G117405


Basic Information

Item Value
gene id G117405
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 24036655 ~ 24043541 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU158244
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>TU158246
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>TU158247
AAAGAGCATTAAAAAGGCTTTATTTGAGAAAAGTCAGGCACGTGTTGACGAAACATAGCTGATGCAATAACACAGGTAATGAAACATTAGGTTTCATCTGCATGAAAATGGCTACATGTGGACATGATTGATCACAGGATAGTTGTTTTATAAGTTGCGGTAGTGCAATGTATCCAATTGTTGGTTGTACTTCTAAAAACAGTCTACAACACAATCAGTAAGAAAATACACAATGCAATTTTTGGGTTGAGTGTGAGAAGAGTGGGTATGGTGCTCGAATTGCTGAGGGCTGAATGAGTTACAGCATGGTCTATGGTTTCCACTAGTTTTTTTGCTGGCAGGAATGGAAAGTGCAAGATTTCTCCAGATCTGTTggaaacagaaaaagacaaaaactgacTTGGGAATTTCAGAACAGGTACATATCTTTATGGTGTCTGTGATGTGTATAGAATACAAAGATACAATTTTAATGTGAATCTGTTAAATTGCGGTCCAGTTAGTCTTGATTTGGCCAACAACAGTAGTACAAACCTGGAGTGGTTTCACTGCACTTTCTGAGTGAATTTATGGAAATCATGTACTGTTCTCCCAAAAACTCTGCATATGTTTTTCCAGCTGGAACCTCCTGGAGACACTTAGTAGAGTCCTTGAAGAGGAGGTTCTTTCCTGACTCTGACTGGAACATCCTGAATGTGGCATCACTGACACTGCTACCAAACTTGGccGCTGATCCCGGAGAACGTTAACAACCTCGTTTCGGGTCTCTGGACGAGTCACCACAGCGTGGGCGGGCACGACAGCCAGATGACAAGAGGCGTAATCAGTGACTGGCACTGGATTCTTCCCAGGGCAGATCAGCCGGTAGTCAGCAGAGTTCACACCACTAGCCCATGGCGCTACATTATTGCCTTTGACAAGAAAGGTGTAAGAATGTTTGGTagctttataaaataaaaaaaaacttgtgtaTATTTGAGATGAAGACAGGCCAGTGTCAGTCTCTTACCATCACTGTTTTCTGAAACGATTGTGTGTTTGATGAAGGCAACATCGCCGGCATCCTCAACCAGACATCTATAATGATATGCAAAACATAACTTGGGCAATATGAAGATGATGTGTACTAGCCTGAGCATGGTACTCTGGAAGTGTAATTCAAAGGAAGGAAGGTttgtcatttttgaaaaaaacatttagttacTTTGCTAGATGAGAACATTGATATCACTCTCATGCCTGAGTGTTAATTAAGAGCTGGATTTGGGAGGCAGTTAGCTTAGCCTAAATAATTAGGAAACAGTTGGCCTATTAGCAGCTTTAGAGTTGCTGGAAGAACTTTAGAGAGAACCATGTTAGCTGTTTCCTTCTGCTTACAGTCTTTGTGCTAGTCTAGGTTAACAACCTCCTGGTTCAAGGTCCGTACTGAGCTCACAGACATGAGAGTAGTATTAATGTTTTCTAATtctcagaaagaaagcaaatgtgcatatttccaaaaatgtccttccttccttgaacatactgtacatgaacGTAAAATTGTATGCAGAGTAATTGCATTGTTGCGTCCTACCTAAAGGCTCCAGCATAGCCGTAGAACTGCTCTTCAGAACTCGCTTTGCACTTATACTCATCTCCCACAGCTTTGCCACTGCCACGACAATTAGTACAGAATGGAGACGTGATGTTTGCTCCGGGGGCACAGCCGCTACTGAAGAACTGGgctgaagagaggaggagacatAATGTGTTGGTGTTGCACTCAGAGGTGTTGAAAAGGCTATCATGTCTGCTAACAGTTATATTTATACACTACAGAAAGGCTTCACCACATACATTTTGGAGGAAACGTAATTTCTGCCTGGATTATGCTCTCTCACAATGTTCCCAGTCCAGGAAATGTTAGGGTATTCTACTTTACACTACAGAAGTCGTAGGGAGGTGGTCGGGGTGGATGTTGGGTATATGCAAAGTACAGAATTTAGACActttggttaaggttaaggAAAAATTTAGGTTTTAACTAAGACCACAATCttaacctaaccataaccaagtgcttcaAGTTGCCTTAACATATTACAACCATAAAGAAAAGATGTTTTAGTTGCTACAAGTGGACTTTGTAattaaatatgtaaacagtTTGCAACCTTACAGATACTGTGCGTTGAAATATTTCCTCACAATGTTGATGGACAAGATCATCTGGGCATTATGTTTCTTTCTTAAGGGAACGGACAATGCTCATGTATTCAGCACCCAAATACAGGAAGGAATCTGTGTTTGCGGGCACCTGCACCAGCTTCTGTGTTGAGTCCTTGAACATCAGATTTTTGGCAGGTGCATAGGCTTCAGAGGAGAAGAGGTTAAAGTCTGAAAGAGACTGAAGAGAAAAAGCTCATTATGTAAGCACTGAAATACATCGTAAGGGAACTAAAACATAATTGAATGAATCATTTTATATTGTGATTCACTGCATTTCTCCCTCATCTACCTTATCAGGCAACTCTACTACTCTTTGTGCAGTACAAATATTTTGTATCATACCTGTATTGAATTGAGGTTATTCCAGATTAATTGAGCCAGCTGTGGGTCCTTGCGGGTGACAACAGCATGAGCTGGTACTCTGGCCAGGTGGCATCTTTGATAATTGTCGATAGGCGCTCTGGTGTTATCCTTGCACAGCAGCTCGTAGTTGTTCTTTTCAGAGTCCAGGTACAGTAAGATGTTTCACAAAAGCCACATCTCCAGCGCCGTCCTTTAGACACCTATTAAGTAGACCAATCAACATTACAGGTTTGTTTCTGTTACCAGAGGTATAGTGTATATCCACTGGGTTTAAGAAAGcatcaaattaataaaataataaaaatgtcacaGGATTACAGACTGAGCTGTGACAGGTTATCATATTTGGAAGATACATGTGTAGAGGTTGATAAAGGAcagtaaaagtcatagtagaacTGAGAAGGATCAAAGAAAGACTGATACTAACTGGAAGGCTCCGGCGTAGTCGTAGTAAGGCTCATTGTGAGACCTGGAGCAGTCTCCTCTGCACAGCGAACACAGTTTGCTGCCCCTTGTTGCCCCCGGGACACAGCTGGCCGAAAAGAACTCGCTCACCGctgcaaaaca

