LOC120567953


Basic Information

Item Value
gene id LOC120567953
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053122.1
NCBI id CM020919.1
chromosome length 39550354
location 13942055 ~ 13948115 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>XR_005640644.1
AGAACTGACTCCAGCAGCCACAGCGCTCAAACCCCGTCTGTGTTTTCGGTCACGGCTGGTGTGCGCGAGTGAAACCATTCAACGCGGACTGGTGCAAACTTTATTTAGTCTCCTTCACGCCATGGCCGAGGCCCTTTAAGACGTGACAGATGTCAGGACTTGTGAACTGGTAGCCGGTTTGTTGGAGTGCCAAAACACACCGGAACACGAGGTGACAGCAAGTGACAGGAGCTTTGATTGACAGGTGAATCATTTTGAATGGACTTGGATCTTTGTGATGCTGTTAGATGGATGCAGTGAAGCTCCGTGACCAGAAGCTGGTTTTAGAGATGAAATGAGCTGGGATTGGAAGGGAAGTTGCCTTTGAACGGCCGGAGCTGAAAAACACAgagcaaaaaaaggaaaacttaAGATTGAATATGATGACTTCTGGAACTTCTTGGGAGGCTGTGCTGAGATTGTGACTCATCCTTTTGGAGTTCTGCTTGTATTGATATTAATGTCTATCACCTCACTATTTTCACCACAGAACACCTCCATTTTCTTCTGGCTTCAACCTCCCCTCATTCATGCCAGCACTAGTCATGACAGAATAAGAGAAGCATCACTTTAATTTGATATAATTTTGCTACAAATGGGGCACAGAATTTGTTAAATGTAAGACCACATACATTGCCTTCCATAATCAGATTTGTAAAGATACATTTTCTTACTAAGTGTGTGAACAGAGCCTCTGTACTGCATGGTGTACTAGTGTATTGACTTGCTTGCCTGGATGTAAGCCATATAGATTTTGCAATATTTGTACTGACAATTCTGAGAAATTTGAGTTGCctaattatttatttcaaacTAATTTATTCAAGTAATGAAGAGCAAGGTGTGGGAGGCGTTTTGGGGAGGTGGGTGTGGATCACAGTATTAGCATAACAGAGCAGATGGACCATGGGTGTATTTTAAGACATATTATATGGACCTGAAAGCAGGCGGCATGCCTacaatttttttacaaatagcAAATATACTATAGCACACCTTACCACTAAAGACTTAATTACAATACATTTgtctataaaaacaaataaggaATAAATATGAATGCAAagactctctgctctctctacTGTAGATGTCCTACAGTAATGTCTTAAAATTGGTTCCTTATGATTCTCATCATGAGGAAACTTGTAAGTCTGTGGAATTCCTTCAGtaattgaaattaaataaatagttaaataaGATTAGCCAGAATCTTCTTACTGTTGAGTTTGAACCTCAGTGTATGTTACATGATAACACTCTGTAAAGCTGCGTTATATAAAAGTTCTCATCCATACAAATCCGGTCACCCAGGATGAATAGAATACCTGCAGGACAAAATATGCAGTTGAACTCCATGAGGACTTTTCTGGTTTCCACTtgctgtgtgtgttatctctctctatcttcctCTTCTTGTTTTCACTTGCTGTGTGTTACTGTAtctcgtcttcttcttctcctttctcACTCCCTCACAAACACCGGACACACCTGGTGTCAGCCTGAGGGCAGCGGAACAAAGCTTTCTACCTCCTACTCTTTTAGATTAATTGCCTTAGCTGGGTCCCGCCTTCTCTGAAtcccacaaaaaacacacacacgcgcacacacacagacagacagacagacagatgcacGCCTGTCATGTCATACACACTACCAGCTTGCAGCAATAACTGTCTTTATCTGTACATCTATAAGTAATGCTCATAGTTTTATGCTTAGCATTATCTAAGCCATTTGCACATAATttgcacatttattttattggtacAATTTACCTTAATGGTTGCCAGTGTTTGACTATAAAATCAGATTGACCCACTGTTGTCCGAAAGGGTAAAgtccagggcactttcacacAGTAGTCGTTGCTAAATcttttaatgtttacattaatgtGTAAGATGAATGTCTTGCTTGCATCTCAATTCAGCTTGGGGCAATCAGTTAATACACATTTGAGTGTCTGTCTTTCAGAACCTTATAGTGTGATGATAATAATTCTTGGCTTTCAGTTTGACACAATCAGTATATCATTGCAGTTGAGGTTGTAAAATGGAAATGTAAGGCAATGGGAACTTAAATGGAAATGTTATCTACCTAATTTGCTCATTTAATGCAGGATATTCAGTACATATTTACATCTAAACATACTtccattgtttttatatttgtatttgtatttaagtCGATAAATTAGAGAATAGACAAAGTCAGATTATTTGACAGTAGATGATGCTAGAAAATGTGTAGGATGTGATGTTCCTGTGCCACTGTGTTGAAGCTTTGATGTTTTTGATACCACTGGAGACTGGAGAGAGTAACTTTTAAAGCTAACAATATTGTTTAAAAATCTACTAACCTGTGTCGAAAGTATACTTTTGGCTAGTTTGTCTAGGGTCTTTGAAAATGAAAGGAACCGGACTCTTCTGCCCGAAATATTTAAACACAGACCTCTAAAGATGTTAACATTAAAACTGTTGTTACTGCTCTGAGACAGTATGATTACAGGTGATTGGACATGTAAGATGGGTTGAGAGAAAACTGGCATGACGCCCAGGGAGCAGTTAGAAATACAGGAATAGTATCAAATGCGGGCAGTGCCAACTCCCCAACAGGATGTAACAGTTTGCAGTCTTGCACCACCTTCCTGCATGAGTAAAATGTAATGACTCAGAGCAATTCAAGCTTTAGTTTATACTGCAAGTCCAAGTCAGTAATTAAAAATGACAGCCGGCGATTGGATGTCAGCGTGCCAGTTTGCACAACGACcatgtacaaaaaaacatggTCTCAAATGACGATGTACAAAAATCATTAATCTCATTCAAAGAGATGAGATGTATTGTTCCAGATTTAGCTACTAGCtaattttatataatattgCTTATTCTACTGTGCcaaaaaccattaaaaaaacactgtgAGCCAAACTGTTGACAAGTTCCTTCATTATGATGATCACAAGcaatgtagtttattttgagtaaaTTTTGAATGTCCTGGGgctgtaaatactcactagacCGCCAACCCTATATTaatccacagctgaaaatagtccccgaCAAATGCACTTATTATTCCTGCTCAAGTAACATTAtttaggaaataaaaaaaaagaataaaaaaaaaaaaagagtcttgCCACAGAGAGGGGGTGGGATGTAGAGATGTTGGTTCTTGAGGAGGGTCTTTTTTTGTCTTGCCATGAGGTGTGTTGGTGGTAAGAAAAACACCAGCCTTTAAGCTGTCACTTCTGGCAAAGGTAAGTTACTAACCGATTAAGTAATTAGGTAATGtctaaacaaaaataatataaatggaACCCTGTAATGGAGACTTGTGTGGCTAAAAGTATATTAATAATGTTAcattgtgatttattttcctTCTCTGTCCACTATGTTACACTTATGTACTATAGATGTGTGGGTGTGAGACACAGAAATAATGGTTTCCCCCCACTGTCTCCTCTGTTGGTGAGAGAAGATTGTGTTTCACTCCCCTCACCTCTTCATGGTGGCTCGTCTTCCTCGTTGCAGCTTTGCTTTGTCCTCAGGAGAGAATAAAGTTGGCCTAGCCTCTTAGTTCATCTCTTATTACCATAGTAGCCTGATTATGGGAGTATTATCATTTAGTGTCCATAGAAACCACATCAAAAGAGTTCTTTTACTAAACTGATTTAGAGTTAAATATATTACACATATAATGTATATTGAGTTTTAATGCTATGGTGAAGTTAGTGTCATGAATACCTCATGTGTCGGTATAAAAATTATTGATATAAATGGTTAGCAGACGAGTTTAAAATACAGCGCAGTCTAAGACAAAGACCATTGTCAGTGTTCAAGAGGTCCtggtaaaatgcaattcaaaacacttttttttttggtgagtgGTGCCATGTTGACTTCATCAGTGGGGGGAGGCAGCATGAATGAAAGGCTTTTCTGTTGACAGTGGAGTGCATGAATCAGCAGTGACTCTGCAATGGAAAAGACAGGAGAGGCAGGCTTTCTATTCAGTCTGATGAATCCTGCTTAATTATAAGCttatttaaaaagacaaagagcTAGGAGAACGGATGAAGAGCTTTATGTACTAATAATGTTTTCGTAATGATGTAATATGTACAGATGATCTTGTAAGTTTTGCGGTAAACTGATATCAGCAACCTAAGTTTCATACAGTTGGACTCTGGGAATACATTTTGCATTGTTTCAGACTTCAATTTGCATCATGTAAGCTTGATATGCAAATGTAGAGTGCAAGGTCACCATTTTAAGTTGAATACTCTCACCATGTCAAGGTGCCAACAAGCAAGGCACTTGAACACCAatctccagtggagctgctcagtgaccAACATTAAATAAATGGTGCTTTATTAAAAACCCAACCTAAAAACAATAGCTACCGCAACCAATGTTAAATCTGATGTTCAACCAACCCTTTACCCAAGAGCCCAGTATCTTTGACTGGTCATACTGTAATGAAAGAAGACAGACATGAAGTGAagccaacacacaaaaaaaagaaatacatgcaTCACTCAAACTTTATTATGGGCCTGAACTTTATTACAGCAAACTTATCAAGGAGTCAGCGGTCGTTagaggtaaaggtactttattgtcacatacacatagcgaaattcattctc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005640644.1 True 4711 lncRNA 0.38 3 13942055 13948115

