCACATGATCCTGCAGGGCCCGTAGTGAATGAGATGGTAAAGAAATATGGTCCTGCCTGCCTTTGTTTTTatcgttttctaactgctctttaatgttttatgtaaagcactttgaattgccctgttgcttaaatgtgctctacaaataaagctgccttgccttaaccagtggattctaGGGCTGCTCTCTCttagtagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagggctgctccctcttagtggattagtggactaatcggtggttttggtcttagtccacttagatttctttagtccattagtcatgtctgatgccgttttcatgctgaatgacttatttccaagaaacgtacgagctcatctctggtaaacacaagaattaaagtggtgcttttgcggagaaactcagatttacagatctgtcgattaaatcaactaatcgattagtcgatgtGATTGAACGAACGTTAGTCGACTGAGaagttcttcaatcgagcacacaGCCCTGGTGGATTCGGTTTTCAGCcaaaccttgaaaaaaatgtagattcggtgcatccctaactgAAAGAAAAACGGCCGATTAGTCGACCACAACCGACTCAGGGGGGGCGGTCAGTGAGTTATGGTTCTTGTAGTTCATCTTACACGAGTCAGCACTTCGGTGAAATGATTAACACAATTAGTCAGTCCCCGACATGAAAAAAACgtgacaaaaacgtaaaaaaataaaaataaaccagcGTTAAGTGTTAATGTGACTTCCTCAGTTGCTTCAGTCTGTGTCTGAGctctctgctcctcttcctcagcGCGTCCTTCGCGGCGACCAGCCTCCTCTCGTCCTCTCGGATCTCGAAGATGAACTCGGTCGCCGTTTTCAGGATCGCCACTTTGGCGGCCTTGTCGTTGCCGGCCACCGCGGGGACCTCGTCCCTCAGGGCCACGAAGCTCATCTTCAGCTCGTTGCGGCGCTGCCTCTCCAGCACGTTGTGAGTCCTGCGTTTGGCGCCGTCGTCCGAGCCGCTGTCCGAGCGAGGACTCGGAGACGGGCTAGAGCCGCCGCCGCTGCTCTCCGACTTCATCCGTTTGCCGGGAGCCGGTCGGAGAGCTGGCGCTGGCGAGGGCTGCTGGGCGGCGTAGTTGTGCTGGTGGAAGTTGACGTGACAGCGCTTCAGGACCAGCGGCGCCGAGGTGTCCGGGACGCGGCCGGCGTGGGAGCGCCGCGACGCCCTCCGCCGCCGGTCAACCGTCACCACGTCGATCTCGTCTTCCTCGCTGTCTttttcttctgcttcttcttcttcttcttcttctggggAGAAATACGGAAAACATTCTGGTGTTAGGATCACCGGAGGAAACAGGGAACAAGAAAAAGTAAGTTTTTACCATTAGGAttaaatgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaagtgtgtgtctctctttgtgtgtgtgtctctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgcatgtgtgtctttatgtgcatgtgtgcgtaagtgtgtgtctctctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctttgtgtgtgtgtgtgtctctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU150528 False 4205 lncRNA 0.45 2 3445400 3449676
TU150529 True 4355 lncRNA 0.45 3 3445400 3450042

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptmab NA coding upstream 141174 3298864 ~ 3304226 (+)
LOC120568826 LOC106675582 coding upstream 711502 2732606 ~ 2733898 (+)
nmnat2 nmnat2 coding upstream 756184 2665824 ~ 2689216 (+)
LOC120568517 NA coding upstream 980560 2463673 ~ 2464840 (+)
LOC120567899 NA coding upstream 1223509 2221448 ~ 2221891 (+)
LOC120568524 NA coding downstream 146373 3596415 ~ 3600572 (+)
LOC120568326 NA coding downstream 265524 3715566 ~ 3715955 (+)
LOC120568529 NA coding downstream 353856 3803898 ~ 3807690 (+)
LOC120568332 NA coding downstream 365778 3815820 ~ 3825434 (+)
vcpip1 vcpip1,LOC102795816 coding downstream 486589 3936631 ~ 3949566 (+)
G111728 NA non-coding upstream 4321 3440166 ~ 3441079 (+)
G111727 NA non-coding upstream 5987 3439188 ~ 3439413 (+)
G111723 NA non-coding upstream 25509 3419424 ~ 3419891 (+)
G111720 NA non-coding upstream 38727 3406445 ~ 3406673 (+)
G111719 NA non-coding upstream 40075 3405066 ~ 3405325 (+)
G111732 NA non-coding downstream 2129 3452171 ~ 3452899 (+)
G111733 NA non-coding downstream 2929 3452971 ~ 3453769 (+)
G111735 NA non-coding downstream 5607 3455649 ~ 3456553 (+)
G111744 NA non-coding downstream 36813 3486855 ~ 3487207 (+)
G111749 NA non-coding downstream 42831 3492873 ~ 3493094 (+)
LOC120567769 LOC102296991,LOC102211951,LOC102799200,LOC101465856 other upstream 46217 3388054 ~ 3399183 (+)
G111494 NA other upstream 369499 3016958 ~ 3075901 (+)
G111484 NA other upstream 379371 2931639 ~ 3066029 (+)
G111486 LOC107102160,LOC102799505,LOC103352980 other upstream 504552 2938149 ~ 2940848 (+)
G111452 NA other upstream 620812 2816944 ~ 2824588 (+)
LOC120568331 NA other downstream 41547 3491589 ~ 3506128 (+)
LOC120568327 LOC102295145 other downstream 50637 3500679 ~ 3525115 (+)
LOC120568521 NA other downstream 90945 3540987 ~ 3852034 (+)
G111848 NA other downstream 638602 4088644 ~ 4137543 (+)
G111850 LOC102799398 other downstream 640466 4090508 ~ 4138933 (+)

Expression


Co-expression Network