si:ch211-106k21.5


Basic Information

Item Value
gene id si:ch211-106k21.5
gene name NA
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 15678394 ~ 15690444 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XM_039816942.1
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>XM_039816943.1
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Function

NR:

description
trophoblast glycoprotein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039816942.1 False 3997 mRNA 0.43 3 15678394 15690444
XM_039816943.1 True 4151 mRNA 0.43 4 15678394 15690444

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120568632 LOC107602512,LOC107688509,LOC107714866,LOC107674362,LOC104964691,LOC102306697 coding upstream 3700 15629931 ~ 15674694 (+)
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LOC120567732 rps8,LOC104932872 coding downstream 30494 15720938 ~ 15724388 (+)
LOC120569147 NA coding downstream 31695 15722139 ~ 15722248 (+)
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G114991 NA non-coding upstream 53071 15625102 ~ 15625323 (+)
G114944 NA non-coding upstream 128474 15549129 ~ 15549920 (+)
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G115055 NA non-coding downstream 152710 15843154 ~ 15848292 (+)
G115095 NA non-coding downstream 403566 16094010 ~ 16097398 (+)
LOC120568625 NA non-coding downstream 413274 16103718 ~ 16107792 (+)
G115103 NA non-coding downstream 445721 16136165 ~ 16138828 (+)
slc35a3b LOC103357859,LOC104957008,LOC101481522,LOC102792347 other upstream 109900 15554471 ~ 15568494 (+)
zgc:153115 klf13,LOC104948390,LOC103358333,LOC101073550,LOC105030379,LOC106568757,LOC107752329 other upstream 149625 15520782 ~ 15528769 (+)
asip2b agrp2,LOC105941385,LOC102299529,LOC102795060,LOC103358555 other upstream 199932 15472702 ~ 15478462 (+)
LOC120568540 LOC108238308,LOC100706341,LOC103359463,LOC106530177,LOC102798013,LOC101474556,LOC102303803 other upstream 309614 15338557 ~ 15368780 (+)
G114789 NA other upstream 521195 15151796 ~ 15157199 (+)
st6galnac3 st6galnac3 other downstream 74239 15764683 ~ 15843094 (+)
st6galnac5a st6galnac5,LOC103370426,LOC102788813 other downstream 175142 15865586 ~ 15921531 (+)
LOC120568164 LOC104950913,LOC104937610,LOC103355754 other downstream 535863 16226307 ~ 16228551 (+)
LOC120568419 LOC102779359 other downstream 748581 16439025 ~ 16527682 (+)
LOC120568363 ankrd12,LOC103396444,LOC102778611 other downstream 919932 16610376 ~ 16612206 (+)

Expression


Co-expression Network