nxph2a (nxph2,LOC101474521)



Basic Information


Item Value
gene id nxph2a
gene name nxph2,LOC101474521
gene type coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053123.1
NCBI id CM020920.1
chromosome length 39440604
location 11156590 ~ 11175940 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>XM_039818994.1
actggtatCATTCAAACAGCCCTGTAGATGATTGTTTTTGCAAGTTGGAAGTCATTATCGTGTAAATTAAAATAACagttttttgtgcattttagACCTTAGTCGTGGCTACGGTTACTCTAATCTGACTGAACATTTACCACCAACAAATATAAAACTACCAGACAAACGAGATTGCAATTATAACgtttaaagggttaaaaacGTGGACGTGTTGCCAGACAAAACCTGATAACAGTGACATCAAGACTCTTATTTCTCCTCGACGGAGAGAGTGAGATTTCAAAGGTAGATCTTTGGTCTGACTCTGTGCACGGATGCGCACCGACCTTGGAGTCTCCAGACGCGCAGCGGAGGATTTTGCGCACTGaaataaagtaggctagagcTGAAGAGAGCGCACAGCGAGCGGACTGCTGTCTGACTGACTGCAGTCCTGTCAATGGGGTCCGGGCTCACTTGGCTATACTTTACCCTGCGCATCGTCATTCTATTGATACCATTGCTCGGGAAGTGTAGGGAGTATAGGGATTAGTCTTCAGTTTATTTCGGTTTGGCTTGATTCGCAACTTAGAGGACTGTTATTTCAACTGAGCCCCTGTAGCCGTTTCACATTGTTTGTAGAGACATCCAAGTGTCCCAGCTGCTCAGGGAAATTTCACTCAGCATCCCAAGAAGCGGAGACGTTTGAGAGGATTTTAGGACTCTTACCCGAGAGTGGATTGAACAAGGATGATTGCAACCGCCTTACTCAATTAAGTGAggtattacataaaaaaaaaaaacggtgATTTCACATCGTCAATGTTTCCACTTTTCTCGCAGGTGATCACAGCAATGCTTCAAAGACATGTGCGTCTGTCCCTCTCCAAATCTGCCAGAGAGGATTTAAGCGCCGCTCATTTTGAATAAGTCGAGAAGTCATTGAAGATGAGAGCTCTGCAAACATTCCTGTTTCTTTTCCTCCTGCACCAGGTCACATGCAGGAAAGCGCATGGAGGAGCCACAGAGCTCATTGAGTGGGGCGACAGCGATAACGAACAGAAGATTTCTCCCACGGGGGCCAGTCCACGGATCCTCAACCCCCTGCGTTTGTTTGCCAGGGGCTCCCCCGGGTTCAAGAGCAACATGAGGGAAATTACATATTTACAGAACATGGAGGACTTCTGGGACTGGTTATCTAACCAGACAGATGTTCAGGGCGCACAGGCCAGAACTAAACGCAGGCCCATCGTTAAGACTGGCAAGTTCAAAAAGATGTTTGGGTGGGGAGACTTCCACTCCAACATCAAGACTGTGAAACTCAACCTGCTGATCACGGGGAAGATTGTCGACCACGGGAACGGCACTTTTAGCGTTTACTTCCGCCACAACTCCACGGGCCTGGGGAACGTGTCGGTCAGCCTGGTACCGCCCTCAAAGGTAGTGGAGTTCGAAATCGCCCAGCAGTCCACGCTGGAGACCAAAGACACCAAATCATTCAACTGTCGCATTGAGTATGAGAAGACTGACCGCAACAAGAAGACTGCCCTGTGCAGCTATGACCCGTCCACGGTGTGCTATCAGGAGCAAACGCAGAGCCATGTGTCCTGGCTGTGCTCAAAACCCTTCAAAGTCATATGCATCTATATAGCCTTTTACAGTGTTGACTATAAACTGGTACAGAAGGTATGCCCTGACTACAACTACCATAGTGACACGCCCTACTCCTCCACAGGATGATCTAGCTGTTGTTAGTATGCATCATCCTTTTGTCTGATCTCAAATAATGTAAACGTCAACCTCTAAGCTCCTTGTCCCGAAATACCTAAATACATGAAACATGTTGCAGGAAGTGCAACTTATAATGGGACACACTCTAGATGCAttgttaaaaaaactaaaaagaaatgtatgtGTATACAGATCTAACTTGAGAAAGTTAGGCATCCAGGGACTTGGTTTTAGGGGTTGACTTGGGATTCAGAGATATCTACCAACCCTGGGTGACTCCTTCCCATCACAACAGCACATGCTCTCCATAAAACCACTGGTATAATTAGCGTGTTGTCCAGATGTTTTCTTCAAGGCTAGACCATAGGCAAAGAGCCTCCCAGTTGGAAGTGTATAGCTGGCTTCTGTGCCAGTGCTGCATTGATGCCAacattgtcaaaaaaaacaacattctcACCTCATTTAAACAGTTCTGGAATTAAATATGAGAAGACTTTAATTCATGTTAATAATTACAATACCAAGATGTGTGAATGGTTGAATAACCAATGTGAAATATCAAATTGTATGCCTTGTTGAATAACAAGGCATCCAATTTGATATTTCACATTTGAAACCTTGCTGACTGATTAGTCAGAATGATCTGTCAATTGCCTTTGAAGTTGAGCTAACATCATTTGTACCTGTTAACAGAACCCAGGCAGGACAGTGTCTATTATTTCAGATTTGCTTGATCAATGGGTATTTTCTCAAGCAGCTCTGAATAATTTATATGACCGTATAATCTATATTTTAGCTGTCTTTCTCTTATAAAGACTGGAATAGCAATTTATGTGTCCATGACTAAATAAATTTATCCAACACATCTAAGCCCCAAAACAAGCAGAGAGCATAATCATAAATCATAACACATATGTATGTAGGTACCCATCCATGTATAACCTGGCTGCTGCCTTGTGTGCTCCTTAAAATGTGTTGGTTTTCTGCTGCAATCATCATAAGGCATGTGTATGCTAAACTAGTCTGAAATCCAACATCTGTGTTTGCAGGATGCACTTTGAGGCATCAGCCTGCCGAGCGGGCCCCGCAGTGGATTAATGTGTCGGGGGGGGTGTCGTTAATTGCAGGACAGGTGGATTTAGCGAGTCTGGCAGACAATTATCAGCACTTTGTCATGGTCCTGCCACCAGTCCTGACATTACCTGTCTTTAATAGGCTTTAATTAGCCTGGGAAATTTCATCTACCTAAGACCAAGAGTGGAGAaaccaaaagcaaaaaaaaaaagaagaaaaaatgcaaAAGTACAAAATCCGTCTGGAATTTTAATGAGACGGGGGacctacatttttaaatgtcataCATTCCCCAATTGTACAGCAGGCTTAAGTTGACTGACTGTTGTGTAAAAGTGGATAACATCCAGTCTTGTAGTAAATGGTGAAATGTGCTTTAACGTAGCGATCACTTAAACTTTTAAAAGGTTCTGTTGAAAACCATCAATTTGACACTTGAATTGTCATACATTTTGTTGATTGTGTTTAtccaggattttttttagaCTAGGGCATGTGCCACTGATTAATCACATGGCAATTATTTAATGATTTAATGTTACTTTATTGCTGTTGCTGTATCTCATGTCTTTCCCCAGCAGCTGTAAATGATATTGTCACATTATACACACGAGGAGAGGTGTATAAGTAAATTATTAAATCCGAGTTGATCtatgttgatgtttttgttCTACTCCTTTGTGCAAATGCTGTGTATTATTGTGTAACTCTTAAACTAACCCTGTTTACAGCTTTAGAGTAAACAATGTCAATTTATTCAAATTTTCCCAGAGAAATATGTATCAATAAGTATACTGTTTACTACTTATTTTTGGTGTTAAGCGATATCATGTAGATAGATGTCATATGTATTGCTCATAGATTGCTTTGATTTCCATTTTTGTAATCCTTGCAGATTGTACCTATTTTTATTTCCTGCTTGCTTAATCTTGTTACAACAGTTTCCtctatatatgaaaaaaagagCACTGCTGTGTGTAAAGTGTAAGTACAAATGTTCATTTTGGAATATTTGATTTCATATGGGGTTGTTAAAATGAAATTGTACAGATCAATTTCGTTTTGTATGGCATTAAACCTTATTTGAACTTGGCTCACAGCATATTGCCACACTGAGTCAGCTCTAGTCTGTCGGTG
