LOC120568789 (kiaa0040,LOC102782613)


Basic Information

Item Value
gene id LOC120568789
gene name kiaa0040,LOC102782613
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 24569528 ~ 24578312 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU158430
AACAGAAAGTGAAGACTTGTCAAGATGTCTGGGTGAGGGGGACCAGATCAGAGCAGAAGCCAGATGTCAAAACAGAAACAGCAGAAGTTTGAGCAGCCGACTGGATTAAACAGGAGGGGCGAGCTGACCTGCTACTTCACAGTAAGACACACCCAAATTGAACTACGTCTCTACAAAATCATACTGAAAGCCAAAGGGCAAGAGGACAAGAGAAGAGTGAAGTAGATAACCAGAAAGAAAAGAGTTAGAGGAATGCCAAGCAGCATAAACAAACTTGGCTGAAGTGCAGATTTTGGCTTTTTCATCTTGCATCAAGATCATCACAACTGGGCGATTTCAAAGAAAACCTTGTTATAAACAAATGAGCTTTTGGTCTTTTGGATTTGTTCAAAGAACGCTTTGGCTTTGTAACCACCTCACAGGGCATTTCAAGGAAGGAGGCATACATGAAGTCACCCTCCATGCTTCCACTGTTTCCATTTAACATAAACAACACAAGCCTGAGCGCATACACATGCCTCATCAGATAGTGCCGTAAACTCTGATCTTTAGAAGTAGAAAACAGAAGCACATGAAAGTTCAATGTCAAGTCGCTAAAAATATCTGACGTGTGACAGcttttggctcggtggatgttTGAGGTTTTCGTAAAGAGTAAAACTTCATAACTTACAACTTTAAAGCTGGAACCAGATTCcgtaaaatgacttaaatgaACACCATATCTTAATTAGCTGGATGTCTGCAGCTGCCTAACAGGCACATTAACTGACTTGCAAAATTCACAACCCTCTGAAGGATTTATTAAAACTTTACAACTGCCAGACAGACTCAACTGAAAGGATTCACGGCTCCGTATCCGAAAGCCATGGATGGAAGAACAGACAGCATCCAGGAGTTTTTCAACCAACTTTGGAGCTTTGCTACAGAAAAACACAACCAGGGGGTGTACAACACAGTCTGCCTGGTGGTCCTCCTAACTCTTCCCCTGCTGGTCCTCCTCACCACTTTGGTGGtgtgctgccactgctgctgctgtcgccATGCCAacagctgctgttgctgctgtggcAAAGACGCCATGGCAACCGCAAGGTcagaaacaaagaagaaaaagaattcCACTGAAGACTTGTGGATTTCTGTCAAGACGGGGCCGTTGACACCTGACAGGGTCGCCCTGGCCATGGAGTAGGAGGAGtagttgttatttttatttttttatttctgatcCTGGGTCAGTTGGTGCAGTGGAGCTGATGGAGCGTCTCAAGAGTGTACAACTCAAACCAGCTTGGACTCAAAAGACATAGTTCAAACCAGGggttgatgcatagactgtataagtgaAGCCACAACATTTCAATTGTCCCCTGGTGGCCCGCTACATTATGGGCGGGACTTTGATACCACGGCTCCACCGCCGGATAACTAGTGCGCAGattctggctccaaaataacAAGAAGGCACTTTGTGGAGTAAGTGGAGATGCATGGACcatttttatatacagtctatggttcaaacCAATGAGACGGCACATTGTGATGGGCACAGATATGGTTGAAACATGTTAACAGTGTACAGTCAGTGTTCTCGTCAttttgtatccatatgatgttaTGTCTGGAGAATGTTTACAACATTTTGTATGAGCTTTTTAGTGAGTGGTACATAAAGGAAGAATATGCagaggcatatatatatatatacaaaactgaaatgtgtttgttgatatgagtgtgttagagagagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagagctcCCATGTGAAATTCATTGTGTCTGTATTTGGGAGAAAGAGCCAATGTAAGGTCTGCCCAGTGTTCTGATTGCTGTAAAACTGCACACACTTTTTACATTCAGGCTGCAATCTAGACTCATGATTCACTCtcactttctaaaaaaaaaacatttaaaaagaaaactataAGTTTgatttctttcctcttttcttacTTTATTTGCTTAACCCTTAGATGCATGACCTACCTGTATTACTGAGAAGTGCTGTAATTGCTAGCAGGTTTAGAGCCACTACTAAAATTAATAAATCATATTGAAATAATTTTTGATGGAAAACTGAAAGCGCATGAAATCTTTCAAAACGCGCTTGTCTTTATAGCTTGTAACTATTGTTGCATTCCATAGACTAAAcatttaattgattaaaaattacagtttacaaatttacaaattAAAAGTTGCAGccataatatttacagtctatggttgcacCCCAGCTACTGACAGGAAATGTAAACACGCCAATATTTAGTTTCATCAAGGCTCACTGTCATCGTGACACACTGTAATTGACTGACACAATGTTGAGCACTAATACATTTTCAACTGGAAATGTCAAAGTGCCAACAGACCTTTCTGACATGTTGGTGGTTACCAGTTAGAAATTATATAACTAACTTaaggtaaagtaaagtaaacatGAAGGGATTTTGGTaagcactgtttttttttttatcagatcaGTGATTGGTAGAGAGTATTTAAAATAATGCTAACATTTAGTAAAAATAACCTTCAGGGTGGTGAGACTGCTGGCATTAGATGTGTGGATCAACAGTAAATGTATACCTGACAGTCACAGCTGATAAAAATCAAAGGCTCCTAGGGTTAACCTTTGAAATTCCATAGAAAAtgcttggggtcatttttgaccccacGTATGGAAATGTGTGGTACTGATGCAAAACATGCAATTTTTAACAAATTTAACAATTAGATACAAATCCAAATGGCCTCATGTCAAAAACAACCTATTTGAGGAATACATGGAAgattaaatgataaaaaaatttaattacaAAGATATTGCAAAAAACAACTGctggggtcatttttgaccccacTTATGCATCTAAGGgttaatataatacagtctaGGCCACAGGACTAGTTTTGGTTTTTTGAGTGTTGCAGTAGGCCTGTTCAGGTCAAGTGTGCCTTAAAGGCACAATTCATAATCTAAatggaaggaaaaaaataaactcgGAATATGTTATCCTTCCCACATTGATTGACATAACTTTTAATGCGCTGATTACCACTAGACAGGAACCATATCGATTTCAGTCATGTTTTCTGGGCCCGTATTTATTCAAGTTTTAGATTTAAGTACAATAATTGCCACTTTACTTTTAACAAACTTAAGAGTAAAAGCTATTTTTCTCTTATTCTTACAACTTAAATGCTCttaacattgtgtgtgtgtcagcgtgGTCCTATATTGTCTGATGTACATTGCCTTTTACTTCATCCCTATACATCAAAAGATTGTTGTTGAGTTGTTCATTCCACATGTTCATTGTTAATAGAGATATTAAGGATGTTAAATATATCATATCACTGAGTAAAATGTAAAGatctttttaaacaaagaaTAAGCAATTCGACAGATCCTTGTCTTTGAGTTCTTGAGTTGCCTTGTCTCTAGAGCGTTTTTTAAGCAAATTCTTAGAAGTCTGATTAATACGGGT
>XM_039816494.1
cactcagagagaagaggaggaggggaaacaaggggagagagggaaacaGGAACAGAAAGTGAAGACTTGTCAAGATGTCTGGGTGAGGGGGACCAGATCAGAGCAGAAGCCAGATGTCAAAACAGAAACAGCAGAAGTTTGAGCAGCCGACTGGATTAAACAGGAGGGGCGAGCTGACCTGCTACTTCACAGTAAGACACACCCAAATTGAACTACGTCTCTACAAAATCATACTGAAAGCCAAAGGGCAAGAGGACAAGAGAAGAGTGAAGTAGATAACCAGAAAGAAAAGAGTTAGAGGAATGCCAAGCAGCATAAACAAACTTGGCTGAAGTGCAGATTTTGGCTTTTTCATCTTGCATCAAGATCATCACAACTGGGCGATTTCAAAGAAAACCTTGTTATAAACAAATGAGCTTTTGGTCTTTTGGATTTGTTCAAAGAACGCTTTGGCTTTGTAACCACCTCACAGGGCATTTCAAGGAAGGAGGCATACATGAAGTCACCCTCCATGCTTCCACTGTTTCCATTTAACATAAACAACACAAGCCTGAGCGCATACACATGCCTCATCAGATAGTGCCGTAAACTCTGATCTTTAGAAGTAGAAAACAGAAGCACATGAAAGTTCAATGTCAAGTCGCTAAAAATATCTGACGTGTGACAGcttttggctcggtggatgttTGAGGTTTTCGTAAAGAGTAAAACTTCATAACTTACAACTTTAAAGCTGGAACCAGATTCcgtaaaatgacttaaatgaACACCATATCTTAATTAGCTGGATGTCTGCAGCTGCCTAACAGGCACATTAACTGACTTGCAAAATTCACAACCCTCTGAAGGATTTATTAAAACTTTACAACTGCCAGACAGACTCAACTGAAAGGATTCACGGCTCCGTATCCGAAAGCCATGGATGGAAGAACAGACAGCATCCAGGAGTTTTTCAACCAACTTTGGAGCTTTGCTACAGAAAAACACAACCAGGGGGTGTACAACACAGTCTGCCTGGTGGTCCTCCTAACTCTTCCCCTGCTGGTCCTCCTCACCACTTTGGTGGtgtgctgccactgctgctgctgtcgccATGCCAacagctgctgttgctgctgtggcAAAGACGCCATGGCAACCGCAAGGTcagaaacaaagaagaaaaagaattcCACTGAAGACTTGTGGATTTCTGTCAAGACGGGGCCGTTGACACCTGACAGGGTCGCCCTGGCCATGGAGTAGGAGGAGtagttgttatttttatttttttatttctgatcCTGGGTCAGTTGGTGCAGTGGAGCTGATGGAGCGTCTCAAGAGTGTACAACTCAAACCAGCTTGGACTCAAAAGACATAGTTCAAACCAGGggttgatgcatagactgtataagtgaAGCCACAACATTTCAATTGTCCCCTGGTGGCCCGCTACATTATGGGCGGGACTTTGATACCACGGCTCCACCGCCGGATAACTAGTGCGCAGattctggctccaaaataacAAGAAGGCACTTTGTGGAGTAAGTGGAGATGCATGGACcatttttatatacagtctatggttcaaacCAATGAGACGGCACATTGTGATGGGCACAGATATGGTTGAAACATGTTAACAGTGTACAGTCAGTGTTCTCGTCAttttgtatccatatgatgttaTGTCTGGAGAATGTTTACAACATTTTGTATGAGCTTTTTAGTGAGTGGTACATAAAGGAAGAATATGCagaggcatatatatatatatacaaaactgaaatgtgtttgttgatatgagtgtgttagagagagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttagagctcCCATGTGAAATTCATTGTGTCTGTATTTGGGAGAAAGAGCCAATGTAAGGTCTGCCCAGTGTTCTGATTGCTGTAAAACTGCACACACTTTTTACATTCAGGCTGCAATCTAGACTCATGATTCACTCtcactttctaaaaaaaaaacatttaaaaagaaaactataAGTTTgatttctttcctcttttcttacTTTATTTGCTTAACCCTTAGATGCATGACCTACCTGTATTACTGAGAAGTGCTGTAATTGCTAGCAGGTTTAGAGCCACTACTAAAATTAATAAATCATATTGAAATAATTTTTGATGGAAAACTGAAAGCGCATGAAATCTTTCAAAACGCGCTTGTCTTTATAGCTTGTAACTATTGTTGCATTCCATAGACTAAAcatttaattgattaaaaattacagtttacaaatttacaaattAAAAGTTGCAGccataatatttacagtctatggttgcacCCCAGCTACTGACAGGAAATGTAAACACGCCAATATTTAGTTTCATCAAGGCTCACTGTCATCGTGACACACTGTAATTGACTGACACAATGTTGAGCACTAATACATTTTCAACTGGAAATGTCAAAGTGCCAACAGACCTTTCTGACATGTTGGTGGTTACCAGTTAGAAATTATATAACTAACTTaaggtaaagtaaagtaaacatGAAGGGATTTTGGTaagcactgtttttttttttatcagatcaGTGATTGGTAGAGAGTATTTAAAATAATGCTAACATTTAGTAAAAATAACCTTCAGGGTGGTGAGACTGCTGGCATTAGATGTGTGGATCAACAGTAAATGTATACCTGACAGTCACAGCTGATAAAAATCAAAGGCTCCTAGGGTTAACCTTTGAAATTCCATAGAAAAtgcttggggtcatttttgaccccacGTATGGAAATGTGTGGTACTGATGCAAAACATGCAATTTTTAACAAATTTAACAATTAGATACAAATCCAAATGGCCTCATGTCAAAAACAACCTATTTGAGGAATACATGGAAgattaaatgataaaaaaatttaattacaAAGATATTGCAAAAAACAACTGctggggtcatttttgaccccacTTATGCATCTAAGGgttaatataatacagtctaGGCCACAGGACTAGTTTTGGTTTTTTGAGTGTTGCAGTAGGCCTGTTCAGGTCAAGTGTGCCTTAAAGGCACAATTCATAATCTAAatggaaggaaaaaaataaactcgGAATATGTTATCCTTCCCACATTGATTGACATAACTTTTAATGCGCTGATTACCACTAGACAGGAACCATATCGATTTCAGTCATGTTTTCTGGGCCCGTATTTATTCAAGTTTTAGATTTAAGTACAATAATTGCCACTTTACTTTTAACAAACTTAAGAGTAAAAGCTATTTTTCTCTTATTCTTACAACTTAAATGCTCttaacattgtgtgtgtgtcagcgtgGTCCTATATTGTCTGATGTACATTGCCTTTTACTTCATCCCTATACATCAAAAGATTGTTGTTGAGTTGTTCATTCCACATGTTCATTGTTAATAGAGATATTAAGGATGTTAAATATATCATATCACTGAGTAAAATGTAAAGatctttttaaacaaagaaTAAGCAATTCGACAGATCCTTGTCTTTGAGTTCTTGAGTTGCCTTGTCTCTAGAGCGTTTTTTAAGCAAATTCTTAGAAGTCTGATTAATACGGGTCCAGGTTTGTTTATATCAATAATGTTTGTACATACAGCATTTACAGTAATTACGttcatttgagaaaaaaaacacaatgataATTTGATCTCTAAATCAAACTATTAATGAATATTCTTCAAAATGTTATGTggtccaaaaaaaagaaaacgagaTTTATAGAGTATTCAAAGCAATTTGGAACTTATTCaactaaacattttcaaaatattcaAAGAGAAACCTTGAAATAATCAAAGATTTGGGCTTCAAGTGGATTGTTGTGATTATTGTGTCTGAAGGCTCATATTTTGTGTTTAAGTGCGTGACATCTCAAAGCCTCTTCATGTTCAGGCATTCAGGCAGCTTACACTGGCACTAAGTTGATCTTGTTGCTCAAGTGCTGCTGGGAAAACAGGCTTGCAACACATTTCATTACTGCTAAGACAGACACATTCCCATGTGGAAATTAATGTCTGTCTCTTCTGCTTCATGTTCAGAGAGAGAAACTGTACTTGCTGAGCTTCATTTTGAAAAAGCTTCCCCTGCAAAATAAAAGCTTATGTAGCAATGTATCACCAATAAGTGGTATCACCCACACTGAAAGGTTTGCCAAGAAATGACATCATCAACATGTTCAGGGGTTGGCTGAACATGTCACTGTGGTTTGTATGTGTCAGAGAGAAATTTGCAGTCAGTTAACAGACATCATTACCAACGGTGACAGGCTTTATTAACAGCATAACAATAATGATAAAAATAAGGAGTAGATGAAAGACAGtaactgttctagctgttctattatttgcctttacccattcattcagtcattatatccacataatactgatgattatttgtcATAAATCTCATTGGGTAAATATTTTGCGAAAGCACCAATACTCAACCCAACAATATCGTCGCGATattgatattgaggtatttggtcaaaaaatattatatttgattttctaCATATTGATCCGCCATagtctgtatggtaaatataaTTGGTTAGCTTtgtttagcacaaagactggaaacggggagAAAAAGCTGCCTGGTTCTGTCCAAagcaaaataataattaatagcTTAATTAATTACCATGTAacatcttgtttgtttagtccagtggttctcaaccctTGAGGTTGGAGTTCGCGACCCCTTCACCCCCCTCGATGAGAGAAAGAGCGCTACAATCTGGTGCAAATAGCTGTTTCTACACGCCTCCCCCTGCTGATTTTGAGTGATTTTTGTGAATGCTCTGATGTAAACAAATAATGCTTTGgtttaatgacagtttagttttAGCAGGTAGCACCTAGCCTTGTCCAATCTGCTTCAGGCTCTGTCGATTTTTGATGTGTTTGTGACTTTACTCTCCCCCTGACCCGCCCTTAGACTACTTTCTGTGTTCCACCTCCTGATTTACAAGTGAAGCTCTACATGAAATGTACCAAGCTCAcacagtaatgtaaaaaaaaaaaaaaaaaatctagaatgtggtatttcatttttttctccccaaccATCTGGCGGCCCCCAGAAATTATCTCACGACCCCCTTGGGGTCCCGAACCACTAGTTTAGTCCGTAGAAAATCgattattttccattattaGAGGGATTATGTGATTTTCTGTTTCTACTAAATACATTCAACTAATATtgcttatattttttttaattcaatcaATCTCAGTTGCCTCCCTGCTGCAATCATTTACCAGCCGACCATGAGTTACTGACACTCATTATCAGTTTTCCAATCCATCATACAGCCCTGTGCTATTAATGTGTATCCTGCTAAAGTGCTGGTTGCATTAAATAGATCACGTTCACACTGTCCACACTTTTCTCTTAACACCTGTTTGGCAGTATTCAACATGTTGAACCTTGCTATGTTTTGACTTCTCTCACTTAGAAcagattattttatattttctagAGGACGTATGTAAAGCCGCTGCAGGGGTGAAAGGGTagagaatatgaaaaaaaaacatgttttgctttttccctttatcaGTTTGCTGTGATCAGAGGGAATGGAGGTGGGAGGATTTGTCATCTGTTTGAACAGCAAATGTGCCGTCCTTTTTTGATCCCATCCAATTATGCATGACATTGTATATTTAGGCATGTTGTCTGTTGTTCCACAATTGAAAAAATGCTGaggtgattcttttttttttattatccgcCTGGCTGGGCTTTGTTCTGCATGCATAATTTATCTTGACATATAGATAAACAATGATGAAGAACAGCACAATGTAGAAAATGAAAGGCAGagaaataaagtatttttttagaGTTGTGAAA

Function

symbol description
kiaa0040 Predicted to be integral component of membrane.

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein KIAA0040 homolog

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU158430 False 3535 lncRNA 0.39 2 24569578 24576002
XM_039816494.1 True 5895 mRNA 0.38 2 24569528 24578312

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tnr tnr coding upstream 23768 24374289 ~ 24545760 (+)
LOC120568202 NA coding upstream 291450 24269684 ~ 24278078 (+)
LOC120568201 NA coding upstream 302242 24259463 ~ 24267286 (+)
LOC120568200 NA coding upstream 312193 24253388 ~ 24257335 (+)
amotl2b NA coding upstream 321908 24240706 ~ 24247620 (+)
mrps14 mrps14,LOC101476193 coding downstream 81820 24660132 ~ 24662064 (+)
plk3 plk3 coding downstream 98671 24676983 ~ 24685579 (+)
eif2b3 eif2b3 coding downstream 180853 24759165 ~ 24797248 (+)
ptch2 ptch2 coding downstream 229932 24808244 ~ 24837694 (+)
kif2c kif2c,LOC101470919 coding downstream 275482 24853794 ~ 24861945 (+)
G117547 NA non-coding upstream 12871 24556419 ~ 24556657 (+)
LOC120568139 NA non-coding upstream 230272 24337693 ~ 24339256 (+)
G117523 NA non-coding upstream 310697 24257554 ~ 24258831 (+)
G117488 NA non-coding upstream 399575 24169668 ~ 24169953 (+)
G117487 LOC104957881 non-coding upstream 399973 24164854 ~ 24169555 (+)
G117632 NA non-coding downstream 259644 24837956 ~ 24838229 (+)
G117704 NA non-coding downstream 539919 25118231 ~ 25118502 (+)
LOC120568228 NA non-coding downstream 547519 25125831 ~ 25130929 (+)
LOC120568901 NA non-coding downstream 1203863 25782175 ~ 25793191 (+)
LOC120568900 NA non-coding downstream 1294017 25872329 ~ 25873402 (+)
LOC120569114 NA other upstream 514824 24049764 ~ 24054704 (+)
G117400 LOC104965054 other upstream 545869 24022441 ~ 24023659 (+)
hes6 LOC104918282,LOC104941260,LOC103366710 other upstream 655030 23912664 ~ 23914498 (+)
G117353 LOC103366712 other upstream 661127 23905870 ~ 23908401 (+)
G117319 LOC101487892,LOC104941256 other upstream 714371 23850879 ~ 23855157 (+)
LOC120569045 cacybp other downstream 89567 24667879 ~ 24675754 (+)
selenot1a selenot,LOC103365166 other downstream 284684 24862996 ~ 24870087 (+)
G117664 NA other downstream 372256 24950568 ~ 24954247 (+)
fgf12a fgf12,LOC100711708,LOC108245531,LOC107083782,LOC107384013,LOC103396031,LOC103365152,LOC103148287,LOC101467833,LOC106535044,LOC102236041,LOC105935916 other downstream 409187 24987499 ~ 25044057 (+)
LOC120568894 LOC102789372,LOC104966552 other downstream 1165015 25743327 ~ 25773468 (+)

Expression


Co-expression Network