G112400


Basic Information

Item Value
gene id G112400
gene name NA
gene type unknown
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 6251390 ~ 6321990 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU151560
CAAACAGCACAAAATGGTTTATTTTTAACAAGCAGATGCTTGTTACTTATTACACAGCTATAACCCACAAAACCACTGTCAAGTCAATCCAAcaggtttttttcttcttcttctgagaACTGAGCTGTGGTGTTTGTTGTTCTACATCAACCACGTTGGTCACACAAAACACTGTTAACACCAAGGAGCCACAGTTTAACTAGGCTTCACGACGGTGGATTGGCGATGGCCGATGATCAGTGAGGATGTGATCTGGTTTCACCATTGTGATTGAGAGTGTGAAcattattaacattaatatgaatgtgGCAGCATAGTGGCTCAGTGTTGGTAGAAAATGCAGTTCAGTGCAGTGAAACATGTTTAAACTCTCCGCAAGGAAGAAAACGGTATTGGATAAAGTAGagatcacacaaacacacacacaccttgtaaATTTCCTTCACACAAACTAAATGTTTTGTCAGTTAAACCAGGGATGACTCCTTCTTCAGAATGGATTtagggaaaacgcatcaaatgGTCTCATCTCCCATTTCTgctaaaattattttaaataattgctCACTGCAGCTTGAGTAAATACAGGGGAAAATAAAAGCTACAGATCATTGAAGGACTTTTGAGCAAAAGTGCATTCCTACagtgaaaaaaagttgaatttcAAAATACACCTGGAAACGAATATAATTAACTACACACAAAAAAGGTATTTAACATAATGTACACTACTTAAAAATTGCTTTTAGGGAAGTTTAGTCTGCAGCTGATATGTGACTTTCATCAGGCAAACTGATAATTAGCATAAAGCTTATTTATAATTATCCAGATGAAAACTTTAAACTACAAATCACCATCcctggaaaaaaaatgacaaaattaacTCAGTTTTATGTGAATGTAAAGCCTTTGGCAGATGAACTAACATGTCATCAAGTTATAAAAGGCTAaaacaactgctgctgctgaaataCATACAGCCAAAACTGACAACTTTCTTCATATATTACAATTTATATGATACAAATATTACGGTTTTAATGTAAAAGGAGGTTAACACTTTACATTTGACAAGTACTGTAATCACTTTAGTTTGTTAAAGATCTGCATTTATTTGCTCTTAAATGTAACTGCTGTTTATACACCTGTAAAAATCCAAATTTACTTCAACAAACATGGTATTTCTAAGAATTTTCTATTGTTGGAAATACATTTCGCTGGGTAAAACGCGGAAAAAAGGCAGTTGTATAGTGTTACCTAATATACACACGTTTGCGATGTACTTGAATGAAAGCTTTTGTTACTAACCAGCAAACGCTCCACAAATATTAAAGCTAGACGTAGAAAAACCATCAGTTTAAATGGACTGTGCTTGTTCGTCGTGTTAATGCCATAACTCACGAGTACAACAGTTGAACTGCCTGTTATCACAACATTAAACACGTTTTTTGACGTTGATTTGTAtcaccacacagacagacagagttcttgtgacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacaaacacacacccctccCCTTTGGCTGTTTTAGTGGCAGTGGGAAAGCAAAGCAGGTGACAGCAAAATGCATCACGACACTCCTCAAAAGATTTCTATTTTCAAAGTACCATAACAAATATGACACTGACTGAATCCCCTACAACACCAATGACTCTAAAGGGCACTGCCAGAAACTACAAAAATAAGTTGGTTCTTTTACAATCATGTCAAGTACTGGTAAATCGGCAGGGCTGGGCATCCGAGGAACATCAATTACTAAATATTTCAAATCTGATGCCGGTTTTAAATGAATCACTTTGTTTTTGAATCAAATTAGCTTTCATTATATGCTAAAGTGAGTTACTTAATATGTTACATGTACACATAATTTGCCTTTCTCTACTGAAAACAGCACTTATTTTATTCCCAGCTTAAAATGCCCTGACATGAGAACTCCGTGCGTAAATCTTTCTAATTTTTTAAAAGAATTTGACAGGCTTTGTGGGAGTTTAGTCCAATGGTCATGTTAGTACAAAGAGTTATCTCTGTGTAGACTTATCGGTGTCCAAGTGTTTAGTAAcattatgttatgtttttattcaaattaATATTGTTTAATACGTTTTAAGATTTGTGGATGAATTTTAGAATAAGTAGCTGAAGGTTTAAGCTCAAGACGATTAAAAATGGGAGCCAATAGATGCATTTACTTCTGAAAACAAAACCGTTCATCCTTATTCAAGCTCTTAAGTTGTTCAACTACTTATTGTCACGTCCTGCGTGAACAAAAATTGTGGGTGAAGAATTCCCCTGTCATTTAAAGTGCACAATTTCAGGATTATTTTTCAATTTGAGTCAGGAACTAAAATGGAACTAAAATGCATCTTATTGTGTATTTCTGCTTGCGTGTTCTCCGCATTTGAAGATCTGTGAAAATGTTGCCAATTTGTCCGAACAACAGACAGCCATGGTGTTGCTCTTTATAGTTTACAGTTGCACAactgtgacatttaaaaaaggacATCACAACGATGTGAAAAAAAAGGCTGAAACCACCAGAGCGGTCTGCAAAGAAGCAACAATCAGCTGAGTGTTTTgggtttatttatttctattttagtTCATAACCTCCTTGAATTAATTAGAAAATAAAGTTTTGATTCTCTTATTCACTTGCTAGTTCTCGTCATCGCgcacagaattttttttaagtgactTTTTGAAAGACTTTGTCACAAAGTCAACTATATAACTTTAACATCAGTTAACATTACAAGAAACGCCATTTATTTTGTGGAAAGTGTCTACGGTGGAAAAAAGCTCTCCATACTTTTAATACCAAATACCAAAAATTAGTATAACATAGGGTACACTATATATTGTGTCTCAGTACCCAGCCCTGCCTAATAACCATTTCAACAGGTGCTGCTTTAACAAACTACAGATTTGTttgcacacaaacagaaacactgaaATCCCCTTTCCTCCCTGCACACAAGGCTTAGATGGTACAATGTCTACACATCTATCCGCCTCTAAACTGTCGACAGGGCAGGGagttgactttttttctctctggctGGTTCATGGctttacacaaacagaaatgcaaTCCGATCCAGACGTCAACACTGTGAGCAGAGTGACCAATGCACCTTCAAATATAATGTGGGATGTCAAACTGCAGAAAAACCTGTCTACTGGGACCAACACAGTCAGTGAAGAACATACTAAAGCCTCCACACAGGACAGGAAGCGGACGTATGTGACCAGTGTAAGCGTTTCAGTCTATAAAACAGAGATGTCCAAACTAAAAGAGAGACCACACCAGTGGCAGTActgggagagaagaaaaaacagcatccacactggaaaaaaaagccatactgGTGTGGCTCCACAGTGGAAAGAAACAATAACATTGCGACCAGGAAATCTGGATGGCTATCAAACAAAGCTCAACATTTCAATAACTCAAGTGTTTTTGCTAAATTTGTTAAAGAAAATTGCTGAAAATTAAATCTGCaaattaaaattgaattatTATTCACACAAATTAAAAACGGTGCAGGATTTCTTCCTCGTTCACTGACTTTAGTGCTGCTTCTAGTGACTGGAAGCTCTACAAACATTAAAGCAAGTCTTATTTATATATTGGTGTGCACATAACAGTTTGGAGTTTGCTCCTTCTGCCTCAAAAGAATGCAAGATGAACTATTTCATATGTGTTTGATTTCTCTTTTAGGTTACAATCACAAAGTAATTAATGATTTTATATTTTGGTGTCTTTCAGTCCATTCAGGCTGGATATAGTTGTGCAAATGACACTAATAAAAACACCACATATAACATTTTTTTAGCTTTATACCGGCAAAACAGTTTCCTTTCTTATAAGTCATATAGAAGTGAGTTCCTAATTTTAACAAGCTTGTTCAAGTTCAGTCTGAAAGCCATCCAGAATCGTGATCCAGTGCCAACAACATACAAGCATACGTATccacactggagagaaaccGTTCTAGTTCTAACACAGCACCACTGCCAGCACAAGAAATGCTTTTACTCACATTTTTCTCAGGTGGCCACAGAAGAGAAACAAGCAAATGTCAGTTCCTTTAACAGCCATCTAGATTTTTACTACAAAATAAGACCATTATTTGCCAAAGTGTCAACAATCCTACCAGCCATCAGCTGAAACTCAGCTGTTTTCCCATTCTGACTGTGTTGACTATGTACATAAGctgcaaatagtttttttttttcctaaaacaGCAATGAAAAGCTATAAGTATTTTCAAAAAAGGTGCATTATTTATCACACAGTGGTTCCTGAACATCTGAGCTCAGCAGAACCGAGCTGTGACAATATGATGTCCGGTTTAAAAGTGTATTATAGACGTAAAGCTAAGAATTTTAGCGTCAATTATAAGAGTGAGTGCTTCTTTCTTGTGCTATTATTTTGCACCAATGTTCAGCAATCATAACAAGCAGGACATTTAAGAAATTAAATGGCCAAGTTATCACAGATTAACTGCTGAAAACACCAAATTGATTATATAAAACTAGTGGGGTTTCCCTTTAAAGCGTCAGACTCTTGTTCAAACATAAATCTGCTGTTAGTGGCACAGATTAGATTTGCTTAAATCAGCAGCTCACTAATCCAACTCTTCAGCGTTcgctttttaaagtttttaacaAAGACGACGAAGCCTCTCCTATGTTACGTCGCTGTGCTTTTTATCATCAGTGGTacacaggttgttttttttcatctttttgatGGAGAGGAATCGCTTccacacaaaaatatataaccacacacacacacgtacatacaca

