G13106


Basic Information

Item Value
gene id G13106
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 309204 ~ 363950 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU17429
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatatatatatatatgtgtgtgtgtgtctctgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtctctctgtcggtctctatgtgtgtctctctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagtgtctctctgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctctctgtgtgtttgtgtgtgtctgtttgtctctctctaggtgtgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctcagtgcTCCAGGCGTCCCaggaacctcaggttgaggatcTTGAGCTGGTCGTCCAGCTCCATGCGGACGATGCCGTCGTCTCCGTCGATGCTCAGCAGGATGCCCGTGGCCTCGCGGTCTTCGCCCAGGATCACCTTCACctggacaacaacaacaacaacaacaacaacttattACTCTTTATTAATTAACTTTATTAATGCTGcaaaggggaaattacaatgttttcactctgttgttactacacacacatg
>TU17432
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtctctctgtcggtctctatgtgtgtgtctctctgtttgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
>TU17435
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtctctgtatgtatgtatgtatgtatgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtctctctgtcggtctctatgtgtgtgtctctctgtttatgtggggtgtgtgtgtgtgtgtggcggagagagagtctgtgtgtttgtgtctctctgtctgtctctctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagtgtctctctgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctctctgtgtgtttgtgtgtgtctgtttgtctctctctaggtgtgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctcagtgcTCCAGGCGTCCCaggaacctcaggttgaggatcTTGAGCTGGTCGTCCAGCTCCATGCGGACGATGCCGTCGTCTCCGTCGATGCTCAGCAGGATGCCCGTGGCCTCGCGGTCTTCGCCCAGGATCACCTTCACctggacaacaacaacaacaacaacaacaacttattACTCTTTATTAATTAACTTTATTAATGCTGcaaaggggaaattacaatgttttcactctgttgttactacacacacatg
>TU17437
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgttgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtat
>TU17438
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtgtgtgtgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgcatgtctttgtgtgtatgtatgtgtgtgtgcgtacgtatgtgtgtgtgtttgtgtatatatctatgtatgtgtgtatatgtgtgtgtaagtatgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtataggtgtgtgtgtatacgggtgtatgtgtgtgtatatgcatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtgtg
>TU17440
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtctctctgtcggtctctatgtgtgtgtctctctgtttatgtggggtgtgtgtgtgtgtgtggcggagagagagtctgtgtgtttgtgtctctctgtctgtctctctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagtgtctctctgtgtgtttgtgtgtctctgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctcgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtctctttgtctgtgtgtgtctgtccgtgtgtggtgcgcgtgtgtctttgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctg
>TU17441
TGATCAACTGGGTCACAGTTTATTGACAGGTTACACTTCTTTCACCAAGAAACCAAAAAGCACTGACCAAAACATTCAAATAGCACTAAAAACAGATTCAGACCACTAGTCAGAATACAGGAAAGCTaacgaaaaataaaaaagtaaaaacgccaggggagggagagaggagtgtgtggagaaagagagagagagaaattaaaCTGGCACACTCAAATATTCAGGATATTAGGGCCAAACACTTGTCTCTGctggagcctgtgggatgtaaTGATCTGCTGTGTGGGTGGTTTGGCTCTTAAACCAGAAAACACTCCCCAAATTCCCaacatgtgtgtctttgtttgtgtgtgcatgccaaCACTGCTCTCACTAcagtctctggtgtgtgtgtgtgtctgtctatctgtctctctatgTATgcaagtgtctgtctgtctgtctgtctgtctctctatgtatgtctgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtctctgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatgtatgtgtgtgtgtctatatatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtatgtatgtatgttgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatatgtgtgtgtgtgtctctatatgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtgtgtatgtatgtatgtatgcatgtctttgtgtgtatgtatgtgtgtgtgcgtacgtatgtgtgtgtgtttgtgtatatatctatgtatgtgtgtatatgtgtgtgtaagtatgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtataggtgtgtgtgtatacgggtgtatgtgtgtgtatatgcatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtgtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU17429 False 1112 TUCP 0.48 5 309204 310881
TU17432 False 644 lncRNA 0.51 4 309204 356455
TU17435 True 1185 TUCP 0.41 4 309204 310881
TU17437 False 867 TUCP 0.36 4 309204 326304
TU17438 False 1035 TUCP 0.39 3 309204 325036
TU17440 False 892 TUCP 0.42 3 309204 363950
TU17441 False 1134 TUCP 0.43 4 309204 325036

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gpr171 NA coding downstream 189216 553166 ~ 570496 (+)
shkbp1 shkbp1,LOC102789242 coding downstream 454175 818125 ~ 842046 (+)
LOC120570981 LOC101882356 coding downstream 621658 985608 ~ 990071 (+)
LOC120571197 NA coding downstream 1733651 2097601 ~ 2116993 (+)
LOC120571101 NA coding downstream 1760409 2124359 ~ 2541178 (+)
G13098 NA non-coding upstream 13355 243739 ~ 295849 (+)
G13099 NA non-coding upstream 29898 258012 ~ 279306 (+)
G13035 NA non-coding upstream 81121 173277 ~ 228083 (+)
G13033 NA non-coding upstream 81417 172922 ~ 227787 (+)
G13009 NA non-coding upstream 189706 56937 ~ 119498 (+)
G13122 supt5h non-coding downstream 511 364461 ~ 383817 (+)
G13126 NA non-coding downstream 14555 378505 ~ 379682 (+)
G13144 NA non-coding downstream 49193 413143 ~ 550753 (+)
G13145 NA non-coding downstream 52352 416302 ~ 416570 (+)
G13158 NA non-coding downstream 113316 477266 ~ 537230 (+)
LOC120553352 LOC107379863,LOC103373565,LOC102295163 other upstream 134055 158592 ~ 175149 (+)
triap1 triap1 other downstream 22423 386373 ~ 446553 (+)
G13234 NA other downstream 401589 765539 ~ 765977 (+)
G13262 NA other downstream 532248 896198 ~ 1281593 (+)
G13286 NA other downstream 633916 997866 ~ 998979 (+)
G13390 NA other downstream 1187914 1551864 ~ 1559663 (+)

Expression


Co-expression Network