G13262


Basic Information

Item Value
gene id G13262
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053113.1
NCBI id CM020910.1
chromosome length 48524041
location 896198 ~ 1281593 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU17665
accaaattcacttctgagacttttttatgtgagaaatcaactatataaagctcaaatatgggccgttttacgaaaattgaaggttaattgcaaatatggtaagactgtgtgtcggacttcagccgcggtgctgctgcctcgccgcccggctagccttccttcacagaccccggcctgctgtgagctccgttaggctggcagccctgacagagctccagggcctgtaactcccctcttcctgctagctaaatggcccgttgtgtgagagtgagagcgcggtcagcgcgcttgttacaccagcaatctcttaccacgttacacacaatgtcacgccacttagctatacaacatctaaatgtcttataaagctaacaacggtgtccgatttcaagttaatatttgtgaagtttagctaggtttttcgttagctgcgactgtcccttcaatcctatctaTGTGTAACTACAAATcacggctagttagcttcatttttggtcgtaattcgagtatatttacagtttgaatttcgtcacaccatttacacatctaactaaatgttttataaagccaactacggtgtccgatttcaagttaatgaatatttgtgagctgtaagggtttcgttagctgcaactgtccctacaatcctatgtgtacaagattgcggctagtaagctagcttcatttttggtcgtaattcgagtatatttacggttagaatttcgtcacgccacttacacatctaactaaatgttttataaagctaacaacggtgtccgatttcaagttaatgaatatttgtgagctgtaagggtttcgttagcggCGACAGTCCctacaatcctatgtgtacaagattgcggctagtaagctagcttcatttttggacgtaattcgagtatatttacggttagaatttcgtcacgccacttacacatctaactaaatgttttataaagctaacaacggtgtccgatttcaagttaatgaatatttgtgagctgtaagggtttcgttagctgcgactgtcccttcaatcctagctgtgtgtagctacaaatcacggatagttagcttcattttcggcgtaattctgagtatatttacagtttgaatttcgtcaagccagttatacaacatctaactaaatgttttataaagctaacaacggtgttcaatttcaagttaatgaatttttgtgaatttcagagtaATTCTAAGAGGCTAGctatagctagcctcctctagctatagctagcctcctctAGCTATatctccatccagccgcaggctctatcaatgagactcgcggacaagaggcgtgtatttcaccgatcgtttgtttaaataactcaacacattataattacacacataatacgattaactggaacctgtggtaagagattgctggcgtaacaagctctctgaccgcgctctcactcacacacacctggcattaggaagaggggaactgcaggccctggagctctgtccgaGCATCAGCGTGTAGTAatccattatccaaaaaccggtgactttgcgcgggtatggagtgctgtgggctgccagttaacggagctccatctacctcagagcaggccggggtgtgtgaaggaaggcaggcgggacggcgaggcagcaacacaggcagcaccggtgctgaactccgacacacagtcggacaaaatgtgcaattagccatccattttcgtaaaacggcccatatttgagctttacatagttgatttctggcataaaaaagtttcagaagtgaattttgtaatggaatagcagagatctgcgcgacctagattcggaagactacctgatctcaggtcagttgtgtagcctatgtaaatgttggggcgtgaccgttctcttaatacacccatgggctgacaaaggtaccggtttttgggaggttgacgtcaacttccagctttgttgggattcgcccgttttcagcggcagtttcaaaatatgagattttcatagtaaaggggtgtcagtgggactttgagcttctatgtatgtcctatttaccctccgaactgtcgttattcaactatgacagggtaaaatcggttttgcattctatcacccctttaaacaggTGAGTTATATAAACAGTTGTTATGAAGTGTGAAATTAGCTTCATAgaccaaaactgtttttttgtaccaggctgtaaacatttttatatttctgatGTTAAGTCTGGATTTTTCCACATGGGGGTCTATGGGGAATGACGCGAAGAACTGTTCAGTGACACACATAACAAACATCGTTTTCAGCATCTTACTGAGATATTAATAATCACtcaaataaaacatacatgacgtgacacaagctagcattagctctaTTCAGTATCAGGACAGTCACTTAACTTCCTGTTAGCTTAAAAGAAGGATTAATGTTACCTTTTTTGATATTAAATTCAACACTTTAGTAATAGTATAAtattgtaaaacacatttttcatctgtgaaatgttattccatgttgCTTAGAGTCTTTAAGATCAGTTGTCTGTCCCAAGATGGCGGGGCCACAGACGCAGTTTAAACacattaagggccctatcttgcacccaccgcaattgcctttgtacaaaacctggtctaaagtcagtggtgctagtctaaagtcagtggtgctagtctaaagtcagtagcgctagtctaaagtcagtagcgctagtctaaagtcagtggtgctagtctaaagtcagtagcgctagtctaaagtcagtggtgctagtctaaagtcagtggcgctttattcagatgctattttaggggcgcatgcttggccataatgtagcgtgtgcacaacgcgcatacacttctctcatctaaacggacgcagcagttcccatttttgcaaaccataattacaaagaaaaatattactgaaaatgcgcttcaggtgtttggatagatcaggaggcactttacagtacagtcctcagaaagtcgcagcattcttcgtggcttgttgtgatttaaacaacatttccatgaatcatggatgtgttgatgacataaatgaggaaatattagaggacttaaggagacgtgatgttgaactacggcaggatctggtccgggagtaatgcgcgatgtgctcctgatggagcgggtggacggagatggagtggggggaggaggaaggagcacaacaggagcaggtggtgcgtttggaggcccacgctccatggctgcagcaatcctctccagacttgaggagatgcgcctgagaggccgcagcaacatcgccacccggccaagacgggcatttattacttttccgcatcccggacagctcccgctggtgtGCGCCAGGAaaatccgccgttataatagcaatccgccatggaacaagcgcgcctgctcttaaagggaatgtgagatgacgctctgattggttattttcacgtcacgcccaaaccacacctagctacttcagaccaacccattttagatttgcgtcgggcgcaagagtcatttatcccgccggtaaaatagcaacagcggccgagatccgcccacaaagctacttgcgttttgcgtttcagatcgttaaaatagggccctaactgttcaagtcattttttaagcagcagaagcagcaatGTTCTGATTAAAGCTTTTCTTCGTCTTAAGtgacaataaactgaatatttcagCAATTTGACATCACCTTAGTAAACAGTGATGGGGATTTTGGTAAATTGTTTATACCAGGTCATTAATTAAGAACAACAAATACTTTTTCGTTGCAGCATTAGTTAAAAAGCACTAGCAGTTTAACCCTGAACTCAGAATATTTTATTACAGCAAAACTAACTAATTTTGAGTGGAATAAACCCCTTCAAAGGGAGGGAGTGTAATGTGTAGTCCTAGCCAGGataacatccatgctgttcagaagataaagttactgctggtcagccttcaatgtggagagaagatcagaaaataacaacacagctatcagggcatgaggaggaggcaggaggaaaccGCTTGGCTCGGAAACATGTTCACAACAcggcagtgtgaatgcgctggtgtcTTTTAAGGCTACTATTcagagaaaatgttttaaaacattgttcacaccagtacggcttctctccagtgtgaatgcgctggtgttTTTTAAGGTCACCGCTCTGAGAAAAAGTTTTACAACATAGATCACACCTgtatggcttctctcctgtgtgaatgcgctggtgagatttaaggtgACTACTctcagaaaaggttttaccacatagatcacagctgtaaggcttctctccagtgtgaatgcgttgatgtcttTTAAGGGCCCCACTCTCAGAAAAATGTTCCCCACATTGTTTACACCAGTACAGCTTCTCTGCAGTGTGAACATGCTGGTGTTTTTTAAGCCCACTACTATAAGAAAAGGTTTTACCACATATACTACAGCTGTGaggtttatctccagtgtgaatgtgttgatgTCTTTTAAGGCTACTACTCAGAGAAAAAGTTTTACAACATAGATCACacctgtacggcttctctccagtgtgaatgcgctggtgttTTTTAAGGTCACCGCTCTGAGAAAAAGTTTTACAACATAGATCACACCTgtatggcttctctccagtgtgaatgcgctggtgagatttaaggtgaccactctgagaaaaggttttaccacatagatcacagcagtacggcttctctctagtgtgaatgcgttgatgtcttTTAAGAGCCCCACTCTCAGAAAATTTTCCCCCAcgttgttcacaccagtacagCTTCTCTGCAGTGTGAACGTGCTGGTGTTTTTTAAGCCCACTACTATAAGAAAACGTTTTACCACATATACCACAGCTGTGaggtttatctccagtgtgaatgtgttgatgTATTTTAAGGTGACCACTCAtagaaaaagttttcccacattgtttacaccagtacggcttctctcctgtgtgaacg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>TU17666
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>TU17667
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>TU17669
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU17665 True 5430 TUCP 0.41 3 1182382 1281593
TU17666 False 2418 lncRNA 0.49 3 896198 898866
TU17667 False 1746 lncRNA 0.48 3 1279680 1281593
TU17669 False 2505 lncRNA 0.44 4 896198 1281593

