G125090


Basic Information

Item Value
gene id G125090
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053123.1
NCBI id CM020920.1
chromosome length 39440604
location 18700887 ~ 18704677 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU168242
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>TU168243
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>TU168244
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>TU168245
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>TU168246
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>TU168251
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko00410 beta-Alanine metabolism
ko00770 Pantothenate and CoA biosynthesis
ko04610 Complement and coagulation cascades
ko05150 Staphylococcus aureus infection
ko05322 Systemic lupus erythematosus
ko05020 Prion disease

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU168242 False 1583 TUCP 0.47 1 18703095 18704677
TU168243 True 2905 TUCP 0.42 1 18701648 18704552
TU168244 False 1549 TUCP 0.47 1 18703129 18704677
TU168245 False 965 lncRNA 0.39 1 18701732 18702696
TU168246 False 2076 lncRNA 0.36 1 18700887 18702962
TU168251 False 1810 lncRNA 0.36 1 18700887 18702696

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120570238 cldn10,LOC103391834,LOC104947506 coding downstream 92073 18606426 ~ 18608814 (-)
LOC120570204 NA coding downstream 95716 18603123 ~ 18605171 (-)
LOC120569518 LOC101478235,LOC102203487,LOC102783581,LOC104922687,LOC104947508 coding downstream 99505 18599472 ~ 18601382 (-)
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gpc6b gpc6,LOC104947503 coding upstream 11 18704688 ~ 18789294 (-)
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LOC120569248 LOC102780588,LOC100690496,LOC101481378,LOC102206814,LOC103352953 coding upstream 168386 18873063 ~ 18885787 (-)
pcdh8 LOC104947529,LOC103352945 coding upstream 193999 18898676 ~ 18903097 (-)
ednrbb LOC103352943,LOC104947527 coding upstream 238674 18943351 ~ 18947075 (-)
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G125000 NA non-coding downstream 608357 18092327 ~ 18092530 (-)
G124872 NA non-coding downstream 677410 18022409 ~ 18023477 (-)
LOC120569506 NA non-coding downstream 878400 17737284 ~ 17822487 (-)
G124691 NA non-coding downstream 1350141 17347911 ~ 17350746 (-)
LOC120570508 NA non-coding upstream 111169 18815846 ~ 18819321 (-)
G125108 NA non-coding upstream 122865 18827542 ~ 18828502 (-)
G125112 NA non-coding upstream 139423 18844100 ~ 18844338 (-)
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G125116 NA non-coding upstream 141155 18845832 ~ 18847369 (-)
G125089 dct,LOC102781940 other downstream 1085 18695480 ~ 18699802 (-)
prkra prkra other downstream 537138 18156732 ~ 18163749 (-)
LOC120569287 LOC103391581,LOC104924425,LOC103375901 other downstream 585790 18113110 ~ 18115097 (-)
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tbl1x LOC103352926,LOC104925011,LOC102307724 other upstream 527310 19231987 ~ 19258846 (-)
G125326 dopey2 other upstream 891252 19595929 ~ 19597521 (-)
si:ch211-214p13.3 NA other upstream 1047024 19751701 ~ 19768586 (-)
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si:ch211-214p13.7 NA other upstream 1216591 19921268 ~ 19923735 (-)

Expression


Co-expression Network