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tnk2b tnk2 coding downstream 26700 13888299 ~ 13915355 (-)
LOC120567950 LOC103354333,LOC102291624,LOC100702032,LOC107083612,LOC107384444 coding downstream 119291 13774982 ~ 13822764 (-)
LOC120567848 LOC102214260,LOC102313714,LOC100696384 coding downstream 254247 13661538 ~ 13687808 (-)
LOC120567847 LOC102799957,LOC102205731,LOC101468926,LOC102313119 coding downstream 282598 13651268 ~ 13659457 (-)
LOC120567845 ptchd3 coding downstream 296861 13643360 ~ 13645194 (-)
c11h7orf26 LOC103366860,LOC102212268,LOC102304778,LOC102798014,LOC100695326 coding upstream 30135 13978250 ~ 13984589 (-)
pgap6 tmem8a coding upstream 48276 13996391 ~ 14006208 (-)
LOC120568034 NA coding upstream 59627 14007742 ~ 14011242 (-)
LOC120568033 LOC103366454,LOC104932767,LOC101066162,LOC108238297 coding upstream 74913 14023028 ~ 14038301 (-)
si:ch211-188c16.1 NA coding upstream 90587 14038702 ~ 14049140 (-)
G114257 NA non-coding downstream 313388 13625776 ~ 13628667 (-)
G114256 LOC102077222,LOC102776852 non-coding downstream 316576 13622903 ~ 13625479 (-)
G114247 anxa13,LOC105930306,LOC100703370 non-coding downstream 377252 13556604 ~ 13564803 (-)
LOC120568710 NA non-coding downstream 392589 13533138 ~ 13549466 (-)
G114215 LOC103354350,LOC100704451,LOC101473770,LOC106904511,LOC103151571,LOC106963118 non-coding downstream 535225 13394461 ~ 13406830 (-)
G114456 c8a non-coding upstream 101379 14049494 ~ 14055523 (-)
LOC120568036 NA non-coding upstream 176588 14124703 ~ 14171474 (-)
G114518 NA non-coding upstream 371228 14319343 ~ 14320763 (-)
G114530 NA non-coding upstream 470736 14418851 ~ 14466248 (-)
G114538 LOC104949927,LOC103364340 non-coding upstream 492766 14440881 ~ 14447933 (-)
dis3l2 dis3l2 other downstream 459830 13469531 ~ 13482225 (-)
G114152 NA other downstream 853492 13084561 ~ 13088563 (-)
LOC120568578 wdr48 other downstream 966727 12966466 ~ 12975328 (-)
LOC120568934 LOC104956577 other downstream 1173430 12760748 ~ 12768625 (-)
nedd8l LOC104931181,LOC104949953,LOC107384241,LOC103360313 other downstream 1333486 12601180 ~ 12608569 (-)
tfr1a NA other upstream 1756 13949871 ~ 13968811 (-)
LOC120568687 NA other upstream 665498 14613613 ~ 14618224 (-)
G114680 NA other upstream 847803 14795918 ~ 14797044 (-)
mfsd8l2 LOC102304717,LOC102799006,LOC108238243,LOC103479065 other upstream 1341967 15290082 ~ 15304610 (-)
G115164 btf3l4 other upstream 2196045 16144160 ~ 16148121 (-)

Expression


Co-expression Network