>XM_039818995.1
actggtatCATTCAAACAGCCCTGTAGATGATTGTTTTTGCAAGTTGGAAGTCATTATCGTGTAAATTAAAATAACagttttttgtgcattttagACCTTAGTCGTGGCTACGGTTACTCTAATCTGACTGAACATTTACCACCAACAAATATAAAACTACCAGACAAACGAGATTGCAATTATAACgtttaaagggttaaaaacGTGGACGTGTTGCCAGACAAAACCTGATAACAGTGACATCAAGACTCTTATTTCTCCTCGACGGAGAGAGTGAGATTTCAAAGGTAGATCTTTGGTCTGACTCTGTGCACGGATGCGCACCGACCTTGGAGTCTCCAGACGCGCAGCGGAGGATTTTGCGCACTGaaataaagtaggctagagcTGAAGAGAGCGCACAGCGAGCGGACTGCTGTCTGACTGACTGCAGTCCTGTCAATGGGGTCCGGGCTCACTTGGCTATACTTTACCCTGCGCATCGTCATTCTATTGATACCATTGCTCGGGAAGTGTAGGGAGTATAGGGATTAGTCTTCAGTTTATTTCGGTTTGGCTTGATTCGCAACTTAGAGGACTGTTATTTCAACTGAGCCCCTGTAGCCGTTTCACATTGTTTGTAGAGACATCCAAGTGTCCCAGCTGCTCAGGGAAATTTCACTCAGCATCCCAAGAAGCGGAGACGTTTGAGAGGATTTTAGGACTCTTACCCGAGAGTGGATTGAACAAGGATGATTGCAACCGCCTTACTCAATTAAGTGAggtattacataaaaaaaaaaaacgGTGATCACAGCAATGCTTCAAAGACATGTGCGTCTGTCCCTCTCCAAATCTGCCAGAGAGGATTTAAGCGCCGCTCATTTTGAATAAGTCGAGAAGTCATTGAAGATGAGAGCTCTGCAAACATTCCTGTTTCTTTTCCTCCTGCACCAGGTCACATGCAGGAAAGCGCATGGAGGAGCCACAGAGCTCATTGAGTGGGGCGACAGCGATAACGAACAGAAGATTTCTCCCACGGGGGCCAGTCCACGGATCCTCAACCCCCTGCGTTTGTTTGCCAGGGGCTCCCCCGGGTTCAAGAGCAACATGAGGGAAATTACATATTTACAGAACATGGAGGACTTCTGGGACTGGTTATCTAACCAGACAGATGTTCAGGGCGCACAGGCCAGAACTAAACGCAGGCCCATCGTTAAGACTGGCAAGTTCAAAAAGATGTTTGGGTGGGGAGACTTCCACTCCAACATCAAGACTGTGAAACTCAACCTGCTGATCACGGGGAAGATTGTCGACCACGGGAACGGCACTTTTAGCGTTTACTTCCGCCACAACTCCACGGGCCTGGGGAACGTGTCGGTCAGCCTGGTACCGCCCTCAAAGGTAGTGGAGTTCGAAATCGCCCAGCAGTCCACGCTGGAGACCAAAGACACCAAATCATTCAACTGTCGCATTGAGTATGAGAAGACTGACCGCAACAAGAAGACTGCCCTGTGCAGCTATGACCCGTCCACGGTGTGCTATCAGGAGCAAACGCAGAGCCATGTGTCCTGGCTGTGCTCAAAACCCTTCAAAGTCATATGCATCTATATAGCCTTTTACAGTGTTGACTATAAACTGGTACAGAAGGTATGCCCTGACTACAACTACCATAGTGACACGCCCTACTCCTCCACAGGATGATCTAGCTGTTGTTAGTATGCATCATCCTTTTGTCTGATCTCAAATAATGTAAACGTCAACCTCTAAGCTCCTTGTCCCGAAATACCTAAATACATGAAACATGTTGCAGGAAGTGCAACTTATAATGGGACACACTCTAGATGCAttgttaaaaaaactaaaaagaaatgtatgtGTATACAGATCTAACTTGAGAAAGTTAGGCATCCAGGGACTTGGTTTTAGGGGTTGACTTGGGATTCAGAGATATCTACCAACCCTGGGTGACTCCTTCCCATCACAACAGCACATGCTCTCCATAAAACCACTGGTATAATTAGCGTGTTGTCCAGATGTTTTCTTCAAGGCTAGACCATAGGCAAAGAGCCTCCCAGTTGGAAGTGTATAGCTGGCTTCTGTGCCAGTGCTGCATTGATGCCAacattgtcaaaaaaaacaacattctcACCTCATTTAAACAGTTCTGGAATTAAATATGAGAAGACTTTAATTCATGTTAATAATTACAATACCAAGATGTGTGAATGGTTGAATAACCAATGTGAAATATCAAATTGTATGCCTTGTTGAATAACAAGGCATCCAATTTGATATTTCACATTTGAAACCTTGCTGACTGATTAGTCAGAATGATCTGTCAATTGCCTTTGAAGTTGAGCTAACATCATTTGTACCTGTTAACAGAACCCAGGCAGGACAGTGTCTATTATTTCAGATTTGCTTGATCAATGGGTATTTTCTCAAGCAGCTCTGAATAATTTATATGACCGTATAATCTATATTTTAGCTGTCTTTCTCTTATAAAGACTGGAATAGCAATTTATGTGTCCATGACTAAATAAATTTATCCAACACATCTAAGCCCCAAAACAAGCAGAGAGCATAATCATAAATCATAACACATATGTATGTAGGTACCCATCCATGTATAACCTGGCTGCTGCCTTGTGTGCTCCTTAAAATGTGTTGGTTTTCTGCTGCAATCATCATAAGGCATGTGTATGCTAAACTAGTCTGAAATCCAACATCTGTGTTTGCAGGATGCACTTTGAGGCATCAGCCTGCCGAGCGGGCCCCGCAGTGGATTAATGTGTCGGGGGGGGTGTCGTTAATTGCAGGACAGGTGGATTTAGCGAGTCTGGCAGACAATTATCAGCACTTTGTCATGGTCCTGCCACCAGTCCTGACATTACCTGTCTTTAATAGGCTTTAATTAGCCTGGGAAATTTCATCTACCTAAGACCAAGAGTGGAGAaaccaaaagcaaaaaaaaaaagaagaaaaaatgcaaAAGTACAAAATCCGTCTGGAATTTTAATGAGACGGGGGacctacatttttaaatgtcataCATTCCCCAATTGTACAGCAGGCTTAAGTTGACTGACTGTTGTGTAAAAGTGGATAACATCCAGTCTTGTAGTAAATGGTGAAATGTGCTTTAACGTAGCGATCACTTAAACTTTTAAAAGGTTCTGTTGAAAACCATCAATTTGACACTTGAATTGTCATACATTTTGTTGATTGTGTTTAtccaggattttttttagaCTAGGGCATGTGCCACTGATTAATCACATGGCAATTATTTAATGATTTAATGTTACTTTATTGCTGTTGCTGTATCTCATGTCTTTCCCCAGCAGCTGTAAATGATATTGTCACATTATACACACGAGGAGAGGTGTATAAGTAAATTATTAAATCCGAGTTGATCtatgttgatgtttttgttCTACTCCTTTGTGCAAATGCTGTGTATTATTGTGTAACTCTTAAACTAACCCTGTTTACAGCTTTAGAGTAAACAATGTCAATTTATTCAAATTTTCCCAGAGAAATATGTATCAATAAGTATACTGTTTACTACTTATTTTTGGTGTTAAGCGATATCATGTAGATAGATGTCATATGTATTGCTCATAGATTGCTTTGATTTCCATTTTTGTAATCCTTGCAGATTGTACCTATTTTTATTTCCTGCTTGCTTAATCTTGTTACAACAGTTTCCtctatatatgaaaaaaagagCACTGCTGTGTGTAAAGTGTAAGTACAAATGTTCATTTTGGAATATTTGATTTCATATGGGGTTGTTAAAATGAAATTGTACAGATCAATTTCGTTTTGTATGGCATTAAACCTTATTTGAACTTGGCTCACAGCATATTGCCACACTGAGTCAGCTCTAGTCTGTCGGTG