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
shkbp1 shkbp1,LOC102789242 coding upstream 54152 818125 ~ 842046 (+)
gpr171 NA coding upstream 325702 553166 ~ 570496 (+)
LOC120571197 NA coding downstream 816008 2097601 ~ 2116993 (+)
LOC120571101 NA coding downstream 842766 2124359 ~ 2541178 (+)
LOC120571617 NA coding downstream 856416 2138009 ~ 2138881 (+)
LOC120571219 NA coding downstream 927388 2208981 ~ 2223970 (+)
LOC120544531 NA coding downstream 964026 2245619 ~ 2251293 (+)
G13186 NA non-coding upstream 140277 632705 ~ 755921 (+)
G13193 NA non-coding upstream 176484 719366 ~ 719714 (+)
G13191 NA non-coding upstream 182692 705498 ~ 713506 (+)
trnar-ucu_9 NA non-coding upstream 221825 674282 ~ 674373 (+)
G13187 NA non-coding upstream 225745 634192 ~ 670453 (+)
G13355 NA non-coding downstream 123122 1404715 ~ 1870128 (+)
G13358 NA non-coding downstream 135303 1416896 ~ 1422120 (+)
G13376 NA non-coding downstream 197400 1478993 ~ 1701243 (+)
G13348 NA non-coding downstream 220646 1502239 ~ 1534666 (+)
G13412 NA non-coding downstream 407048 1688641 ~ 1738901 (+)
G13234 NA other upstream 130221 765539 ~ 765977 (+)
triap1 triap1 other upstream 449645 386373 ~ 446553 (+)
G13106 NA other upstream 532248 309204 ~ 363950 (+)
LOC120553352 LOC107379863,LOC103373565,LOC102295163 other upstream 721049 158592 ~ 175149 (+)
G13390 NA other downstream 270271 1551864 ~ 1559663 (+)
LOC120571187 NA other downstream 981817 2263410 ~ 2294888 (+)
LOC120571130 NA other downstream 1329279 2610872 ~ 2792845 (+)
G13555 NA other downstream 1444726 2726319 ~ 2738188 (+)
zgc:162872 LOC103361195,LOC100694875,LOC101467947,LOC102198539,LOC102776046 other downstream 1667041 2948634 ~ 2964772 (+)

Expression


Co-expression Network