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU151560 True 4928 TUCP 0.37 2 6251390 6321990

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120569021 NA coding upstream 728 6191772 ~ 6250662 (+)
trnas-uga_21 NA coding upstream 10487 6240822 ~ 6240903 (+)
trnas-cga_6 NA coding upstream 11128 6240181 ~ 6240262 (+)
stard3nl stard3nl coding upstream 145573 6084729 ~ 6105817 (+)
LOC120568059 NA coding upstream 193906 6055758 ~ 6057484 (+)
LOC120568642 dip2c coding downstream 50443 6372433 ~ 6572346 (+)
LOC120568554 NA coding downstream 422740 6744730 ~ 6745611 (+)
rnf2 rnf2 coding downstream 667511 6989501 ~ 7003033 (+)
LOC120568979 LOC102307644 coding downstream 1066501 7388491 ~ 7466201 (+)
LOC120568864 LOC103365115 coding downstream 1166483 7488473 ~ 7614340 (+)
G112401 NA non-coding upstream 32721 6217893 ~ 6218669 (+)
G112314 NA non-coding upstream 76635 6119845 ~ 6174755 (+)
G112302 NA non-coding upstream 180780 6062803 ~ 6070610 (+)
G112301 NA non-coding upstream 181020 6060958 ~ 6070370 (+)
G112286 NA non-coding upstream 239588 5967053 ~ 6011802 (+)
G112458 NA non-coding downstream 33470 6355460 ~ 6357979 (+)
G112457 NA non-coding downstream 36079 6358069 ~ 6359263 (+)
G112459 NA non-coding downstream 37468 6359458 ~ 6360062 (+)
G112487 NA non-coding downstream 86550 6408540 ~ 6409029 (+)
G112499 NA non-coding downstream 108071 6430061 ~ 6434740 (+)
LOC120568055 NA other upstream 234790 6003685 ~ 6016600 (+)
epdr1 epdr1,LOC104965688 other upstream 257679 5983857 ~ 5993711 (+)
LOC120568547 LOC106674584,LOC106676354,LOC106675207,LOC106675343,LOC106676464,LOC106676424,LOC106675739 other upstream 461973 5788223 ~ 5789417 (+)
dnaaf11 NA other upstream 1659043 4498994 ~ 4592347 (+)
G111910 NA other upstream 1705308 4545425 ~ 4546082 (+)
LOC120568552 dip2c other downstream 252806 6574796 ~ 6682272 (+)
G112562 NA other downstream 419111 6741101 ~ 6770912 (+)
LOC120568557 NA other downstream 550335 6872325 ~ 6873814 (+)
LOC120568216 NA other downstream 568997 6890987 ~ 6949130 (+)
G112655 NA other downstream 685252 7007242 ~ 7009157 (+)

Expression


Co-expression Network