Function


symbol description
nxph2 Predicted to enable signaling receptor binding activity. Predicted to be located in extracellular region.

NR:

description
PREDICTED: neurexophilin-2

GO: NA

KEGG:

id description
K16657 NXPH2; neurexophilin-2

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_039818994.1 True 3924 mRNA 0.41 3 11156590 11175940
XM_039818995.1 False 3886 mRNA 0.41 3 11156590 11175940

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
rabl3 rabl3,LOC102779363 coding upstream 22446 11130057 ~ 11134144 (+)
LOC120569327 LOC103358003,LOC100710305,LOC102781664,LOC101475894 coding upstream 938940 10211110 ~ 10217650 (+)
LOC120570306 NA coding upstream 1052423 10099932 ~ 10104167 (+)
fev fev,LOC102784253 coding upstream 1201713 9949090 ~ 9954877 (+)
cryba2b cryba2,LOC106581834,LOC106586156 coding upstream 1209889 9943512 ~ 9946701 (+)
LOC120569661 NA coding downstream 368668 11544608 ~ 11546302 (+)
dars1 dars,LOC102778528 coding downstream 374975 11550915 ~ 11581353 (+)
pnkd pnkd,LOC100703611,LOC104967495 coding downstream 411068 11587008 ~ 11595507 (+)
gmppaa gmppa coding downstream 421934 11597874 ~ 11608077 (+)
asic4a asic4,LOC102777753 coding downstream 567395 11743335 ~ 11838604 (+)
G123184 NA non-coding upstream 213687 10940052 ~ 10942903 (+)
G123181 kdelc1 non-coding upstream 223235 10931682 ~ 10933355 (+)
G123172 nepro non-coding upstream 234289 10919046 ~ 10922301 (+)
G123148 LOC105912973,LOC105900140,LOC105893694,LOC105893089,LOC105940532 non-coding upstream 354737 10801489 ~ 10801853 (+)
G123133 NA non-coding upstream 464121 10692265 ~ 10692469 (+)
G123279 NA non-coding downstream 233730 11409670 ~ 11425251 (+)
LOC120570367 NA non-coding downstream 442656 11618596 ~ 11634792 (+)
G123322 NA non-coding downstream 667440 11843380 ~ 11845465 (+)
G123323 NA non-coding downstream 669733 11845673 ~ 11846949 (+)
G123324 NA non-coding downstream 671117 11847057 ~ 11847386 (+)
lrp1bb lrp1b,LOC102779748 other upstream 537894 10335991 ~ 10618696 (+)
umps umps other upstream 1227699 9920624 ~ 9928891 (+)
G122846 NA other upstream 2359844 8795453 ~ 8796746 (+)
hdac4 LOC103356262 other upstream 2839897 8170700 ~ 8316693 (+)
G122588 NA other upstream 4007551 7146625 ~ 7149039 (+)
LOC120570060 NA other downstream 75977 11251917 ~ 11260642 (+)
serp2 NA other downstream 831717 12007657 ~ 12013200 (+)
G123539 sept10,LOC102785043,LOC103375466 other downstream 1873818 13049758 ~ 13279866 (+)
G123633 NA other downstream 2177366 13353306 ~ 13354085 (+)
cps1 cps1 other downstream 2459614 13635554 ~ 13696334 (+)

Expression



Co-expression Network