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU158244 True 4157 lncRNA 0.40 6 24036655 24043541
TU158246 False 3923 lncRNA 0.43 10 24036891 24043541
TU158247 False 3144 lncRNA 0.41 4 24036891 24042022

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
clcn2a clcn2,LOC102213982,LOC102290034 coding upstream 31644 23963949 ~ 24005011 (+)
LOC120567818 gpr55,LOC103396173,LOC103366713 coding upstream 131126 23899208 ~ 23905529 (+)
snorc NA coding upstream 139744 23891144 ~ 23896911 (+)
gigyf2 gigyf2 coding upstream 145687 23870051 ~ 23890968 (+)
trnaw-cca_13 NA coding upstream 168330 23868254 ~ 23868325 (+)
LOC120568612 NA coding downstream 11238 24054779 ~ 24057075 (+)
LOC120569088 NA coding downstream 40155 24083696 ~ 24089942 (+)
cdc20 cdc20,LOC102779045 coding downstream 94614 24138155 ~ 24142097 (+)
bokb LOC103360102,LOC100707238 coding downstream 108619 24152160 ~ 24160339 (+)
kif1ab NA coding downstream 127504 24171045 ~ 24197651 (+)
G117398 NA non-coding upstream 15600 24019654 ~ 24021055 (+)
G117385 NA non-coding upstream 53672 23982191 ~ 23982983 (+)
G117374 NA non-coding upstream 88453 23947926 ~ 23948202 (+)
G117364 NA non-coding upstream 102848 23929848 ~ 23933807 (+)
G117359 NA non-coding upstream 116626 23916758 ~ 23920029 (+)
G117406 NA non-coding downstream 428 24043969 ~ 24044484 (+)
G117476 NA non-coding downstream 106917 24150458 ~ 24150771 (+)
G117487 LOC104957881 non-coding downstream 121313 24164854 ~ 24169555 (+)
G117488 NA non-coding downstream 126127 24169668 ~ 24169953 (+)
G117523 NA non-coding downstream 214013 24257554 ~ 24258831 (+)
G117400 LOC104965054 other upstream 12996 24022441 ~ 24023659 (+)
hes6 LOC104918282,LOC104941260,LOC103366710 other upstream 122157 23912664 ~ 23914498 (+)
G117353 LOC103366712 other upstream 128254 23905870 ~ 23908401 (+)
G117319 LOC101487892,LOC104941256 other upstream 181498 23850879 ~ 23855157 (+)
LOC120567964 dpp6,LOC100710983 other upstream 350851 23592732 ~ 23685804 (+)
LOC120569114 NA other downstream 6223 24049764 ~ 24054704 (+)
LOC120568789 kiaa0040,LOC102782613 other downstream 525987 24569528 ~ 24578312 (+)
LOC120569045 cacybp other downstream 624338 24667879 ~ 24675754 (+)
selenot1a selenot,LOC103365166 other downstream 819455 24862996 ~ 24870087 (+)
G117664 NA other downstream 907027 24950568 ~ 24954247 (+)

Expression


Co-expression Network